Calothrix sp. PCC 6303: Cal6303_4089
Help
Entry
Cal6303_4089 CDS
T02372
Name
(GenBank) multi-sensor hybrid histidine kinase
Organism
calt
Calothrix sp. PCC 6303
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Response_reg
DUF3365
HATPase_c
PAS_9
GAF
HisKA
PAS
PAS_3
PAS_4
Hpt
GAF_2
PAS_8
GAF_3
HAMP
PAS_12
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFZ03005
UniProt:
K9V6Z2
LinkDB
All DBs
Position
complement(4882051..4886838)
Genome browser
AA seq
1595 aa
AA seq
DB search
MIHRHRLKLTTKFNILLLLILIIGCIVSGLTLSAAMQNRAEVEIMDKAEMLIENMNSVRT
YTSEQIQPLLSDRLKTDKKFISETVPAYSAQKVFENFRKQPDYKNYHYKEATLNPTNPKD
KADKFESELVKQFRQKPNLKQLTGYRNISGEDLFYIARPLKVTKASCLQCHSHPDVAPKS
LIDTFGSEGGFNWNLNEIIASQTIYLPAKNVFAKGHEYLLLVMKIFTSIFIVLLFVINLL
LKQSVVNPIKTITKLTKKLKTGEVVNFASENNTEAIALKLIAQRRDETGELAKTFEHMAQ
EVLSREYDLKQAQKEIKRSEEYFRSLIEQASDVILILNREMNILYVSYSVKRVLGYEIEK
VLNQDIIHFIPSEEVSRICQFIDKVIYSPGISASIELKFRHQDGSWRTMEGVSKNLLDDS
IVEGIVLNLRDLTQRKQADERLRLLESVVVNSNDAIVITESEPIDITNGPKIVYVNEAFC
KMTGYSLQDVIGKTPRILQGKNSDRIALKKIRNALESWQSVNVEMINYRKDGTEYWVEIN
IVPIADKSGWFTHWVAIERDITERKLAEKELRESEASIRTLYEVTANIELSLSVRVQQML
QMGCQQFDLEVGTLSRIDEDDIEVMNIYLSDNCPLTIRQGDIFNLNETFCYETIQVNTAI
SIVNASKNKWKNHPCHVHGQVENYLGTRVIVGGKVYGTLNFYGTNSRSSSFKSLQIELLK
LMAQWVGSEIERQNFHIALQQQLQKTILLEKITQKIRQSLNTQEILQTTVNQLGQSLEVD
RCVIHYYIEEPNPRLPCVSEYSTLSTKSMLNLDIPVIGNAHAEKVLNQDNAVVSDNVFTD
PLLIPSANLCVELNIKSMLVIRASYQGQTNGVLALHQCNYQRQWQQDEIELLEAVAAQVG
IALAQAHLLERETSQRELLAQQNQELNIAKKDAEAANRSKSDFLATMSHEIRTPMNAVIG
MTGLLLNTKLTPSQEDFVETIRSSGDSLLTLINDILDFSKIEAGKLDLEEQPFELRSCVE
EALNLVANRALEKKLELACLIDPTTPNIIVGDVTRLRQILVNLLSNAVKFTANGEVVVFV
NTRSVNSTNSNSDRNLYEIEFAVKDTGIGIPADRMNRLFQSFSQVDASTTRQYGGTGLGL
AICKRLCEMMGGKIWVESEAGVGSTFSFNIWAEISENQAFQEESADNEFLGKRVLIVDDN
ATNRQILTLQTQSWGMFNCAVESGSEALKLFDQGVSFDLAILDMQMPEMNGITLGEKIRQ
KPNCENMPLVMLTSINAQEISTQINNVEFAAIINKPIQQRQLYRTLGHILGGNLIKVNQS
TTHLQNDQEQLSQNLPLRILLAEDNTVNQKVALLTLERIGYRADLAGNGLEVLQALQRQP
YDLILMDVQMPEMDGLTATQRICEQFPDSQRPRIIAMTANAMQGDREICIKAGMDDYITK
PIRVNELRNALSKCQPLNYNLELLEPVKNNQIEEVEKIEVIKVIDESVLQELKDMAGEDY
VAFLTEIVDAFVGDAATSIDAIALAIEQANPVELREIAHGLKSASAYLGAIQLSHLCQEL
ETLGRNGAIAGALEIFTQLQQEYKRVETALLLECQ
NT seq
4788 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattcatagacatagactgaaattaacaaccaaatttaatatcctactgctcctaatt
ctaattatcggctgtatagttagcggtttgactttatccgcagctatgcaaaatagagct
gaagtggaaattatggataaagcagaaatgctaatcgaaaatatgaattccgtgagaacc
tatacgagcgaacagatacaaccattgttatcggataggctgaaaacagacaaaaaattt
atttcagagacagttccagcttattctgcacaaaaagtttttgaaaattttcgtaaacaa
cctgactacaagaattatcactataaagaagcaacattaaatcccacaaatcctaaagat
aaagctgataagtttgaatctgaattggtaaaacaatttaggcaaaaaccaaatttaaaa
caattgactggctatcgaaatatctctggagaagatttattttatattgctcgaccttta
aaagttactaaagccagttgtttgcaatgtcacagtcatccagatgtcgcacctaaaagc
ttaattgatacttttggttctgaaggtggttttaattggaatttgaatgaaattatcgca
tctcaaactatttatcttccagctaaaaatgtatttgcaaaagggcatgaatatttattg
ttggtaatgaaaatttttacaagcatttttattgttttgctatttgttattaatttatta
ttgaaacaatccgtagtcaacccaattaaaactataactaaacttacaaaaaagctcaaa
acaggagaggttgtaaattttgcctcagaaaataatacagaagccattgccttgaaatta
attgctcaacgtcgtgatgagacaggagaattagcaaaaacatttgaacacatggctcaa
gaagttttgagtcgagaatacgatctgaagcaagcacaaaaagaaattaagcgcagtgaa
gaatattttcgctcactaattgaacaagcttctgatgtaattttaattctaaatcgagag
atgaatattctttatgttagttattcagttaaacgtgttctaggatatgaaattgaaaaa
gttctaaatcaagatattattcattttattccttcagaagaagtgagtaggatatgtcag
tttattgacaaagttatctatagccctggtatttcagcatcgatagaattaaaatttcgc
catcaggatggttcttggcgaactatggaaggggttagtaaaaatctactggatgattcg
attgttgaaggtatagttttaaatctacgggatttaactcagcggaagcaagcagatgaa
agattacgcttattagaatcagttgttgttaattctaatgatgcaattgttattacagaa
tcagaacctattgatattactaatggacctaagattgtctatgtgaatgaagcattttgt
aaaatgacgggctatagcttgcaagatgtaattggtaaaacacctcggatattacaagga
aaaaatagtgatcgcattgccttgaaaaaaattagaaatgcattagaatcatggcaatca
gtcaatgtagaaatgattaattatcgcaaagatgggacagaatattgggtagaaataaat
attgttccaattgccgataaaagtggttggtttacccattgggtagcgatagaaagagat
attacggaacggaaactagcagaaaaggaattgcgagaaagtgaggcatcaattagaact
ttatacgaagtcacagccaatattgaactgagtttatctgtgagagtccaacagatgttg
caaatgggttgtcaacaatttgatttagaggttggtactctcagtagaatagatgaggat
gatattgaagtgatgaatatttatttatcagataactgtcctctaactattcgtcaaggt
gacatttttaatttgaacgaaacgttttgttatgaaactatacaggtaaatacagcaatt
agtattgtcaatgctagtaaaaataaatggaaaaatcatccttgtcatgtccatggacaa
gtagaaaactacttaggaacaagagtgattgttggtggtaaagtttatggaactctgaat
ttttatggaactaattctagatcttcgtctttcaaatccttacagatagaacttttgaaa
ttgatggctcagtgggtaggtagtgaaattgaacgccagaattttcatatagccttacag
caacagctacaaaaaaccatattgctggaaaaaattactcaaaaaattcgtcaaagttta
aatacacaagaaattttacagacaacagttaatcaattaggtcaatctttagaggtcgat
cgctgtgtaattcattattatattgaagagcctaatcccagactaccttgtgtgtcggaa
tattcgacattaagcacaaaatcaatgctgaatttagatattcccgtaattggtaatgcc
catgcagaaaaagttttaaatcaagacaatgctgttgtttctgataatgttttcactgat
ccgttactaattccatctgcaaatctatgtgtggaattaaatattaaatcaatgttagtt
attcgtgcttcttatcagggacaaacaaatggagtactagcattacatcaatgcaattat
caacgtcaatggcaacaagatgaaatagaattactcgaagctgttgctgctcaagttggt
attgctcttgcccaagcacatttattagaacgagaaacaagtcaacgagaattattagct
caacaaaaccaggagttaaatatagctaaaaaagatgcagaagcagcaaatcgctccaaa
agtgattttcttgccacaatgagtcacgaaattcgtactccaatgaatgcagtaattggg
atgacaggattgttgttaaatacaaaattaactccatcacaagaagattttgtggaaaca
attcgtagtagcggagactctcttctaacactaattaatgatattctcgacttttctaaa
attgaagctggtaaattagatttagaagaacagccatttgaattacgttcttgcgttgaa
gaagcactaaatttagtagctaatagagccttagaaaaaaaactagaattagcatgttta
attgatccaacaactcccaacataattgtgggagatgtcacacgcttacgacaaatttta
gtgaatttactcagtaatgcagttaaatttacagccaatggagaggttgtcgtctttgtc
aatactcgttctgtgaatagtacaaatagtaatagcgatcgcaacctttatgaaattgaa
tttgcggtgaaagatacaggtattggtattcccgcagataggatgaatcgtctatttcaa
tcctttagccaagtagatgcttctaccactcgtcaatatggaggtactggactaggttta
gcaatttgtaaacgtttgtgtgaaatgatgggaggtaaaatatgggtggaaagtgaagca
ggagtcggttcaacattctcctttaatatttgggcagaaatatcagagaatcaagcattt
caggaagaaagtgccgataacgaatttctcggaaaacgagtcttaatagtagatgataat
gctactaatcgacagatacttaccctacaaacacagtcatggggaatgtttaattgtgcc
gtagaatcaggctcagaagcactgaaattatttgatcaaggggtatcttttgatttggca
attcttgatatgcaaatgccagaaatgaatgggattaccctgggtgaaaaaattcgtcaa
aagcctaactgtgaaaacatgcccttagtcatgttaacttctattaatgcacaagaaatt
agcacgcaaatcaataatgtagaatttgctgctatcattaacaagccgattcaacagaga
caactttatcgaacacttggtcatattctgggtggtaacttaattaaagttaatcaatct
actactcatcttcagaatgatcaagagcagctttcgcaaaatctgcctttacgaattctt
ttagcagaagataatacagttaatcagaaagttgcattattgaccctagagcgtatagga
tatcgtgcagatctagcaggtaacggtttagaggttctccaagctctgcaacgtcaaccc
tatgatttgattttaatggatgtacaaatgccagagatggatggattaacagcaacacaa
aggatttgcgagcagttcccagacagtcaacgcccacgaattattgccatgactgcaaat
gcaatgcagggagacagagaaatatgcatcaaagctggaatggatgactatattaccaaa
cctattcgagttaatgagttaagaaatgcactaagtaaatgtcagccattaaattataat
ctggagttattggaacctgtaaaaaataatcaaattgaagaagttgaaaaaattgaggta
ataaaagtgatcgatgaaagtgtcttacaagaattaaaggatatggcaggagaagattat
gtagcatttttaactgaaattgtggatgcttttgtgggggatgctgctacaagtattgat
gcgatcgcattggcaatcgagcaagcaaatccagtagaattaagggaaatcgctcatgga
ctcaagtctgcaagcgcttatttaggagcaatccaactttctcatctttgccaagaacta
gaaactttaggtcgcaatggtgcgatcgcaggtgcattggaaatattcacccaactacaa
caagaatacaaaagagttgagactgcattattattggaatgtcaatag
DBGET
integrated database retrieval system