Caldisphaera lagunensis: Calag_0719
Help
Entry
Calag_0719 CDS
T02380
Name
(GenBank) alpha-amylase/alpha-mannosidase
Organism
clg
Caldisphaera lagunensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF3536
Glyco_hydro_57
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFZ70464
UniProt:
L0AAL0
LinkDB
All DBs
Position
complement(705820..708228)
Genome browser
AA seq
802 aa
AA seq
DB search
MTNNEKYISIFGHFYQPPRFNPWTLEIDLDISSRPYHDWNDKITIESYLSNAYARLKNDD
LIEDIVNNYEKITFSFGPLLLSYLKNKYNKLYNLIIEADKESASKFSGHGNAIAQPYAHI
ILPLSTKQNKERAIYWGIKYFEKTYDRYPEGFWLPEAAVDNQTLEILSNYGIKFVILSPH
QAKSIKSGSEFIEVNEKKLNTKITYRAILPSGNNIGVIFYNRWLSGLVAFGEILKSGELF
ARKLIESFDNSDSPQLVSIATDGETYGHHKPKGEEELAKALSIIESNGINITNYSYYFST
YGPRLDVIINENTSWSCPHGIERWRSNCGCASEIRPGWNQEWRVPLRKSIDWLSDIVEDV
IQKLGQQVSTDINNAILDYIDVMYNYDAEKVSTFIDKYVIKENENNTINFLKLMELVKNS
ILMQSSDAWFFEDIYRPEPIQSLKFAKRVIQLIEDLSNTKIEDKFLEILKDAKSNDQRYG
NGKDIYEREVIPSFMPPEKIGASFAMRLLFKNYPNENDYYSYKIIIGPYKRYELGRARAI
NGIATLISKITWRSTPIVFSSIYYGWYNLHSGAKILMDQKSYFELDKNMEELFSKGLLPD
IIDLIQKTFYPNYYNLNNLLKDDQKFVMDHVLESAIEELSKHYEILYNNYLPVMEYVKSL
NLNYPKVFEILLQYELEKSFLEMLESEFIDFNKLGQVIQWSKNLEVKIDDLVHSILRNRI
EKEIDNLIDNPKDINSISTLQQLLEISMELNVPIEYLWEAQNKFIYLRNRILRPIISSKE
DMDKTFINSYKLISNNLKVKFP
NT seq
2409 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaccaataatgaaaagtatatatcaatatttggccatttttatcaaccacctcgtttc
aacccttggactttagaaattgatttagatatatcatctaggccttaccatgattggaat
gataaaataaccatagaatcatatctttctaatgcatatgcaagacttaaaaatgatgat
ctaatcgaagatatagttaacaactatgaaaaaattactttttcatttggcccgttgctt
ctttcatatttaaagaataaatataataagttgtacaatttaattattgaagctgataag
gaatcagcatctaaattttctggtcatggaaacgcgatagctcaaccttatgctcatata
atacttcctttatcaacgaaacaaaataaggaaagagccatatactggggcataaaatac
tttgaaaaaacctacgatagatatccagaaggtttttggttaccagaagctgctgtagac
aaccaaacattagaaattctttctaattatggaataaaatttgttattttaagtcctcat
caggctaaatctataaaatccggatctgagttcatagaagttaatgagaaaaagcttaat
actaaaataacttatagagctatattaccttcaggaaataatataggggtaatattttat
aatagatggctatccggtttggtagcttttggtgaaatcctaaaaagcggagaacttttt
gcgagaaagctcattgagtcttttgataattctgattcaccacaactagtaagcattgca
acagatggagaaacttatggacatcataagccaaagggagaagaagaacttgcaaaagct
ttatcaattatagaatcaaatggtattaacataactaactatagctattatttttcaaca
tatgggccccgattagatgtaattataaatgaaaatacttcgtggagttgtccacatggc
atagaaaggtggagatcaaattgtggatgcgcatcagaaataaggcctggatggaatcaa
gaatggagagttccattaagaaaatctatagattggttaagtgatattgttgaggatgta
attcaaaaattaggccaacaagtttctactgatataaataatgctatacttgattatatt
gatgttatgtataactacgatgccgaaaaagtttctacctttatagataaatatgttata
aaagagaatgaaaacaatacaattaattttttgaaacttatggaactggtaaaaaattct
atattaatgcaatcaagcgatgcatggttctttgaagatatatataggccagaacccata
cagtcactaaaattcgcaaaaagagtaatacaattaattgaagatctatcaaacacaaaa
atagaagacaaattcttggaaattttaaaggatgcaaaatcaaatgatcaaagatatgga
aatggtaaagatatatatgaaagagaagttataccatcgtttatgcctcctgaaaaaatt
ggagcaagctttgcaatgagactactttttaagaattatccaaatgaaaacgattattat
tcatataaaataattattggtccatacaaaagatatgaacttggaagagcaagggctatt
aatggaatagcaacattaatatctaaaataacgtggagaagcaccccaatagtgttttct
tcaatatattatggttggtataatttacattctggtgcaaaaattcttatggatcaaaaa
tcttattttgaattagacaaaaacatggaagaattattcagcaaaggtctgcttcccgat
ataattgatttaatacaaaaaaccttttatcctaattattataatttaaataacttatta
aaggatgatcagaaatttgttatggatcacgtattagaatctgcaattgaagagctttca
aaacactatgaaattttatataataattatctccccgttatggaatatgttaaaagcctt
aatctaaactatcctaaagtatttgaaatcttattacaatacgaattagaaaaatctttt
ttagagatgctggaatccgaatttatagattttaataaattgggacaagtaattcaatgg
tctaaaaatttagaagttaaaatagatgatttagttcatagtattcttagaaataggata
gaaaaagaaattgataacctaattgacaatcctaaagacataaactctataagcacttta
caacagttattagagatttcaatggaattaaatgtcccaattgaatacctttgggaagcg
caaaacaaatttatttatttaagaaacagaatattgagacctataatttcatcaaaggaa
gatatggataagacctttattaattcatataagcttatttctaataatttaaaagttaaa
ttcccataa
DBGET
integrated database retrieval system
