Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0268662
Help
Entry
DDB_G0268662 CDS
T00245
Name
(RefSeq) DNA2/NAM7 helicase family protein
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_12
AAA_11
AAA_19
TUTase
PAP_assoc
AAA_30
Viral_helicase1
nSTAND3
AAA_22
T2SSE
AAA_29
NTP_transf_2
AAA_16
UvrD_C_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8616531
NCBI-ProteinID:
XP_646848
dictyBase:
DDB_G0268662
UniProt:
Q55F22
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(1881042..1888712)
Genome browser
AA seq
2523 aa
AA seq
DB search
MNYLTTEDDSSIPSPPSPPSPPLPPSPPPSTSSSSYFSYFSFSLLSKLTSTIYNSIFYTT
PPTSDVATPSTVSSISTQSTAPPTVPISSKSTMPLPPPPLTMPLPPSPPTMPLPPPPSSP
PTVPISPPTVPISPPSTMPLPPTVAQLATPSTVSPISPPPTVPISSKAPPILQPTLTSIA
QTPIYQSVTTKTTNTSTIDSITNNMNQLNITKNSQIINSGGEFDIFKTIFRHSNLKDIIN
ETDYVSKLFPSFDINYIKEILKSNQTSLGNKIEYTENIASKEISDKFRNLVQKKDLLNNN
NINPNNNYNNNNNNDIFQIYNDFIALKVMIEFSFLYQRLILKKLFTGDKSITADEKQKLY
DQLSAQNRTITLPEVFKCNNPPSFHQISNDFNFVLKGKYYRIKNLKFSDSQDISISIQSN
FINLCKLYNKCLGIASPLPTKALPTPSTKSSSTPLPTTTASTTTASKSPSTPLTKPTPST
TSTKSASTALPTPSPTPLPKPSTPLPTTALPTTPSTALPKPSPTPSPTALPKPSTSSTKS
PTVESSSSSTIFTMEPTTTEIIVFSIFYKIFYKLEGIQDLIKKHSIFEFELLSVETIIKE
NQTSFQSIIDSVKITTLNQLKKSLDSKINFIKFEEIKTTLVTIVLLIEFSNLYQRITLKK
HLPNPKRIHPSLFNLLEIQHQSLKIDLEKLISQTISSNVLDFVPVPSKLELKSEKVLFNI
DLFKLQIGHKNNDSNTIGQLIGSHLIYIKSLILDYQLLSDSTTTTTASPTEIKPVPVPVP
PPTITTPTSTSTPTPTSTPTPTSTPTPTPTSTPTPTPIPTPTPTTPKELLSNIPTVILKK
PSNIEKQIFSLFNTFFNKPEEIDSLKNQYPAFNLQIGLIKSATKDIISLFKRKIEFHKNN
TSKAVQELLISSVNPSKFNEINETIFTIISLIEFSNLSQRNYIKEYFDKNFTVENSQDIL
NFKLEAFNLLNIHHQRFCIKVEAFIDQKSIDILNYIPEQVELNIKSKSKKTEYTMNVELF
KLPLGHKNQSDNTIGTLIKSFIIYIKSLVLDYKDLSLSNSQKISNTTSSTTPTASATISI
IKDKATTTAPSPTTTSQISIVPSPSSNNNTTTTFENDHSLKHSLLKLIFEDSNSADSIIK
TLDRLSQSHPYNKESIKQVRNIINESKIQFNTNINGIKHRLKTDFSKIQKNNTSNQNIEK
IYNKSLSLMVLLEFNHFSQYSELREKTKTCRQYLNQLNSELAKNNKMKLEFSDIVKGKFF
DNLVSNFESTTKINGSTLKIPSFKLLNSEKLGLISKLQFNEIYQLIKSEKLFVNSSTGTT
TIRSRNNNNSNNNNNNNGKVVLVRDHVEVISKDSEEILSIFLKSSPERIPLIQADNIHSL
QDSYSDQSEFVNLMKPLIVEEYRAQLEGDFNEIEGVSISEQDGTLIGLDRVKMNDTPTIH
SFRELSEDLVAIKFNIKVKDELEEIYLNDILLFKTFDHTSKPMFALGLVTSNSVLKGKKQ
IIICEFVLSDSTKPLIEKFYSVSLNSKTSKDILHFIKVSNSTTFIRELEAPEIFKNSKTL
LNQILQPSLEVYNLMTSMRMEIPSLLRSMCIQELNTSQFSAVETSLSTKGITLIQGPPGT
GKTTTIYYLLSILLAINPKFKILVCGPSHASVDEVAKRCLKKSLVNIDGKPYLPNMVRIG
KLQNISPDCHRISLFDKTPAQRKAIIRNATIIFATLSASGSKPIRSNFKANIVLVDESTQ
SSEPASLIPLCIGNIEKLILVGDPLQLPPTIFSSESAKNGLNISLFERLSKVLPVEMLNT
QYRMHPTISRFPSNQFYKDRLLDGDNVKSLVYNQHNFHSDIKYGPIRFYDVIDSKEESGK
RSLKNKLEITMVFTLIKKLVQDYPECKKFSFGIITPYKLQKSEIKEQHKQFNYPLNIETS
TIDGVQGSEKDIIILSCVRSERIGFLSDRRRINVALTRAKFGLFVIGNSKLLKKDRTWGP
FCQYVHSINSMVSIDSKGISVLEQQIQEYDSLNPNGLIEFHSDSEDDYDDSEDEEEDEDE
DNEEIQEHDEDDESNRIKKINQEGEDNDDLEDDDDDDNEHGDEEYHSISEEYDEDEEVFD
TNNLVIDKDFPNALINIIIELQKSNQEKIDQSTLSKKKKLRDNFIKHSRFLDPYLKKVLN
NLEIQEISQSLSSSSSNINKSLNEIISKIECKKKSIKQDSYNRLKKLISEGFATASINLY
GSFLSGLSLNDSDLDINFSSTQKEDTTHLKQVYKYLNRSQLYKLIEKRTDAKVPIIRFKE
ISSGVHFDMCFNSMMSYHNSLLLGEYCSIDNRSRDLVLLVKWWAVSKDLNNAAEKTFSSF
CLVNMVIHFLQSLNPPILPNLQTTSNQLLEKYSTNRNLIKLKSQTIVENYLVKYYDWSSF
NKFEPKRNKLTIAQLFYQFFYYYSTFNYKENIISISHSSGGGSLCENGALLKRSNIRSRA
VRDHIIVLDPFINDRNLASSIKKTYQRVLMEFIMMEYSLRSTKSTINDLFKENLSLSSNG
LLS
NT seq
7572 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaactatttaacaacagaagatgattcatcaattccatcaccaccatcaccaccatca
ccaccattaccaccatcaccaccaccttctacttcttcttcttcttatttttcttatttt
tctttttctcttttatcaaaattaacatcaacaatctacaacagcatcttctatacaaca
ccaccaacatcagatgtagcaacaccctcaacagtatcatctatatcaacacaatcaaca
gcaccaccaacagtaccaatatcatcaaaatcaacaatgccattaccaccaccaccacta
acaatgccattaccaccatcaccaccaacaatgccattaccaccaccaccatcatcacca
ccaacagtaccaatatcaccaccaacagtaccaatatcaccaccatcaacaatgccatta
ccaccaacagtagcacaattagcaacaccctcaacagtatcaccaatatcaccaccacca
acagtaccaatatcatcaaaggcaccaccaatattacaaccaacattaacatcaatagca
caaactccaatttatcaaagtgtaactactaaaacaacaaatacatcaacaatagattca
ataacaaataatatgaaccaattgaatattactaaaaattcacaaattataaatagtggt
ggtgaatttgatatttttaaaactatattcagacatagtaatttaaaagatatcataaat
gaaactgattatgtttctaaattattcccaagttttgatattaattatattaaagaaatt
ttaaaaagcaatcaaacttctttagggaataaaattgaatatactgaaaatatagcatca
aaagaaatatctgataaatttagaaatttagttcaaaaaaaagatttattaaataataat
aatatcaatcctaataataattataataataataataacaatgatatttttcaaatttac
aatgattttatagcattgaaagttatgattgaatttagttttttatatcaaagattaatt
ttaaagaaattgtttacaggtgataaatcaatcacagctgatgaaaaacaaaaactttat
gatcaattgtcagctcaaaatagaacaataacattaccagaggttttcaaatgtaataac
ccacctagttttcatcaaatttcaaatgatttcaattttgttttaaagggtaaatattat
agaataaaaaatttaaaattttcagattctcaagatatatcaatttcaattcagtcaaac
tttatcaacctttgtaaattatataataaatgtttaggtatagcttcaccattaccaaca
aaagcattaccaacaccatcaacaaagtcatcatcaacaccattaccaacgacaacagca
tcaacaacaacagcatcaaaatcaccatcaacaccattaacaaaaccaacaccatcaaca
acatcaacaaaatcagcatcaacagcattaccaacaccatcaccaacaccattaccaaaa
ccatcaacaccattaccaacaacagcattaccaacaacaccatcaacagcattaccaaaa
ccatcaccaacaccatcaccaacagcattaccaaaaccatcaacatcatcaacaaaatca
ccaacagtggaatcatcatcatcatcaacaatattcacaatggaaccaacaactactgaa
atcatagttttttcaattttttataaaattttctacaaattagaaggtattcaagatttg
attaaaaaacactcaatctttgaatttgaattattatcagttgaaacaattataaaagaa
aaccaaacatcatttcaaagtatcatagattcagtgaaaattacaacattaaatcaactt
aaaaaatcattggattcaaagattaactttataaaatttgaagaaattaaaactacacta
gttactatcgttttattaatagagtttagtaatctttaccaaagaattactcttaaaaaa
catttacccaatccaaagagaatacatccatcgcttttcaatttattagaaattcaacat
caaagtttaaaaattgatttagaaaaactcattagtcaaactatatcatctaatgtttta
gatttcgttccagtaccatcgaaattagaattaaaatctgaaaaagttttatttaacatt
gatttatttaaattacaaattggtcacaaaaataacgatagtaataccattggacaatta
atcggatcacatttgatttatataaaatctttaattttagattatcaacttttatcagac
tcaacaactacaacaacagcatcaccaacagaaataaaaccagtaccagtaccagtacca
ccaccaacaatcacaactccaacgtcaacatcaacaccaacaccaacatcaacaccaaca
ccaacatcaactccaactccaacaccaacatcaacaccaacaccaacaccaataccaaca
ccaacaccaacaacaccaaaagagttattatcaaatataccaacagtaattttgaagaaa
ccatcaaatattgaaaaacaaatattttcattatttaatacattttttaataaaccagag
gaaattgatagtttaaagaatcaatatccagcatttaatttacaaattggtttaattaaa
tcagcgactaaggatataatttcattattcaaaagaaagattgaatttcataaaaacaat
acatcaaaagctgtacaggaattattaatatcaagtgtaaatccatcaaagtttaatgaa
attaatgaaacaatttttacaatcatttcattaattgaatttagtaatctttctcaaaga
aattatattaaagaatattttgataaaaatttcacagttgaaaactcacaagatattttg
aattttaaattagaggcattcaatttattgaatattcaccaccaaagattttgtattaaa
gttgaagcatttattgatcaaaaatcaatagatattttaaactatattccagaacaagta
gaattaaatattaaatctaaatctaaaaaaactgaatatacgatgaatgtagagttattt
aaattaccacttggtcataaaaatcaaagtgataatacaattggaactttaataaaatct
tttattatttatataaaatctttagtgttggattataaagatttatcactttcaaattca
caaaaaatatctaatacaacaagttcaacaacacccacagcttcagctaccattagtatt
ataaaagataaagctacaacaacagcaccatcaccaacaacaacatcacaaatatcaata
gtaccatcacctagttctaataataatactactacaacatttgagaatgaccattcattg
aaacatagtttattgaaattaatatttgaagattctaatagtgcagattcaattattaaa
acattggatagattatcacaatcacatccttataacaaagaatcaattaaacaagttagg
aatataatcaatgagagtaaaattcaatttaatacaaatattaatggtattaaacataga
ttaaaaacagatttttcaaagattcaaaaaaataatacaagcaatcaaaatattgaaaaa
atatataacaagtcattatcattaatggtattattagagtttaatcatttctcacagtat
tcagaattaagagaaaaaacaaagacttgtagacaatacctcaatcaattgaattcagaa
ttagcaaaaaataataaaatgaaattagaattttcagatatagttaaaggtaaattcttt
gataatctcgtcagtaactttgaatcaacaacaaaaatcaatggttcaactttaaagatt
ccatcttttaaattattaaattctgaaaagttaggtttaatttcaaagttacaatttaat
gaaatttatcaattaattaaaagtgaaaagttgtttgtcaactcctcaacaggaacaact
acaataagatcaagaaataacaataatagtaataataataataataataatggaaaagtt
gttttagttcgtgatcatgttgaagtaatttcaaaagattctgaagagatattatcaata
tttttaaagagtagtccagaaagaattccattaattcaagctgataatattcattcatta
caagatagttattctgaccaatcagaatttgtaaatttaatgaaacctttaatagtagaa
gaatatagagcacaactcgaaggtgattttaatgaaattgaaggtgtttcaatttcagag
caagatggtacattaataggtttagatagagttaagatgaatgatacaccaacaattcat
tcattccgagagttgtcagaggatttggttgcaattaaatttaatattaaggttaaggat
gaattagaggaaatataccttaatgatattttactttttaaaacatttgatcatactagt
aaaccaatgtttgcattggggttagtaacatcaaattcagttttaaagggtaaaaaacaa
ataattatttgcgaatttgtattatcggattcaacgaaaccattaattgaaaagttttat
tcagtttcgttgaattcgaaaacttcaaaagatattttacattttataaaggtttctaat
agtactacatttattagagaattagaagcaccggaaatatttaaaaattcaaaaacactt
ttaaatcaaattttacaaccatcattggaagtttataatttaatgacatcaatgagaatg
gagattccatcattgttgagatccatgtgtattcaagaattgaatacatcacaatttagt
gcagttgaaacatcattatcaacaaaaggtattacattaattcaaggtccaccaggtact
ggtaaaactacaacaatttattatttactttcaattttattagcaattaacccaaaattc
aagatattagtatgtggtccatcacatgcatcagtagatgaagttgcaaagagatgtttg
aaaaagagtttagttaatatagatggtaaaccttatttaccaaatatggtacgtattggt
aaacttcaaaatatatcaccagattgtcatcgtatatcactttttgataaaacaccagca
caaagaaaagcaattattagaaatgcaactattattttcgcaactctatcagcaagtggt
tctaaaccaataagaagtaactttaaagcaaatattgtattagtagatgaatcaactcaa
tcatctgaaccagcttcactaattccattatgtattggtaatattgaaaagttaattctt
gttggtgatccattacaattaccaccaactattttctcatcagaaagtgcaaaaaatggt
ttaaatatatcattatttgaaagattatcaaaagtattacctgttgaaatgttaaataca
caatatcgtatgcatccaacaatttcaagattcccatcaaatcaattctataaagacaga
ttattagatggtgataatgtaaagtcattagtatacaatcaacataatttccattcagat
atcaaatatggtccaattagattctatgatgttattgattcaaaagaagaaagtggtaaa
agatcattaaagaataaattagaaatcacaatggtatttacattgattaaaaagttagtt
caagattatccagaatgtaaaaagttctcatttggtattattacaccatacaaattacaa
aagagtgaaatcaaagaacaacataaacagtttaactatccattaaatattgaaacatca
acaattgatggagttcaaggttcagaaaaagatatcataattttatcgtgtgtaagaagc
gaaagaattggtttcctttctgatcgtagacgtattaatgtcgcactcacaagagctaaa
tttggattatttgtaattggtaattctaaactcttaaaaaaagatagaacttggggtcca
ttttgccaatatgttcattcaataaactcaatggtctcaattgattctaaaggtatcagt
gttttagaacaacaaattcaagaatatgactctttaaatccaaatggattaattgaattc
cattcagattctgaagatgactatgatgatagtgaagatgaagaggaagacgaagatgaa
gataatgaagaaatacaagagcatgatgaagatgatgaaagtaatagaatcaagaaaatt
aatcaagaaggtgaagataatgatgatttggaggatgatgatgatgatgataatgagcat
ggtgatgaagaatatcatagtatcagcgaagagtatgatgaagatgaagaagtatttgat
acaaataatttagtcattgataaagattttccaaatgctctcattaatattattatagaa
ttacaaaaatcaaatcaagaaaaaatagatcaatcaactttatcaaaaaagaaaaaatta
agagataattttataaaacactcacgtttcttggatccatatttaaagaaagttttaaat
aatttagaaatacaagaaatttcacaatctttatcatcatcctcatcaaatataaataaa
tctcttaatgaaattatttcaaaaattgaatgtaaaaagaaatcaattaaacaagatagt
tataatagattaaagaaattaatatcagaaggtttcgcaacagcatcaattaatttatat
ggttcattcttgagtggattatcattgaatgatagtgatttagatattaatttctcaagt
actcaaaaagaagatacaactcatttaaaacaagtttataaatatttaaatagatctcaa
ctatataaattaattgaaaaaagaacggatgcaaaagtacctatcattagattcaaagag
atatcatcaggtgttcatttcgatatgtgttttaattcaatgatgagttatcacaattca
ttattgttaggcgaatattgttcaatcgataatagaagtagagatttagtattattagta
aaatggtgggcagtttcaaaagatttaaataatgcagcagagaaaacatttagttcattc
tgtttagttaatatggtaatccatttccttcaatcattaaatccaccaattttaccaaat
ttacaaacaacatcaaatcaactcttagaaaagtattcaacaaatagaaatttaattaaa
ttaaaatcacaaacaatcgtagaaaattatttagttaaatattatgattggtcaagtttt
aacaaatttgaaccaaaaagaaacaaattgacaatcgctcaattgttttatcaattcttt
tattattattcaacatttaattataaagagaatatcatatcaattagtcactcaagtggt
ggtggtagtttatgtgaaaatggagcattattaaaaagatcaaatataaggagtagagct
gtaagagaccatatcattgtacttgatccatttattaatgatagaaatttagcatcatca
attaaaaaaacataccaaagagtattaatggaattcataatgatggaatattctttaaga
tcaaccaaatcaacaattaatgatttattcaaagagaatttatcattatcgtcaaatgga
ttactttcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
