Dictyostelium purpureum (cellular slime mold): DICPUDRAFT_154593
Help
Entry
DICPUDRAFT_154593 CDS
T02090
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K14544
U3 small nucleolar RNA-associated protein 22
Organism
dpp
Dictyostelium purpureum (cellular slime mold)
Pathway
dpp03008
Ribosome biogenesis in eukaryotes
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dpp00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03008 Ribosome biogenesis in eukaryotes
DICPUDRAFT_154593
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
dpp03009
]
DICPUDRAFT_154593
Ribosome biogenesis [BR:
dpp03009
]
Eukaryotic type
90S particles
U3 small nucleolar RNA-associated proteins
DICPUDRAFT_154593
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Nrap_D3
Nrap_D5
Nrap_D4
Nrap
Nrap_D2
Nrap_D6
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
10504472
NCBI-ProteinID:
XP_003290102
JGI:
Dicpu1_154593
UniProt:
F0ZRR2
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1259 aa
AA seq
DB search
MVEKRKTTTKGGNDAKSNKKNKIEQDNSIMALGMDDYDDEISDQDIEGAVSYNDKYYNGE
SNDNSESEDDDEELDYIDGNNSDDEEEKLDDSEAAMGRPTILPEKSEIEAKKFVNLKIKN
VPVSQQSAAPTSDEIQNLKETQFLFNSNLFRLQINELFKEIKIDYSKLSSLESALHQIKT
AIEKIPEQDVDITEDNISAVKLFDFNGGEGLSVHYSRPSSIDVVGSFMSRSVIKSNPNVD
MTIEIPLSSLSSKDANDFKYFTKRNLYLLKVANELKKHPRFSDLSFKNFNDDSNKQIIVI
KPKEDPKTGSKTKFQIRIIPTIPKELFNIYTKFNPNISCIFLESEKDNIKIQTFKENDSI
YENNESKKVEDDSKTKKKRSFDEIKRSPFYNNSILEDILLNDHMQLINEKCENAPVLVDT
MLLVKLWLDLKKIPTVNSFHLSMLLIHLYNNGRINKSMSSYQAFRMLMVFISKEISSKSV
IFMKLSQDAISSGSIKQNQYFEEFEKLYPVALVDDTGLLNVWSSVSSWGLRQLILESRLV
LENLDSGNGFEEIFMTKFHFYTEYDLVLKIILGKEELSQFEVPLNDYYQKESYLENRIYQ
LLRKSLTKRVTKVTIFKHDNDEYTCWKDEMPENVDRTLTVGIKVNTENWLSVIDLGPPAD
HVNSAKFREFWGAKSQVRRFKDGSILDAVTWSPKNGSRHLVIEEIVKYILNLHLKIPVTR
VSTIVSELDSLIIGEKVQDQTLNVIAAKEKLIHVIGQLGLPLGIEAFSPISPALRYTDVL
TSFDENYLENEPIQILLHFQTSQQWTKDVDSINALKTAFLLKMARELENTIFRPRLTEKY
LDLQVDGFVFRLISYYPKEMEFMREQWKVEGLPELESLQRNSIHHTFIQSLHTTYSSYGP
TTRIALRWIHSHLFSDFIDQQSVELLVGSLYKGIERDDGSMDSTNVPKTPLMGFLRFLFL
LYTYNFEEQPLIIDFNNSIKESTIQEIKNMFALQKQSNNPPIIYFATDKDRNNQWFRHTT
IRDQDQWSKIKLLAQKSIELIEDNFTNQTFNWLSIFEPSLFDFDAIFNLNEQLIPNHSKE
ILNIINNKKFNLLSYLNTNSNGTNNNNNNISNTSTSKKPVFKNIIKKSDNNNNNNNNNDS
NQLNNGNNNNLIYKDFKPGFNPVVELINQLKDKFSEYCIFQYDLVGGNKITLKWKSQAFL
PVPFKPSKSKYVTPISKDSNLVIPNIFEILNEIQMLGGKLIKSFKLNQNSNNLLKEWSL
NT seq
3780 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtagagaaaagaaagactaccactaaaggtggtaatgatgccaagtcaaataaaaaa
aataagattgaacaagataatagtattatggcattgggaatggatgattatgatgatgaa
atcagcgatcaagacattgaaggtgcagtttcatataatgataaatattataatggcgaa
tcaaatgacaatagcgaaagcgaggatgacgacgaagagttggattatatcgatggtaat
aatagcgatgacgaggaggagaaattggacgatagcgaagcagcaatgggtagaccaaca
atattaccagaaaaatcagaaattgaagcaaaaaaatttgtaaatcttaaaattaaaaat
gtaccagtttcacaacaatctgcagcaccaacaagtgacgaaattcaaaatcttaaagaa
acccaatttctttttaattcaaatttattcagacttcaaatcaacgagttattcaaagag
atcaaaattgattatagtaaactttcatctttggaatcagctttacatcaaatcaaaaca
gccatcgaaaaaataccagaacaagacgtagacattacagaagataatataagcgccgtt
aaattatttgatttcaatggtggtgagggtttatcagtacactatagcagaccatcttca
atcgatgtagtcggtagttttatgagcagatcagttattaaatccaatccaaatgtagat
atgactattgaaatcccattatcttcattatcaagtaaagatgcaaacgacttcaaatat
tttacaaaaagaaatttatatttattaaaggttgctaatgaattaaagaaacatccacgt
ttttcagatttatcattcaagaactttaatgatgattcaaataaacaaatcattgttatc
aaaccaaaagaagatccaaaaactggttcaaaaactaaattccaaattcgtatcattcca
accattccaaaagaattatttaatatttataccaagtttaatccaaatattagttgtata
tttttagaatcagaaaaagataatatcaaaattcaaacttttaaagaaaatgattcaatt
tatgaaaataatgaaagtaaaaaagttgaagatgattcaaaaactaaaaagaaaagatca
tttgatgaaattaaaagatcaccattttataataattcaattttagaagatattttatta
aatgaccacatgcaattaattaacgaaaaatgtgaaaatgcaccagttttagtagataca
atgttattagttaaattatggttagatttaaagaaaattccaacagtcaactcattccat
ttatcaatgctattaattcatttatataataacggtagaatcaataaatccatgagttca
tatcaagcttttcgtatgttaatggtatttatcagtaaagaaatttcaagtaaatcagta
atctttatgaaattatctcaagatgctatcagcagtggaagtattaaacaaaatcaatat
tttgaagaatttgaaaaactttatccagttgctttagtcgatgatacaggtttattaaat
gtttggtcaagtgtttcaagttggggcttaagacaattgattttagagtctcgtttggtt
ttagagaatttagattctggtaatggttttgaagagatctttatgaccaaattccatttc
tacactgaatatgatttagttttaaagatcatccttggtaaagaagaactctcacaattc
gaggtaccacttaacgactactaccaaaaagaaagttatttagaaaatcgtatataccaa
ttacttagaaaatcattaaccaaacgtgttactaaagtcacaattttcaaacacgataat
gacgagtatacctgttggaaagatgaaatgccagagaatgtcgaccgtactcttactgtt
ggtattaaagttaatacagagaattggttaagtgttatcgacttgggcccaccagctgat
catgttaactctgctaaattccgtgaattctggggtgccaaatcacaggttcgtcgtttc
aaagatggttccattttagatgctgttacctggtcaccaaagaatggctcacgtcatttg
gttattgaagagattgttaaatacattttaaatctccacttaaagatcccagtcactaga
gtttcaaccattgtctctgaattagattcacttattattggcgaaaaggttcaagatcaa
actttaaatgtcattgctgctaaagaaaaattaattcatgttattggtcaattaggttta
ccattgggtatcgaagcattctctccaatcagtccagcactccgttatactgatgtttta
acatcattcgatgaaaactacctcgaaaatgaaccaattcaaatcttattacacttccaa
actagccaacaatggaccaaagatgtagacagcatcaacgcactcaaaacagctttcctc
ttaaagatggcccgtgaattagaaaacacaatctttagacctcgtttaaccgaaaagtat
ttagacttacaagttgatggatttgttttccgtttaattagctactatccaaaagaaatg
gagtttatgcgtgaacaatggaaagtagagggattaccagagttagaatcattacaaaga
aattcaattcatcacacttttatccaatcacttcacaccacctattcatcatacggacca
actacacgtattgcattacgttggattcattctcatctctttagcgatttcatcgaccaa
caatccgttgaactcttagtcggtagtttatataaaggaatcgaaagagacgacggatca
atggattcaaccaatgtaccaaaaacaccactaatgggcttccttagatttttattcctc
ctctacacctacaactttgaagaacaaccattaattatcgattttaacaacagtatcaaa
gaatcaactattcaagaaattaaaaatatgtttgctcttcaaaaacaatccaataatcca
ccaattatttattttgcaaccgataaagatcgtaataatcaatggtttagacatacaacc
atcagagatcaagatcaatggtcaaaaattaaattattagctcaaaaatcaattgaatta
attgaagataactttacaaatcaaacattcaattggttatcaatctttgaaccatcatta
ttcgactttgatgcaatctttaatttaaatgaacaattaataccaaatcattcaaaagaa
attttaaatattatcaataataagaaatttaatttattatcatatttaaatacaaatagt
aatggtacaaataataacaataacaatatttcaaatacatcaacttcaaagaaaccagtt
tttaaaaatattattaaaaaatcagataacaataacaataataataataataatgattca
aaccaattaaataatggtaataataataatttaatatataaagattttaaaccaggtttc
aatccagttgtagaattaattaatcaattaaaagataaattttcagaatattgcatattc
caatatgatttagttggtggaaataaaattactttgaaatggaaatcacaagcttttctt
ccagttccatttaaaccatcaaaatcaaaatatgtaacaccaatttcaaaagattcaaac
ttggttattccaaatatctttgaaattttaaatgaaattcaaatgctcggcggtaaatta
atcaaatcatttaaattaaatcaaaactctaataaccttttaaaagaatggtcattataa
DBGET
integrated database retrieval system
