Helicobacter pylori Puno135: HPPN135_02380
Help
Entry
HPPN135_02380 CDS
T01920
Name
(GenBank) outer membrane protein HofC
Organism
heu
Helicobacter pylori Puno135
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HP_OMP_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEN18176
UniProt:
G2M9E9
LinkDB
All DBs
Position
469266..470852
Genome browser
AA seq
528 aa
AA seq
DB search
MKLKKRKVVATLLKRFSLPLLFTTGSLGAVTYEVHGDFINFSKVGFNHSPINPVKGIYPT
ETFVNLTGKLEGSVHLGRGWTVNLGGVLGGQVYDSTRYDRWAKDFTPPSYWDKTSCGTDS
MSLCMNATKMWQQQGPGGVINTRGIGWEYMGEWNGLFPNYYPANAYLPGGSRRYEVYKAN
LTYDSSRVHMVMGRFDVTEQEQMDWVYQLFQGFYGTFKLTNKMKFLLFSSWGRGIADGQW
LFPIYREKPWGIHKAGIIYRPTKNLMIHPYVYLIPEVETDPGVKIEYDTNPGFSGRGIRN
RTAFYALYSYRWNNAEYGRYAPARYNTWDPFLDNGKWRGLQGPGGATLFLRHHIDINNYF
VVGGAYLNIGNPNMNLGTWGNIIAVDGIEQWVGSIYSLGFAGIDNITDADAFTEYVKGGG
KHGKFSWSVYQRFTTAPRALEYGIGMYLDYQFSKHVKAGLKLVWLEFQIRAGYNPGTGFL
GPNGQPLNLNNGLFESSAFAQGPQDMGGIKKSITQDRSHLMTHISYSF
NT seq
1587 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaattaaagaaacgaaaagttgtggctacattgctaaagcgttttagcttgccactg
ttgttcactacgggttcattaggggcagttacttatgaagtgcatggggattttatcaat
ttctccaaagtgggttttaaccattcgcctattaaccctgttaaaggtatctatcccaca
gaaacttttgttaaccttacgggtaagctagaggggtctgtgcatttaggtaggggatgg
accgtgaatttaggcggtgttttgggcggacaagtttatgatagcactaggtatgatagg
tgggcaaaggattttacccccccaagctattgggataaaacttcttgtggcactgattct
atgagcctttgtatgaacgccactaaaatgtggcaacagcaagggccaggcggtgtcatt
aacactagaggtattggttgggaatatatgggtgagtggaacggcttgttccctaactac
tatccggctaacgcttacttgcctgggggttcaaggcgttatgaagtttataaagcgaat
ctcacctatgatagtagcagagtccatatggtaatggggcgctttgatgttactgaacag
gagcaaatggattgggtttaccaattgtttcaaggtttttatgggactttcaagctcacg
aataagatgaagttcttgctctttagctcttggggtcgtggtatcgctgatggtcaatgg
ttgttccctatctatcgtgaaaagccttggggtattcataaagccggtattatttatcgc
cctacaaagaatttaatgatccacccttatgtgtatcttatcccagaagtagaaacagat
cccggtgttaaaatagagtatgataccaatccggggtttagtggtaggggcattaggaat
agaacggctttctatgcgttatacagctatcgttggaataacgctgaatacggtcgttac
gcgcccgctcgttataacacttgggatccgttcttggataatggtaagtggcgtggcttg
caaggtcctggtggtgcgacgctctttttacgccaccatatagatattaacaactacttt
gtggttggtggtgcttatctcaacattggtaaccctaacatgaacttaggtacttggggt
aacatcatcgctgtggatggtatcgaacaatgggttggcagtatctacagcttagggttt
gcggggattgacaacattaccgatgctgacgcgttcaccgagtatgttaaaggtggaggc
aagcatggtaagtttagttggagcgtttatcagcgcttcaccaccgctccaagggctttg
gaatatggtatcggtatgtatctagactatcagttcagcaagcatgttaaagcgggtctc
aaactcgtatggttagagttccaaatccgtgcgggttacaaccctggaaccggtttcctt
gggccaaacgggcaaccgcttaacttgaataatggtttgtttgaatcttctgcgttcgcg
caaggtcctcaagacatgggtggcattaaaaagagtattacccaagacagaagccatttg
atgacacacattagttatagtttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
