Daucus carota (carrot): 108204381
Help
Entry
108204381 CDS
T05350
Name
(RefSeq) vacuolar-sorting receptor 6-like
Organism
dcr
Daucus carota (carrot)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PA
cEGF
EGF_CA
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
108204381
NCBI-ProteinID:
XP_017229269
LinkDB
All DBs
Position
1:41642215..41648767
Genome browser
AA seq
629 aa
AA seq
DB search
MSRSLLGVLFCVVLVSVNGRFVVEKESIRVLSPYKLRSKHDAAIGNFGVPEYGGSMVGSM
VYSHQNSYACKPFDEEKKQPFKTNSTRLHILIVDRGECFFALKVWNAQQAGAAAVLVTDD
RDEPLITMESPGESADADGYIDKIGIPSALIDRSFGETLKAAVQKAEEDVVIKLDWRESM
PNPDQRVEYEFWTNSNDECGIRCDEQMNFVKDFKGHAQILEKGGYTMFTPHYITWFCPAP
FILSDQCKSQCINHGRYCAPDPEKNFGTGYQGKDVVFENLRQLCVHRVANESNKSWVWWD
FVTDFHIRCSMKEKRYSKECAEDVLKSLNLPIEKIKDCMGDPEADVENDVLKIEQDRQVG
RGSRGDVTILPTLVINDVQYRGKLERTAVLKALCAGFQETTEPPICLSGDMETNQCLERN
GGCWRDSKSNITACKDTFRGRVCECPVANGVQYKGDGYMSCEAFGPGRCAINSGGCWSET
KYGQTLSACSDSDITGCRCPHGFQGDGHKCEDINECSEGLACQCEGCSCKNTWGGYGCKC
KGEKLYIMEQDTCIERNSTKFGWFLALLILGAVVSAAFAGYIFYKYRFRSYMDSEVMAIM
SQYMPLDSQHHNQVTQHENGSLRQGSSGV
NT seq
1890 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaagaagcttgctgggtgttctcttttgtgtcgttttggtgagtgtgaatgggaga
tttgtggtggagaaagagagcataagagtgctctcgccttataagctgaggtcgaagcat
gatgctgctattggtaactttggagttcctgaatatggaggttctatggtggggtccatg
gtgtattctcatcagaattcttatgcgtgcaagccttttgatgaggaaaaaaagcagccc
tttaagaccaactctactagactccacattcttattgttgatcgtggagagtgcttcttt
gctttgaaggtttggaatgcgcaacaagcaggtgctgcagctgttttggtgactgacgac
agagatgagcctctcataactatggagtctccaggagaaagtgctgacgcagatggctat
attgacaagattggaatcccatcagctttaattgatcgatcgtttggtgagacgttgaaa
gctgctgtacagaaagctgaagaagatgtagttattaaattggactggagagagtcaatg
cccaacccggatcagagggttgagtatgaattttggactaacagcaatgatgagtgtgga
attcgctgtgatgagcaaatgaattttgtcaaggacttcaaaggacatgcacagattctt
gaaaagggcggttacaccatgtttacaccacattatataacatggttttgtcctgcgcct
ttcattctgagcgaccagtgcaagtctcagtgcataaaccatgggagatattgtgcacct
gatccagaaaagaattttgggacggggtatcaaggaaaagatgtggtattcgagaacttg
agacagctttgtgtacacagggttgctaacgagagcaacaaatcttgggtttggtgggat
tttgtgacagattttcacattaggtgctcaatgaaggaaaagaggtatagcaaagaatgt
gctgaggatgtcttgaagtccttaaatctgccaattgagaagataaaagattgcatgggt
gaccctgaagctgatgttgaaaatgatgtcctaaaaattgagcaagatcggcaggttgga
cgaggatctcgtggcgatgttactatcttaccgacattagtcattaacgatgttcagtat
agagggaaacttgagagaactgctgtgctgaaggccttatgtgctggatttcaggagact
actgagcctccaatttgtttaagtggagatatggagaccaatcagtgccttgagaggaat
ggtggttgctggcgagactcaaaatctaatataactgcttgcaaggacacgtttagagga
agagtatgtgagtgtcccgtggccaatggggtgcaatataaaggcgatggatacatgtct
tgtgaagcctttggacccggaaggtgtgcaataaacagtgggggttgctggtcagaaact
aaatacggacaaacgctttcagcttgctcagattccgatataacaggctgtcgatgccca
catggttttcagggggatggccataaatgtgaagatattaatgaatgctcagaaggtctt
gcttgtcaatgtgagggctgttcctgcaagaatacgtggggtggatatggctgcaagtgc
aagggggagaaactttatataatggagcaagacacatgtattgaaagaaattctacaaaa
tttggatggttcctagccttgttgatcttaggggcagttgtttctgctgcttttgctggc
tatatcttctacaaatataggttccggtcttatatggactccgaggtaatggccattatg
tctcagtacatgccacttgacagtcagcatcataaccaagtcactcaacatgaaaatggg
tccctacgacaaggcagctccggcgtataa
DBGET
integrated database retrieval system