Hydra vulgaris (swiftwater hydra): 100201742
Help
Entry
100201742 CDS
T01080
Name
(RefSeq) uncharacterized protein LOC100201742
Organism
hmg
Hydra vulgaris (swiftwater hydra)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Lectin_C
PK_Tyr_Ser-Thr
Pkinase
DUF6794
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100201742
NCBI-ProteinID:
XP_047141386
LinkDB
All DBs
Position
10:complement(30254299..30429385)
Genome browser
AA seq
1666 aa
AA seq
DB search
MFKCCLDIYFGIYFVSMISFLKDCNGCDDGWFAYGRYCYFFQNKTLNGKSWRDASLSCQA
MGANLLSIEDQAENYFIKNIFKDDSLKKDNYWIGLNDEVNNREFKWSDGKYLKFSNWLPK
TPNNQGTGENCVETSRIGWNDNDCSKSYGFICKIIKENNNSCTRGWINYKNYCYLFRKKD
EKFDGSNWSDSYSFCRSKGGDLLSIDDQEENSFVTNILESERSMKYQNFWIGLNYLMSYK
KFLWSDHTKWNLKIPIENILTHTNNISTRCVVINTDSWNGQDCSNKYGYICKVKGESNNS
CSSDWFQFASYCYYFHTKNESNGKGWLYSYLNCLEKGGNLLSIDDEAEYAFILNTLKNYS
MSKNNYWIGLTSRWFNSWFLWSDNTYSQYINLKLNGSYDEKYKSIIINKAYWEVRNYKSL
NGFICKKRRAINHNCAEGWTSYRKHCYFINSKSKTWSDSFSSCQYKGGNLLSIENQEENR
FIQSSLIKDNGDYWIGLNKLWNYRKFAWSDNTYTQFFDWIINEPDTIHDVENCVAMNSNG
WSDRDCNILNGFVCKAKRVNLDYVNHPDEIILTQGYLFGTLKVLKTEYTISFNVKPLIYS
KGSKSVLQLISGNNSRDYIDKNLGVWFHEDGSGKLVIQAAVYGFSSCLVKTDPLTLGQWS
NIKIYQWLFCSKFWFAVDINGVNIYKMENFFTVDLKEIKIYVSNLWDDAQNGSISHFLII
NGKAKFLIEDSNTSLIKGISIANLSKINKEYLVSFDFIPMVFETGLHSIINFTVGDYIVN
SRSVLLGIWLDENGTGRIKVLALINEKPTLFYYPVLLNKWSNIEVSQRFNGLFYVFILRI
NGDVIFSVINNQAQELIDVKALASNPWVNEVIWPQNYVRPTANTMQLSQLFQNVVGTTVN
RIQFSQLIQSIVAPITNPMQLRQLIQNLIGQIENEIKLRQLTQKAVGLIANPMQFGQLKQ
NIDQTANLMQFGRLPQNGLVMDNELKSLVIFPKDYIALKHEFVLNQGRILGILNVLKKEY
TISFNLKSMSYSKGLKSVLYLILCNSSEIYDDFSLGIVFHEDGSGSLVIYATVHGNSNYY
VKTNPLLLGQWQNIRICQLLVGKKFIFTVYLNDINVYRVENSLAVEFKNIKVYGSNIKDS
PQDGSVSDLLIINGKVEYIVGNFVTPLVKGKLIAEIPVLDKEYFVSLDFNPTKFDFGLHN
VIHFTIGSNYSNKGDKTPGIWSNSQGNGALEIASLNNGNVYEHTFSTNAFKVNQWSNIVI
RQIFNGSFYVYTIIINEKVVFSITNYQATSFGNVKVYASNPWTKAQNGLIKNFFVVNGNS
MLFTLLLSVLSESYSDREEDEFEKEHDKKEKRRITTSTSTYKKVSVISVAVLVPVLFVLV
AVIFVIAFCVSNIDGKSSVNFIYTQGYQESLKTTTTTGDLYMGVGQNKTLPKDDGTLTPE
DLLSFSWQVASGMEFLSSSKLVHRDLAARNILVGPGKIVKVSDFGLTRKINDELTYMSKK
KRRLPVKRMSVEAIFDQKFTSFSDVWAYGVVLFEIVTLGGTPYPTIGNRELLSLLKSGYR
MDKPENCSESMYDIMLQCWNEDPLQRPTFTTLREHFDEVLSQGGCYLNFEFNENSVSSFL
PYETDNDDDNTVEDGIFNKPVHIKSTEEMKNLEEPILPLYNRYTNI
NT seq
5001 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttaaatgctgtttggatatttattttggaatatattttgtttctatgatatcattt
ttaaaagattgcaatggttgtgatgatggctggtttgcgtatggaaggtattgctatttt
tttcaaaataaaacattgaatggaaaaagttggagagatgcttcattatcatgtcaagct
atgggtgcaaatttgttaagtattgaggatcaagctgaaaactattttattaaaaatatt
tttaaagatgacagcctgaaaaaagataattattggattggactcaatgatgaagtcaac
aatagagagtttaagtggtcggatggcaagtatttaaaattctcgaattggttaccaaaa
acacctaacaatcaaggaactggagaaaactgtgtggaaacaagtagaattggttggaat
gataatgactgttctaaatcatatggatttatttgtaaaattattaaagaaaacaataac
tcatgtacccgtggttggattaattataaaaattactgttatttgttccgaaaaaaagat
gaaaaatttgatggaagtaattggagtgactcatattcattttgtcgctctaaaggagga
gatttgttaagtatagatgatcaagaagaaaattcatttgttacaaatattctagaaagt
gaacgaagtatgaaataccagaatttctggattggcctcaattatcttatgagttataaa
aagtttctttggtctgatcacactaaatggaatttaaaaatacctattgaaaatatatta
actcatacaaacaatatttcaacaagatgtgtggtaataaatactgatagctggaatggt
caagattgtagcaataaatatggatacatttgtaaagtaaaaggagaaagcaacaatagt
tgctcaagtgattggttccaatttgctagttattgctactattttcatactaaaaatgag
tcaaatggaaaaggatggctttattcctatttaaactgcttagaaaaaggaggaaacttg
ttaagcatagatgatgaagcagaatacgcatttattttaaacactcttaaaaactacagc
atgagtaaaaataattactggattggtctcactagtcgttggtttaactcatggtttttg
tggtctgataatacatactcgcagtatataaatttaaagttaaatgggtcatatgatgaa
aaatataagtctatcataataaataaagcatattgggaagtgaggaattacaaatcttta
aacggatttatttgtaaaaaaagaagagcaattaatcacaattgtgctgaaggttggaca
agttatagaaaacattgctactttattaatagtaaaagtaaaacatggtcagactctttt
tcatcatgtcagtataaaggagggaatttgctaagtatagaaaatcaagaagaaaatcga
ttcattcaaagcagtttaatcaaagataatggtgattattggattggtctcaataaactt
tggaattacagaaaatttgcatggtctgataatacttacacacagttctttgattggatt
ataaatgaaccggacactattcatgatgttgaaaattgtgtagcaatgaactctaatgga
tggagcgacagagattgcaatattcttaatggatttgtttgtaaagctaaaagagttaat
ttagattatgtaaaccaccctgacgaaattattctaacccaaggctatctttttggaaca
cttaaagttttgaaaacggagtatactatttcatttaatgtgaaacctctgatttattcg
aagggttcaaaaagtgttcttcaactaatctcaggtaataacagtcgagattatattgac
aaaaatctaggtgtttggtttcatgaagacggatctggaaaacttgttatacaagctgca
gtttatggttttagtagttgcttagttaaaacagatccgctcactttaggtcaatggtct
aacataaaaatataccagtggctattttgcagtaagttttggtttgccgtggatataaat
ggtgtaaatatctataaaatggaaaattttttcactgtagatttaaaagaaataaaaatt
tatgtttcaaatctctgggatgatgcacaaaatggatcaatatctcactttttaattatt
aatggaaaagcaaaatttcttattgaggatagtaacacttcattaataaaaggaataagt
attgctaacttatcaaagataaataaagaatatttagtgtcttttgattttattccaatg
gtatttgagactggactgcacagtattattaactttactgttggagattatattgttaac
agtagaagtgtacttttaggcatatggttagatgaaaatggcacaggaagaattaaagtt
ttagctttaattaatgaaaaaccaactttgttttattaccctgttttattgaataagtgg
tcaaatatagaggtttctcaaagattcaatggcttgttttatgtattcatattgagaata
aatggagatgtgattttttctgtgattaacaatcaagctcaggagttaattgatgtcaaa
gcattagcttcaaatccatgggtcaacgaagttatctggccgcaaaactatgttagacca
acagcaaatacaatgcagttgagccaattatttcaaaatgtggttggtacaactgtaaat
cgaattcagttcagccagctaattcaaagtatagtagccccaattacaaatccaatgcag
ttgcgccagctaattcaaaatctaattggtcaaatagaaaatgaaatcaagttgcgccaa
ctaacgcaaaaagcagtcggcctaatagcaaatccaatgcagttcggccaactaaaacaa
aatattgaccaaactgctaatctaatgcagttcggccgactgccgcaaaatgggttggtc
atggataatgaattaaaatctcttgttatttttcctaaagattatattgctcttaaacat
gagtttgttctaaatcaaggaagaattctaggaatacttaatgttttaaaaaaggagtac
actatttcttttaatttgaagtctatgagttattctaaaggtttaaaaagtgttctttac
ttaatcttgtgtaatagcagtgaaatatatgatgactttagccttggtattgtatttcat
gaagatggttctggaagtcttgttatttatgctacagttcatggtaatagtaactactac
gtcaaaacaaatccacttctattaggacaatggcaaaatattagaatatgtcaattattg
gttggaaaaaagtttatatttactgtttatttgaatgacattaatgtttatagagtagaa
aattctttggctgtagaatttaaaaacattaaagtttatggttctaatataaaggattct
ccacaagatggttccgtttcggaccttctgataatcaatggaaaagttgagtacattgtt
ggcaattttgttactccattagtaaagggaaaactaattgcagagattccggtcctagat
aaagagtattttgtttctcttgattttaatcctactaaatttgattttggtttacacaat
gttattcattttactattggttctaattattctaataagggtgataaaacacccggaatc
tggtcaaattcacaaggtaatggcgcacttgaaatagcatctttaaataatggaaatgtg
tatgaacatactttttctacaaatgcatttaaagttaatcagtggtcaaatattgtaata
cgtcaaattttcaatggttctttttatgtatacacaatcattattaatgaaaaagttgtc
ttttctataacaaactatcaagctactagctttggtaatgtcaaagtatatgcttcaaat
ccttggacaaaagctcaaaatggtttaataaaaaacttttttgttgtcaatggaaattca
atgctatttacactacttctttcagttttaagtgaatcttattccgatagagaagaggat
gagtttgaaaaggagcatgataaaaaagaaaaaaggagaattacaacttcaacctcaact
tataagaaagtatcagtcatctctgttgccgtcttagttcctgttttatttgttcttgtt
gctgttatttttgttattgctttttgtgtttcaaatattgatggtaaatcgtctgtaaac
tttatatatacacaaggatatcaagaatctcttaagacaacaacgacaacgggtgattta
tatatgggtgttgggcaaaataaaactctgccaaaagatgatgggaccttaacacctgaa
gatttgcttagtttttcttggcaagtggcatcaggaatggaatttctttcatcttctaaa
ttggttcatcgagatctggccgctagaaatattttggtcggacctggaaaaattgtaaaa
gtatctgattttggtcttactcgaaaaattaatgatgaattaacctacatgagcaagaaa
aagcgtcgtttaccagtaaagaggatgtctgttgaagccatatttgaccagaagtttaca
tcatttagcgatgtgtgggcatatggagttgtattatttgaaattgtaactttaggaggt
acgccttatcctacaataggtaaccgtgaacttctctctcttttgaaatctggttatcga
atggataaacctgaaaattgttctgaatcaatgtatgatattatgttgcagtgttggaat
gaggatccattacaacgtccaacttttacaacactacgtgagcattttgatgaagtattg
tctcaaggtggttgttatctcaactttgaattcaacgaaaatagtgtgtcctcatttttg
ccgtatgaaacagataatgatgacgataacacagtagaagacggaatttttaacaaacct
gtacacataaagtcaactgaggaaatgaaaaatctggaagagcccattcttccattgtac
aatagatatacaaatatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
