Cyanobacterium stanieri: Cyast_2108
Help
Entry
Cyast_2108 CDS
T02377
Name
(GenBank) Tetratricopeptide TPR_1 repeat-containing protein
Organism
csn
Cyanobacterium stanieri
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TPR_12
CHAT
TPR_10
TPR_7
TPR_2
TPR_1
TPR_8
TPR_MalT
TPR_16
TPR_19
TPR_17
SNAP
DUF2225
SPO22
SHPRH_helical-1st
MIT
ComR_TPR
CLZ
FlaC_arch
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFZ48058
UniProt:
K9YPM4
LinkDB
All DBs
Position
2334580..2337534
Genome browser
AA seq
984 aa
AA seq
DB search
MNTKNITLHLVILASLSLWNVSPCRGINLKDQISPQFLDSKRSQDILIAQNQENDPFAIP
RMLNTQGIRLFNEGKYEQAIMMIEKALSMTREIFGDKHLYTATIINNLGSVYHQIGAYDR
AENLYQESLNIRKELVEENHISLARSYNNLATLYSDQGDYQRAKPLFQQALSIFQENQGN
QHPETLTIINNLAILHQELEDYQQAESFFYIALATRMEILGINHPETLQTLNDLGTLYRI
QGNYADAEEIMQQALEIARELFDETDYQLAIVLNNLALLRTNQNYYQEAESLYEQALNIT
RQVLGNNHDRTASLLNNLGMNYVYQGKYPPAQQALTEAVTILEQVFGEKHPSVGVTLNNL
GLLHTRQGNFQEAELVHTKSLELSREIFGHRHIQTRNSLHNLAGLYWADNRLPLAVDYLT
QSMDIEEEKISYFLHNIGDESRKQAYMESLYISTNWAMDLHLNFMADDHRARELAINTIL
RRKGRVLDVVSNMMATLQNSENPTIEALFEDLAQRRSELALMTFQGVGEGNLRLYQERVN
RLELEIRSLETDLSNLSAEFEMINQEIDWQGVQKKIPDGALLLEYMVYTPFDVESHGWKS
TRYGVYVMGNDGLPQGIDLGETQEIDELISQWRDYLGWATFHGDEELLRQEMLAELAPRL
YELIFEPLLPWMEGNEQILIAPDSQLNLIPFAALQDGEGRYLLEDYSISYLTSGRDLLRL
QNQWESQSPAVMVGNPSYDLHSPDGLIFRGGSGQRSFDLRGLAGCCEALPGTAEEVRAIA
PLFENVRIYVEDEALAKNIVNVQGPEILHLATHGFFLPDVSMELPDNLGFGNEQTPISGT
ENPLLRSGLAFAGFNPATNQLEGALTALDISSLNLWGTQLVTLSACQTGVGEVRNGEGVY
GLRRALVLAGAQTQVMSLWNVDDMATKHLMVNYYQRLSNGEGRSQALRQVQLEMLNSPNY
NSPYYWSAFTLSGNWHNVPSSSEI
NT seq
2955 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatacaaaaaatataacccttcaccttgttatcctcgcttccctaagtctttggaat
gtgtcaccctgccgaggaataaatttgaaagatcaaatttcgccacaatttcttgatagt
aaacgatcccaagatattttgatcgcccaaaatcaagaaaatgatccctttgccattccc
cgaatgctcaacactcaggggataagattatttaacgagggaaaatatgaacaagccata
atgatgatagaaaaagccctctccatgactagagaaatatttggagataaacacctatac
accgccacaatcatcaataacttagggtcagtttatcatcaaataggagcctacgatcgc
gccgaaaacctatatcaagaatccttaaacatcagaaaagaattagtagaagaaaatcat
atttcccttgctcgctcctataataaccttgcaaccttatactcagaccaaggagattat
caaagagcaaagcctttatttcaacaagccttaagcatattccaagaaaaccaaggtaat
cagcatcctgaaacccttaccataattaataatttagcgattctccaccaagaattagaa
gactatcaacaggcagaatcttttttttatatagccctcgctactcgtatggaaatttta
ggcattaatcaccctgaaaccctacaaaccctcaatgatttaggtactttatatcgaatt
caaggaaactacgcagatgctgaagagattatgcaacaggcgttggaaattgcgagggaa
ttatttgatgaaactgattatcaacttgccattgttttaaataatttagctttattacgt
acaaatcaaaactactatcaagaagcagaatccctttatgaacaagccctaaatattacg
agacaagtattggggaataaccatgatcgaacagcctctttattaaataatttaggtatg
aactatgtttatcagggtaaatatccccctgcccaacaggcactgacagaagcagtgaca
attcttgagcaggtatttggtgaaaaacatccgagtgttggtgttaccctcaacaattta
ggtttgttacatacccgtcagggcaattttcaggaagccgaattagtccatactaaatct
ttagagttaagcagggaaatttttggtcatagacacattcaaacccgtaatagtttacat
aatttggcgggattatattgggcagataatcgtttacctcttgcggtggattatctaact
cagagtatggatattgaggaagagaagatcagttattttctccataatattggtgatgaa
tcccgtaaacaagcatatatggaaagtctgtatatttccacaaattgggcgatggattta
catctaaattttatggcagatgatcatcgggcgagagagttagctataaatactatttta
agacgtaaaggtcgtgttttggatgtcgtcagtaatatgatggcgactttacaaaactca
gaaaatcccaccattgaggctttatttgaagatttggcacaaaggaggagtgaattggct
ttgatgacttttcagggggtaggggaaggtaatctgagactttatcaggaaagggtgaat
cggttggagctagaaattcgtagtttggaaacggatttatccaatcttagtgcggaattt
gaaatgattaatcaggagattgattggcaaggggtacagaagaaaattcctgatggggcg
cttttgttggaatatatggtttatactccttttgatgtggaatcccatggctggaagtct
acccgttatggggtgtatgtaatgggtaatgatggtttaccccaagggattgatttaggg
gaaacacaggagattgacgagttgatttcccagtggcgagattatctaggctgggcaact
ttccatggggatgaggagttattacggcaggaaatgttggcggagttggccccaaggtta
tatgaattaatttttgagcctcttttgccttggatggaagggaatgagcagattttgatt
gctcctgatagtcagttaaatttaattccttttgcggcattgcaggatggggaggggcgt
tatttgttggaggattattctattagttatctcaccagtggtagggatttgttacggttg
caaaatcaatgggaatctcaatctcctgcggtgatggtgggtaatcctagttatgattta
cattcccctgatgggctgatttttcggggaggaagtgggcaacgttcttttgatttgcga
ggtttggctggttgttgtgaggctttaccgggtacggcggaggaggtaagggcgatcgca
cctttgtttgaaaatgtaaggatatatgtggaggatgaagcgttagcaaagaatattgta
aatgtccaagggcctgaaatattacatctggctacccatggtttctttttgcctgatgta
tctatggagttacctgataatctgggttttggcaatgagcaaactcctataagtggcaca
gaaaatcccctgttacgctcaggattagcgtttgctggatttaaccccgctaccaatcaa
ctcgaaggggcgctcacggctttggatatttctagtttgaatctttggggtactcaattg
gttactctatctgcctgtcagacaggggtgggggaggtgaggaatggtgaaggggtatat
ggtttacgaagggctttggtattggcaggggcgcaaacccaagtgatgagtctttggaat
gtggatgatatggcaactaaacacttgatggttaattattatcaacgtttgagtaatggg
gaagggcgatcacaggcactccgtcaagtacaattagaaatgttgaatagtcctaactat
aatagtccttattattggtctgcttttactctctcagggaattggcataatgtcccatcg
tcttctgaaatataa
DBGET
integrated database retrieval system
