Cicer arietinum (chickpea): 101488987
Help
Entry
101488987 CDS
T02819
Name
(RefSeq) pentatricopeptide repeat-containing protein At2g04860
Organism
cam
Cicer arietinum (chickpea)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PPR_2
PPR
PPR_1
PPR_3
E_motif
PPR_long
ATP13
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
101488987
NCBI-ProteinID:
XP_004501568
UniProt:
A0A1S2Y9M7
LinkDB
All DBs
Position
Ca5:36787916..36790198
Genome browser
AA seq
718 aa
AA seq
DB search
MTVASTTVSCFRSRPNLSLFHSLFHCGKSSALVIFRQLLEANVNPNAFTFSLLIKACLSS
SSFAYASLNLGLQARQIQTQLLKRGVNQFIHVNTSLIDLYMKLGFTSHAHHLFEEMVFRD
VVSWNVLICGYSQNGYLYDALKFFVGVLRENFRPNQTTIISLLPSCGCHELILQGRSIHG
FGIKAGLGLDSQLNNALISMYSKCDDLKASQLLFDEMDEKNVVSWNTMIGAYGQSGFYDK
AIICFKDMLKAGFRPSSVTMMNLMSANAVPETVHCYVIKCGFTDDASVVTSLVCLYAKQG
LTDMAKLLYIHYPTKDLISLTAIISSYSEKGDIESAVECFIKTMQLDIKPDAVALIGVLH
GITIPSHVALGCAFHGYAVKSGLSNDCLVANGLISLYSRFDEIEAALSLFYDIRDKPLIT
WNSAISGCVQAGRSSDALELFSKMNMCGQKPDAITIASLLSGCCQLGYLRIGEMLHNYIL
RNNVKVEDFTGTALIDMYSKCGKLDYAEKLFYSIKDPCLATWNSIISGYSLYGLEHKAFS
CYSKLQEQGLKPDKITFLGVLAACYHGGLVCLGLKYFTNMIEEYGLMPTLQHYACLVGLL
GREGLFKEAIEFINYMEIRPDSAVWGALLSACCIQQEVKLGECLAKKLFLLNHKNGGFYV
LMSNLYAIVGRWDDVARVREMMRDGGGDGCSGVSVIEVAYINDSNNNLDMKFVHSLSE
NT seq
2157 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacggttgcctccacaacggtttcttgcttcagaagcagacccaatctgtctctgttt
cactctctctttcattgtgggaagtcttctgcacttgttatctttcgccaacttttagaa
gcaaatgtgaaccccaatgcttttactttttcgttactcatcaaagcttgtctttcatcg
tcttcttttgcttatgcttcattaaatttggggttacaagcacgccagattcaaacccaa
ttgctgaaacgaggcgttaaccaatttattcatgtaaatacttctcttattgatttgtac
atgaaacttggttttacttctcatgcacaccacctgtttgaagaaatggtttttagagat
gttgtttcatggaacgtattgatttgtggatattcacaaaatggatatctttatgatgct
cttaaattttttgtaggcgtgttaagagagaattttaggcctaatcaaactacaattatt
agtttgttaccttcttgtggttgtcatgagctgattcttcaaggtagatccattcatggg
tttggaatcaaagctggccttggtctggattctcagttgaataatgcccttatctcaatg
tattctaaatgtgatgatttgaaagcatcccaactcttgtttgatgaaatggatgagaag
aatgttgtctcttggaatactatgattggtgcctatggtcaaagtggcttttatgataag
gctattatttgcttcaaagacatgctgaaggcaggttttcgacccagttcggtgacgatg
atgaaccttatgtctgctaatgctgttccggaaactgtccattgctatgttatcaaatgt
ggctttaccgatgatgcttctgtcgttacttcgctggtttgtttatacgcaaagcaaggg
ttaacagatatggcaaaactgctttacatacactatcccacaaaagacctgatttcttta
acagcgataatctctagctattctgaaaaaggcgatatagagtctgcagttgaatgtttt
atcaaaactatgcagttagatataaaaccagatgcagttgccttgattggtgtccttcat
ggaattactattccttcacatgttgctcttggatgcgctttccacggttatgcggtgaag
agtgggctgtccaatgattgtttagttgctaatgggctaataagcttgtattctagattt
gatgagatagaagccgcattgtctttgttttatgatataagagataaaccactgatcact
tggaattcggcgatatccggctgtgtgcaggctggaaggtcaagtgatgccctggagttg
ttctccaaaatgaacatgtgcggacaaaaaccagatgccattactattgccagtcttcta
tccgggtgttgccagcttggttacctgcggattggagagatgctgcataattatattctg
aggaacaatgtgaaagtggaggattttacaggaactgctctaatagatatgtatagcaag
tgtggaaaattagactacgctgaaaagctattttatagcatcaaggatccatgtttggca
acatggaattccattatatcaggttatagtttatatggacttgaacataaagctttcagc
tgttattctaaactgcaagagcaagggttaaaaccggataaaatcaccttcttgggagtt
ttagcagcatgctaccatggaggacttgtctgtttgggattgaaatacttcactaacatg
atagaggaatatggtttgatgccaactttgcaacattatgcttgcctagttggtctatta
ggtagagaaggcttgttcaaggaagcaattgaatttataaactacatggaaattcgacct
gattctgctgtttggggagctttgttaagtgcttgttgcatccaacaagaagtgaagctt
ggggaatgcttggcgaaaaaattgtttttgttgaatcacaaaaatggtgggttttatgta
ttaatgtcaaatctttatgccattgttgggagatgggatgatgtagcaagggtgagggaa
atgatgagagatggtggaggagatggatgttcaggtgttagtgttattgaagtggcatat
attaatgactctaataacaacttagatatgaagtttgtccattcattatcagaatag
DBGET
integrated database retrieval system
