Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0290965
Help
Entry
DDB_G0290965 CDS
T00245
Name
(RefSeq) RING zinc finger-containing protein
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
zf-TRAF
Sina_RING
zf-C3HC4_3
zf-C3HC4_2
zf-TRAF_2
zf-RING_2
TRAFD1-XIAF1_ZnF
Sina_ZnF
Ribonuc_red_2_N
CENP-F_leu_zip
ABC_tran_CTD
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8627913
NCBI-ProteinID:
XP_635412
dictyBase:
DDB_G0290965
UniProt:
Q54FC5
LinkDB
All DBs
Position
5:complement(4802105..4803917)
Genome browser
AA seq
575 aa
AA seq
DB search
MSINSKFTINDVLLNIESLQKKNKYSCPICFEFIYKKSIFQCKSGHFACKECWEKSLKIK
KECMICRSKVNSINDLSRCLVIEQGFGKKECYCIYSFNNDHFIDYANLDENITLVKDKEN
GCKEIINIDQLDRHIQNCKFKFVECSHNGCDVVLRLNSLKEHENQCGYKLVKCKYCACDD
TIQKELENHNNECPKFPIGCPQSCSIMVERDQTQSHINNDCNNSTIQCKYYEYGCKVEMK
RSELQNHLNNVNHQYFMGILIDKLSSKLIQSHNIQDELVKKIEQSEKNQEILNKEYDQSK
VICENRSKIICDKHVKKIEQLEKTQENLNKQFELSRIIGENRSKIICDKLVKTIEKSEKN
QENLYKEYERSKIICDKLVKKIEQLEKTQENLNKQFELSRIICDKLQKQNDQLLSLNALK
YKNEWIISDYSKIVKKNPKGSLLNSPSFQVNQNNFLKSQSLCNILQNIFHLSFYQNGLSR
INKIAIFLMGKSIEGTNVEFICKLVNVLDETNSIKFKTQKLKDIDDLEWDWSWGRSYIID
SNLITQENGWLTKDDKLTIEFKVKIFNNVNKPLES
NT seq
1728 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaataaattcaaaatttacaataaatgatgttttattaaatatagaatcattacaa
aagaaaaataaatattcatgtccaatttgttttgaatttatttataaaaaatcaattttt
caatgtaaatccggtcattttgcatgtaaagaatgttgggagaaatcattaaaaattaaa
aaagaatgtatgatttgtagatcaaaagtaaattcaatcaatgatttatcaagatgttta
gtaattgaacaaggttttggtaaaaaagaatgttattgtatttattcattcaataatgat
cattttattgattatgcaaatctagatgaaaatataacattggttaaagataaagagaat
ggttgtaaagaaataataaatatagatcaattagatagacatatacaaaattgtaaattt
aaatttgttgaatgttcacataatggatgtgatgttgttttaagattaaattcattgaaa
gaacatgaaaatcaatgtggttacaaattagttaaatgtaaatattgtgcttgtgatgat
accattcaaaaggaattagagaaccataataatgaatgtccaaaatttccaattggctgt
ccacaaagttgttcaattatggttgaaagagatcaaactcaatcacatataaataatgat
tgtaataattcaacaatacaatgtaaatattatgaatatggttgtaaagttgaaatgaag
agatcagagttacaaaatcatttaaataatgtaaatcatcaatatttcatgggtatatta
attgataaactatcttcaaaattaattcaatcacataatatccaagatgaacttgttaaa
aagattgaacaatcagagaagaaccaagaaatccttaataaagaatatgatcaatcaaag
gttatctgtgagaatcgatcaaagattatttgtgataaacatgttaaaaagattgaacaa
ttagagaaaactcaagaaaaccttaataaacaatttgaattatcaagaattattggtgag
aatagatcaaagattatttgtgataaactagttaaaacgattgaaaaatcagagaaaaac
caagaaaatctttataaagaatatgaacggtcaaagattatttgtgataaacttgttaaa
aagattgaacaattagagaaaactcaagaaaaccttaataaacaatttgaactatcaaga
attatttgtgataaacttcaaaaacaaaatgaccaacttttatcattaaatgcacttaaa
tacaaaaacgaatggatcatttcagactattcaaaaattgttaaaaaaaatccaaagggt
agtttattaaattctccatctttccaagttaatcaaaataattttttaaaatcccaatca
ctgtgcaatattctgcaaaatatatttcatctttctttttatcaaaatggtttatcaaga
ataaacaaaattgcaatatttttgatgggtaaaagtattgaaggaacaaatgttgagttc
atttgtaaattggttaatgttttggatgaaacaaattcaataaaatttaaaacgcaaaag
ttaaaagacatagatgatttggaatgggattggagttggggaagatcatatattatagat
tcaaatttaattacccaagagaatggttggctaactaaagatgataaattaacaattgaa
tttaaggtaaaaatatttaataatgttaataaaccacttgaatcataa
DBGET
integrated database retrieval system
