Candidatus Arthromitus sp. SFB-mouse-Yit: MOUSESFB_1242
Help
Entry
MOUSESFB_1242 CDS
T01857
Name
(GenBank) putative helicase
Organism
asm
Candidatus Arthromitus sp. SFB-mouse-Yit
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2_assoc
SNF2-rel_dom
Helicase_C
ResIII
DEAD
ERCC3_RAD25_C
SWI2_SNF2
DUF4479
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAK80384
LinkDB
All DBs
Position
1411724..1414936
Genome browser
AA seq
1070 aa
AA seq
DB search
MKKVNIGKITEFSNFNNGNDGITIYKKNKLNMKYYEFTRDGIHVWFDVPSMRNITYITKI
YIDDQNTLKGFSCSCTYKNTINDVCKHIIASYIFFLNELKDNIKPNVIYDFSQLDQINKL
NEENTLDIDIDYFKIDYFVYVNDINDIMLEIKLISNKTYSVSDISEFLNSILSSHPYSIN
KNTSLNITTNSFNEKDRIFICKLLTIYSLIKINAVIIENIFSNQYIKLNSYLFESLVTSL
GEDNLHIKFKHLLFESCKIIKEDLDISPVISTDENNNITLSLKALNIIELFSNKPYFYYD
GTIFETSLSFIKNYNCIKELVLRNNTSYFTITDDNKNIFLNQIIPKLSLNFNLKISESLN
NILNIEECKCKFYINKVSNDIVIIKVIFNYKDLNINPLDTSCLNTSILRDYNIENKVLTT
LNRLSESKNSIYYIIKSPEKIIDFKENGIPTLKTLGEIYYTKKFKQYKIISSSSYKTSFS
IGLNNLLNISFSFDGITNDELYSAIKNIRKGEKYLKLKDKGILNLENDYLKQINSILKDL
DIDEKELKNDSLNIDKYYAFYINNTYSNNFKSMGELTKNENFLKITDDLSNISNIDLSPP
KNLNASLRNYQLEGFKWIKTLKEYNLSGILADEMGLGKTLQTIAFLQKEYENNSLENAII
ICPKSLIYNWFDEIKKFAPNLKILIFNGNKNVRSKLINEFQNYDIILTSYGIIQKDIDLL
KLKNFNICIIDEAQNIKNKSSKNTISLRELNVNYKFALTGTPIENSIEELWSIFNFLMPG
YLYSYSKFRSIYGDQENYTSSNLNKKISPFILRRLKKNVLTELPPKIETKIMIDLNNEQK
KLYYSYINKFKEEFNFENNSSNDKNLKFKMLSALTRLRQICCDPKVISEDYSYGSSKIDT
LMEIVNEHIKNNKKIIVFSNFTTVLGIIKDKFIKNNIKYTYLDGTIPSKDRIDIVNDFNQ
NDYNIFLISLKAGGFGLNITSAEIVIHFDPWWNNAVEDQATDRAHRIGQKNTIHVIKLIT
KGTIEEKIFEIQEKKNILINSIIRDNELEYNSISKMSIEDLKNLFTIDTL
NT seq
3213 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaagtcaatataggaaagataactgagttttccaactttaataatggaaatgac
ggtattactatttacaaaaaaaataaattaaatatgaagtactatgaatttacaagagat
ggtatacatgtttggtttgatgtcccatctatgcgcaatataacatacataactaaaata
tatattgatgatcaaaatactttgaagggattttcttgttcttgtacatataaaaatacg
ataaatgatgtttgcaagcatattatagctagttatatatttttcttaaatgaacttaag
gataatattaaacctaatgtaatatacgatttttcacaattagaccaaataaacaaatta
aatgaagaaaatacattagatattgatatagactattttaaaatagattattttgtatat
gtaaatgatattaatgatatcatgttagaaattaaacttatatcaaacaaaacttattct
gtatcagatatatctgaatttctaaattctatattatcatcacatccatacagtataaat
aaaaatacttcgttaaatataactacaaatagtttcaatgaaaaagatagaatttttata
tgtaaattattaactatatattctctcatcaaaatcaatgctgtgattatagaaaatata
ttttctaaccaatatataaaactaaactcttatctatttgagagtttggttacctcttta
ggggaagataatttacatataaaatttaaacacttattatttgaatcctgcaaaataata
aaagaagatttagatatatctcctgttatatcaacggatgaaaataataatataacgcta
tctttaaaggcactaaatattattgaattatttagcaataaaccttatttctattatgat
ggaacaatatttgaaacttcactctcatttataaaaaattataattgtataaaagagtta
gttctacgcaacaacacttcctattttacaataactgatgataataaaaatatattcctt
aatcagatcataccaaaactatctttaaattttaatttaaaaatttcagaaagtttaaat
aacatactaaatattgaggaatgtaaatgtaaattctacataaacaaagtttcgaatgat
atagtcataataaaggttatatttaattacaaagatttaaacataaacccactggatact
agctgtcttaatacatctatccttagagattataatattgaaaataaagtattaactaca
ttaaatagacttagtgaatctaaaaactcaatttactacattattaaatcacctgaaaaa
ataattgattttaaagaaaatggaattcctacgcttaaaaccttaggagaaatttattac
acaaaaaaatttaaacaatacaaaataatttcttcatcttcttataaaacttcctttagt
atagggttaaataatctattaaatatatcattctcatttgatggaataacaaatgatgaa
ttatattctgcaattaaaaacatacgaaaaggtgaaaaatacctgaaattgaaagataag
ggtatcctaaatctggaaaatgattacttaaaacagattaattcaatccttaaagattta
gatatagatgaaaaagaacttaagaatgattcattaaatattgataagtattatgcattt
tacataaacaacacatattcaaataattttaagtcaatgggtgaattaactaaaaatgaa
aatttcttaaaaataacagatgatctttctaacatttctaatattgatttatctcctccg
aagaatttaaacgcttctcttagaaattatcaattagaaggattcaaatggattaaaaca
ctaaaagaatacaatttatctgggatcttagcagatgagatgggacttggtaaaactcta
caaaccatagcatttcttcaaaaagaatacgaaaataactcacttgaaaatgcaataata
atctgccctaagtctcttatatacaactggtttgatgagattaaaaaatttgccccaaat
cttaaaattcttatatttaatggaaacaaaaatgttcgttcaaaactcataaatgaattt
caaaattacgatatcatattaacttcttacggaataattcaaaaagatatagacctctta
aagttaaaaaattttaatatttgtataatagatgaagctcaaaatataaagaataaatca
tccaaaaacacaatctctttaagagaactgaatgtaaattacaaatttgcattaacaggt
actcccatagaaaactccatagaagaactatggtctatatttaatttcctaatgccagga
tatctatattcctattcaaaatttagatcgatatatggggatcaggaaaattatacttca
tctaatttaaacaaaaaaatatctcctttcatattaaggagacttaaaaaaaatgtatta
actgaacttccacctaaaattgaaactaaaataatgattgatttaaataatgaacaaaaa
aaattatactattcatacataaataaatttaaagaagaatttaattttgaaaataacagc
tcaaatgataaaaatcttaaatttaaaatgctaagtgcattaacacgtttaagacagatt
tgttgtgatcctaaggtaatatctgaagattattcctatggtagttccaaaatagataca
ttaatggaaatagtaaatgaacacattaagaataacaaaaaaattatagtattttcaaat
ttcacaaccgtacttggaattattaaagataaattcataaaaaataacattaaatataca
tacttagatggaacaattccttccaaagatagaattgatattgtaaatgattttaatcaa
aatgattataatatattcctaatttctcttaaagctgggggatttggtttgaatataaca
tctgctgaaattgtaattcattttgatccttggtggaataatgctgttgaagatcaggcc
acagatagagcacataggattggacaaaaaaatacaattcatgttataaaattaataact
aaaggaactattgaagagaaaatatttgagatacaggagaagaaaaatatattaataaat
tctataataagagataatgaactagaatataattcaatctctaaaatgtctattgaggat
cttaaaaatttatttacaattgatacattatag
DBGET
integrated database retrieval system
