Trichormus variabilis: Ava_0613
Help
Entry
Ava_0613 CDS
T00277
Name
(GenBank) Periplasmic Sensor Signal Transduction Histidine Kinase
Organism
ava
Trichormus variabilis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HATPase_c
HisKA
HAMP
HATPase_c_5
HATPase_c_2
HATPase_c_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABA20237
CyanoBase:
Ava_0613
UniProt:
Q3MFJ9
LinkDB
All DBs
Position
770956..772374
Genome browser
AA seq
472 aa
AA seq
DB search
MNNIKKNWINIDPFSLQLRLTVGMASFSALVLGSLATWTSWKMQQILIDSRKHEVEQIAK
RLPQDLQIYSRMMQPEMSLQKAINNFANTNTLIWFKNSNNEILSKTENLDLLPDSLVAKL
MKLTQMPIKAQVYQIDPSYFVVCGTSIKVQGKLLGELFVVKDITREQTMFVAMVRNLGIT
SILAIIILTVAIAFYIRRSLQPLRQLSQMTAVISAEDLGQAQLYLDNAPSEVKELAQTLT
MLLSRLAQSWEQEREFVSNVSHELRTPLTIVYGYLQSVLRRQNNLTPLQQEALEIAASEA
ERTIRLLQDLLDLARADSGYLYFQMKTYVLNDIVAEIVVMAEKYSDRLITIESTISPIEV
KVDYSRFKQVLLNLIDNAVKYSEADTPITFKLDQLQDTAIIQVCDQGYGIPLQHQARIFE
RFYRIDESRSQATGGCGLGLSIVKTLVEGMGGSVSVQSKLGEGSIFTIILPR
NT seq
1419 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaataacattaaaaaaaattggataaatatcgacccattttccctacagttacgccta
acagttggtatggcttccttttcagctttggtattaggtagcctggctacctggacaagt
tggaagatgcagcaaattttaattgatagccgtaaacatgaggtagaacaaatagccaag
cgtttaccacaagacctgcaaatttatagcagaatgatgcaacctgagatgagtttacaa
aaggctattaataattttgcgaatactaacacattgatatggtttaaaaattctaacaat
gaaatattatcaaaaactgaaaatttagatttattacctgactctttggtagctaagtta
atgaaattgactcagatgccgattaaagcgcaagtttatcaaattgatcccagctatttt
gttgtatgtggaacttctatcaaagtccaaggtaagttgttgggtgagttatttgtagtc
aaggatattacccgcgaacaaaccatgtttgtagcaatggtgcgtaatttaggtattact
agtattctggcaattattattctgactgtagcgatcgcattttatatcaggcgctctcta
caacctttgcgccaactcagtcaaatgactgctgtgatttctgctgaagatttagggcaa
gcccaattatatcttgataatgctcctagcgaagtcaaggaattagcacaaaccttaact
atgcttttatcccgtcttgcccaatcctgggaacaggagcgggaatttgtcagtaatgtt
tctcacgaattacgtacacccttaacgattgtatatggttatttacaaagcgtattgcgg
cggcaaaataatttaacccctcttcaacaagaagctttagaaattgctgcatcagaagcg
gaaagaactatccgcctgttacaagatttactagatttagcaagagcagatagcggttat
ttatactttcagatgaaaacttatgtgctgaatgacatagttgcagaaattgtagtcatg
gctgaaaagtatagcgatcgcctaattactatcgagtcaacaatttcccctattgaagtg
aaagtagattacagtcgctttaaacaagtattactgaatttgattgataatgctgttaag
tattctgaagctgatacacccataacctttaagttagatcaacttcaagacacagcaatt
attcaagtttgtgatcaaggttatggtattcctttgcaacaccaagcccggatttttgag
cgattttatcgtatagatgaatctcgctcccaggcgactggcggctgtggtttgggttta
tcgattgtcaaaacgctggtagagggtatgggaggtagtgttagcgtgcaatcaaagtta
ggagaagggagcatatttacaataattctgccgagatag
DBGET
integrated database retrieval system
