KEGG   ORTHOLOGY: K04100Help
Entry
K04100                      KO                                     

Name
ligA
Definition
protocatechuate 4,5-dioxygenase, alpha chain [EC:1.13.11.8]
Pathway
Benzoate degradation
Polycyclic aromatic hydrocarbon degradation
Aminobenzoate degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Metabolism
  Xenobiotics biodegradation and metabolism
   00362 Benzoate degradation
    K04100  ligA; protocatechuate 4,5-dioxygenase, alpha chain
   00627 Aminobenzoate degradation
    K04100  ligA; protocatechuate 4,5-dioxygenase, alpha chain
   00624 Polycyclic aromatic hydrocarbon degradation
    K04100  ligA; protocatechuate 4,5-dioxygenase, alpha chain
Enzymes [BR:ko01000]
 1. Oxidoreductases
  1.13  Acting on single donors with incorporation of molecular oxygen (oxygenases)
   1.13.11  With incorporation of two atoms of oxygen
    1.13.11.8  protocatechuate 4,5-dioxygenase
     K04100  ligA; protocatechuate 4,5-dioxygenase, alpha chain
BRITE hierarchy
Other DBs
Genes
XCC: 
XCC0805(ligA)
XCB: 
XCA: 
XCP: 
XCV: 
XCV0914(ligA)
XAC: 
XAC0879(ligA)
XCI: 
XCT: 
XCU: 
XCN: 
XCW: 
XCR: 
XCM: 
XCF: 
XCJ: 
XFU: 
XAX: 
XAO: 
XOM: 
XOO3524(XOO3524)
XOR: 
XOZ: 
XGA: 
XVE: 
XPE: 
VNA: 
VEJ: 
VFL: 
PPUT: 
PVR: 
AVN: 
AVL: 
AVD: 
PAT: 
AAW: 
CSA: 
MMW: 
MME: 
MPC: 
GSN: 
GBI: 
RPJ: 
RIN: 
CCUP: 
BGE: 
BGF: 
BUQ: 
BPH: 
BPX: 
PSPW: 
PPK: 
PPNO: 
PPNM: 
PRB: 
PPUL: 
PSPU: 
PAPI: 
PVE: 
POX: 
PTX: 
PFG: 
PNR: 
AIS: 
CDN: 
PHN: 
RFR: 
RSB: 
RHY: 
PNA: 
ACK: 
ACRA: 
ACID: 
VEI: 
DAC: 
DEL: 
DTS: 
DHK: 
CTT: 
CTES: 
RTA: 
LIM: 
LIH: 
HYR: 
HYB: 
HYL: 
CBAA: 
CBAB: 
LCH: 
RGU: 
SHD: 
DAR: 
AZO: 
azo2523(ligA1) azo2538(ligA2)
THU: 
TCL: 
ARA: 
RTR: 
NGL: 
NGG: 
BRA: 
BBT: 
AOL: 
RPA: 
RPB: 
RPD: 
RPE: 
RPT: 
RPX: 
RHZ: 
MAAD: 
BSB: 
MALG: 
HBA: 
NAR: 
NPP: 
NPN: 
SPHP: 
SMAZ: 
SPHI: 
SSAN: 
SPAN: 
SKR: 
SCH: 
SSY: 
SPHB: 
SPHR: 
SPHG: 
BLAS: 
AAY: 
WYH_01046(ligA_2) WYH_01908(ligA_3) WYH_03215(ligA_4)
ADO: 
A6F68_01080(ligA_1)
CMAN: 
RGI: 
MAG: 
MAGX: 
MAGN: 
ABS: 
ABQ: 
TMO: 
MAGQ: 
APB: 
SLS: 
ARZ: 
SRO: 
BSD: 
MMAR: 
SVI: 
AMQ: 
PDX: 
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
PMID:2185230
  Authors
Noda Y, Nishikawa S, Shiozuka K, Kadokura H, Nakajima H, Yoda K, Katayama Y, Morohoshi N, Haraguchi T, Yamasaki M
  Title
Molecular cloning of the protocatechuate 4,5-dioxygenase genes of Pseudomonas paucimobilis.
  Journal
J Bacteriol 172:2704-9 (1990)
DOI:10.1128/JB.172.5.2704-2709.1990
LinkDB All DBs

KEGG   ORTHOLOGY: K04101Help
Entry
K04101                      KO                                     

Name
ligB
Definition
protocatechuate 4,5-dioxygenase, beta chain [EC:1.13.11.8]
Pathway
Benzoate degradation
Polycyclic aromatic hydrocarbon degradation
Aminobenzoate degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Metabolism
  Xenobiotics biodegradation and metabolism
   00362 Benzoate degradation
    K04101  ligB; protocatechuate 4,5-dioxygenase, beta chain
   00627 Aminobenzoate degradation
    K04101  ligB; protocatechuate 4,5-dioxygenase, beta chain
   00624 Polycyclic aromatic hydrocarbon degradation
    K04101  ligB; protocatechuate 4,5-dioxygenase, beta chain
Enzymes [BR:ko01000]
 1. Oxidoreductases
  1.13  Acting on single donors with incorporation of molecular oxygen (oxygenases)
   1.13.11  With incorporation of two atoms of oxygen
    1.13.11.8  protocatechuate 4,5-dioxygenase
     K04101  ligB; protocatechuate 4,5-dioxygenase, beta chain
BRITE hierarchy
Other DBs
Genes
XCC: 
XCC0804(pcaH)
XCB: 
XCA: 
XCP: 
XCV: 
XCV0913(ligB)
XAC: 
XAC0878(pcaH)
XCI: 
XCT: 
XCU: 
XCN: 
XCW: 
XCR: 
XCM: 
XCF: 
XCJ: 
XFU: 
XAX: 
XACM_0859(ligB)
XAO: 
XOO: 
XOO3734(pcaH)
XOM: 
XOO3525(XOO3525)
XOP: 
XOY: 
XOR: 
XOZ: 
XGA: 
XVE: 
XPE: 
VNA: 
VEJ: 
VFL: 
PVR: 
AVN: 
AVL: 
AVD: 
PAT: 
AAW: 
TTU: 
CSA: 
MMW: 
MME: 
MPC: 
GSN: 
GBI: 
KKI: 
RPJ: 
CCUP: 
BGE: 
BGF: 
BUQ: 
BPH: 
BPX: 
PSPW: 
PPK: 
PPNO: 
PPNM: 
PRB: 
PPUL: 
PSPU: 
PAPI: 
PVE: 
POX: 
PTX: 
PFG: 
PNR: 
AIS: 
CDN: 
PHN: 
RFR: 
RSB: 
RHY: 
PNA: 
ACK: 
ACRA: 
ACID: 
DAC: 
DEL: 
DTS: 
DHK: 
CTT: 
CTES: 
RTA: 
LIM: 
LIH: 
HYR: 
HYB: 
HYL: 
CBAA: 
CBAB: 
LCH: 
MIU: 
RGU: 
SHD: 
RBU: 
DAR: 
AZO: 
azo2522(ligB1) azo2537(ligB2)
THU: 
TCL: 
MESO: 
ARA: 
RTR: 
NGL: 
NGG: 
BRA: 
BRADO2342(ligB) BRADO2380(mhpB)
BBT: 
BBta_2702(ligB) BBta_2734(mhpB)
AOL: 
RPA: 
RPA1007(mhpB) RPA4702(ligB)
RPB: 
RPD: 
RPE: 
RPT: 
RPX: 
RHZ: 
MAAD: 
MMED: 
BSB: 
MALG: 
CON: 
HBA: 
NAR: 
NPP: 
NPN: 
SMAZ: 
SGI: 
SPHI: 
SSAN: 
SPAN: 
SKR: 
SCH: 
SSY: 
SPHB: 
SPHR: 
SPHG: 
BLAS: 
AAY: 
WYH_01045(ligB_1) WYH_01909(ligB_2) WYH_03214(ligB_3)
ADO: 
CMAN: 
RGI: 
MAG: 
MAGX: 
MAGN: 
ABS: 
ABQ: 
TMO: 
TMO_b0115(mhpB)
MAGQ: 
APB: 
SLS: 
MVD: 
AGY: 
CART: 
CPHY: 
ARZ: 
SRO: 
NOA: 
NML: 
BSD: 
MMAR: 
SVI: 
AMQ: 
PDX: 
PSEA: 
AMS: 
ACTN: 
AFS: 
AFO: 
PYR: 
POG: 
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
PMID:2185230
  Authors
Noda Y, Nishikawa S, Shiozuka K, Kadokura H, Nakajima H, Yoda K, Katayama Y, Morohoshi N, Haraguchi T, Yamasaki M
  Title
Molecular cloning of the protocatechuate 4,5-dioxygenase genes of Pseudomonas paucimobilis.
  Journal
J Bacteriol 172:2704-9 (1990)
DOI:10.1128/JB.172.5.2704-2709.1990
LinkDB All DBs

KEGG   ENZYME: 1.13.11.8Help
Entry
EC 1.13.11.8                Enzyme                                 

Name
protocatechuate 4,5-dioxygenase;
protocatechuate 4,5-oxygenase;
protocatechuic 4,5-dioxygenase;
protocatechuic 4,5-oxygenase;
protocatechuate:oxygen 4,5-oxidoreductase (decyclizing);
protocatechuate:oxygen 4,5-oxidoreductase (ring-opening)
Class
Oxidoreductases;
Acting on single donors with incorporation of molecular oxygen (oxygenases);
With incorporation of two atoms of oxygen
BRITE hierarchy
Sysname
3,4-dihydroxybenzoate:oxygen 4,5-oxidoreductase (ring-opening)
Reaction(IUBMB)
3,4-dihydroxybenzoate + O2 = 4-carboxy-2-hydroxymuconate semialdehyde [RN:R01632]
Reaction(KEGG)
Substrate
3,4-dihydroxybenzoate [CPD:C00230];
O2 [CPD:C00007]
Product
4-carboxy-2-hydroxymuconate semialdehyde [CPD:C04484]
Comment
Requires Fe2+.
History
EC 1.13.11.8 created 1965 as EC 1.13.1.8, transferred 1972 to EC 1.13.11.8
Pathway
Benzoate degradation
Polycyclic aromatic hydrocarbon degradation
Aminobenzoate degradation
Microbial metabolism in diverse environments
Orthology
K04100  
protocatechuate 4,5-dioxygenase, alpha chain
K04101  
protocatechuate 4,5-dioxygenase, beta chain
Genes
XCC: 
XCC0804(pcaH) XCC0805(ligA)
XCB: 
XCA: 
XCP: 
XCV: 
XCV0913(ligB) XCV0914(ligA)
XAC: 
XAC0878(pcaH) XAC0879(ligA)
XCI: 
XCT: 
XCU: 
XCN: 
XCW: 
XCR: 
XCM: 
XCF: 
XCJ: 
XFU: 
XAX: 
XAO: 
XOO: 
XOO3734(pcaH)
XOM: 
XOO3524(XOO3524) XOO3525(XOO3525)
XOP: 
XOY: 
XOR: 
XOZ: 
XGA: 
XVE: 
XPE: 
VNA: 
VEJ: 
VFL: 
PPUT: 
PVR: 
AVN: 
AVL: 
AVD: 
PAT: 
AAW: 
TTU: 
CSA: 
MMW: 
MME: 
MPC: 
GSN: 
GBI: 
KKI: 
RPJ: 
RIN: 
CCUP: 
BGE: 
BGF: 
BUQ: 
BPH: 
BPX: 
PSPW: 
PPK: 
PPNO: 
PPNM: 
PRB: 
PPUL: 
PSPU: 
PAPI: 
PVE: 
POX: 
PTX: 
PFG: 
PNR: 
AIS: 
CDN: 
PHN: 
RFR: 
RSB: 
RHY: 
PNA: 
ACK: 
ACRA: 
ACID: 
VEI: 
DAC: 
DEL: 
DTS: 
DHK: 
CTT: 
CTES: 
RTA: 
LIM: 
LIH: 
HYR: 
HYB: 
HYL: 
CBAA: 
CBAB: 
LCH: 
MIU: 
RGU: 
SHD: 
RBU: 
DAR: 
AZO: 
azo2522(ligB1) azo2523(ligA1) azo2537(ligB2) azo2538(ligA2)
THU: 
TCL: 
MESO: 
ARA: 
RTR: 
NGL: 
NGG: 
BRA: 
BBT: 
AOL: 
RPA: 
RPA1006 RPA1007(mhpB) RPA4701(ligA) RPA4702(ligB)
RPB: 
RPD: 
RPE: 
RPT: 
RPX: 
RHZ: 
MAAD: 
MMED: 
BSB: 
MALG: 
CON: 
HBA: 
NAR: 
NPP: 
NPN: 
SPHP: 
SMAZ: 
SGI: 
SPHI: 
SSAN: 
SPAN: 
SKR: 
SCH: 
SSY: 
SPHB: 
SPHR: 
SPHG: 
BLAS: 
AAY: 
WYH_01045(ligB_1) WYH_01046(ligA_2) WYH_01908(ligA_3) WYH_01909(ligB_2) WYH_03214(ligB_3) WYH_03215(ligA_4)
ADO: 
A6F68_01079(ligB) A6F68_01080(ligA_1)
CMAN: 
RGI: 
MAG: 
MAGX: 
MAGN: 
ABS: 
ABQ: 
TMO: 
MAGQ: 
MGMAQ_2661(ligB) MGMAQ_2662(ligA) MGMAQ_2669(ligA) MGMAQ_2670(ligB)
APB: 
SLS: 
MVD: 
AGY: 
CART: 
CPHY: 
ARZ: 
SRO: 
NOA: 
NML: 
BSD: 
MMAR: 
SVI: 
AMQ: 
PDX: 
PSEA: 
AMS: 
ACTN: 
AFS: 
AFO: 
PYR: 
POG: 
 » show all
Taxonomy
Reference
1
  Authors
Trippett, S., Dagley, S. and Stopher, D.A.
  Title
The bacterial oxidation of nicotinic acid.
  Journal
Biochem. J. 76 (1960) 9.
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
UM-BBD (Biocatalysis/Biodegradation Database): 
BRENDA, the Enzyme Database: 
CAS: 
9029-56-5
LinkDB All DBs

KEGG   REACTION: R01632Help
Entry
R01632                      Reaction                               

Name
protocatechuate:oxygen 4,5-oxidoreductase (decyclizing)
Definition
3,4-Dihydroxybenzoate + Oxygen <=> 4-Carboxy-2-hydroxymuconate semialdehyde
Equation
Reaction class
C00230_C04484
Enzyme
Pathway
Benzoate degradation
Polycyclic aromatic hydrocarbon degradation
Aminobenzoate degradation
Microbial metabolism in diverse environments
Orthology
K04100  
protocatechuate 4,5-dioxygenase, alpha chain [EC:1.13.11.8]
K04101  
protocatechuate 4,5-dioxygenase, beta chain [EC:1.13.11.8]
Other DBs
RHEA: 
LinkDB All DBs

DBGET integrated database retrieval system