Pukyongia salina: C5O00_08825
Help
Entry
C5O00_08825 CDS
T05335
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
aue
Pukyongia salina
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
aue00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
aue02000
]
C5O00_08825
Transporters [BR:
aue02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
C5O00_08825
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_S8
Por_Secre_tail
Cleaved_Adhesin
Calx-beta
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AVI51271
UniProt:
A0A2S0HX65
LinkDB
All DBs
Position
1956436..1961178
Genome browser
AA seq
1580 aa
AA seq
DB search
MLLSLFVGSAQTLQRSEDANPRKTDSTKYSKQIKAIVDSYDQTALADLLLANDAKERAEK
QDALAYALVKNIPVKKYNPDGTFDELQKIAADGTPIYYTLHNVNAAISTRANFLNTGGGL
GLTVDGNGMTAHVWDGGPTRPTHEAFDGPGGTNRVTINDGNTTLDGNSFHAQHVTGTILA
SGQPDASSKGMAWQATALTHDWNSDLTEATAEAMAGMLLSNHSYGYNATAIPDAWFGQYG
SDARDWDQLLYNSPYYLQIKSAGNDGSNDSANALPLDGQSAYDKLNGDACAKNNLVIANG
QDASVNATTGALISVTRNSGSSEGPTDDYRIKPDIMANGTSLRSTLETSDSAYGNLTGTS
MSAPNTTGTLLLLQEHYNDVNGSFMKAATLKGLALHTADDVAPSGPDAQTGWGQLNAKFA
AETISASPTTALISELNLTNGGTYQITIQSDGVNPLMASISWTDPAGVANSGTNSNTPAL
VNDLDLRLNNGTTYTPWRLTGVTTNGTGDNIVDPYERIDISGASGQYTLTVTHKGSLTNG
SQDFSLIVTGGTIAASSPEISYGTTTTTSTEGTDCSFTDVVVPLNIAMAPSQNADVTFSV
NGGTATNGVDYEILTPSVTFLQGQTASQNLTVRFYNDGVVESPETAIIDFTVNANGGDAT
ANPAADSLTITMNDDDAVPAVSTDVTLFTEDFEDWTGWLNADRDGDGNVWVSISFSSGGY
TGFSGNFAGSETDLTILGGTGSANADNYLISPQVSIPSNTTNTAFNFSVGGFNSVEHYRL
QWTTDISTYGTIDAGVILEERNSISGDGEIRTVNRTDLAGQTGYFVIRHYNSSANNGLLL
FDGLSIVATTETPVQTAVNSGTSDQTDVPGSGTMYADDSSSGSIMLAINNTGGDDYGCVT
SHVSRAGTSAQAYMGSTSPNLVMDKTFNISTANSVATGNTSITFYFTEAEVAGWEAAAPG
ARANLVAARDDGSSVETSTLVIGAFGSHVTLTGTFTGLEGTYYFGPLGAFVPCTGVTKTW
DGSNWSPAGAPGGTDIVVINGNYNTATHGDLDACTLTINSGFTLTVNANGYLNVDGDITV
SGTLDVEHTGSVVQVDPDGVVTNSGSINVDITTPPLKERDFLILGSPMNAETRGGVFGSA
YNVQEYTPANFIPHGSVPAGGTNFADDNFNDWNEMTSGTLNPGEGYLVYPQAAYIDPAYA
GPPPVTTIAFPLSYTQGTLNNGTINQSIVYNGGSNPDGTPNILANPYPSPISANLLVSNN
ALINEVYFWEHLTPPSSSTPGANNINVSMDDISMHNGTMGVPAANDTGTSTTPNGVISTA
QGFGIKAGASGTVTFTNSMRLTTGNTTLRNNIEEIDKITLKVENDQFELRSYTGIGFRSE
GTPQLDQNMDSNRLATMIALYSHLEDGSEQLGIQTRESFETGIKIPMGFASQVDTDALYV
VSISSIEGSEIANAHVYLVDHLTNTITDLTQGSYQFSSNKGTFNSRFTLQFESENLGTDD
LALEKISVYPNPTDNLLTILSPGAGIDGVVIYDLRGRKVEEVSLNGERSYAVDMSALGSA
MYFITISTENGSITKRVIKQ
NT seq
4743 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcttctgtcgttgttcgtaggttcagctcaaaccttgcaacgcagtgaagatgccaat
ccaagaaaaacagattctacaaaatattcgaagcagatcaaagcgattgtagatagctat
gatcagactgcccttgcagacttactcctggctaatgatgccaaagaaagagccgagaaa
caggatgctcttgcctacgctctagtaaagaacattcctgtaaaaaaatataacccggat
gggacattcgatgaactgcaaaagatagccgcagacggtactcctatctattatactctt
cacaatgtaaatgccgcaatttccacgcgagccaattttttgaacaccggaggaggttta
ggtttaactgtagacggaaatggaatgaccgctcatgtctgggatggggggccaactcgc
cctacgcatgaggcattcgatggtccgggaggaacaaatcgagttactattaatgatgga
aataccactcttgatggtaatagttttcatgcgcaacacgtaactggaacaatcttagct
tccggtcagccggatgcatcctctaaagggatggcctggcaggcaactgcattaacgcac
gactggaatagcgacctaaccgaagcaacagccgaggcgatggcgggaatgctgctctcc
aatcactcgtatggatataatgcaaccgccatacccgatgcctggtttggccaatatggt
tctgatgccagggattgggaccagttgttgtataattctccctactacctccagataaaa
tcggccggaaatgatggtagcaacgattctgcgaacgctttaccgctggacgggcagtcg
gcatacgacaagcttaatggtgatgcttgcgccaagaacaacctcgtaatagcaaacgga
caggatgcatcggtgaacgccaccacaggagcactgatatctgtaacacggaactccgga
agtagtgaaggacctacagatgattacaggatcaaaccggatatcatggccaatggtacc
agtttaagatctactctggaaactagcgattctgcctacgggaatttaacagggacgtcc
atgtcggcgccaaatacaactggtactcttctgctattgcaagaacactataacgatgtg
aacggatcctttatgaaggccgccacccttaaagggttagcgctacacacagcagatgat
gttgccccttcaggcccagatgctcagacgggttggggacagttaaatgctaagtttgct
gctgaaactatctctgcttcaccaacaactgcattgatctcagaattaaatttaacaaat
ggtggaacgtatcaaatcaccattcagtctgatggtgttaacccattaatggcatcgatc
tcctggaccgatcccgcgggtgttgcaaatagtggaaccaatagtaatacccctgccttg
gtaaacgaccttgatctaagactgaataatggaacaacatacactccctggagactaaca
ggagttacaacaaacggaactggagacaatattgtggacccatatgagcgaatcgatatt
tcgggtgcgtctggtcaatatacactcactgtaacacataaggggtcccttaccaatgga
tcgcaggacttttcacttatcgttactggaggtactatagcagcctcctctccggaaatt
tcttacggaacaaccacaaccacatctaccgaaggtacagattgtagctttaccgatgta
gtggtaccactcaatatcgccatggctccttcccaaaacgccgatgtcacgttttcggta
aacggcggaacggcaacaaatggcgttgattacgagatattaacaccatcggttactttc
ctgcaaggacaaactgcctctcaaaacctaaccgttcgtttttataacgatggggtagtt
gagagtccggaaactgcgataatcgactttaccgtgaatgcaaatggtggagatgctaca
gcgaatcctgcggcagattccctcaccataactatgaacgacgacgatgcggtacctgcc
gtatctaccgatgtcaccttatttaccgaagactttgaggattggaccggctggttgaac
gccgatagagatggcgacggcaatgtatgggtgtccatttctttctcctcaggaggatat
acaggattttcgggtaattttgcaggttcggaaacagatctaaccatcctgggaggtact
ggttctgctaatgcagataattacctaattagccctcaggtaagcatcccatcaaacacc
actaatacggcctttaatttttctgttggcggattcaattcggtagaacattacagacta
cagtggactacagacatttccacctatggcactatagatgccggtgttatactggaagaa
cgaaattcaatatctggtgatggtgaaatacggaccgtaaacaggaccgacctggccgga
cagacgggctattttgtgatcaggcactataattcatctgccaacaatggtcttctactc
tttgacggactttccattgttgctaccacagaaactccggttcaaaccgcggttaactcg
ggaacaagcgatcaaacagatgtgccgggatccgggactatgtatgcagacgatagttca
tccgggagcattatgctggccattaacaataccggaggcgacgattacggttgtgtaaca
tcccatgtgtcgagagcgggtacaagtgcccaggcctatatgggaagtacaagcccaaac
ctggtgatggacaaaacctttaatattagtacagctaatagcgtcgctaccgggaacact
tctataacattctattttaccgaggcggaggtggccggatgggaagctgctgcgccaggg
gcgagagctaatctggttgctgctcgtgatgacggtagctcggttgagacttctacactt
gttattggtgcatttggaagtcatgtcaccttaacaggtacctttaccggattggagggg
acatactatttcggcccgctgggtgcctttgtcccttgtaccggggtaaccaagacctgg
gatggttctaactggagccctgccggagcacctggtggaacagatatagtggtcatcaat
gggaattataacacagcgacacatggggatcttgatgcttgtactttaaccattaattca
ggatttacccttactgtaaacgcaaatggttacctgaatgtggatggagatataactgta
tccggtaccttagacgtagaacatacggggagtgtggtacaggtagaccctgatggagtg
gttacaaattccggttcgattaatgttgatattaccacccctcctcttaaagaacgcgac
ttcctaatactgggtagccctatgaatgctgaaaccaggggaggtgtcttcggaagcgct
tataatgtacaggaatataccccggctaatttcatcccccatggtagcgtgcctgctggt
ggaacaaattttgccgacgacaactttaacgattggaacgagatgacctccggtactctc
aacccgggtgaaggatatcttgtatatcctcaggcggcgtatatcgatccggcttatgcg
ggtccaccgccggttaccactatcgcgttcccgttatcctatacacagggaacactgaac
aatggaacaataaatcaatctattgtgtacaatggtgggtctaatccggacggaactcct
aatatcctggctaatccatacccttcgcctataagtgcgaacctgttggtgtccaataac
gccttgatcaatgaggtgtatttctgggaacatcttaccccgccaagttcatccactccg
ggagcaaataacatcaatgtctccatggatgatatttcaatgcacaatggaacgatgggt
gtgccggcagctaacgatacaggaaccagtaccacaccaaatggtgtgatctcaacggcc
cagggatttggaattaaagctggtgcttccggaacggttaccttcaccaacagtatgcgt
ctcaccactgggaacacaactcttagaaataatatcgaagaaatcgataagatcaccttg
aaagtagagaacgatcaattcgagctaagaagttacaccgggattggtttccgaagtgaa
ggaacaccgcaactcgaccagaatatggattctaacagactggctacaatgatcgccctt
tattcacatctggaggatggtagcgaacagttaggaatacaaacacgtgaaagctttgaa
accgggataaagatccctatgggctttgcttcacaggtagatacagatgcgctctatgtg
gtctccatcagtagtattgaaggtagtgagatagccaatgctcatgtctatctcgttgat
cacttaactaatacaattaccgatcttacccaaggatcttaccagttcagtagtaataaa
ggtacttttaatagcaggtttaccttacagtttgaaagtgaaaatctgggtaccgatgat
ctggcccttgagaagatctcagtttatccgaaccctacagacaaccttcttactatattg
tcaccaggtgcaggaatagatggagttgtgatctatgatcttcgaggtagaaaagtggaa
gaagttagtctaaatggcgagagaagctacgccgtagatatgtcggcacttggatcggct
atgtatttcatcacgatttccaccgagaacggatcgatcactaaaagagttataaaacaa
tag
DBGET
integrated database retrieval system