Aliivibrio wodanis: AWOD_II_0797
Help
Entry
AWOD_II_0797 CDS
T03808
Name
(GenBank) putative chitodextrinase
Organism
awd
Aliivibrio wodanis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_7
CBM_5_12_2
Big_15
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CED57425
UniProt:
A0A090I6X0
LinkDB
All DBs
Position
2:904678..907968
Genome browser
AA seq
1096 aa
AA seq
DB search
MFSGYLYAADANLTSNIVTFVPGETKVQNGDMVSFNGDCFVAKNNPGVWESPTADSWFWD
VAVCSGEPGPDPEPTPDPDLGDVIPFIPGKTQVSNGDVVSYDNQCFIAQNNPGVWETPSA
SSWFWSLTECSDEPVNPEPEPEETELSILAPTAGQVVQANETIAISAHVDGNQAAKVEFW
VSSTKLAEKAVNESNTQYSHAWTPVEAGNATVNVFVFDKNNQKIEQKSVSVTVEAEVTED
FVAPVVKFITPANGSTIKVTESVAISVNATDTDNDLTALVVKANNKQICSFDETNTETFT
CEWQSTQAGSVTFSAIATDAQDLSSTTSVKITVEEDVVEPPVTGELCKDFNVYPDWTNGD
HATGGDIMVHNNIAYSAIYWTQTLPGSDSSWALHLNCDGTEPGTAPLLSLPNPMDPVRLE
VAGWPNTLVVASPSSAAPAMLTIEASNSADLANFDKLTSTFVSIINAAAHAGSASIIINT
DVLDQATQDKALSSNSIAVKEALTKAMDITGNKIDIDDINALSNDLKGWANAHHLIISTL
APEANYGWSLSIGDFAFDTHSGRQSVWDEASNYSADLLDKLELFKADVANKADFIAFTKS
SSTAALTSDQWHNALEYVKQVSDFVKTPVMLNNIPTDQASAYFMGDNASKPQVRKAAFSN
VFAIVFDKDTANLTAEIEEYKKAKMPLYYVGESTENGQLTIIDALNRELADAEDTMNNTA
FLYETPQSQWVPSTVYKWTDFMTGLNAMHNVGVAGNKFWLLDENVDDATNIKYAKVAIAA
FLAQSMQETIRYNACDENNWAEIRYGAATDYPMSASCGQLGQKYADYGVNPVSGLDHAYS
CPRDNKMEVSALTHAKWYGAPAPVFAAPNAVLEERGLLVNGSVGRWTNSGHCNDVPTSVD
TSKQVWERDTCKTYVDQKAGSFIWDGSSQADVEGCGWWGRGVIQTTGRQNFGTLNHYLGR
SHVDPETIGKTIDGVVVEAPPENPLYAELDFCSNPGLICSSEENKEIKWIAGLFYWVTSV
QAYPDESGQYGNWNYHNELKKYVDSGMKGTDFIDDVSGIVNRGCPDLVCSTGEVHNVKER
RANFKLVLEQLGLSPQ
NT seq
3291 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttcagtgggtacctatacgccgctgatgcaaatttaacgtctaacattgttactttt
gttccaggtgagacaaaagttcaaaatggagacatggtttctttcaatggagactgtttt
gttgctaaaaacaaccctggtgtgtgggaatctccaactgcagattcatggttctgggat
gttgctgtatgctcaggcgagccaggtccagatcctgaaccgacaccagatccagattta
ggcgatgttattccatttatcccaggtaaaactcaagtttcaaatggcgatgtagtttca
tacgacaaccagtgttttattgctcaaaataatcctggtgtatgggaaacgccaagcgca
agctcatggttctggtctctaacagaatgttcagacgagcctgttaatcctgagcctgaa
ccagaagaaactgaactgtctattcttgctccaacagctggtcaagttgttcaagcaaat
gaaacgattgctatcagtgcacatgttgatggtaatcaagctgctaaagttgagttttgg
gtaagcagcacaaaactagctgaaaaagcagttaacgagagcaacactcaatactctcac
gcttggactccagttgaagcaggtaatgcgacagttaacgtatttgtattcgataaaaat
aaccaaaagatcgaacaaaaatcagtatctgttactgtagaagctgaagtaacagaagat
tttgtggcacctgttgttaaattcattacaccagctaatggctctacaattaaagtcact
gaaagcgttgctatctctgttaatgcaacagatactgataacgatttaacggcattagtt
gttaaagcgaataataaacaaatctgttcatttgatgaaactaacacagaaacatttacg
tgtgagtggcaatcaacccaagcgggtagcgtgacttttagtgctatcgctactgatgct
caagatctttcatctacaacaagtgtaaaaatcactgttgaagaagatgtagttgagccg
ccggtaacaggcgagctatgtaaagactttaatgtttaccctgactggacaaatggcgat
cacgctactggcggcgacattatggttcataataatatcgcttactcggcaatttactgg
actcaaacgcttccaggcagtgatagctcttgggcgcttcacctaaattgtgatggcaca
gaaccaggtacagcaccgcttctttctctaccaaacccaatggacccagttcgtctagaa
gtcgctggttggccaaacacgttagtagttgctagcccatcgtctgcggcaccagcaatg
ctaactattgaagcaagcaacagtgctgatttagctaattttgataagctaacaagtacg
tttgtatctatcattaatgcagctgcacacgctggctctgcatcaatcatcatcaacact
gatgttcttgatcaagcaacgcaagataaagcattatcttcaaacagcattgcggttaaa
gaagcgctaactaaagcgatggatatcactggcaacaagattgacatcgacgatatcaac
gcgcttagcaatgacttgaaaggctgggctaatgcgcaccacctaatcatctctacgcta
gcaccagaagcaaattacggttggtctctaagcattggtgatttcgcgtttgatactcac
tctggcagacaatctgtttgggatgaagcatctaactacagcgccgatctactagacaag
ctagagttgttcaaagcagatgttgcaaataaagctgatttcattgcgttcactaagtca
agctcaacggccgctctaactagcgaccaatggcacaatgcactagagtacgttaagcaa
gtttctgactttgttaaaacgccggtaatgctaaacaatatccctacagatcaagcttct
gcttattttatgggtgataatgcaagcaaaccacaagtgcgtaaagctgcattcagcaac
gtatttgctatcgtatttgataaagatacagcaaacttaacggctgaaatcgaagaatac
aaaaaagctaaaatgccactgtactacgttggtgaatcaacagaaaatggtcaattaact
atcattgatgcgttaaaccgtgaattggctgatgctgaagataccatgaacaacaccgca
ttcttgtacgaaacacctcaatcacaatgggttccgtctactgtttataagtggactgac
ttcatgactggtctgaatgcaatgcataacgtgggtgttgcgggtaacaagttctggcta
ctagatgaaaacgttgatgatgcaaccaacatcaaatacgcgaaagtagcgattgctgcg
ttcttagcacagagtatgcaagaaacgattcgttacaacgcatgtgatgaaaacaactgg
gctgagattagatacggtgctgcaacagattacccaatgtcagcgagctgtggtcaactt
ggtcaaaaatatgcagattacggtgtaaatcctgtttctggtttggatcacgcttactct
tgtcctcgtgataacaaaatggaagtaagtgcactaactcacgctaaatggtacggtgct
ccagctccagtatttgctgctccaaatgcagtactagaagagcgtggcctgcttgttaac
ggtagcgttggtcgttggactaacagcggtcactgtaacgacgtacctacttctgtagat
acatctaagcaagtatgggaacgtgatacatgcaaaacatacgtagatcaaaaagcaggt
agctttatttgggatggcagcagccaagctgatgttgaaggttgtggttggtggggccgt
ggtgtaattcaaactactggtcgtcaaaacttcggtacacttaaccactacttaggtcgt
tcacacgttgaccctgagacaattggtaaaacaattgatggtgttgttgttgaagcgcca
ccagagaacccgttatacgctgagttagatttctgttcaaacccaggcttaatttgtagc
tctgaagagaataaagaaatcaagtggattgctggtctattctactgggttacttcagta
caagcctaccctgatgagtctggccagtacggtaactggaactaccacaacgaacttaag
aagtatgttgatagcggtatgaaaggcactgactttatcgatgatgtttctggtatcgta
aaccgtggttgtcctgatttagtgtgttctactggtgaagttcataacgtgaaagaacgt
cgtgctaactttaaactggttctagagcaactaggccttagcccacaataa
DBGET
integrated database retrieval system