Clostridium acetobutylicum EA 2018: CEA_G0062
Help
Entry
CEA_G0062 CDS
T01864
Name
(GenBank) Conserved hypothetical protein
Organism
cay
Clostridium acetobutylicum EA 2018
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Prophage_tail
Prophage_tailD1
F5_F8_type_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADZ19105
LinkDB
All DBs
Position
70657..75594
Genome browser
AA seq
1645 aa
AA seq
DB search
MICLYDGKTALKEENFKNNGLVVLSDCKSCFIEEKLNDSYELTLEYPIDDRGKWQYLVEK
NIIKADGQLFRIYHKEKNLEGVTVNARHIFYDLLDNFIEEVSIVNTTGVGAVDLILNNTQ
FPHPFKVTGDVSSNASASYVRKNVVEAIMSSDSSDGDGSGSILSNYGGELERDNFIIKYL
NNRGEDRGVTVRYGKNIVGIEETLDMDDVVTRIMPLGKDDLLLLEKYVDSPLINNYHNPI
VREVEFSDIDDEAKLKEAAEAYIQTVDKPTINYTVDFIELTKTEEYKNYKVLESVYMGDT
VTVKHSRLGIDLKAEVIRIKKNVLTNRIEEVELGDFKKTLSDMFGDLSNSISDTQSMINK
VNDDVTIQLDSKIESYYQDKDPKIWSTESNLAHNGDMWYKTDTKQLYRFNGSTGNWDEIK
SQNAIDAYEKASKAQDIADSKRRVFVAQPNPPYDQGDLWSQGKEGDILICINSKLSGATY
DASDWELASRYTDDTKLVEFMNGVYKTDKANMQAQLDGVIDTWFYKGEPSLANEPSSAWK
DDNTKNNHLGDLYYDIDTGYAYRFALVDKEYQWLKITDIDVTEALSKAQKAGDTADSKRR
VFVAQPIPPYDIGDLWCQGDTGEILTCQRSKAPGTSYAEGDFQKLNKYTDDSYAKNIQVG
GRNLLRNTSNFKDTNYWFLETGTNQKTVLKIVNDDVYGSVIYIDKQNDVSWSVIRNIFYS
YYTQLFDTDKEYTLSFMGKSTENKELLVAFVNGDGTNWCLEEQEFQLSDKWTKFTVTFKP
KEKGDQPCLYIITDIGELWLTNFKLEVGNKATDWTPAPEDTQSQIDKTQKDVDNALSTAN
NASINATNAINAIDNMSQDNKLSPIEKQNLNQTWFAIQSEKSYIDAQADHYEIDKANYDN
SYAALEMYVTPLISDITVTSDIDSNTFKSNFISYYNAKNELLQLIVKKVKENLDELENNG
VNLIVGSTDNLHTYPSGLIGVKQSDNFWRLGLNSTDEILQDKTTNIIEGKQYTESFLFKT
DGIFNSFSITFFTNNGHHPIQASIQDRGNGVFKAYATYTTQVGDQYIRALDINNINITNG
TYIDILNPKLEKGNKATDWTPAPEDTQKKIDDNYNDYKNFINTIYNNDKSAMQKSIEDAT
TTINSALGGYVLKRNSELLIMDNNDVNAAQKIWRWNVNGLGYSSTGYNGPYATAITKDGK
INADFVTTGTLDANVIKTGVLSSQDDSLKFDLTGGSMKTSDNQGNYTTISAGGIKHHSTL
KGIRYIRAYGSGSTSNTGTMEWVNIAAYNAAGTNVAYQKDTSYTGTRLSSDDEYNVVLDR
EDESYNFGVATDGSNQYFQVDLGVIEEVNNINVKHIWDDSRVYRSSIAVSQDGNSWTNIF
DSEAKTHRNIRYIRDWLNGSNIDNTNDWVEIQAINSSGQNVAQGKNAWGSMGSNLTSLTD
GNLDKDSAKVHSSGLSYVIVDLGQNYNDIQTLKIFHFYGDRTYHGTRTEVSEDGVTWYSA
WSSALDGGEYFEASSGHSIDITSVWNRYAETNTGMNFSVPELPVVNNNSEYHYLLYSGKV
VLSDKVPLAIIHLPAEFVGKNYSVNVNPANIVNYSDGFMLKSFCCFVSEQHDDWFGINGS
CFVCHESNWNEPILINLEVNYTVVA
NT seq
4938 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgatttgtttatatgatggaaagacagcattaaaagaagaaaattttaagaataatgga
cttgtggttttaagcgactgcaagtcttgttttatagaggaaaaattaaatgatagctac
gagttaactcttgagtatccaatagatgatagaggtaagtggcagtatcttgtagaaaaa
aatattataaaagccgatggacagctatttaggatttatcataaagaaaaaaatttagaa
ggtgtaactgtaaatgcaagacacatattttatgatcttctagataattttattgaagag
gtaagtatagtaaatacaaccggtgttggagctgtagatttaatacttaataatactcaa
tttccacatccctttaaagtaacgggtgatgtttcttcaaatgcatcagctagttatgta
agaaaaaatgttgttgaagcaataatgtctagtgatagttcagatggagacggctcagga
agtattcttagtaattatggtggagaattagaaagagataattttatcattaagtattta
aacaatagaggggaagatagaggggtaactgtacggtatggcaaaaatattgtgggtata
gaggaaaccttggacatggatgatgtggttactaggattatgccattgggaaaagatgat
ttgctacttttagaaaagtatgtagattcaccgcttataaataattatcataatcctatc
gtacgtgaagttgaattctcagatatagatgatgaagctaaattaaaggaagcagctgag
gcatatattcaaaccgtagataaaccaacaattaattacacagttgactttattgagctt
actaaaacagaagagtataaaaattataaagtacttgaaagtgtatacatgggagataca
gtaactgtaaaacattcaaggcttggcattgatttaaaggctgaggttataaggataaaa
aagaatgttttaactaataggatagaagaggttgaacttggagattttaaaaagacctta
tcagatatgtttggtgatttaagtaattcaattagtgatacccaatctatgataaataaa
gttaatgacgatgtaacaattcaacttgatagtaagatagaaagctattatcaggataag
gatcctaagatttggagtactgaaagcaatttagcacacaatggtgatatgtggtataaa
acagatacaaaacagttgtatagatttaatggttctacaggaaattgggatgaaataaaa
agccagaatgctatagatgcatatgaaaaggcttcaaaggctcaagatatagcagattct
aaaagaagagtttttgtagctcagccaaatccgccttatgatcaaggtgatttatggtct
caaggaaaagaaggggatattttaatatgtataaattctaaactctccggagcgacgtat
gatgcttcggattgggagctagcaagtaggtatactgatgatacaaaattagtagaattt
atgaatggtgtttataaaacggataaagctaatatgcaggctcaattggatggtgtaatt
gacacttggttttataaaggggagcctagtttagctaatgaaccttcaagtgcttggaaa
gatgacaatacaaaaaataatcatttaggggatctatattatgatattgatacaggatat
gcttacaggtttgcgttagtagacaaagaatatcaatggcttaaaatcactgatattgat
gtaacagaagcgctaagtaaagcacaaaaggctggagatacagcagattctaaaagaaga
gtttttgtagcgcaaccaatacctccttatgatattggagatttgtggtgccaaggggat
acaggagaaattctaacctgtcaaagaagtaaagcgcctggaacctcatatgctgagggg
gattttcagaagcttaataaatatactgatgatagctacgctaagaatatacaggttggt
ggaagaaatttattaagaaatactagtaactttaaggacacaaattattggtttttagaa
acaggaactaatcaaaaaacagttttaaaaattgtaaatgatgatgtttatggttctgta
atttatattgataagcagaatgatgtttcctggagtgtaattcgtaatatattttattct
tactatactcagttatttgatacagacaaggagtatactttgtcatttatgggtaaatca
actgaaaacaaagagttattagttgcatttgtaaatggggatggtactaattggtgtctt
gaggaacaagagtttcaactatcagataagtggacaaagtttactgttacgtttaaacca
aaggaaaaaggagatcaaccctgtttgtatattatcaccgatattggtgaactttggtta
actaattttaagttagaagtaggaaacaaagcaactgactggacgccagcgccggaagat
actcaaagtcaaatagataaaactcaaaaagatgtggataatgcattaagtacagcaaat
aatgcaagtataaatgctacaaatgcaataaatgccatagataatatgtcacaggataac
aagttatcgccaattgaaaaacagaatttaaaccaaacttggtttgctatacagtcagaa
aaaagttatattgatgctcaagcagatcattatgagatagataaagctaattacgataat
agttatgctgcactagaaatgtatgtaactccactaatatcagatattacggttacttcc
gatattgatagcaatacatttaaaagtaattttataagttattataatgctaaaaatgaa
ttgttacagttaatagttaagaaagtaaaagaaaatttagatgagttggaaaataacggt
gtaaatttgattgtaggatcaactgataacttacacacgtacccaagtgggcttataggt
gtaaagcaatcagataatttttggagattaggactaaattcaacggatgaaatattacaa
gataagactacaaacataattgaaggaaaacagtatacagaaagtttcttattcaaaact
gatgggatatttaatagcttcagcataaccttttttactaataatggacatcatccaatt
caagcaagtatacaagatagaggaaatggagtttttaaagcatatgcaacttatacaaca
caggttggagatcaatatataagggctcttgatattaataatataaatattactaatggc
acatatatagatatactgaatccaaaactagaaaaaggcaacaaagcaaccgactggaca
ccagctccagaagatactcaaaagaaaatcgatgataattataatgactataaaaatttt
ataaatacaatctacaacaatgataaatcagcaatgcaaaagtccatagaagatgctaca
actacgataaattcagcactaggaggatacgttctaaaacgtaatagtgagctacttatt
atggataataatgatgtaaatgcagctcagaaaatatggagatggaatgtaaatggattg
gggtatagttctacaggatacaatggaccatatgccacagctattacgaaagatgggaag
attaatgccgattttgtaactacaggaacgttagatgctaacgtaattaagactggtgtt
ttatcaagccaagatgattctcttaagtttgatttaactggaggaagtatgaaaacttct
gataatcaagggaactatacaacaatatctgctggaggaataaaacaccatagcacatta
aagggtataaggtatataagagcttatggtagtggaagtacttcaaatacaggtactatg
gaatgggtaaatattgctgcatacaatgcggcgggaacaaatgtagcatatcaaaaagat
actagttatacaggaacaagattaagttcagatgatgaatacaatgttgttcttgacaga
gaggatgagagctataactttggagtagctacagatggttctaatcagtattttcaagtg
gatttgggagtaattgaagaggtaaataatataaatgtaaagcacatatgggatgattct
agagtgtatagaagtagtattgcagttagccaagatggtaatagttggacaaatatattt
gatagtgaagctaaaacacataggaatataaggtatataagagattggctcaatggttct
aatatagataatactaacgattgggttgaaatacaagctatcaattcatctggtcaaaat
gtggctcaagggaaaaatgcttggggatcaatgggaagcaatttaacttcattaacagat
ggaaatcttgataaagattctgcaaaggtacattcttctgggttatcttatgtgattgtg
gatttagggcaaaattacaatgatattcaaacccttaaaatttttcatttttatggtgat
agaacctatcatggaacaagaacagaagtttcggaagatggcgttacatggtattctgct
tggtcaagtgctttagatggtggggaatattttgaggctagtagtgggcattcaatagat
attactagtgtgtggaatagatatgcagaaacaaatacaggaatgaattttagtgtgcct
gaattaccagtagtaaataataattcagaataccattatttattatacagcgggaaagtt
gtgttgtcagacaaggtgcctcttgcgataatacatttaccagcagagtttgtagggaaa
aattacagtgtaaatgtaaatcctgcaaatatagttaattactcggatggatttatgctt
aagagtttttgttgttttgtatcagaacagcatgatgattggtttggcataaatggaagc
tgctttgtttgtcatgagagtaattggaatgaacctatattaataaatttggaagttaat
tatacagtagtagcgtga
DBGET
integrated database retrieval system
