Colwellia sp. MT41: CMT41_17920
Help
Entry
CMT41_17920 CDS
T04159
Name
(GenBank) RNA-binding transcriptional accessory protein
KO
K06959
protein Tex
Organism
com
Colwellia sp. MT41
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
com00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09192 Unclassified: genetic information processing
99973 Transcription
CMT41_17920
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Tex_N
Tex_YqgF
HHH_3
HHH_9
S1
YqgF
HHH_7
RuvX
CRS1_YhbY
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALO36410
UniProt:
A0A0S2JK83
LinkDB
All DBs
Position
complement(4222410..4224788)
Genome browser
AA seq
792 aa
AA seq
DB search
MLTIAEQIAQELNVNAVQINAAITLLDDGSTVPFIARYRKEVTQGLDDNHLRHLAQRLSY
LRELEDRRQVILTSIKQQDKLSAELEKSIQQADNKTRLEDLYLPYKPKRRTKGKIASEAG
ITPLANKLFNNWQLSPEQEAKAFINEAAGFAEVKAVLEGASYILAERFSEDANLLAKLRR
HLLKQAHLTSKLVKGQDKAAAKFRDYFEHSEKLRTVPSHRMLAMLRGRNEGFLQLNIDVD
PGQDARACSSAEHIISEHLTLRLTKQAGAEFLTKVVQLTWKAKLSISLTNELLSSLREQA
ETQAIDVFSNNLADLLMAAPAGPQVTLGLDPGLRTGCKIAIVDGTGKLLYTTTIFPHVPQ
KHWDKSVRTLVSICRQHKVELVAIGNGTGSRESDKLVAEVIQNFKDDESKLTLTKMIVSE
AGASVYSASEFAANEFPDLDVSLRGAVSIARRLQDPLAELVKIDPKAIGVGQYQHDVSQS
QLSKTLDDVVEDCVNAVGVDLNSASAALLTRVSGLNKTMANNIVAFRDSHGRFTNRKQLK
KVARLGPKAYEQAAGFLRITDGDNPLDQSALHPESYALVEKIIKQLQLNVTEVLNNSSQL
KALDISQLTNDDFGEVTVKGIIEELAKPKRDPRPEFKTASFAEGVHTMADLIPGMILEGV
VSNVANFGAFVDIGVHQDGLVHISSITDKFISDPREIVKAGEIVKVKVLEVDAARKRISL
TMRLDEQTNARVNKPYQVKDSGKRDNNKTKNQQNSSHNQKKPSATQNKSKVKKGDNAAMG
NAFADAFAKFKK
NT seq
2379 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttaactattgccgagcaaattgctcaagaactcaatgttaacgcggtacaaattaat
gccgctattaccttacttgatgatggctctaccgtgccatttattgcccgttaccgtaaa
gaagtcacccaagggttagacgataatcatttgcgtcatttagcacagcggttaagttat
ttacgggaactagaggatcgccgtcaggtgattttaaccagtatcaagcagcaagataag
cttagcgctgagctggaaaaatcaattcagcaagccgataataaaactcgtttagaagac
ttatatttaccctataagccaaagcgccgtactaaaggcaagatagccagtgaggccggt
atcacgcctttggcgaataaactattcaataactggcaactttctcctgagcaggaagct
aaagcttttataaatgaggcggctggttttgccgaggtaaaagcggtacttgagggggcg
agttatattttagccgaacgttttagcgaagatgccaatttattagcaaagctgcgtcgt
cacttattaaaacaggcgcacttaaccagcaagcttgttaagggccaagataaagccgcc
gcaaaatttcgtgattactttgagcatagtgagaaactgagaactgtaccttcacatcga
atgttagcgatgttacgtggtaggaatgaaggttttttacagcttaatattgatgtcgat
cccggacaagatgccagggcatgtagtagcgcagaacacattattagtgagcacttaacg
ttgcggttaactaaacaagcaggtgctgaattcttaaccaaggtagtgcaattaacttgg
aaagctaaattaagtatcagtttaactaatgaattactcagtagtttacgcgagcaagca
gaaacacaagcgatcgatgttttctctaataaccttgctgatttgttaatggctgcacca
gctggaccacaagtgactcttggcttggatccgggtttaagaaccggttgtaaaattgcc
attgttgatggcaccggaaaattattatacaccaccactatattcccgcatgtgccacaa
aaacactgggataaatccgtgcgcaccctagtcagtatttgtcgccaacataaagtagag
ctagtggctattggtaatggcactggttcacgtgaaagtgacaaattagttgccgaggtt
atacaaaactttaaagacgatgaaagtaaattaacactcactaaaatgattgttagtgag
gccggcgcctctgtttattctgcctctgaatttgctgccaatgaatttcctgacctagat
gtatcattacgtggcgcagtttctattgcccgacgattacaagatcccttggctgaatta
gtaaaaattgacccgaaagcaataggggttggccaatatcagcatgatgtcagtcagagt
cagctgagtaaaacccttgacgatgtcgttgaagattgtgttaatgctgttggtgttgac
ttaaacagtgcgtcagcagcgttattgacacgtgtttcagggttaaacaaaactatggct
aataacattgttgcttttcgagatagccacgggcgttttactaatagaaaacaattgaaa
aaagttgcccgcttagggccaaaagcttatgagcaagcagccggttttttacgtattact
gacggagataacccgttagatcagtcggccttacatccggaaagttatgccttggtagag
aaaattatcaaacaattacaactgaatgtaactgaggtactaaataacagttcacaatta
aaagcgttagatataagtcagttaacaaatgatgactttggtgaagtcacggtcaaggga
attattgaagagctagcaaaaccaaagagagatccgcgccctgagtttaaaaccgcgagt
tttgctgaaggcgttcatactatggcagacttaatcccaggcatgatacttgagggtgtg
gtctctaatgtggctaatttcggtgcttttgttgatattggtgtacaccaagacggttta
gtacatatttcatcaataactgataagtttattagtgacccacgtgaaattgtcaaggcg
ggggaaattgttaaggtaaaagtgttagaagttgatgcggctcgtaagcgtatcagttta
accatgcgattggatgagcaaactaatgcccgagttaacaagccttatcaagttaaggat
agtggcaagcgtgataacaataaaacgaaaaatcagcaaaacagtagccataatcaaaaa
aaaccatcagcaacgcaaaataaatcgaaagttaaaaaaggtgataatgccgctatgggt
aacgctttcgccgatgcttttgctaagtttaagaaataa
DBGET
integrated database retrieval system