Phocaeicola vulgatus: BVU_1701
Help
Entry
BVU_1701 CDS
T00546
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
Organism
bvu
Phocaeicola vulgatus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
OMP_b-brl_3
TonB_dep_Rec
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
Plug
EMC7_beta-sandw
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABR39377
UniProt:
A6L113
LinkDB
All DBs
Position
2190007..2192772
Genome browser
AA seq
921 aa
AA seq
DB search
MMKAQMKGISLMIILLMLVLTVQAAALRGTVTDKATKEPLIGAAVQLSGTNTGTITDVDG
NFELAGLRNGTYKLIISYVSYCTQTVEVTINGMFEIKVELEQDNQQLGEVVVVADAKKNT
ENAIITQQRTSLVMQTGVSAQQITKTQDKDASEVIRRVPGISIIEEKFVMVRGLSQRYNN
VWINNSAVPSSEADARAFSFDIIPSSQLDNMLVVKSPAPEYPADFSGGFILVNTKDVPSS
NLFTISVGTSLNDQTHFKKFLYNKGSGTDFLGFDNGFRSLKGGINAVLSPMNNGYDLLNN
GLNNDWTVKDRRPLADLSLNMNFSRRWVDSSGRTLAILGTVNYSNSYRTYLDMDNNLFGA
YDMTHDCSNYLRKSIDDQYNHSVRIGTMLNFTYIPASGNSRYEFKNIFNQLGKDRYTYRK
GTDAQSDYEESAEYYYQSRTTYNGQFTGKHTLGNTDKLDWSAGYSYANRNMPDRRRYTTV
LNEETNQLEVENLNEINREFSRLDEHILSANINYQHDFSFGIFTPSLKVGAYTEHRAREY
NTRFFIYSWKNGLPGAYKVMNVPNELLQEKNYGENGLYLLEQVDWRNNYEGNNLLSAGYV
GGNLPLGKLNVYAGVRFEYNRMELVSHTQKNEESPTSVFYTYDDFFPSVNAAYRLNDKHQ
FRLSYGRTVNRPEFREVSSSVYYDFDLASNVQGNYNLKPAYIDNLDFGYEFYPSSGELIS
VSLFYKRFKNPIEWTYTVSGGTDLIYSYVNAKGADNYGVEVDIRKNLDFIGMRNFSLSLN
GALIKSKVKFEPGAKEKDRPMQGQSPYLINAGFFYQHADSGWNAALLYNRIGKRIIGVGC
SLGTADNEVRVPDSYEMPRNAVDLSVSKKIGNLEIKVAVRDLLAEKVSFKQFEETRHGKV
AQITRQYKSGRNFNLNINYTF
NT seq
2766 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgaaagctcagatgaaaggcattagccttatgataattctcttgatgttggtattg
actgtacaggcggctgctttgagaggaactgtaacagataaagcgactaaagagccactt
attggtgctgctgtacagttaagtggtacaaatacaggaactattactgatgtggatggt
aatttcgaacttgcgggattaagaaatggaacgtacaagcttattatatcttatgtgtct
tattgtacacagactgttgaggttacaataaacggcatgttcgaaataaaagtagaacta
gaacaggataatcaacaattaggagaagttgtggttgtagcggatgctaaaaagaatacg
gagaatgctattattacccaacaacgtactagcttggttatgcaaacgggagtttctgcc
cagcagattaccaagacgcaagataaagatgcttcggaagtgattcgccgtgtaccgggt
atcagtataattgaggagaaattcgttatggtacgtgggctttcacaacggtataataat
gtgtggattaataatagtgccgtacctagttctgaagccgatgcgcgtgctttctctttc
gatattattccatcgtcgcagttggataatatgttggtagtgaaatcgcctgcaccggaa
tatccggctgatttcagtggtggttttattttagtgaataccaaagatgttcctagcagt
aatctgtttactatttcggttggaactagtttaaatgatcagactcattttaaaaagttt
ctgtataataaaggaagtggcacagattttctaggtttcgataatggctttcgtagcttg
aaaggtggaatcaatgctgtgcttagtccgatgaacaatggctatgatttattaaataat
gggttaaataatgactggaccgttaaagatcgtaggcccttggcagatcttagcctgaat
atgaatttcagccgtcgctgggtggatagtagcggacgtactttggctatattaggaaca
gtgaactatagcaatagctataggacatatctggatatggataacaatttgtttggtgct
tatgatatgactcacgattgttctaattatttacgtaaaagtatagatgaccaatataat
catagtgttcgtataggaactatgctgaattttacttatatacctgccagtggtaacagt
cgctatgagtttaagaatatttttaatcaattagggaaagaccgctatacttaccgtaag
ggaacagatgcacaaagtgattatgaagagagtgcggaatattattatcagagtcgtacc
acttataatggtcaatttacggggaagcatacattgggtaataccgataagttggattgg
agtgctggatattcttatgccaatcggaatatgccggaccgccgtcgatatactaccgta
ctcaatgaggagaccaatcagttggaagtagagaacttgaatgagattaatcgggagttt
tcccgattggatgaacatattttgtcggctaacatcaattatcagcacgatttctctttc
gggatttttactcctagcctgaaggttggagcttacacggagcatcgtgctcgtgaatat
aatacccgtttttttatctatagttggaaaaatggtttgccgggtgcttataaagtaatg
aatgtccctaatgaattattacaagagaagaattatggagagaatggactttatttattg
gaacaagtggattggcgcaataattacgaaggcaataacctcttgagtgctggttatgta
gggggtaatcttccgttgggcaaattgaatgtatacgcaggagttcgttttgaatataat
agaatggagttggttagccatacacagaaaaacgaggaaagccccactagtgtgttttac
acgtatgatgactttttcccgtctgtaaatgcggcttatcgtttgaatgataagcatcag
ttccgtttatcttatggacgtactgtgaatcgtccggaatttcgggaggtttcttcttct
gtatattatgattttgatcttgccagcaatgtacaaggtaattataatttaaagcctgct
tatattgataatttagattttggttatgagttttatcccagcagtggagagctgatttct
gtttctcttttctataaaaggtttaagaatcctattgaatggacttatactgtatccgga
ggtacagaccttatctattcgtatgtcaatgccaaaggagcggataattatggagtagaa
gtggatatacgcaaaaatctggattttataggtatgcgtaattttagtcttagtctgaac
ggggctttaattaaaagtaaagtgaaatttgagccgggagccaaagagaaggaccgtccg
atgcaaggtcaatctccatatttgattaatgccggtttcttctatcaacatgccgatagc
ggatggaatgctgcattgctttataaccgtatcggtaaacgtattattggtgtaggctgt
agtttgggaaccgcagacaatgaagtcagagtacccgattcttatgaaatgccccgtaat
gcagtagatttaagtgtttcgaaaaaaattggtaatctggaaataaaggttgctgtacgc
gatttgttggcggagaaagtttctttcaagcaatttgaagaaactagacatggaaaagtg
gcgcaaattacccgtcaatacaaatcagggcgtaatttcaatttgaacattaactatacg
ttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
