Francisella cf. novicida Fx1: FNFX1_1685
Help
Entry
FNFX1_1685 CDS
T01937
Name
(GenBank) Chitinase
Organism
fcf
Francisella cf. novicida Fx1
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_18
CBM_5_12
ComA
DUF5603
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEE88070
LinkDB
All DBs
Position
complement(1760151..1762823)
Genome browser
AA seq
890 aa
AA seq
DB search
MQKVKKDGYNVMIVAYGEVYDDNIGFYTNSVTSTQTIIDKIRDAKKAGMKVLLAVGGSPN
TFHPGVKQGAPDPKIFGNDLTDAQIKSLANNIVSFLNKNDIDGILYCIKKFTSPEFITKL
SADIKKINAKIIIAAEPEVNNYKLVTTGLSNDYDKAIEDGNIDYLFIQEYNTYPEYDPNF
ISESYPKIIENVNIPIKTKILIEEPTNAVSGGTNTIYHPQGNATKSLSTEQAIKLLLPQL
EKLKFKPRFSGVAGWSLNTDYAADLYGDSSHNAGAFAKGLSACIYKNTCTEIDNQIHGPV
VAGILPLWGKSSSYNISGQQINTIPISISMPKDKEYCDYNPNVCKYNVIIAAYLTYTSSK
GFELSFNEENGSSKKIYSPEELKAFITYMNSKGKHTIVSIGGKYSHINWETINFSDLVKI
VQEYGFNGINFDLSSSDMPKNDKVAKIAADKINKLITALRQNNHGFWLTFSPEWHYIVAP
LAKNDKDNIYVNHNYIELLDSLGMSKIDYIWLNTFADKPSDGILSFYKGKDGEHIKITPV
DGYAKFLASLAWALTTRAGYDANMPKYDEIDKPLHIPANKLVLMIPATKGTTHSDMVYVL
SEKDIKEVVSLMKGNNASFAGFAVWSIDFDATNINNGDLGNDYSHKPWSTTAAISDISLP
PIVSQLKDQIKQETKATSPIQEQEQSIDTGIINYPDKIGAYNVDTIINFQGKKYKCKSNL
EVKLCNDKGYIPNGLYGYLAWDEIDTAKQTKVKRKQRKLAVGEIVKYPKFIGNYNVGQIV
IAGDRKFECQKQELCNDKSYRPIGKSGYLAWSDITDDVAHLATEAKQVKPKGAEYIYPFG
IEDYSAGTVVAIGQELYRCKVGPESSLCNSEAYKPTGKYGTDAWTKIDSK
NT seq
2673 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaaaggttaaaaaagatggctacaatgtgatgatagttgcctatggagaggtatat
gatgataatatagggttttatactaattctgtaacttctacacagactataatagacaaa
attcgtgacgctaagaaagctggtatgaaagtactattagctgttggtggaagtcctaat
acttttcatcctggggttaagcaaggtgctccagatccgaaaatatttggtaatgattta
actgatgcgcaaataaaatcattagctaataatatagttagctttttaaataaaaatgat
attgacggaattttatactgtattaaaaaatttacatcacctgaatttattacaaaactt
tctgcggatataaaaaagattaatgcaaaaattataattgctgctgaaccagaagttaat
aattataaattagtaacaacagggttaagtaatgattatgataaagctatagaagatggt
aatatagattatctttttatacaagagtataatacatatcctgagtatgatccaaatttt
atttctgaaagttatccaaaaattattgaaaatgtaaatattcctattaaaacaaaaatt
ttgatagaagaaccaacaaatgctgtttctggcggaacaaatactatatatcatccacaa
ggaaatgctacaaaatcattatcgactgagcaagcaataaaactattattaccgcaactt
gagaagctgaaatttaaaccaaggttttctggggttgcggggtggtcattaaataccgat
tatgctgctgatctgtatggagattcttcacataatgccggagcctttgcaaaggggctt
agcgcatgcatctataaaaatacttgtacagaaatagataatcaaatacatgggccagtt
gttgctgggattttaccactttggggtaaaagtagttcttataatatttctggtcagcag
ataaatactatacctataagtatatcgatgccaaaagataaagagtattgtgattataac
cccaatgtttgcaaatataatgtaattatagctgcatatttaacttatactagtagcaaa
ggatttgaactatcttttaatgaagagaatggtagttctaagaagatatattctccagaa
gagttaaaagccttcataacttatatgaattcaaaaggaaagcatactattgtttctatt
ggtggcaaatattctcatattaactgggagacaataaattttagtgatcttgtaaaaatt
gttcaagaatatggttttaatggcataaattttgatttaagtagttctgatatgcctaag
aatgataaggtagcaaaaatagctgctgataaaataaataaattaatcacagcattgaga
caaaataaccatggtttttggttaactttctctcctgaatggcactatatagttgcaccc
ttagctaaaaatgacaaagataatatctatgtcaaccataattatattgagctgttagat
agtcttggtatgagtaaaatagattatatttggcttaatacatttgcagataaaccctct
gatggaatcttgagtttttataaaggtaaggatggcgagcacataaagattactcctgtt
gatggttatgctaagtttctggcatcacttgcgtgggctttgacgacgcgagcaggatat
gatgcaaatatgccaaaatatgatgaaattgataaacctttgcatattcctgccaataag
ctagtcttaatgattcctgctaccaaaggtactacacatagcgacatggtatatgtgctg
tcagaaaaagatatcaaagaggtagtttctttgatgaaaggaaataatgcttcttttgca
ggttttgcagtttggagtatcgattttgatgcaactaatattaataatggtgatttgggt
aatgactatagtcataagccttggagtacaacagcagcaatttcagatattagtttacca
cctattgtttcacaattaaaagatcagataaagcaagaaacaaaagctacatcaccaata
caagaacaggagcaaagtatagatactggaattataaactatcctgataaaattggcgct
tataatgttgatactatcataaatttccaaggtaaaaaatataagtgcaaatctaattta
gaagttaaactttgtaatgataaaggatacattccaaatggactatatggttatcttgct
tgggatgagattgatacggctaaacaaactaaagtaaaacgtaaacaacgtaagcttgct
gttggtgaaatagttaaatacccaaaatttattggaaattataatgttggacaaattgtt
attgctggagatagaaaatttgaatgtcaaaagcaagagttatgtaatgataaatcatac
cgacctataggtaaaagtggatatcttgcttggagtgatataactgatgatgtagctcat
ttagcaactgaagctaaacaagttaaaccaaaaggtgcagagtatatttatccatttggt
attgaggattatagtgctggtacggtagttgctattggtcaagagctatatcgttgtaag
gttggtcctgaatctagcttgtgtaatagtgaagcttataaaccaactggtaagtatggt
acagatgcttggacaaaaatagatagtaaataa
DBGET
integrated database retrieval system