Clostridium perfringens 13: CPE0980
Help
Entry
CPE0980 CDS
T00074
Name
(GenBank) probable transcriptional regulator
Organism
cpe
Clostridium perfringens 13
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HTH_18
HTH_AraC
AraC_binding
Cupin_2
MannoseP_isomer
AraC_binding_2
EutQ
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAB80686
UniProt:
Q8XLR1
LinkDB
All DBs
Position
complement(1180337..1181155)
Genome browser
AA seq
272 aa
AA seq
DB search
MSNYIYENHFHSDPNFPVIFHCDILNKNRPSFLMHYHENIELLYFLDGHAKVVCDNKILQ
AKADDIIIINSKELHSIEKISDSCKYYCLIIDKDLLNDNLNDFDNFRFKNLVKDSFLKTK
IEEINRELNNKNDYFKEFIKSDILQILIHIKRNHAQKNSSLIKIKDNNKILMVREIINYL
KENYKEEISIDHICNHVAFSKYYTCRTFKEVTGQTILDHINHIRCINARNLILYNGYTIS
ESAYKSGFNNLSYFSKTYKKYMGLLPSEEKIT
NT seq
819 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtaattacatatatgaaaatcactttcatagtgatcctaatttcccagtaatattt
cattgtgatattttaaataaaaatagacctagttttttgatgcattatcatgaaaatata
gaacttctctacttcttagatggacatgctaaggttgtttgtgataataaaatacttcaa
gctaaagctgatgatattataataattaattcaaaggaacttcattccatagaaaaaata
tctgattcctgtaaatattactgccttattatagataaagatttacttaatgataattta
aatgattttgataattttagatttaaaaacttagttaaagattcctttttaaagaccaag
attgaggaaataaatagagaattaaataataaaaatgattattttaaagaatttataaaa
tcagatatacttcaaattttaattcatattaagagaaaccatgctcaaaaaaactcatca
ttaataaaaataaaagataataataaaatactaatggtaagagaaataataaactatcta
aaagaaaactataaagaagaaatttcaatcgatcatatatgtaaccatgttgcttttagt
aaatattatacctgtcgtacctttaaggaggtaacagggcaaactattttagatcatatt
aatcatattagatgtattaatgctagaaatttaatcctctataatggatatactatatct
gaaagtgcttataaaagcggttttaataacttatcttatttttcaaaaacctataaaaaa
tatatgggattacttccatctgaagaaaaaattacataa
DBGET
integrated database retrieval system