KEGG   ENZYME: 1.1.1.41Help
Entry
EC 1.1.1.41                 Enzyme                                 

Name
isocitrate dehydrogenase (NAD+);
isocitric dehydrogenase;
beta-ketoglutaric-isocitric carboxylase;
isocitric acid dehydrogenase;
NAD dependent isocitrate dehydrogenase;
NAD isocitrate dehydrogenase;
NAD-linked isocitrate dehydrogenase;
NAD-specific isocitrate dehydrogenase;
NAD isocitric dehydrogenase;
isocitrate dehydrogenase (NAD);
IDH (ambiguous);
nicotinamide adenine dinucleotide isocitrate dehydrogenase
Class
Oxidoreductases;
Acting on the CH-OH group of donors;
With NAD+ or NADP+ as acceptor
BRITE hierarchy
Sysname
isocitrate:NAD+ oxidoreductase (decarboxylating)
Reaction(IUBMB)
isocitrate + NAD+ = 2-oxoglutarate + CO2 + NADH [RN:R00709]
Reaction(KEGG)
Substrate
isocitrate [CPD:C00311];
NAD+ [CPD:C00003]
Product
2-oxoglutarate [CPD:C00026];
CO2 [CPD:C00011];
NADH [CPD:C00004]
Comment
Requires Mn2+ or Mg2+ for activity. Unlike EC 1.1.1.42, isocitrate dehydrogenase (NADP+), oxalosuccinate cannot be used as a substrate. In eukaryotes, isocitrate dehydrogenase exists in two forms: an NAD+-linked enzyme found only in mitochondria and displaying allosteric properties, and a non-allosteric, NADP+-linked enzyme that is found in both mitochondria and cytoplasm [7]. The enzyme from some species can also use NADP+ but much more slowly [9].
History
EC 1.1.1.41 created 1961, modified 2005
Pathway
Citrate cycle (TCA cycle)
Metabolic pathways
Biosynthesis of secondary metabolites
Microbial metabolism in diverse environments
Orthology
K00030  
isocitrate dehydrogenase (NAD+)
Genes
HSA: 
3419(IDH3A) 3420(IDH3B) 3421(IDH3G)
PTR: 
453565(IDH3A) 458048(IDH3B) 741179(IDH3G)
PPS: 
100968720(IDH3B) 100972968(IDH3G) 100987648(IDH3A)
GGO: 
101126919(IDH3G) 101135027(IDH3A) 101141517(IDH3B)
PON: 
100172089(IDH3A) 100172344(IDH3B) 100436005(IDH3G)
NLE: 
100590336(IDH3B) 100593540(IDH3G) 100606177(IDH3A)
MCC: 
677715(IDH3A) 698558(IDH3G) 716726(IDH3B)
MCF: 
101865050(IDH3A) 102124727(IDH3G) 102129545(IDH3B)
CJC: 
100403538(IDH3B) 100405727(IDH3G) 100413152(IDH3A)
MMU: 
15929(Idh3g) 170718(Idh3b) 243996(4933405O20Rik) 67834(Idh3a)
RNO: 
100125384 114096(Idh3a) 25179(Idh3g) 94173(Idh3B)
CGE: 
100751753(Idh3g) 100754480(Idh3a) 100771661(Idh3b) 100772968
NGI: 
103726021(Idh3a) 103731201(Idh3g) 103751138(Idh3b)
HGL: 
OCU: 
100328743(IDH3G) 100338100(IDH3A) 100342113(IDH3B) 103351073
TUP: 
102475641(IDH3G) 102479509(IDH3A) 102493633(IDH3B)
CFA: 
477177(IDH3B) 479066(IDH3A) 481081(IDH3G)
AML: 
UMR: 
103659417 103660316(IDH3A) 103674513(IDH3B) 103679698(IDH3G)
FCA: 
101085721(IDH3A) 101099035(IDH3B) 102902308(IDH3G)
PTG: 
102955736(IDH3B) 102968859(IDH3A) 102972038(IDH3G)
BTA: 
282446(IDH3A) 613338(IDH3B) 614145(IDH3G)
BOM: 
102269910(IDH3B) 102273099(IDH3G) 102281295(IDH3A)
PHD: 
102318399(IDH3A) 102322009(IDH3G) 102324803(IDH3B)
CHX: 
102172823(IDH3B) 102181480(IDH3G) 102181902(IDH3A)
OAS: 
101104080(IDH3B) 101110910(IDH3G) 101120868(IDH3A)
SSC: 
100157242(IDH3A) 100525850(IDH3G) 100624447 733641(IDH3B)
CFR: 
102504528(IDH3A) 102504939(IDH3B) 102513449(IDH3G)
BACU: 
102998515(IDH3B) 103016817(IDH3G) 103018652(IDH3A)
LVE: 
103072517(IDH3B) 103087344(IDH3A) 103091109(IDH3G)
ECB: 
100052969(IDH3B) 100057896(IDH3G) 100060114(IDH3A)
MYB: 
MYD: 
PALE: 
102879783(IDH3B) 102885938(IDH3G) 102898135(IDH3A)
MDO: 
100012825(IDH3A) 100017654(IDH3B) 100027983(IDH3G)
SHR: 
OAA: 
100080286(IDH3G) 100082669(IDH3A)
GGA: 
415362(IDH3A) 426573(IDH3B)
MGP: 
APLA: 
101795551(IDH3A)
TGU: 
FAB: 
101812942(IDH3B) 101821410(IDH3A)
PHI: 
102101435(IDH3G) 102102008(IDH3A) 102102923(IDH3B)
FPG: 
FCH: 
CLV: 
102084068(IDH3A) 102089326(IDH3B)
ASN: 
AMJ: 
PSS: 
102447300(IDH3B) 102452545(IDH3A)
CMY: 
ACS: 
100558969(idh3b) 100566326(idh3a) 100567899(idh3g)
PBI: 
XLA: 
443821(idh3b) 444419(idh3a) 444551(idh3g)
XTR: 
100144949(idh3b) 394979(idh3a) 594985(idh3g)
DRE: 
393926(idh3a) 415247(idh3b) 550579(wu:fa01b02)
TRU: 
MZE: 
OLA: 
XMA: 
LCM: 
CMK: 
103173064(idh3b) 103188099(idh3a)
BFO: 
CIN: 
SPU: 
DME: 
DPO: 
DAN: 
DER: 
DPE: 
DSE: 
DSI: 
DWI: 
DYA: 
DGR: 
DMO: 
DVI: 
MDE: 
AGA: 
AAG: 
CQU: 
AME: 
409292(GB19422) 410396(GB15716) 552128(GB18960)
NVI: 
TCA: 
BMOR: 
API: 
PHU: 
ISC: 
CEL: 
CELE_C30F12.7(idhg-2) CELE_C37E2.1(idhb-1) CELE_F35G12.2(idhg-1) CELE_F43G9.1(idha-1)
CBR: 
BMY: 
LOA: 
TSP: 
HRO: 
LGI: 
SMM: 
NVE: 
HMG: 
TAD: 
AQU: 
ATH: 
AT1G32480(IDH-IV) AT2G17130(IDH2) AT3G09810(IDH-VI) AT4G35260(IDH1) AT4G35650(IDH-III) AT5G03290(IDH-V)
ALY: 
CRB: 
EUS: 
BRP: 
CIT: 
CIC: 
TCC: 
GMX: 
PVU: 
MTR: 
CAM: 
FVE: 
PPER: 
PMUM: 
MDM: 
PXB: 
CSV: 
CMO: 
RCU: 
POP: 
POPTR_0004s21440g POPTR_0005s10260g(POPTRDRAFT_558763) POPTR_0006s12860g POPTR_0007s08590g(POPTRDRAFT_819931) POPTR_0009s16680g(POPTRDRAFT_832930) POPTR_0016s09240g(POPTRDRAFT_825258)
VVI: 
SLY: 
SOT: 
OSA: 
DOSA: 
Os01t0276100-01(Os01g0276100) Os02t0595500-01(Os02g0595500) Os04t0479200-01(Os04g0479200)
OBR: 
BDI: 
SBI: 
SORBI_03g011050(SORBIDRAFT_03g011050) SORBI_04g024840(SORBIDRAFT_04g024840)
ZMA: 
SITA: 
PDA: 
MUS: 
ATR: 
s00001p00200380(AMTR_s00001p00200380) s00002p00262880(AMTR_s00002p00262880) s00003p00237430(AMTR_s00003p00237430) s00034p00097160(AMTR_s00034p00097160) s00040p00206830(AMTR_s00040p00206830)
SMO: 
PPP: 
CRE: 
VCN: 
CSL: 
CVR: 
CME: 
GSL: 
CCP: 
SCE: 
YNL037C(IDH1) YOR136W(IDH2)
AGO: 
ERC: 
KLA: 
LTH: 
VPO: 
ZRO: 
CGR: 
NCS: 
NCAS_0B06290(NCAS0B06290) NCAS_0H02250(NCAS0H02250)
NDI: 
NDAI_0B03590(NDAI0B03590) NDAI_0C01410(NDAI0C01410)
TPF: 
TPHA_0D01560(TPHA0D01560) TPHA_0E01480(TPHA0E01480) TPHA_0J02770(TPHA0J02770)
TBL: 
TBLA_0B02240(TBLA0B02240) TBLA_0B06910(TBLA0B06910)
TDL: 
TDEL_0A03370(TDEL0A03370) TDEL_0C03840(TDEL0C03840)
KAF: 
KAFR_0B06370(KAFR0B06370) KAFR_0J01410(KAFR0J01410)
PPA: 
DHA: 
PIC: 
PGU: 
SPAA: 
LEL: 
CAL: 
CTP: 
COT: 
CDU: 
CTEN: 
YLI: 
CLU: 
NCR: 
SMP: 
PAN: 
TTT: 
MTM: 
CTHR: 
MGR: 
TMN: 
FGR: 
NHE: 
TRE: 
MAW: 
MAJ: 
CMT: 
VAL: 
ELA: 
SSL: 
BFU: 
MBE: 
ANI: 
AFM: 
AOR: 
AOR_1_1098194(AO090012000629) AOR_1_14154(AO090003000008)
ANG: 
ANI_1_798074(An08g05580) ANI_1_906164(An18g06760)
AFV: 
ACT: 
NFI: 
PCS: 
CIM: 
CPW: 
PBL: 
URE: 
ABE: 
TVE: 
AJE: 
PNO: 
PTE: 
BZE: 
BSC: 
BOR: 
ZTR: 
PFJ: 
BCOM: 
NPA: 
TML: 
SPO: 
CNE: 
CNB: 
CGI: 
TMS: 
PPL: 
DSQ: 
PCO: 
SHS: 
PSQ: 
ADL: 
FME: 
GTR: 
LBC: 
MPR: 
MRR: 
CCI: 
SCM: 
ABP: 
AGABI1DRAFT113316(AGABI1DRAFT_113316) AGABI1DRAFT113330(AGABI1DRAFT_113330)
ABV: 
AGABI2DRAFT135516(AGABI2DRAFT_135516) AGABI2DRAFT192040(AGABI2DRAFT_192040)
CPUT: 
SLA: 
UMA: 
PFP: 
MGL: 
PGR: 
MLR: 
WSE: 
MBR: 
DDI: 
DPP: 
DFA: 
DFA_05642(idhA) DFA_10000(idhB)
ACAN: 
TET: 
PTM: 
EHX: 
NGR: 
EFE: 
XFA: 
XFT: 
PD1973(icdA)
XFM: 
XFN: 
XFF: 
XFL: 
XFS: 
XCC: 
XCC0967(icd)
XCB: 
XCA: 
XCP: 
XCV: 
XAC: 
XAC1046(icd)
XCI: 
XAX: 
XAO: 
XOO: 
XOO1024(icd)
XOM: 
XOP: 
XOR: 
XAL: 
XFU: 
SML: 
SMT: 
BUJ: 
SMZ: 
PSU: 
PSD: 
FAU: 
RHD: 
DJI: 
DJA: 
SON: 
SDN: 
SFR: 
SAZ: 
SBL: 
SBM: 
SBN: 
SBP: 
SBT: 
SBS: 
SBB: 
SLO: 
SPC: 
SHP: 
SSE: 
SPL: 
SHE: 
SHM: 
SHN: 
SHW: 
SHL: 
SWD: 
SWP: 
SVO: 
ILO: 
ILI: 
CPS: 
PHA: 
PAT: 
PSM: 
AMC: 
AMAC: 
AMB: 
AMG: 
AMH: 
AMK: 
AMAA: 
AMAL: 
AMAE: 
AMAO: 
AMAD: 
AMAI: 
AMAG: 
ALT: 
AAL: 
GAG: 
GNI: 
FBL: 
MCA: 
MMT: 
MAH: 
AEH: 
CSA: 
HCS: 
ABO: 
ADI: 
AHA: 
AHY: 
AHD: 
AHR: 
AHP: 
ASA: 
AVR: 
AMED: 
OCE: 
RPJ: 
REH: 
H16_B1016(icd3)
CNC: 
BXE: 
BXB: 
RFR: 
VAP: 
VPE: 
VPD: 
HAR: 
MMS: 
CFU: 
CFU_0031(citC)
LCH: 
TIN: 
THI: 
THI_2911(idh2)
BBA: 
Bd1264(leuB)
BBAT: 
Bdt_1246(leuB)
BBW: 
BBAC: 
BEX: 
MXA: 
MFU: 
MSD: 
CCX: 
SUR: 
SCL: 
sce5773(icd1) sce6432(leuB2)
SCU: 
HOH: 
MET: 
GOX: 
GOH: 
GBE: 
GBH: 
GBC: 
GBS: 
GDI: 
GDJ: 
GXY: 
GXL: 
APT: 
APW: 
APF: 
APU: 
APG: 
APQ: 
APX: 
APZ: 
APK: 
THL: 
CAC: 
CA_C0972(citC)
CAE: 
CAY: 
CEA_G0983(citC)
CNO: 
CBO: 
CBA: 
CBH: 
CBY: 
CBL: 
CBB: 
CBI: 
CBN: 
CBF: 
CBM: 
CBJ: 
CLJ: 
CCB: 
CPAS: 
CAH: 
AMT: 
EHA: 
CLE: 
CPY: 
CDF: 
CDC: 
CDL: 
CDG: 
CST: 
DCA: 
DKU: 
DRU: 
PTH: 
PTH_2517(LeuB)
DAU: 
DAI: 
APR: 
ELM: 
AWO: 
TMR: 
BPRS: 
CHY: 
TEP: 
TAE: 
MTA: 
ADG: 
TPZ: 
Tph_c09030(leuB1)
CSC: 
ATE: 
COB: 
CHD: 
COW: 
CKI: 
CKN: 
CLC: 
MAS: 
HOR: 
HAS: 
AAR: 
HHL: 
SSG: 
MED: 
MHG: 
AFN: 
AIN: 
RXY: 
RRD: 
CCU: 
ELE: 
ABA: 
ACA: 
ACM: 
GMA: 
SUS: 
CTM: 
EMI: 
IPO: 
LBA: 
STR: 
GAU: 
GBA: 
ACO: 
PSL: 
PLM: 
PBS: 
IPA: 
SACI: 
CYA: 
CYB: 
SYNE: 
SYNP: 
TEL: 
THN: 
AMR: 
PSEU: 
GVI: 
gvip428(icd)
GLJ: 
SRU: 
SRM: 
HSW: 
HYM: 
CTS: 
DET: 
DEH: 
DEB: 
DEV: 
DEG: 
DMC: 
btf_415(icd)
DMD: 
DMG: 
DLY: 
HAU: 
STI: 
TTA: 
PMO: 
CCZ: 
FGI: 
TYE: 
LFC: 
LFI: 
LFP: 
TTR: 
MTP: 
MCJ: 
MCON_1315(aksF)
MHI: 
MAX: 
TAR: 
MER: 
ABI: 
ACF: 
IAG: 
THG: 
PFM: 
KCR: 
 » show all
Taxonomy
Reference
1  [PMID:14063317]
  Authors
HATHAWAY JA, ATKINSON DE.
  Title
THE EFFECT OF ADENYLIC ACID ON YEAST NICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE ISOCITRATE DEHYDROGENASE, A POSSIBLE METABOLIC CONTROL MECHANISM.
  Journal
J. Biol. Chem. 238 (1963) 2875-81.
Reference
2  [PMID:14832224]
  Authors
KORNBERG A, PRICER WE Jr.
  Title
Di- and triphosphopyridine nucleotide isocitric dehydrogenases in yeast.
  Journal
J. Biol. Chem. 189 (1951) 123-36.
Reference
3
  Authors
Plaut, G.W.E.
  Title
Isocitrate dehydrogenases.
  Journal
In: Boyer, P.D., Lardy, H. and Myrback, K. (Eds.), The Enzymes, 2nd ed., vol. 7, Academic Press, New York, 1963, p. 105-126.
Reference
4  [PMID:13152105]
  Authors
PLAUT GW, SUNG SC.
  Title
Diphosphopyridine nucleotide isocitric dehydrogenase from animal tissues.
  Journal
J. Biol. Chem. 207 (1954) 305-14.
Reference
5
  Authors
Ramakrishnan, C.V. and Martin, S.M.
  Title
Isocitric dehydrogenase in Aspergillus niger.
  Journal
Arch. Biochem. Biophys. 55 (1955) 403-407.
Reference
6  [PMID:13925783]
  Authors
VICKERY HB.
  Title
A suggested new nomenclature for the isomers of isocitric acid.
  Journal
J. Biol. Chem. 237 (1962) 1739-41.
Reference
7  [PMID:8593959]
  Authors
Camacho ML, Brown RA, Bonete MJ, Danson MJ, Hough DW.
  Title
Isocitrate dehydrogenases from Haloferax volcanii and Sulfolobus solfataricus: enzyme purification, characterisation and N-terminal sequence.
  Journal
FEMS. Microbiol. Lett. 134 (1995) 85-90.
Reference
8  [PMID:10601238]
  Authors
Kim YO, Koh HJ, Kim SH, Jo SH, Huh JW, Jeong KS, Lee IJ, Song BJ, Huh TL.
  Title
Identification and functional characterization of a novel, tissue-specific NAD(+)-dependent isocitrate dehydrogenase beta subunit isoform.
  Journal
J. Biol. Chem. 274 (1999) 36866-75.
  Sequence
[hsa:3420]
Reference
9  [PMID:12204383]
  Authors
Inoue H, Tamura T, Ehara N, Nishito A, Nakayama Y, Maekawa M, Imada K, Tanaka H, Inagaki K.
  Title
Biochemical and molecular characterization of the NAD(+)-dependent isocitrate dehydrogenase from the chemolithotroph Acidithiobacillus thiooxidans.
  Journal
FEMS. Microbiol. Lett. 214 (2002) 127-32.
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 
CAS: 
9001-58-5
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