Bacteroides fragilis NCTC 9343: BF9343_1637
Help
Entry
BF9343_1637 CDS
T00239
Name
(GenBank) putative outer membrane protein
Organism
bfs
Bacteroides fragilis NCTC 9343
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CarbopepD_reg_2
Plug
CarboxypepD_reg
GpP-like_1st
CooC_C
MRP-S23
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAH07418
UniProt:
Q5LEN3
LinkDB
All DBs
Position
2005661..2008930
Genome browser
AA seq
1089 aa
AA seq
DB search
MKKTIFLILCILCSLGAMAQKKSITGVITDGAGESIIGASVVEVGTTNGTITDFDGKFSL
TIATGAKFTVSYIGYKSQTITVGAENTYNIVLKEDTEVLDEVVITGYGGSQKRATLTTAI
SKLDNSVLKNAAFSNAGQSLQGSVTGLRVVNKTGQPGSEPDITLRGGATITGDNSKALIV
VDGIVRNSMSDINPSDIESIQVLKDAASTAIYGARANGGVILVETKSGKEGKASVNYKFK
MGVNFARKGYDFCDAHDYIYYNRLGYKRTGRTNVDTQMGYGIGNNLFDIRYLTDENANLK
NEGWASMADPFYDGKTILYKDYSGELDDVVFNNSALTQDHYVNITGGNDKGTFSASLGYY
KEDGQIRGTGYERFNGALNGSYKVFPFLTVKANATYSWSTQPELWIGQYEFFYRTRSQRP
TWNPWNEDGTPASGFGTGDGNPDYYRDKLTSENSTNKSTYSVGFALDILPKKLVLNGNAS
LYRYDWQREKFNKSYQAQSSATPDNTRQAEAYVQKYNQIQLNGTLTYTDTFAEKHNLEAM
LGTEYFTYDQFDFEAKTQNSPTDDIPTLNAGSTRTYTSTTKTAYRILSGFGRINYNYDMR
YLISFVARYDGISKLKDNRWGFFPGVSVGWNIMEERFWKDSKISGVISNLKPRLSYGVNG
NVNGIGNFDVYGAYSQVGAKTYGGSTAFYNSGLVNTGLRWEQSQSFEAGLDIGFLNNRLS
FIFDYYNRTTKDLLTKQALPGYTGFTEIMTNMGTLRNYGFEMEVRANILNNPKGLTWDVT
ANLSSVANKIVKLPYNGNPNNRVGGYEVATGRKKADGTDETKWIAGRQEGGKLGELVAYK
QNHIFKDWDDVKKYANNRIDEVANLYGPGLAAQYAGKEGWQPIEPGDVCWEDINGDGVIN
GYDRQVVGNIFPKVTGGFSTTLGYKNLSLYARFDYALGHTIYNDLAARSLGQYQGSFNII
KEVKKTWSETNTDTDLPAFYYADQLSKKNITRSNNGLTAIDNNSSRFYEKGDYLALRELT
LNYNLPKTWISKVGMTDASVYVTGQNLFYITGYTGVSPEPAVDTTYGRGIDNGRYPTPRT
VLFGLSVTF
NT seq
3270 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaaaaccatcttcttgattttgtgcattttatgttctcttggggccatggcgcaa
aagaaatctatcacgggtgtgattacagatggtgccggtgagtcaatcattggtgcaagt
gtcgttgaagttggtacaactaatggtaccataactgactttgacggcaagttctcttta
acgatagctactggtgctaaatttacagttagctatattgggtataaatctcagacgatt
actgttggtgctgaaaatacctataatatagtactgaaggaagacacagaagtgttggat
gaagtagtgataacaggatatggaggttcacaaaagcgtgctactttgactactgctatc
tctaaattggataactcggtacttaaaaatgcggctttcagcaacgcaggacaatccttg
caaggctctgtaacaggactccgtgttgttaacaaaacaggtcaacccggtagtgaaccg
gatattacattacgtggtggtgccactattacaggtgataatagtaaagcacttatcgta
gttgatggtattgtccgcaatagcatgagcgatatcaatccttccgatattgagtcgatt
caagtccttaaagatgctgcttcaaccgctatttatggagcgcgtgccaatggcggtgtt
attttggttgagactaaaagtggtaaagaaggtaaagcatctgttaactataaattcaaa
atgggtgtgaatttcgctcgtaaaggttatgacttttgcgatgcgcacgactacatctac
tacaatcgtttaggttacaaaagaaccggacgtaccaatgtagatacacaaatgggatat
ggtattggtaacaatctatttgacatccgttatttgacagatgaaaacgctaacttaaag
aatgaaggttgggcttctatggcagacccattttatgatggaaaaacaattctatataaa
gactactcaggtgagttggatgatgttgttttcaataatagcgctttgacacaagaccat
tatgtaaacattacaggcggtaacgataaaggaaccttctctgccagcctaggctattac
aaagaagatggtcagattagaggtaccggatacgaacgtttcaatggagcattgaacggt
tcgtataaagtattcccttttttgacggtaaaggcaaatgcgacttactcttggtcaact
caaccggaactctggatcggtcaatatgaatttttctaccgtacacgctctcaacgtccg
acatggaatccttggaatgaagatggaactccggcctccggtttcggtacaggagacggt
aatcccgattattacagagataagttgacgagcgagaacagcactaataaatcaacctac
agtgttggatttgcccttgacattttacctaaaaaattagtgttaaatggcaatgcttca
ctttatcgttatgactggcagagagagaagtttaataaatcttatcaagctcaatcttcc
gcaactcctgacaatacacgccaggctgaggcttatgttcagaaatacaatcaaattcag
ttgaacggaacactgacatacacagatacttttgcagaaaagcataatctggaagcaatg
ttaggaaccgaatatttcacttatgatcagttcgattttgaagctaaaactcaaaattct
ccgactgatgatattcctaccttaaacgcaggctctacaagaacttatacttcaacaacc
aaaacagcatatcgtattctttccggattcggacgtattaactataactacgatatgaga
tatttaatttcgtttgttgctcgttatgacggtatttcgaaactgaaagataatcgttgg
ggattcttcccgggtgtgtctgtcggttggaatattatggaagaaagattctggaaagac
tctaagatatcaggagttatttctaacttgaaaccccgtttgagctatggtgtcaatgga
aatgtgaatggaatcggaaattttgatgtatatggtgcatattcacaagtaggcgcaaaa
acatacggaggttcaaccgcattctacaattcaggtttggtaaacactggattacgttgg
gaacaaagtcagtcatttgaagcaggacttgacatcggattcttaaataatcgtttgagc
tttatcttcgactattataaccgtactacaaaggatttgttaaccaaacaagctcttccg
ggatataccggtttcacggaaatcatgaccaatatgggaactctgcgtaattatggtttt
gaaatggaagtcagagctaatattctgaataatccgaaagggttaacatgggatgtaaca
gccaacttgtcttctgttgcaaacaagatcgtaaaattgccctacaatggtaaccccaat
aatcgtgttggtggttatgaagtagcaaccggacgtaaaaaagccgatggaacagatgaa
accaaatggatcgccggtcgtcaggaaggtggtaaactgggagaactagttgcctataaa
caaaaccacatattcaaagattgggatgatgtgaaaaaatatgccaataatcgtatcgat
gaggtagccaacttatatggtccgggacttgcagcccaatatgccggaaaagagggatgg
caacctatcgaaccgggtgatgtttgctgggaagacattaatggcgatggtgttattaat
ggatacgaccgtcaagtagtaggaaatatattcccaaaagttaccggtggattctctact
acattgggttataaaaacctctccttatatgcccgtttcgattatgctttaggacatacg
atttataatgaccttgcagcacgttcattggggcaatatcaaggttcgttcaacatcatt
aaagaagttaaaaaaacatggagtgaaacaaataccgatactgatctgcctgcattctat
tatgccgaccagttaagtaagaagaatataacacgttcaaataatggtcttacggctatt
gacaataacagttcacgtttctatgaaaaaggtgactatttggcccttcgtgaactgaca
ttgaactataatctgcctaaaacatggattagtaaagtaggcatgacagatgcctcagtt
tatgtaacaggtcagaatctattctatatcaccggatacacaggcgtttcacctgaaccg
gctgtagatacgacttatggccgtggaatagataacggccgttatcctactccgagaaca
gttttattcggtttgtcagtgacattctaa
DBGET
integrated database retrieval system