Dehalococcoides mccartyi DCMB5: dcmb_1372
Help
Entry
dcmb_1372 CDS
T02476
Symbol
rdhC
Name
(GenBank) PAS domain signal transduction histidine kinase
Organism
dmd
Dehalococcoides mccartyi DCMB5
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HATPase_c
PAS_9
PAS_8
HisKA
PAS
PAS_4
PAS_3
PAS_11
HATPase_c_3
Rh5
HATPase_c_2
DUF3810
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGG06962
UniProt:
A0AA86A0S0
LinkDB
All DBs
Position
complement(1291020..1292666)
Genome browser
AA seq
548 aa
AA seq
DB search
MQAKLGTLSLHLRADLFEAATECMPNLVIGFLQDGRIIYANKATLLRLGYKQKQLKGMSI
RDICPEISVDNWRLLWLDIRQNKSIQLSAKFHTQGRGLIDIDSTATYISSNARGLGFICG
RDSIPATNNVQVIDNRASQLEQIITERTHQLNETKNALEKEIIKNNTVIEKYKNLSKRYK
LFFNSSNDAIIVTRVYNSTVNGRIIHEVNDRACRALGYTREELIGRSTADIHPPEDWTSM
LPSMGVHLIKDRHVVFESTHMTKLGKRIPVEISSHLFTLQGMRMGFSVVRDITMRKMSEQ
ALLQSLEQEKLLRNELEESMSKRIEFTRALVHELKTPLTPLMGASGALTDRVDTEPLISL
ARCIRKSSESLNKRIQELLDFSKGEIGLLKLNRVSVDPVQLIQEVCEYVQPLAKSKNIKM
QAAIRGNLPRIWADEERLTQILLNLTDNAFKFTPSKGSITISVETVSDQLVFKVTDTGKG
MSEEKQRSLFNKDKTYAFTDKDIQSGLQLGLTLCRMLVELHGGKIQVSSRLGEGFEVMFS
IPVLAPSK
NT seq
1647 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaagctaaattgggaacgttatctctgcatttgagggcggatttatttgaagctgct
accgaatgtatgccgaatttggttattggttttttgcaggatgggcgtatcatttatgca
aataaagctaccctactccggttagggtataaacaaaagcagcttaaaggtatgtctatt
cgggatatctgcccggaaatttctgtagataactggcgtttgttgtggttagatataaga
caaaataagtctatccagttgtcagcaaaatttcatacacaaggcagggggctgattgat
atagattcaaccgcaacttatatttcctcaaatgcgcgtggtctgggttttatttgtggc
agggatagtatccctgccacaaataatgttcaggttatagataatcgggccagccaactg
gaacagattatcaccgaaaggacccatcagttaaacgaaacaaaaaatgccttagagaaa
gagattatcaagaataatactgttatagaaaaatataaaaacctttccaagcgatataag
ttgttttttaatagcagcaatgatgccataattgtaacccgggtttacaattcaactgtg
aatggcaggattatacatgaagtaaatgaccgtgcttgtcgggcactgggttatacgcgc
gaagagcttattggcagaagtacggctgatatacaccctccggaagattggaccagtatg
ttgccttctatgggtgtgcatttaattaaagacaggcacgttgtgtttgaatctacccat
atgactaaattgggcaaacgtattccagtggaaatcagttctcatttatttactctccaa
ggaatgcgaatgggtttttcagttgtgcgtgatatcacaatgcgaaaaatgagtgaacag
gccctgttacaatcacttgaacaagagaaattattgcggaatgaacttgaagaatctatg
agcaagaggattgagtttaccagggcacttgttcacgaattgaagaccccgttgacgccc
ctgatgggagccagcggggcattaacagacagggttgataccgaacctttgatttcctta
gccagatgtatacgaaaaagctctgaatctttaaataaaaggattcaggaattactggat
ttcagcaaaggtgaaattggccttctgaagttaaaccgtgtatcagttgatccagtacaa
cttatccaggaagtttgcgagtatgtacagccactggcgaaatctaaaaatataaaaatg
caggcagctatacgagggaatcttcctcgaatatgggcagacgaagagagattaacccag
atcttacttaatttaacagataatgcttttaaatttactccatctaaaggtagcattacc
atttcagttgaaactgtgtcagaccagttggtatttaaggttactgatacaggaaaaggt
atgagtgaagaaaaacagcggagtttgttcaacaaagacaagacgtatgccttcacagat
aaagatatacaaagcggattacaactggggctgacactttgcagaatgctggtggaactg
catggaggtaaaattcaggtgtccagtcgattaggcgagggcttcgaagttatgttcagt
attccggtattggcaccttccaaatga
DBGET
integrated database retrieval system