Calothrix sp. PCC 7507: Cal7507_4120
Help
Entry
Cal7507_4120 CDS
T02358
Name
(GenBank) filamentous hemagglutinin family outer membrane protein
Organism
calo
Calothrix sp. PCC 7507
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TPS
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFY34501
UniProt:
K9PNG9
LinkDB
All DBs
Position
complement(4668520..4672209)
Genome browser
AA seq
1229 aa
AA seq
DB search
MAKNWLVLVSRVLAIAIAFIYPSTKVCAQNITLDGSLGTRETLTGPNYTIPQSAGQTVGN
NLFHSFGKFNLNSNEAAIFQNADNIRNILSRVTSGSQSLIDGLIRTQSGVNLFLINPSGI
IFGKNARLDVGGSFVASTANSLKFPDNLEFSATNNLQQPPLLSINVPIGLQYGKQQPGEI
TLQGQGNSELRVTPGNSLILAGGKINVNQFKLFAPGGKIELAGIAGDGIVDLQVNSNDVD
LSLPQKIGQADVTLKNSTLDITADSGRGIKINARNLDLSNSNISSQTQGKGDAGSVLLQT
VGSIFLRNSSISSVTYGQGNSGNISLTAKGAIFFDTSSISTSTPSGLGDAGKISLQANGS
IAFVGGGIFSDVAYGRGSGGSISLVAGDSILVTQGVTFDSEAISDRSGAGNILFQAGNSV
VISDNSRIYSTTGGKGDAGRINLQARSFSLLNGSELVSTTSNEGKGGDIEINTTDAVNIS
GLYPDGSLLKYSSIRSNAIADATAKKAGDIKITTQTFQLSDAAVLNAGTSSSARGGDITI
NSRTVEITGGAKLLTSTFGFNGGNAGNITINASEKIAILGSDRNYFPQQQARQSYLYFND
QISPASGLFSNTTPGSNGNGGRISLQTPTLLLANGATVVTSTIGSGKAGDIYLGSPDEPI
KQITISGANTGFFANTQASSITLPLKFITVNEIGEAGQLPSTAQKIPTIGTFVEKISGSL
DSSNDVDLYQIELEGNQTFSAETFVSNVRDTRLFLFDSNGIGVYANDDTIFSSFDSYQSS
LPPKHPLTPKNPGTYYLAITQYPITAVSNGGEVFSFLTPTEISGATGKGGSLPLSGWIGD
GFEQDKYTILLRGLTARPQILPGGDGGNITVHAASLIVKDSAQLTTSTSGNGKAGNITIN
AVDSINLLGSSSGVYANTTPGSSGNGGNIIIDPKNMIIRDGAKIAVDSQGEGIGGNIELA
AGILTLNNGTISAETRSSTGGNITLNLQDLLLLRNGSKISTTAGNNQFAGNSGNININSK
FIVAVPNENSDISANAFTGTGGKVTINATGIYGITPRSREELVKLLGTNKPQDLDPAKLF
TSDITAISQTSPILNGDVILNTPDLDPTRGLTVLPTNLVDVSKQIAQGCTPKGKIASHFT
STGRGGLPLNPDEPLRGRAVMTNWVTLGEGNQQIREITNKSTPETIIEAQSWVINSDGKV
ELVAYVPGSTFNNSSLLSNLSCNAFPSSQ
NT seq
3690 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgaaaaattggctagtgttagtgtcaagagttttggcgatcgctattgcgtttatc
taccctagcactaaagtctgcgcccaaaatattaccctagatggttcattaggaacacga
gaaactctaacaggccctaattacacaattcctcaatctgctggacagactgttggtaat
aatttatttcatagttttggcaagttcaaccttaactccaacgaagcggcaatttttcaa
aatgcagataacatcagaaatattttgtcgcgggtgactagtggttcgcaatctctaatt
gatggtttgattcgcacccaaagtggcgtaaatctttttttaattaatcccagtgggatt
atatttggaaaaaatgcacggttagatgtgggtggttcgtttgtggcgagtacagcaaac
agtttgaagtttccagataacctagaatttagtgctacaaataatctacaacagccgcct
ttgttaagtattaatgtccctataggcttgcaatatggcaaacagcaaccaggtgaaatt
acactgcaaggacaaggcaattctgaactgcgagtgactccaggaaacagcttgattttg
gctgggggaaaaatcaatgtcaaccaatttaaattatttgcccctggtggaaaaattgaa
ttagcaggaatagcaggtgatggaatagtcgatttgcaggtgaatagtaatgatgtggat
ttgagtcttcctcaaaagataggacaagccgatgttacactcaagaattcaacactggat
ataacagcagatagtggtagaggtatcaaaattaatgctcgtaatttagatttatccaat
agcaatattagcagtcaaactcaaggtaaaggagacgctggaagtgtcttattacagact
gttggatctatttttttgagaaacagtagtatttctagtgttacttatggacagggaaac
tcagggaatatttcattaacagcaaaaggcgcgattttttttgataccagcagcatctct
actagcactccttctggcttaggagatgctggtaaaatttcactacaagcaaatggttcc
attgcttttgttggtggtggtatctttagtgatgttgcctatggtaggggtagtggtggt
agcatttccctggtagctggggactcgattttagttactcaaggagttacatttgatagc
gaagcaattagcgatcgctctggtgctggtaatattttatttcaagcaggtaactctgtt
gtcatcagtgacaatagtcgtatatatagtacaactggtggtaagggtgatgcaggtaga
atcaatctacaagcacgttctttctcgttgctaaatggttctgagttagtctccacaacc
tctaatgaagggaaaggaggcgatattgaaattaataccactgatgctgtgaatatttcc
ggactttaccccgatggttccttactgaaatatagcagcatacgcagtaatgccattgca
gatgctactgctaaaaaagcaggtgatatcaaaattacaacgcaaactttccaactgtca
gatgcagccgttttaaatgctggaaccagcagcagtgctaggggtggcgatatcactatc
aatagccgtaccgtagaaattacaggtggtgcaaagttgctcacctctacttttggcttt
aatggcggcaatgcaggtaatatcactatcaatgctagcgaaaaaattgctattttaggt
agcgatcgcaattattttccacaacaacaagcaagacaatcatatttatatttcaatgac
caaatcagtcctgctagtgggctattttccaatactacacctggttctaatggcaacggt
gggagaatttctctacagacacccactcttttattagctaacggagctacggttgttact
agcacaataggcagtgggaaagccggtgacatttacttgggtagtcctgatgaacctatt
aagcaaattaccatatcgggtgctaatacaggattttttgctaacactcaagcctcatct
atcaccttaccactaaaatttatcacagttaacgaaataggtgaagctggtcaattacct
agcactgctcaaaaaattcctactattggaacttttgtcgaaaaaatttctggtagtctc
gatagtagcaatgatgtagacctttatcaaatcgaattggagggaaatcaaactttctca
gcagaaacattcgtttctaacgtaagagatactcgcctgtttctatttgatagcaatggt
attggtgtttatgccaatgatgacacgatattttcatcatttgattcatatcaatcatct
ctaccacccaagcatccattaacccctaaaaatcctggaacttactatttagctatcacc
caatatcctataactgctgttagtaatggaggtgaagtttttagttttcttacccccacg
gaaattagtggtgcgactggaaaaggggggagtttacctctgagtggttggattggtgac
ggctttgagcaagataaatatactattttacttcgcggattgactgctagaccgcaaatc
ttaccgggtggagatggtggtaatatcactgttcatgctgcttctctgatagttaaagat
tctgctcagttaacaaccagcaccagcggtaacgggaaagccggaaatatcacgattaat
gccgttgatagtattaatttgttaggttctagtagtggtgtatatgctaacactactccc
ggttccagtggcaacggcggtaatattatcatcgaccctaaaaacatgattattcgagac
ggcgcaaagatagcagttgatagtcaaggagaaggtattggcggtaatattgaactagca
gcaggtattctcactctcaataatggaactatttccgccgaaacccgcagcagtacaggt
ggtaatattactctgaatttgcaagatttattactattacgtaatggcagcaaaatttct
accacagccgggaataatcagtttgctggaaatagcggtaacatcaatatcaactcaaaa
tttatcgttgcagttcccaatgaaaacagcgatatctctgccaatgctttcactggaacc
ggtggcaaagttaccatcaatgcaactggtatttatggcatcacaccccgtagtcgagaa
gagttagtgaaattattaggaactaacaaacctcaagatttagatcctgcgaaactattc
actagcgatattactgctatttctcaaactagtccgattttaaacggtgatgtcattctc
aacacaccagatttagatcccactcgtggtttaaccgtactccccaccaatctagttgac
gtatccaaacaaattgctcaaggttgtacccccaagggaaaaatagccagtcattttaca
tctacaggacgaggcggtttaccattaaatcctgatgaaccgttacggggaagagcggtg
atgactaattgggtgactttgggtgaggggaatcaacagataagggaaattacgaacaaa
tcaaccccggagacaattatagaagcgcaaagctgggtaataaattctgatggtaaagtc
gagttggttgcatatgtgccggggagtacttttaataactcttcgttgctatctaattta
agttgtaatgcgtttccctcttctcagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
