KEGG   Ehrlichia muris: EMUR_00825
Entry
EMUR_00825        CDS       T02967                                 
Symbol
rpoB
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta
  KO
K03043  DNA-directed RNA polymerase subunit beta [EC:2.7.7.6]
Organism
emr  Ehrlichia muris
Pathway
emr03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:emr00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    EMUR_00825 (rpoB)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery [BR:emr03021]
    EMUR_00825 (rpoB)
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:emr03400]
    EMUR_00825 (rpoB)
Enzymes [BR:emr01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     EMUR_00825 (rpoB)
Transcription machinery [BR:emr03021]
 Prokaryotic type
  Bacterial type
   RNA polymerase
    Core subunits
     EMUR_00825 (rpoB)
DNA repair and recombination proteins [BR:emr03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    TCR (transcription coupled repair) factors
     DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
      EMUR_00825 (rpoB)
SSDB
Motif
Pfam: RNA_pol_Rpb2_6 RNA_pol_Rpb2_2 RNA_pol_Rpb2_3 RNA_pol_Rpb2_7 RNA_pol_Rpb2_45 RNA_pol_Rpb2_1
Other DBs
NCBI-ProteinID: AHC39002
UniProt: V9R5J4
LinkDB
Position
195688..199830
AA seq 1380 aa
MSSSVISTKYVLNSFNSVPRLSYAKSIDIKDSLTDLIKIQRDSYNAFIGVDQSTESGIKN
IFQSMFPIQDLLGRAVLEFVSYSIGEPQYDEYECIKRGITFSVPIRIVLRFIVWKVQEVS
FKEVKYVVDEETSEKSIKYIKEQEVSIGDLPTMTSHGTFIINGIERVIVSQMHRSPGVFF
DSDKGKTYSSGKLIYSARIIPYRGSWLDFEFDIKDILYFRIDRKRKLPVSLLLRALGLSN
NDILDTFYDKVRYVRCEKGWIVPFVADRFRGVRLSHDLMDSDGNVLVKANTRITLRIAKK
LANDGLTEYLVPFDEIQGLFIANDLLDPSGNALIISAGENITSEHINKLELFNIDEIFVL
NIDFLTVGPYVLNTLFLDKNVSYEEALFEIYKVLRSGESPSLDVIKAFFDGLFFEKERYD
LSTVGRIKLNDHLGLSVSEDITVLTKDDIIHVIKKLVLLRDGEGSVDDIDHLGNRRVRSV
GEFIENQFRIGILRLERMIMDYMSSVNFDNAMPCDFVNPKILATVLKDFFSSSQLSQFMD
QTNPLSEVTHKRRLSALGPGGLTRERAGFEVRDVHPTHYGRICPIETPEGQNIGLISSLA
IYARINKHGFIESPYRKVDKGVVTDKVEYLLAMQESNYYIADASATLDENNQFVDDMLYC
RHDGNFVMVKREEVDYIDVSPKQIVSVAASLIPFLENNDANRALMGSNMQRQAVPLLKAD
APLIGTGMELIVAAGSGTVVLAKRGGIVHRVDGLYIVIRAFDQEKNEYLGVDIYNLRKFQ
RSNHNTCINQRPLVKPGDYVKANDVIADGSAIDQGELALGKNVLVAFMSWQGYNFEDSIV
ISSEVVKKDVFTSIHIEEFECVVRDTTLGPEKIMRSVPDINEDSLSHLDDVGIVNVGAEV
SAGDILVGKVTPRPPISLPPETKLLVTIFGEKVFDCVDSSLYLPLDVEGTVVDVHVFVRR
GVEENDRSLLIKQNEINGFIKERDYEIDVVSEYFYDELKRVLVNSEMQYNNQDMNDYLAS
TPKKDWWDINLSNEYVLSQVKDLKEKFDSMIQNAHSKFDQKIDKLNYGYDLPQGVLCIVK
VFVAVKHNLQPGDKMAGRHGNKGVISRIVPVEDMPYLEDGTPVDIILNSLGVPSRMNVGQ
ILETHLGWASVNLGKKIGHILDNIDELTISHLRNFLDQVYDGQDLKYNIQSMSDDDLLAF
AERLRDGVPMAAPVFEGPKDSQISNLLKLADLDVSGQVDLYDGRIGEKFDRKVTVGYIYM
LKLHHLVDDKIHARSVGPYGLVTQQPLGGKSHFGGQRFGEMECWALQAYGAAYTLQEMLT
VKSDDIVGRVKIYESIIKGDSNFECGIPESFNVMVKELRSLCLDVALKQDKDFLNNEVKD
NT seq 4143 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtcttcttctgtaatttctactaaatatgtattaaattcttttaattcagtacctaga
ttgtcttatgcaaagtcaatagatataaaagattctttaactgatttaataaaaatacag
agggattcatacaatgcatttattggggtagatcaaagtactgaaagtggaataaagaat
atttttcagtctatgtttcctatacaagatttgttaggtagggctgttcttgaatttgta
agttatagtattggtgaaccacagtatgacgagtatgagtgtataaaaagaggtattacc
ttttctgttcctatacgtatagttttgcgttttatagtatggaaggtgcaggaggtatct
tttaaagaagtaaaatatgtagtagatgaagagacttcagaaaaaagtataaagtacata
aaagagcaggaagtttccataggggatcttcctactatgacttctcatggaacatttatt
ataaatgggatagagagagtaatagtatcgcaaatgcatcgttctccaggtgtatttttt
gatagtgataaaggaaaaacttatagttctgggaaattaatttattcagctagaattatt
ccctataggggttcatggttagattttgaatttgatataaaagatatactttactttcgt
attgatagaaagaggaaattaccagtttctttgcttttgagagctttaggtttatctaat
aatgatattctagatactttctatgacaaggtacgttacgtaagatgtgaaaaaggatgg
atagttccatttgttgctgataggttcaggggtgttaggttgtctcatgatcttatggat
tcagatggaaatgtattagtaaaggccaatacgagaattactttgagaatagctaaaaaa
ttggctaatgatgggcttacagaatatttagttccatttgatgaaattcaaggattattt
attgctaatgacttgttagatccaagcggtaatgctttgattatatctgcgggagagaat
attactagtgagcatataaataagttagaattatttaatatagatgagatcttcgttcta
aatatagattttttaacggttggtccatatgttttaaatacgttatttttagataagaat
gtatcttatgaagaggcgctttttgaaatatataaagttttgcgttctggtgagtcgcct
agtttagatgttataaaagctttttttgatggattgttttttgaaaaggaaagatatgat
ctatctacggttggaagaataaaattaaatgatcatcttggattgagtgttagtgaagat
attacagtcttaactaaagatgatataattcatgttataaagaagctggtattgttaagg
gatggtgaaggttctgttgatgatatagatcatcttggtaatcgtagggtaaggtctgtt
ggtgagtttattgaaaatcaatttagaattgggatattgagacttgaaagaatgattatg
gattacatgtcttcggtaaattttgataatgcaatgccatgtgattttgtaaatcctaag
attttagctacagttttaaaagacttctttagttcttctcagctttctcagtttatggat
caaactaatccattgtctgaggttactcataaacgtaggttatctgctttaggcccaggt
ggtttaactagagaaagggcaggatttgaggtgagagatgtacacccgacacattatgga
agaatttgtccaattgaaactccagaaggtcaaaatattgggttgatcagtagtttagct
atctacgctcgtattaataagcatggatttattgaaagtccttatcgaaaggtagataaa
ggagttgttactgataaggtggagtatctgttggctatgcaggaaagtaattattatata
gctgatgctagtgctactcttgatgaaaacaaccaattcgttgatgatatgctttattgc
agacatgatggaaattttgttatggttaagagggaggaagttgattatatagatgtttct
ccaaaacaaattgtttcagttgctgcatctttgatacctttcttggaaaataatgatgcg
aaccgtgctttgatgggttctaatatgcaacgtcaggcagtgccactattaaaagcagat
gctcctttgattggtactggtatggaattaatagttgctgctggatcaggaacagttgtt
ttagctaaacgtgggggtattgtccatagagtagatgggttatatatagttattcgtgcg
tttgatcaggaaaaaaatgaatatctaggtgttgatatttataatttaagaaaattccag
cgttctaatcataatacttgtattaatcaacgacctttagttaaacctggagattatgta
aaagcaaatgatgttatagctgatggatcagctatcgatcaaggtgagcttgctttaggt
aagaatgtgttagttgctttcatgtcttggcaagggtataactttgaagattcaatagtt
atttcaagtgaagttgtaaaaaaagatgtatttacttcaatacatatagaggaatttgaa
tgtgtagttagagatacaacacttggtccagaaaagattatgaggtctgttcctgatatc
aatgaagatagtttgtctcatttggatgatgtaggaattgttaatgttggtgctgaagtt
tctgccggggatattttagttggtaaagttactcctagacctccaatttctctacctccg
gagacaaaattattagttactatttttggggaaaaagtatttgattgtgtagattcttca
ctgtatttgccacttgatgttgaaggtacggtagttgatgtgcatgtttttgtacgtcgt
ggggttgaagaaaatgatagatctctcctaatcaagcaaaatgagattaatggattcata
aaagaaagggattatgaaattgatgtagttagtgaatatttttatgatgaattgaagaga
gttttagtaaattctgagatgcagtataataatcaggatatgaatgattatttggcatct
actccaaaaaaggattggtgggatattaatttgtctaatgagtatgtattatctcaagtt
aaagacttaaaggaaaaatttgattcgatgattcaaaatgctcatagtaaattcgatcaa
aagatagacaagttaaattatgggtatgatttaccacagggtgttttatgtatagttaaa
gtttttgttgcagtgaaacataatctgcaaccgggagataaaatggctggtagacatggt
aataaaggggtaatttcccggatcgtgcctgttgaagatatgccatacttagaagatgga
actcctgttgatattatacttaattctttgggggtcccttctcgtatgaatgttggacag
atcttagaaacacatttaggatgggcttctgttaatttaggaaaaaagatagggcatata
ttggataatattgatgagttgacaatatctcatttgagaaactttttagatcaggtgtat
gatggacaagatttaaaatataatattcaatctatgagcgatgatgatcttttggcgttt
gcagaaaggttacgtgatggtgtaccaatggctgctccagtgtttgaagggccaaaagat
agtcaaatttctaacttattaaagttagctgatttagatgtttcagggcaggtagatctt
tatgatggaaggattggtgaaaaatttgatcgtaaggttactgtgggatatatatacatg
ttaaaattgcatcacttggtggatgataagatacatgcaagatctgttggtccatatgga
ttagtaactcagcaaccattaggtggaaaatctcattttggtggtcagcgttttggggaa
atggaatgttgggcattacaggcttacggagctgcttatactttacaagaaatgcttaca
gtaaagtctgatgatattgttggaagagttaagatctatgaatctataattaagggtgat
agtaattttgagtgcggaataccagagtcctttaatgtcatggtgaaagagttaagatca
ttgtgtttagatgttgctttaaagcaagataaggatttcttaaataatgaagtgaaagat
taa

DBGET integrated database retrieval system