Alteromonas naphthalenivorans: ambt_00380
Help
Entry
ambt_00380 CDS
T01513
Name
(GenBank) OmpA family Oar-like outer membrane protein protein
Organism
alt
Alteromonas naphthalenivorans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CarboxypepD_reg
Plug
TonB_dep_Rec
Rv2179c-like
Dehydratase_LU
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEF01638
UniProt:
F5ZA24
LinkDB
All DBs
Position
93410..96430
Genome browser
AA seq
1006 aa
AA seq
DB search
MYSSAKLSRVAAAVALTVGLTTTAMAQVTSSDMNGQIVGPNGNPAVGTVVKVTHVPTGAV
KSVTVNSAGTFNLRGLRVGGPYTVEIDSDEFADQTISDIYLELGEAATIQRTLESAADYE
NIVVTASQVGSLAFGQTGPSANFDLATLQQAPAINRDITDIVRIDPRIYVDEGGSGGIQC
VGKSPRFNSLTVDGVRMNDLFGLNSNGYPTERMPFSFDAIEGVSVEIAPFDVIYGGFSAC
NISAVSKTGTNEVHGSAFYDYGSDSLRGDSLEGDDINLGSYTEKRYGFTVGAPLIKDKLF
VFAAYEKLEGANTFDRGAIGSGAINEVALTQAQLEQIQSVSQSLYNFDAGTTPLSMPNED
EKLLVKLDWNINENHRFAFTYNYNDGNNFSESDGDADEFELSSHIYERGAELQSFVGVLY
SDWTDKFSTEIRVSRTELDNLQRSMYGDGTPGGNDFGEIKIELGNDTDTSDDDLTVFLGS
DDSRQANDLDWEALSLMFRGNYYFDNGHALTFGYESDKLDIYNLFVQHSETSITFESLED
FTNGTNAEIEYGYAYSGELLDRAAEWGYTSHSTYAQDEFYLTDDLKVVAGLRYDWITTSD
EPVGNADFVAGNGYDNTANLDGLSLLQPRVGLNYTVSDSTELRGGVGLFSGGNPNVWMTN
NYQNTNVIGGEVDGEYADLFDGSITWVNTEDGVTAGPGYSVPSDLDEEMSSGAGSNFESN
NLDPGFVMPREWKISAGMTHINDEDYVFNLDFLLSVTQKQAMIKYVGLERVGTTDEGYPD
YDSVGYGSLELTNSDEDSVSYSLTATMNKSWDNGFTFTGGYNYSHAEDVQPMTSSVAFSN
FQYRAFTDINEEVSSVSDWNIEHRFTADLRYTTELIDGYSTIFSAYAVAQSGRPFSYTIS
GNSVYGYTPYLEGNNVLPIGAERNDETSPWWFKMDIAVRQNIPAFREDHSAQVYFVMNNF
TNFINDEWGILEEVNFNTAALGTSSPESRQGDASLWEMRVGIDYRF
NT seq
3021 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtactcatcagctaagctcagccgcgttgctgcagcagttgcactaacagtgggtcta
accacgactgcaatggctcaagtaacgtcttcagatatgaatggtcaaatcgtcggtcca
aacggcaaccctgctgttggaaccgtagttaaagtaactcacgtaccaactggtgcggtt
aaatcagtcacagtaaatagtgctggtacatttaaccttcgtggtttacgtgtaggtggt
ccttacactgttgaaatcgactcagatgaatttgcagatcaaacgatcagcgatatttac
ctagagcttggtgaagcggcaactatccaaagaacacttgaatctgcagctgattacgaa
aatatcgtagtaacggcttctcaagtaggtagcttggcattcggtcaaactggcccttca
gcaaactttgatttggcaacacttcaacaagcgccagcgattaaccgtgatatcactgat
atcgttcgtattgaccctcgtatctacgtagatgaaggcggtagcggtggtatccagtgt
gttggtaaaagcccgcgttttaacagtttaactgttgatggcgttcgcatgaatgacctt
ttcggtcttaactcgaacggttaccctacagaaagaatgcctttctcttttgacgctatc
gaaggcgtatcagtagaaattgctccttttgatgtaatctacggcggtttctctgcgtgt
aacatcagtgcggtaagtaaaacaggtacaaacgaagttcacggttcagcgttctacgac
tatggtagcgacagcctacgtggtgactctcttgaaggtgatgatatcaaccttggtagt
tacactgaaaaacgttacggcttcacagtgggtgccccactaatcaaagataagttgttt
gtttttgctgcttacgaaaaactagaaggcgcaaatacatttgaccgtggtgctatcggt
tctggcgcaattaatgaagtagcgcttacacaagcccagcttgaacaaattcagtctgta
tctcagtcactatataactttgatgccggtacaacgcctcttagcatgcctaatgaagat
gaaaagcttcttgttaagttagactggaacatcaacgaaaatcaccgttttgcgtttacg
tacaactacaacgatggtaacaacttctcagaatctgacggcgacgcagatgagtttgaa
ctatctagccacatttacgagcgtggcgcagagcttcaatcgtttgttggtgtactttac
tcagactggacagacaaattctcgactgaaattcgtgtttctcgcaccgagttagataac
ctacagcgttctatgtacggtgacggcactccaggcggcaacgactttggtgaaatcaaa
attgagctaggtaatgacacagatacttctgatgacgatctaacggttttcctaggttct
gatgacagccgtcaagcaaacgacctagattgggaagcgcttagcctaatgtttcgtggt
aactattacttcgacaacggccacgcgttaactttcggttacgagagcgacaaactagat
atctacaaccttttcgttcagcactctgaaacctctattacttttgaaagcttagaagat
ttcactaacggtactaatgcagaaatcgaatacggttatgcttattctggcgagctatta
gaccgtgctgctgagtggggttacacgtcacactctacttacgcacaagatgagttctat
cttactgatgatttgaaagtggttgcgggtttacgttatgactggatcacaacgtcagac
gagcctgttggaaacgctgatttcgtagctggaaacggttatgacaacacagctaaccta
gacggtcttagcttactacaaccacgtgttggccttaactacacggtaagtgactcaact
gaattacgtggtggtgttggtttattctcaggtggtaacccgaacgtatggatgacaaac
aactatcaaaatactaacgttattggtggtgaagttgatggtgaatacgctgacttattc
gacggcagcattacatgggttaacacagaagacggcgtaacagctggtcctggttactca
gtaccttctgatttagacgaagaaatgtcttctggtgcaggtagtaactttgaaagtaac
aacctagatccaggcttcgtaatgcctcgcgaatggaaaatctctgcgggtatgactcac
atcaatgatgaagactacgtattcaacttagattttcttttaagtgtgacgcagaaacaa
gccatgattaaatatgtgggtcttgagcgtgtaggtacaactgatgaaggttaccctgat
tatgattcagtaggttacggttcacttgaactgaccaactctgatgaagattcagtgtct
tactcactaacagcgaccatgaacaagtcttgggacaacggttttactttcaccggtggt
tataactacagccacgctgaagatgtacaaccaatgacgagttcagtcgcgttctctaac
ttccagtacagagcatttactgacattaacgaagaagtatcttcagtgtctgattggaat
atcgagcaccgttttactgctgaccttcgttacacaactgaacttatcgacggttacagc
actatcttctctgcttatgcagtagcgcagtctggtcgtccgtttagttacaccatcagc
ggtaactctgtatatggctacacgccgtatcttgaaggtaacaacgtattaccgattggc
gcagagcgtaatgatgaaactagcccttggtggttcaaaatggatatcgcagttagacaa
aatattcctgcgttccgtgaagatcactctgctcaggtttacttcgttatgaataacttc
accaacttcatcaacgatgaatggggtattttggaagaagttaacttcaatactgctgcg
ctaggtacatcatctcctgaaagtcgtcagggtgatgcatcactttgggaaatgcgtgta
ggtattgactaccgcttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
