ORTHOLOGY: K00228 Entry K00228                      KO                                      Name CPOX, hemF Definition coproporphyrinogen III oxidase [EC:1.3.3.3] Pathway ko00860   Porphyrin and chlorophyll metabolism Module M00121   Heme biosynthesis, glutamate => protoheme/siroheme Disease H00202   Hepatic porphyria H01763   Porphyria Brite KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]  Metabolism   Metabolism of cofactors and vitamins    00860 Porphyrin and chlorophyll metabolism     K00228  CPOX, hemF; coproporphyrinogen III oxidase KEGG modules [BR:ko00002]  Pathway module   Nucleotide and amino acid metabolism    Cofactor and vitamin biosynthesis     M00121  Heme biosynthesis, glutamate => protoheme/siroheme      K00228  CPOX, hemF; coproporphyrinogen III oxidase Enzymes [BR:ko01000]  1. Oxidoreductases   1.3  Acting on the CH-CH group of donors    1.3.3  With oxygen as acceptor     1.3.3.3  coproporphyrinogen oxidase      K00228  CPOX, hemF; coproporphyrinogen III oxidase Other DBs RN:  R03220 COG:  COG0408 GO:  0004109 Genes HSA:  1371(CPOX) PTR:  460544(CPOX) PPS:  100968382(CPOX) GGO:  101130717(CPOX) PON:  100442862(CPOX) NLE:  100582923(CPOX) MCC:  698849(CPOX) MCF:  102118929(CPOX) CSAB:  103228475(CPOX) RRO:  104654528(CPOX) CJC:  100389961(CPOX) SBQ:  101029765(CPOX) MMU:  12892(Cpox) RNO:  304024(Cpox) CGE:  100772187(Cpox) NGI:  103732635(Cpox) HGL:  101704613(Cpox) CCAN:  109698522(Cpox) OCU:  100339410(CPOX) TUP:  102481934(CPOX) CFA:  487948(CPOX) AML:  100482118(CPOX) UMR:  103673239(CPOX) FCA:  101097336(CPOX) PTG:  102968341(CPOX) AJU:  106982560(CPOX) BTA:  540283(CPOX) BOM:  102265707(CPOX) BIU:  109564600(CPOX) PHD:  102316115(CPOX) CHX:  102168486(CPOX) OAS:  101108542(CPOX) SSC:  100511474(CPOX) CFR:  102516527(CPOX) BACU:  103019584(CPOX) LVE:  103079414(CPOX) ECB:  100072394(CPOX) MYB:  102262487(CPOX) MYD:  102757261(CPOX) HAI:  109377046(CPOX) RSS:  109460794(CPOX) PALE:  102889499(CPOX) LAV:  100664497(CPOX) MDO:  100031341(CPOX) SHR:  100923430(CPOX) OAA:  100089783(CPOX) GGA:  418377(CPOX) MGP:  100541589(CPOX) CJO:  107320593(CPOX) APLA:  101804003(CPOX) ACYG:  106037088(CPOX) TGU:  100221663(CPOX) GFR:  102045457(CPOX) FAB:  101820973(CPOX) PHI:  102101962(CPOX) CCW:  104687206(CPOX) FPG:  101915787(CPOX) FCH:  102060011(CPOX) CLV:  102098317(CPOX) AAM:  106490720(CPOX) ASN:  102381414(CPOX) AMJ:  102563135(CPOX) PSS:  102453845(CPOX) CMY:  102942083(CPOX) CPIC:  101942211(CPOX) ACS:  100565041(cpox) PBI:  103050922(CPOX) GJA:  107124732(CPOX) XLA:  108707428(cpox.L) XTR:  100145617(cpox) NPR:  108797257(CPOX) DRE:  321294(cpox) SRX:  107717573 107751032 SANH:  107657924 107700480 SGH:  107550392 107585846 IPU:  108265742(cpox) TRU:  101067500(cpox) TNG:  GSTEN00028915G001 LCO:  104920248(cpox) NCC:  104965938(cpox) MZE:  101478289(cpox) OLA:  101156396(cpox) XMA:  102224230 102224481 CSEM:  103392985(cpox) LCF:  108881309(cpox) SASA:  106573996(HEM6) 106613521 ELS:  105007740(cpox) SFM:  108931951(cpox) 108937951 LCM:  102355030(CPOX) CMK:  103187288(cpox) SPU:  580851 SKO:  100367799 DME:  Dmel_CG3433(Coprox) DPO:  Dpse_GA17449 DAN:  Dana_GF15439 DER:  Dere_GG10448 DPE:  Dper_GL26198 DSE:  Dsec_GM16261 DSI:  Dsimw501_GD23442(Dsim_GD23442) DWI:  Dwil_GK18283 DYA:  Dyak_GE14253 DGR:  Dgri_GH13345 DMO:  Dmoj_GI17730 DVI:  Dvir_GJ17558 MDE:  101900787 AGA:  AgaP_AGAP004749 AAG:  AaeL_AAEL013389 CQU:  CpipJ_CPIJ006245 AME:  552084 BIM:  100740439 BTER:  100648147 SOC:  105201431 AEC:  105149763 ACEP:  105621991 PBAR:  105429099 HST:  105186017 CFO:  105253796 LHU:  105671716 NVI:  100119936 TCA:  656916 DPA:  109540184 NVL:  108566847 BMOR:  692932 PXY:  105381552 API:  100160677 DNX:  107172052 107173984 PHU:  Phum_PHUM212330 DPX:  DAPPUDRAFT_111417 ISC:  IscW_ISCW010977 TUT:  107359782 HRO:  HELRODRAFT_86324 LGI:  LOTGIDRAFT_229358 CRG:  105321998 OBI:  106870177 SMM:  Smp_162280 OVI:  T265_14894 NVE:  NEMVE_v1g149268 NEMVE_v1g229388 ADF:  107335326 HMG:  100213358 TAD:  TRIADDRAFT_25736 AQU:  100634446 100635286 ATH:  AT1G03475(LIN2) AT4G03205(hemf2) ALY:  ARALYDRAFT_887500 ARALYDRAFT_911882 CRB:  CARUB_v10003781mg CARUB_v10009383mg EUS:  EUTSA_v10007888mg EUTSA_v10029252mg BRP:  103843696 103844502 BNA:  106369273 106401564 106406811 106406826 106406827 106423089 THJ:  104815952 104826018 CIT:  102614806 CIC:  CICLE_v10011903mg TCC:  18612293 GRA:  105790539 105803476 GHI:  107897850 107912651 107915439 107955637 EGR:  104425176 GMX:  100818277(CPX) PVU:  PHAVU_008G289900g VRA:  106764977 VAR:  108338699 CCAJ:  109814330 109814340 109814341 MTR:  MTR_5g098800 CAM:  101494025 ADU:  107463921 107464323 107467791 107467994 107496080 AIP:  107609106 107614917 107627821 LJA:  Lj0g3v0060729.1(Lj0g3v0060729.1) Lj3g3v0306960.1(Lj3g3v0306960.1) LANG:  109342177 FVE:  101315071 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Purification, molecular cloning, and induction of mRNA during erythroid differentiation.   Journal J Biol Chem 268:21359-63 (1993)   Sequence [mmu:12892] Reference PMID:10217486   Authors Johansson P, Hederstedt L   Title Organization of genes for tetrapyrrole biosynthesis in gram--positive bacteria.   Journal Microbiology 145 ( Pt 3):529-38 (1999) DOI:10.1099/13500872-145-3-529 LinkDB

ORTHOLOGY: K02495 Entry K02495                      KO                                      Name hemN, hemZ Definition oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase [EC:1.3.98.3] Pathway ko00860   Porphyrin and chlorophyll metabolism Module M00121   Heme biosynthesis, glutamate => protoheme/siroheme Brite KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]  Metabolism   Metabolism of cofactors and vitamins    00860 Porphyrin and chlorophyll metabolism     K02495  hemN, hemZ; oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase KEGG modules [BR:ko00002]  Pathway module   Nucleotide and amino acid metabolism    Cofactor and vitamin biosynthesis     M00121  Heme biosynthesis, glutamate => protoheme/siroheme      K02495  hemN, hemZ; oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase Enzymes [BR:ko01000]  1. Oxidoreductases   1.3  Acting on the CH-CH group of donors    1.3.98  With other, known, physiological acceptors     1.3.98.3  coproporphyrinogen dehydrogenase      K02495  hemN, hemZ; oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase Other DBs RN:  R06895 COG:  COG0635 GO:  0051989 Genes ECO:  b3867(hemN) ECJ:  JW3838(hemN) ECD:  ECDH10B_4057(hemN) EBW:  BWG_3537(hemN) ECOK:  ECMDS42_3306(hemN) ECE:  Z5403(hemN) ECS:  ECs4789 ECF:  ECH74115_5313(hemN) ETW:  ECSP_4920(hemN) ELX:  CDCO157_4528 EOJ:  ECO26_4723(hemN) EOI:  ECO111_4687(hemN) EOH:  ECO103_4304(hemN) ECG:  E2348C_4173(hemN) EOK:  G2583_4667(hemN) ELR:  ECO55CA74_22345 ECC:  c4816(hemN) ECP:  ECP_4077 ECI:  UTI89_C4456(hemN) ECV:  APECO1_2595(hemN) ECX:  EcHS_A4092(hemN) ECW:  EcE24377A_4386(hemN) ECM:  EcSMS35_4251(hemN) ECY:  ECSE_4150 ECR:  ECIAI1_4066(hemN) ECQ:  ECED1_4567(hemN) ECK:  EC55989_4342(hemN) ECT:  ECIAI39_3134(hemN) EOC:  CE10_4528(hemN) EUM:  ECUMN_4390(hemN) ECZ:  ECS88_4316(hemN) ELO:  EC042_4240(hemN) 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ENZYME: 1.3.3.3 Entry EC 1.3.3.3                  Enzyme                                  Name coproporphyrinogen oxidase; coproporphyrinogen III oxidase; coproporphyrinogenase Class Oxidoreductases; Acting on the CH-CH group of donors; With oxygen as acceptor Sysname coproporphyrinogen:oxygen oxidoreductase (decarboxylating) Reaction(IUBMB) coproporphyrinogen III + O2 + 2 H+ = protoporphyrinogen-IX + 2 CO2 + 2 H2O [RN:R03220] Reaction(KEGG) R03220 Substrate coproporphyrinogen III [CPD:C03263]; O2 [CPD:C00007]; H+ [CPD:C00080] Product protoporphyrinogen IX [CPD:C01079]; CO2 [CPD:C00011]; H2O [CPD:C00001] History EC 1.3.3.3 created 1972, modified 2003 Pathway ec00860   Porphyrin and chlorophyll metabolism ec01100   Metabolic pathways ec01110   Biosynthesis of secondary metabolites Orthology K00228   coproporphyrinogen III oxidase Genes HSA:  1371(CPOX) PTR:  460544(CPOX) PPS:  100968382(CPOX) GGO:  101130717(CPOX) PON:  100442862(CPOX) NLE:  100582923(CPOX) MCC:  698849(CPOX) MCF:  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J. 97 (1965) 731-40. Reference 2  [PMID:8955072]   Authors Medlock AE, Dailey HA.   Title Human coproporphyrinogen oxidase is not a metalloprotein.   Journal J. Biol. Chem. 271 (1996) 32507-10. Reference 3  [PMID:8407975]   Authors Kohno H, Furukawa T, Yoshinaga T, Tokunaga R, Taketani S.   Title Coproporphyrinogen oxidase. Purification, molecular cloning, and induction of mRNA during erythroid differentiation.   Journal J. Biol. Chem. 268 (1993) 21359-63.   Sequence [mmu:12892] Other DBs ExplorEnz - The Enzyme Database:  1.3.3.3 IUBMB Enzyme Nomenclature:  1.3.3.3 ExPASy - ENZYME nomenclature database:  1.3.3.3 BRENDA, the Enzyme Database:  1.3.3.3 CAS:  9076-84-0 LinkDB

ENZYME: 1.3.98.3 Entry EC 1.3.98.3                 Enzyme                                  Name coproporphyrinogen dehydrogenase; oxygen-independent coproporphyrinogen-III oxidase; HemN; coproporphyrinogen III oxidase Class Oxidoreductases; Acting on the CH-CH group of donors; With other, known, physiological acceptors Sysname coproporphyrinogen-III:S-adenosyl-L-methionine oxidoreductase (decarboxylating) Reaction(IUBMB) coproporphyrinogen III + 2 S-adenosyl-L-methionine = protoporphyrinogen IX + 2 CO2 + 2 L-methionine + 2 5'-deoxyadenosine [RN:R06895] Reaction(KEGG) R06895 Substrate coproporphyrinogen III [CPD:C03263]; S-adenosyl-L-methionine [CPD:C00019] Product protoporphyrinogen IX [CPD:C01079]; CO2 [CPD:C00011]; L-methionine [CPD:C00073]; 5'-deoxyadenosine [CPD:C05198] Comment This enzyme differs from EC 1.3.3.3, coproporphyrinogen oxidase, by using S-adenosyl-L-methionine (AdoMet) instead of oxygen as oxidant. It occurs mainly in bacteria, whereas eukaryotes use the oxygen-dependent oxidase. The reaction starts by using an electron from the reduced form of the enzyme's [4Fe-4S] cluster to split AdoMet into methionine and the radical 5'-deoxyadenosin-5'-yl. This radical initiates attack on the 2-carboxyethyl groups, leading to their conversion into vinyl groups. This conversion, ---(.)CH-CH2-COO- -> ---CH=CH2 + CO2 + e- replaces the electron initially used. History EC 1.3.98.3 created 2004 as EC 1.3.99.22, transferred 2016 to EC 1.3.98.3 Pathway ec00860   Porphyrin and chlorophyll metabolism ec01100   Metabolic pathways ec01110   Biosynthesis of secondary metabolites Orthology K02495   oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase Genes ECO:  b3867(hemN) ECJ:  JW3838(hemN) ECD:  ECDH10B_4057(hemN) EBW:  BWG_3537(hemN) ECOK:  ECMDS42_3306(hemN) ECE:  Z5403(hemN) ECS:  ECs4789 ECF:  ECH74115_5313(hemN) ETW:  ECSP_4920(hemN) ELX:  CDCO157_4528 EOJ:  ECO26_4723(hemN) EOI:  ECO111_4687(hemN) EOH:  ECO103_4304(hemN) ECG:  E2348C_4173(hemN) EOK:  G2583_4667(hemN) ELR:  ECO55CA74_22345 ECC:  c4816(hemN) ECP:  ECP_4077 ECI:  UTI89_C4456(hemN) ECV:  APECO1_2595(hemN) ECX:  EcHS_A4092(hemN) ECW:  EcE24377A_4386(hemN) ECM:  EcSMS35_4251(hemN) ECY:  ECSE_4150 ECR:  ECIAI1_4066(hemN) ECQ:  ECED1_4567(hemN) ECK:  EC55989_4342(hemN) ECT:  ECIAI39_3134(hemN) EOC:  CE10_4528(hemN) EUM:  ECUMN_4390(hemN) ECZ:  ECS88_4316(hemN) ELO:  EC042_4240(hemN) 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Biol. Chem. 277 (2002) 34136-42.   Sequence [eco:b3867] Reference 2  [PMID:14633981]   Authors Layer G, Moser J, Heinz DW, Jahn D, Schubert WD.   Title Crystal structure of coproporphyrinogen III oxidase reveals cofactor geometry of Radical SAM enzymes.   Journal EMBO. J. 22 (2003) 6214-24.   Sequence [eco:b3867] Other DBs ExplorEnz - The Enzyme Database:  1.3.98.3 IUBMB Enzyme Nomenclature:  1.3.98.3 ExPASy - ENZYME nomenclature database:  1.3.98.3 BRENDA, the Enzyme Database:  1.3.98.3 LinkDB

REACTION: R03220 Entry R03220                      Reaction                                Name Coproporphyrinogen:oxygen oxidoreductase(decarboxylating) Definition Coproporphyrinogen III + Oxygen <=> Protoporphyrinogen IX + 2 CO2 + 2 H2O Equation C03263 + C00007 <=> C01079 + 2 C00011 + 2 C00001 Comment multi-step reaction Reaction class RC00884   C01079_C03263 Enzyme 1.3.3.3 Pathway rn00860   Porphyrin and chlorophyll metabolism rn01100   Metabolic pathways rn01110   Biosynthesis of secondary metabolites Module M00121   Heme biosynthesis, glutamate => protoheme/siroheme Orthology K00228   coproporphyrinogen III oxidase [EC:1.3.3.3] LinkDB

REACTION: R06895 Entry R06895                      Reaction                                Name coproporphyrinogen-III:S-adenosyl-L-methionine oxidoreductase(decarboxylating) Definition Coproporphyrinogen III + 2 S-Adenosyl-L-methionine <=> Protoporphyrinogen IX + 2 CO2 + 2 L-Methionine + 2 5'-Deoxyadenosine Equation C03263 + 2 C00019 <=> C01079 + 2 C00011 + 2 C00073 + 2 C05198 Reaction class RC00021   C00019_C00073 RC00884   C01079_C03263 Enzyme 1.3.98.3 Pathway rn00860   Porphyrin and chlorophyll metabolism rn01100   Metabolic pathways rn01110   Biosynthesis of secondary metabolites Module M00121   Heme biosynthesis, glutamate => protoheme/siroheme Orthology K02495   oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase [EC:1.3.98.3] LinkDB

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