Daucus carota (carrot): 108224644
Help
Entry
108224644 CDS
T05350
Name
(RefSeq) nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form-like
Organism
dcr
Daucus carota (carrot)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
108224644
NCBI-ProteinID:
XP_017254819
LinkDB
All DBs
Position
1:47386497..47403575
Genome browser
AA seq
2421 aa
AA seq
DB search
MKPSLPTLFLVVLCATALVPQGESQYEEEKLFFRRPWPFFKFPFQHYRLPHYPMLPHYPM
LPHYPVPMKKPAISGECIKAKLALSDCVKEKLVSTWYSKPLVKDCCDPIFNHKKSCPGFI
VMIDEHLIPQYIKYACHAHVHPSSCSSSISCSPPNTFCSCPPSVPFQRPSRWSSCPASLP
FQRPSRWSSCPPSVPFQRPSRWSSCPPSVPFQRPSRWSSCPPSVPFQRPPPAHPPSPSNG
SSPSPPAHPPSPSNGSSTSPPPHPPSPCNGSSTSPPTHHTSPSNGSSPSPPSHHPTPSNS
LPVHPPSPSKGPPASPPAHPPSPSNGPPASPPAHPPSPSKGPPASPPAHPPSPSKGPPAH
TPSPSNGSSPSPPAHPPSPSNGSSTSPPTHPPSPCNGSSTSPPTHHSSPSNGSSPSPPSH
HPTPSNSLPVHPPSPSKGPPASPPAHPPSPSNGPPAHPPSPSNGSSPSPPAHPPSPSNGS
STSPPAHPSSPCNGSSTSPSAHPPSPSNGSSTSPPAHPPSPSNGSTNILPIHPPSPSKGP
PAHPPTPSHSLPVHPPSPSKGPPSSPSKGPPASPPAHPPSPSNGSSTSPPAHPPSPCNGS
STSPSAHPPSPSNGSSTSPPAHPPSPSNGSTNILPIHPPSPSKGPPAHPPTPSHSLPVHP
PSPSKGPPSSPSKGPPASPPAHPPSPSNGSSTSPPAHPPSPCNGSSTSPPAHPPSPSNGS
STSPPAHPPSPSNGSTNILPIHPPSPSKGPPAHPPTPSHSLPVHPPSPSKGPPSSPSKGP
PASPPAHPPSPSNGSSTSPPAHPPSPCNGSSTSPPAHPPSPSNGSSTSPPAHPPSPSNGS
TNILPIHPPSPSKGPPAHPPTPSHSLPVHPPSPSKGPPSSPSKGPPASPPAHPPSPSNGS
STSPPAHPPSPCNGSSTSPPAHPTPPAHPPSPCNGSSTSPPAHPTSPSNGSSPSPPSHHP
TPSNSLPVHPPSPSKGPPASPPAHPPSPSNGPPAHPPSPSNGSSPSPPAHPPSPSNGSST
SPPAHPSSPCNGSSTSPSAHPPSPSNGSSTSPPAHPPSPSNGSTNILPIHPPSPSKGPPA
HPPTPSHSLPVHPPSPSKGPPSSPSKGPPASPPAHPPSPSNGSSTSPPAHPPSPCNGSST
SPSAHPPSPSNGSSTSPPAHPPSPSNGSTNILPIHPPSPSKGPPAHPPTPSHSLPVHPPS
PSKGPPSSPSKGPPASPPAHPPSPSNGSSTSPPAHPPSPCNGSSTSPPAHPPSPSNGSST
SPPAHPPSPSNGSTNILPIHPPSPSKGPPAHPPTPSHSLPVHPPSPSKGPPSSPSKGPPA
SPPAHPPSPSNGSSTSPPAHPPSPCNGSSTSPPAHPPSPSNGSSTSPPAHPPSPSNGSTN
ILPIHPPSPSKGPPAHPPTPSHSLPVHPPSPSKGPPSSPSKGPPASPPAHPPSPSNGSST
SPPAHPPSPCNGSSTSPPAHPTPPAHPPSPCNGSSTSPPAHPTSPSNGSSPSPPSHHPTP
SNSLPVHPPSPSKGPPASPPAHPPSPSNGPPAHPPSPSNGSSPSPPAHPPSPSNGSSTSP
PAHPSSPCNGSSTSPSAHPPSPSNGSSTSPPAHPPSPSNGSTNILPIHPPSPSKGPPAHP
PTPSHSLPVHPPSPSKGPPSSPSKGPPASPPAHPPSPSNGSSTSPPAHPPSPCNGSSTSP
SAHPPSPSNGSSTSPPAHPPSPSNGSTNILPIHPPSPSKGPPAHPPTPSHSLPVHPPSPS
KGPPSSPSKGPPASPPAHPPSPSNGSSTSPPAHPPSPCNGSSTSPPAHHTSPSNGSSPSP
PSHHPTPSNSLPVHPPSPSKGPPASPPAHPPSPSNGPPASPPAHPPSPSKGPPASPPAHP
PSPSKGPPAHTPSPSNGSSPSPPAHPPSPSNGSSTSPPTHPPSPCNGSSTSPPTHHSSPS
NGSSPSPPSHHPTPSNSLPVHPPSPSKGPPASPPAHPPSPSNGPPASPPAHPPSPSKGPP
ASPPAHPPSPSKGPPAHTPSPSNGSSPSPPAHPPSPSNGSSTSPPTHPPSPCNGSSTSPP
THHSSPSNGSSPSPPSHHPTPSNSLPVHPPSPSKGPPASPPAHPPSPSNGPPAHPPSPSN
GSSPSPPAHPPSPSNGSSTSPPAHPSSPCNGSSTSPSAHPPSPSNGSSTSPPAHPPSPSN
GSTNILPIHPPSPSKGPPAHPPTPSHSLPVHPPSPSKGPPSSPSKGPPASPPAHPPSPSN
GSSTSPPAHPPSPCNGSSTSPPAHPPSPSNGSSTSPPAHPPSPSNGSSNSPPAHPPSPCN
GSSTSPPAHPPSPSNGSSTTPAHPPSPSNGSSTSPPHAHPPSPSNGSSTSPPAHPPAPSN
GSSTSPPAHHPSPCNGSSTSPPAHHSSPSNGPAAGPSPSAGHHAGPPSPSTSHPAGPPSP
SAGHHAGPPSSPPASDSTIPK
NT seq
7266 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagccttcacttccaactctttttcttgttgttttatgtgcgacagctttggttcct
cagggtgaatcccagtatgaagaggaaaagctgttcttcaggcgtccatggccttttttc
aagtttccgtttcaacattatagattacctcattaccctatgctgccgcattaccctatg
ctgccgcattaccctgtgccaatgaagaagccagctattagcggtgagtgcattaaggca
aagttggctttgtcagactgtgttaaagagaagctggtttccacctggtattcgaagcct
cttgtcaaagattgttgtgatccgatttttaaccataagaagagttgtcctggttttatt
gttatgattgatgagcatttgatcccacaatatattaagtatgcttgtcatgctcatgtt
cacccttcctcctgctcatcctccatctcctgctcaccacccaacaccttctgctcctgc
ccaccctccgtccccttccaaaggccctcccgctggtcatcctgcccagcctccctcccc
ttccaaagaccctcccgctggtcatcctgcccaccctccgtccccttccaaaggccctcc
cgctggtcatcctgcccaccctccgtccccttccaaaggccttcccgctggtcatcctgc
ccaccctccgtccccttccaaaggccncctcccgcccacccgccatccccttccaatgga
tcttcccctagtcctcccgctcaccctccatccccttccaatggatcttccactagtcct
ccgcctcatcctccatctccttgcaatggctcttctactagtcctcccactcaccatacg
tccccttctaatggctcttcccctagtcctccctctcaccatcccaccccttccaatagc
cttcccgttcaccccccctccccatccaaaggccctcccgctagtcctcccgctcatcct
ccatccccttctaatggccctcccgctagtcctcctgcccaccctccgtccccttccaaa
ggccctcccgctagtcctccggcccaccccccttccccttccaaaggccctcccgcccac
acgccatccccttccaatggatcttcccctagtcctcccgctcaccctccatccccttcc
aatggatcttccactagtcctccgactcatcctccatctccttgcaatggctcttctact
agtcctcccactcaccattcgtccccttctaatggctcttcccctagtcctccctctcac
catcccaccccttccaatagccttcccgttcaccccccctccccatccaaaggccctccc
gctagtcctcccgctcatcctccatccccttctaatggccctcccgctcacccgccatcc
ccttccaatggctcttcccctagtcctcccgctcaccctccatccccttccaatggatct
tccactagtcccccggctcatccttcatctccttgcaatggctcttctactagtccttct
gctcatcctccttctccttccaatggctcttccactagtcctcctgctcaccctccatcc
ccttccaatggctctaccaatatccttcccattcaccccccatccccttccaaaggccct
cccgctcaccctccaaccccttcccatagccttcctgttcaccccccatccccttccaaa
ggccctccctctagtccttccaaaggccctcccgctagtcctcccgctcaccctccatcc
ccttccaatggatcttccactagtcctccggctcatcctccatctccttgcaatggctct
tctactagtccttctgctcatcctccttctccttccaatggttcttccactagtcctcct
gctcaccctccatccccttccaatggctctaccaatatccttcccattcaccccccatcc
ccttccaaaggccctcccgctcaccctccaaccccttcccatagccttcctgttcacccc
ccatccccttccaaaggccctccctctagtccttccaaaggccctcccgctagtcctccc
gctcaccctccatccccttccaatggatcttccactagtcctccggctcatcctccatct
ccttgcaatggctcttctactagtcctcccgctcatcctccttctccttccaatggttct
tccactagtcctcctgctcaccctccatccccttccaatggctctaccaatatccttccc
attcaccccccatccccttccaaaggccctcccgctcaccctccaaccccttcccatagc
cttcctgttcaccccccatccccttccaaaggccctccctctagtccttccaaaggccct
cccgctagtcctcccgctcaccctccatccccttccaatggatcttccactagtcctccg
gctcatcctccatctccttgcaatggctcttctactagtcctcccgctcatcctccttct
ccttccaatggttcttccactagtcctcctgctcaccctccatccccttccaatggctct
accaatatccttcccattcaccccccatccccttccaaaggccctcccgctcaccctcca
accccttcccatagccttcctgttcaccccccatccccttccaaaggccctccctctagt
ccttccaaaggccctcccgctagtcctcccgctcaccctccatccccttccaatggatct
tccactagtcctccggctcatcctccatctccttgcaatggctcttctactagtcctccc
gctcaccctactcctccggctcatcctccatctccttgcaatggctcttctactagtcct
cccgctcaccctacgtccccttctaatggctcttcccctagtcctccctctcaccatccc
accccttccaatagccttcccgttcaccccccctccccatccaaaggccctcccgctagt
cctcccgctcatcctccatccccttctaatggccctcccgctcacccgccatccccttcc
aatggctcttcccctagtcctcccgctcaccctccatccccttccaatggatcttccact
agtcccccggctcatccttcatctccttgcaatggctcttctactagtccttctgctcat
cctccttctccttccaatggctcttccactagtcctcctgctcaccctccatccccttcc
aatggctctaccaatatccttcccattcaccccccatccccttccaaaggccctcccgct
caccctccaaccccttcccatagccttcctgttcaccccccatccccttccaaaggccct
ccctctagtccttccaaaggccctcccgctagtcctcccgctcaccctccatccccttcc
aatggatcttccactagtcctccggctcatcctccatctccttgcaatggctcttctact
agtccttctgctcatcctccttctccttccaatggttcttccactagtcctcctgctcac
cctccatccccttccaatggctctaccaatatccttcccattcaccccccatccccttcc
aaaggccctcccgctcaccctccaaccccttcccatagccttcctgttcaccccccatcc
ccttccaaaggccctccctctagtccttccaaaggccctcccgctagtcctcccgctcac
cctccatccccttccaatggatcttccactagtcctccggctcatcctccatctccttgc
aatggctcttctactagtcctcccgctcatcctccttctccttccaatggttcttccact
agtcctcctgctcaccctccatccccttccaatggctctaccaatatccttcccattcac
cccccatccccttccaaaggccctcccgctcaccctccaaccccttcccatagccttcct
gttcaccccccatccccttccaaaggccctccctctagtccttccaaaggccctcccgct
agtcctcccgctcaccctccatccccttccaatggatcttccactagtcctccggctcat
cctccatctccttgcaatggctcttctactagtcctcccgctcatcctccttctccttcc
aatggttcttccactagtcctcctgctcaccctccatccccttccaatggctctaccaat
atccttcccattcaccccccatccccttccaaaggccctcccgctcaccctccaacccct
tcccatagccttcctgttcaccccccatccccttccaaaggccctccctctagtccttcc
aaaggccctcccgctagtcctcccgctcaccctccatccccttccaatggatcttccact
agtcctccggctcatcctccatctccttgcaatggctcttctactagtcctcccgctcac
cctactcctccggctcatcctccatctccttgcaatggctcttctactagtcctcccgct
caccctacgtccccttctaatggctcttcccctagtcctccctctcaccatcccacccct
tccaatagccttcccgttcaccccccctccccatccaaaggccctcccgctagtcctccc
gctcatcctccatccccttctaatggccctcccgctcacccgccatccccttccaatggc
tcttcccctagtcctcccgctcaccctccatccccttccaatggatcttccactagtccc
ccggctcatccttcatctccttgcaatggctcttctactagtccttctgctcatcctcct
tctccttccaatggctcttccactagtcctcctgctcaccctccatccccttccaatggc
tctaccaatatccttcccattcaccccccatccccttccaaaggccctcccgctcaccct
ccaaccccttcccatagccttcctgttcaccccccatccccttccaaaggccctccctct
agtccttccaaaggccctcccgctagtcctcccgctcaccctccatccccttccaatgga
tcttccactagtcctccggctcatcctccatctccttgcaatggctcttctactagtcct
tctgctcatcctccttctccttccaatggttcttccactagtcctcctgctcaccctcca
tccccttccaatggctctaccaatatccttcccattcaccccccatccccttccaaaggc
cctcccgctcaccctccaaccccttcccatagccttcctgttcaccccccatccccttcc
aaaggccctccctctagtccttccaaaggccctcccgctagtcctcccgctcaccctcca
tccccttccaatggatcttccactagtcctccggctcatcctccatctccttgcaatggc
tcttctactagtcctcccgctcaccatacgtccccttctaatggctcttcccctagtcct
ccctctcaccatcccaccccttccaatagccttcccgttcaccccccctccccatccaaa
ggccctcccgctagtcctcccgctcatcctccatccccttctaatggccctcccgctagt
cctcctgcccaccctccgtccccttccaaaggccctcccgctagtcctccggcccacccc
ccttccccttccaaaggccctcccgcccacacgccatccccttccaatggatcttcccct
agtcctcccgctcaccctccatccccttccaatggatcttccactagtcctccgactcat
cctccatctccttgcaatggctcttctactagtcctcccactcaccattcgtccccttct
aatggctcttcccctagtcctccctctcaccatcccaccccttccaatagccttcccgtt
caccccccctccccatccaaaggccctcccgctagtcctcccgctcatcctccatcccct
tctaatggccctcccgctagtcctcctgcccaccctccgtccccttccaaaggccctccc
gctagtcctccggcccaccccccttccccttccaaaggccctcccgcccacacgccatcc
ccttccaatggatcttcccctagtcctcccgctcaccctccatccccttccaatggatct
tccactagtcctccgactcatcctccatctccttgcaatggctcttctactagtcctccc
actcaccattcgtccccttctaatggctcttcccctagtcctccctctcaccatcccacc
ccttccaatagccttcccgttcaccccccctccccatccaaaggccctcccgctagtcct
cccgctcatcctccatccccttctaatggccctcccgctcacccgccatccccttccaat
ggctcttcccctagtcctcccgctcaccctccatccccttccaatggatcttccactagt
cccccggctcatccttcatctccttgcaatggctcttctactagtccttctgctcatcct
ccttctccttccaatggctcttccactagtcctcctgctcaccctccatccccttccaat
ggctctaccaatatccttcccattcaccccccatccccttccaaaggccctcccgctcac
cctccaaccccttcccatagccttcctgttcaccccccatccccttccaaaggccctccc
tctagtccttccaaaggccctcccgctagtcctcccgctcaccctccatccccttccaat
ggatcttccactagtcctccggctcatcctccatctccttgcaatggctcttctactagt
cctcctgctcatcctccttctccttccaatggttcttccactagtcctcctgctcaccct
ccatccccttccaatggctcttccaatagtcctcccgctcaccctccatccccttgcaat
ggatcttccactagtcctcccgctcatcctccatctccttccaatggctcttccactact
cccgctcatcctccatccccttcaaatggctcttccactagtcctcctcatgctcatcct
ccgtccccttccaatggctcttccactagtcctcctgctcatcctccagccccttccaat
ggctcttccactagtcctcctgctcatcatccatctccttgcaatggctcttccactagt
cctcctgctcatcattcatctccttccaatggccctgctgctggtccatccccttctgct
ggtcatcatgccggtcctccatctccttccaccagccatcctgctggtcctccatcgcct
tccgctggccatcatgctggtcctccatcaagtcctcctgccagtgattctactattcca
aaataa
DBGET
integrated database retrieval system
