Ruminiclostridium cellulolyticum: Ccel_0277
Help
Entry
Ccel_0277 CDS
T00835
Name
(GenBank) Fibronectin type III domain protein
Organism
cce
Ruminiclostridium cellulolyticum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
fn3
Pur_ac_phosph_N
SLH
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACL74664
UniProt:
B8I584
LinkDB
All DBs
Position
311987..315943
Genome browser
AA seq
1318 aa
AA seq
DB search
MKTKRIFAALILLIFFITTYGTVYAAPIDVPIPAAPTQLVIPKIIPSTEPSIGYDSADGG
KSGYYADIQWQVPNPMGKFVNIYLQESPKEYRTARPTYLKEKDLPAGTTPIRMRDLTSGT
VYTASSKAYATDVDPVTGQVYKSGESDSSNLVKFMTDINIQCITSGTNKIKIIWDDVWND
GKRINYQLYVSENRDFANTLPITVTQEQISKSGPVYVNQSDGTLEYEHTVKDPGRVYYVK
IVPVISDQSIIKTSQTKTILVSTYILVKTSRVSTTDDGTIWRLDWSPVITGLSSSNITVQ
YQINRFEADNMPKIIMVETGTTTFITVPEGQENSYMIRAIVKKDGLPYYPSNIDIVSDKV
TLKESDVPATPSAPELVSQFKDSTDSVIIAYEDVKDINGVVIKKGELGKDTATILWRLPK
KADGTIDSDVMYDLWLLEDSNLIDDPPVETKIQTNLKPGTPNFVKDESNNGKVIGYKYKI
ENLQPNHTYYFRIAAKKTFAEEKEGIIQNVEHISTPALKVIVTLPGGFIDTPLIPSNPPL
QIRKQEDGIKDMITDTSVTIQLKNRWFERFDPNTGIWSYIQADKTSMSDTPPYNPQTTPP
DNQNYRKVEYDPGVTLYVGCTEYTSGIDISAINTYKLEKVSTTPNDDLEDMYLNVPENVP
VPASGTPVYAKHNVVVPVKNLKPNTTYILWVRASRDGNPPLFSDISNPIIFTTLPTPSDT
IEKPVVPDLRSTNVSDTFADLAWNYKEQNTYYIKYGTVDDITKAQGSLTVTGAQIKNSGL
DYVRITGLTADTQYYFWIQAEAFNSSLSASEKSEWSDSLPLRTLKLMPPSTPRGFGVKNT
ADAVTKNSITFEWIQEPGLTYILEIAGKIDYSDAKVYECGSVTEFKVEGLTSNFRYYARL
YAYDPNKKLRSLPTQSISVRTLRSSDDYDSDQDVDHPITGDVIEKAPTIVNGTWVVKITG
VNADRLVQIMMTDNILDYTVDISKPPAPATNISLMISKKVFDKLDQLKENIAFKTAVVTY
NLKAGILSNVNTADTKKEQIYTFNIALAPQKPSARANELILRQPLAQMGVTLDTGASIMT
ISGFDRPLIISYPYTNSKDYVEGQTLGYRYNGVTSSWEQKATSNRFDVDNRKGTISFQSA
VPGLFALADRTNNLFDDIYGHIYEDAILNVAMAHKLKSITSRMFNPDKAATAGEAVKLAF
DSLEYSYGSNYMDLAAKTGLAKVGKTASAVLTRQDAACLAAVLYEMKTNTRVNGNKDVIS
TYKDYSKIDKTLLNKVAFAAENGFLPYQSSTLFNPTQSVTRGELMYMLEKALVLAGDI
NT seq
3957 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagacaaaaaggatatttgcagcactaatattgctgatatttttcataacaacatat
ggaacggtatatgcggcacccattgatgtacctataccggctgcacccacacagctggtg
attccgaaaattattccaagtacggaacccagcatagggtacgattcagcggacggagga
aagtcaggctattatgcagacattcagtggcaggttccaaatccaatgggtaagtttgta
aacatatatttacaggaatctccaaaagaatacagaactgccagaccgacatatttaaag
gaaaaagatcttccggcagggacaacccctatcaggatgagagaccttacatcaggaacg
gtttatactgcaagctcaaaggcttatgctactgatgtagaccctgtaacgggacaggtt
tataaatctggcgagtcagacagctctaacctggtaaagttcatgacagatatcaacata
caatgtattacatcgggaaccaataagataaaaataatttgggatgatgtatggaatgat
gggaaaagaataaattaccaactatatgtatcagaaaacagggattttgccaataccctt
cccataacagttactcaggagcagattagcaaatccgggcctgtgtacgttaatcagtct
gatggaacactggaatatgagcatactgtaaaagatccgggtagagtgtactatgtcaaa
attgttccagttatttccgaccagtcaattatcaaaacgtcacaaacaaaaaccattctg
gtcagtacatatatactggtaaaaacatcaagggtctcaacaacagatgacggtacaata
tggagacttgattggagtcccgttataacaggattatcatcgtccaatataactgtacaa
tatcagataaataggtttgaagcggataacatgccaaagattataatggtggaaacaggc
actactacctttattacagttcccgaaggacaggaaaacagctacatgataagggcaatc
gtaaagaaggatgggctgccctattaccccagcaacatagatatagtttcagacaaggtt
accctgaaggagagcgatgttccggcaacaccttcggcaccggaattggtatctcagttc
aaggattcaaccgattcagttataatagcatatgaagatgtcaaggatatcaacggggta
gtcataaaaaaaggtgaacttggaaaggatacggctacaatattatggcgtttgcctaaa
aaggctgatggaacaatagactcggatgttatgtatgacttatggctattggaggattca
aatttaattgatgatcccccagtggaaacaaagatacaaacgaacttaaagccgggaacc
cctaacttcgtaaaggatgaatcaaataacggaaaagtaataggctacaaatataaaatt
gaaaaccttcagccaaaccatacatattatttcagaatagcagcgaagaaaacctttgca
gaggaaaaggaaggaatcattcagaatgttgagcatatttccacccctgcactaaaggta
attgttacactgccgggagggttcatagacaccccgttgataccgtcaaatccgccgctt
cagataagaaagcaggaggacggaattaaggacatgattaccgatacaagcgtaacaatc
cagttgaagaacaggtggtttgagcggtttgatcctaataccgggatatggtcctatata
caggcagataaaacatctatgtcagatacaccgccatataatccgcaaacaacaccgccg
gataatcagaattacagaaaagttgaatatgatccgggggtaactctgtacgtgggttgt
actgaatatacttcgggaattgatatatcggcaataaatacatacaaactggaaaaagtg
tcaacaactccaaatgatgatttggaggacatgtacctcaatgtacctgaaaatgtacct
gttccagcttcgggtactcctgtttatgcaaagcataacgttgtagtacctgttaagaac
ttaaaaccgaataccacatacatactgtgggtgagagcatccagagacggtaatccgcca
ttgttttcggatatttccaacccaataatttttaccacactccccacgccgagcgatact
atagaaaagcctgtggttcctgacctgcggtctacgaatgtttcggatacatttgccgat
ttggcatggaattacaaggagcaaaacacttattacattaaatatggtaccgtagacgat
attacaaaagcacaaggttctttaactgttacgggagcacaaataaaaaattccggcctt
gactatgtaaggataacaggacttacagctgacacacagtattacttctggattcaggca
gaagcctttaattccagcttgtcagccagtgaaaagtcagagtggagcgattcactgcct
ttgaggacattaaagctaatgcctccctcaacaccaagaggctttggagttaagaatact
gcggatgcagtgaccaagaacagtataacctttgaatggattcaggaaccgggacttacg
tatatacttgaaattgcggggaaaatagactattccgatgcaaaggtatacgagtgcgga
agtgttactgaattcaaggttgaaggacttacatctaacttcagatattatgcacgactt
tatgcatatgaccccaataaaaagctccgctcattgcctacacagagtatcagtgtaaga
acgttaaggagcagtgacgactatgattccgatcaggatgtagaccatccgattacaggg
gatgtcatagaaaaggcaccgaccattgtaaacggcacatgggtggttaaaataaccgga
gtaaacgctgatagactggtacagataatgatgactgacaatatacttgactacactgtt
gatatatccaagccaccggcacctgcaaccaatatttcactaatgatatccaaaaaggtg
tttgataagctggatcagttaaaagagaacatagcctttaaaacagcggttgttacatat
aatctgaaagcaggaatactttcaaacgttaatactgcggatactaaaaaggagcagata
tatacctttaatattgcacttgcacctcagaaaccttctgcccgggcaaatgaacttata
cttaggcagcccctggcacagatgggggttacacttgataccggtgcaagcatcatgact
atatccgggtttgacagaccgttgataatcagctatccttatacaaactcaaaggattat
gttgaaggacagacgttaggataccgttataacggtgtaacaagcagctgggagcaaaaa
gccacgtcaaacaggtttgacgtagacaacagaaagggtacaataagcttccaatcagca
gtccccggactttttgcactagctgacagaaccaataatttgtttgatgacatatatggg
catatatatgaagacgctatacttaatgttgcgatggctcataagcttaaaagcataacc
agccgaatgttcaatcctgacaaggccgcaacagcaggggaagctgtcaaactggcattt
gacagccttgagtatagctacggcagtaactacatggatctggcggcaaagacaggctta
gctaaggtaggaaaaacagcatcggcagtactcaccagacaggatgcggcatgtttggcg
gctgtattatatgaaatgaaaacaaatacaagagttaacggaaacaaggacgtaatctct
acatataaagactatagcaagatagacaagacactcctcaacaaagttgcttttgctgct
gaaaatgggttcttgccctatcaatcatccacactatttaaccccacccaaagcgttaca
aggggtgaactgatgtatatgctggaaaaggcattagtacttgccggagacatataa
DBGET
integrated database retrieval system
