Clostridium acetobutylicum EA 2018: CEA_P0003
Help
Entry
CEA_P0003 CDS
T01864
Name
(GenBank) Transglutaminase-like predicted protease domain fused to ChW-repeats and cell-adhesion domain
Organism
cay
Clostridium acetobutylicum EA 2018
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ChW
Big_2
DUF5050
Transglut_core
Invasin_D4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADZ22786
LinkDB
All DBs
Position
EA2018plasmid:4107..6680
Genome browser
AA seq
857 aa
AA seq
DB search
MKKNVLLTIVLIFMLVISYSGGDFKADTNEVGVSYETHVQNVGWQNWFSDGVEAGTNGQG
LRIEALKIKLVNAPVGAQISYSAHVQNVGWQDWVNDGAEAGTDGKGLRVEALKIKLVNMP
DYTVQYQAHVQNIGWQNWVSDGAEAGTDGKGYRVEALRIKIVKKVAVQAITLNKASDELK
VGQTDQLSAAFNPTDATNKNLSWTSSDASIASVDSSGKITALKQGTSIITATTEDGSKTA
NCSVTVNPGDLQISYTTHVQNVGWQNWFSDGVEAGTDGQGLRIEALKIKLLNAPAGAQIT
YRAHVQNVGWQNWVSDGTEAGTDGKGLRVEALQIKLVNMPDYTVQYQAHVQNVGWQNWVS
DGAEAGTDGKGYRVEALKIRIVKKIAVQSITLNKNSDELNVGQTDQLSAVFNPTDATNKN
IKWTSSDNYVATVDSTGKITAVSGGNAVITATTEDGSKTANCSIVVNSTDSKDNQALEKA
KTVLNTIVQPGMTQVQKELAIHDYIVTNTQYETAVFTSDNVSDDIYTAYGALINHRAVCQ
GYAEAFKMMCNLVGIPTDIIEDFKLDHAWNIVKLDDGNYYQVDTTWDDPVYGDDTSLSIS
HEYFNLSDRQMFADHTIDKDKWHYPKAAVDNSEFYSISGDSYDSNVVYTNYNGKLSSVDS
SGNMKTLNDDPSASINYYNGSIYYLSGSSIYKVDTNGQNKVQIASGDIRKMYLYNGAIYY
LDANDFSINKLVLDGTYKNKKVIGITWNSSYFINNGCLYYEAYDDDYLHKVDLQSLTNTK
ILTVSDYYVTSYSNYLFYKDSNNLYRTDLNGGNSKLIVNNITDNFIDIFENYIYYNDSNN
IWYKMNLDGSNLIKLMF
NT seq
2574 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaagaatgtattattaactattgtcctaatatttatgcttgtaatctcatattca
ggcggcgattttaaagcagatactaacgaagtaggagtttcctatgagacgcatgtacaa
aatgtagggtggcaaaactggtttagtgatggtgttgaggcaggaactaatggtcaagga
cttaggattgaagccttaaaaattaagcttgtaaatgcaccagtaggagcacaaatttcc
tatagcgcacatgtacaaaatgtaggctggcaagactgggttaatgacggagctgaggca
ggaactgatggaaaaggtcttagagtagaagctcttaagataaaacttgtaaatatgcca
gattatacagttcaatatcaggcacatgtacaaaatataggctggcagaattgggttagt
gatggagctgaagctggaacagacggcaaaggatatagggttgaagccttgagaataaag
atagttaaaaaggtagccgttcaagcaataacattaaataaagcctcagatgaattaaag
gtgggacagacagatcaattaagtgcagcctttaatccaacagatgctactaataaaaat
ttaagttggacatcttctgatgcaagcatagcttctgtagattctagtggcaaaattacg
gcgcttaagcagggaacttcaataattacagcaactacagaggatggaagtaaaacagct
aattgcagtgttactgttaaccctggcgatttgcaaatttcatatacaacacacgtacag
aatgtagggtggcaaaactggtttagtgatggtgttgaagcaggaactgatggtcaagga
cttaggattgaagccttaaaaattaagcttttaaatgcgccagcaggagcacaaattaca
tacagagcgcatgtacaaaatgtaggctggcagaattgggttagtgatggaactgaggca
ggaactgacggcaaaggtcttagagttgaagcactacaaataaaacttgtaaacatgcca
gattatacagttcaatatcaagcgcatgtgcaaaatgtagggtggcagaattgggttagt
gacggagctgaagcaggaactgatggaaagggatacagggttgaagcattaaagataagg
atagttaagaagatagctgttcaatctataactttaaataaaaattcagatgaattaaat
gtaggacaaacagatcaattaagtgcagtttttaatccaacggatgctactaataaaaat
attaagtggacttcttctgataattatgtggctacagtagatagcactggaaagataacg
gcagtttctggtggaaatgcagtgataacagcaacaacagaggatggaagtaaaacagct
aactgcagtattgttgtaaacagcactgattcaaaagataatcaagcactagaaaaggct
aaaactgtcttaaacacaatagtacagcctggtatgacgcaggttcaaaaggagcttgca
atccatgattatatagtaactaatactcagtacgaaacggctgtttttacaagcgataat
gtttctgatgatatatacactgcctatggggcacttataaatcatagagctgtatgtcaa
ggttacgcagaagcttttaagatgatgtgtaatttagtaggaattccaacagacataata
gaggactttaagcttgatcatgcatggaatattgttaaattagatgatggaaattactat
caggttgatactacgtgggatgatcctgtatatggagacgatacttccttaagtataagc
catgaatactttaatttgtcagacaggcaaatgtttgcggatcataccattgataaagat
aaatggcattatcctaaggctgcagttgataacagcgagttttattcaatttcaggagat
tcatatgactcaaatgtggtttacactaattataatggtaagctttcaagtgtagattca
agtggaaatatgaaaaccttgaatgatgatccatcagcaagtattaattattataatgga
tcaatatactatttaagtggttcttcaatatataaggtagatactaatggacaaaataaa
gtgcaaatagcaagtggagatatacgtaaaatgtatttgtataatggagctatttactac
cttgatgctaatgatttttctattaacaagttagttttagatggaacctataaaaataaa
aaagtgattggcattacttggaacagcagctattttataaataatggatgtttatattat
gaagcatatgatgatgactatctccataaggttgatttacagtcacttacaaatactaaa
atattaacagtatctgattattatgtaactagttatagtaattatttattctataaagat
tccaataatctttatagaacagatctaaatggtggaaattcaaaacttattgtaaataat
attacagataattttattgatatattcgaaaattatatctactataatgacagtaataat
atttggtataagatgaatcttgatggaagcaatttaataaaattaatgttttaa
DBGET
integrated database retrieval system