Helicobacter mustelae: HMU00600
Help
Entry
HMU00600 CDS
T01191
Name
(GenBank) putative outer membrane autotransporter
Organism
hms
Helicobacter mustelae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CBG39324
UniProt:
D3UFQ3
LinkDB
All DBs
Position
67685..71527
Genome browser
AA seq
1280 aa
AA seq
DB search
MQKFSNYKKIFQPFITNTFVFSLASSFGNAADGASQITVTVDNPAAEKQTAAVSGSGGNA
TFLFTNGAGSLVQDGATSAGVGTATGTNIVVNIANTINTFSVTGKALTGGSGGVGSAGKP
VNLTFDFGDISGSQKTLNLNIGSTGAGQANALTGNVNVIGGGGSNLQKGNAGTTFNANFD
KAIVTGNITTRRGASGAGANHITFSNTGANQATVVLRGNILNFGGINNVSFDQGTMKGNI
EARHLSNASPGYNQVQFLQDGVVYEGNITASGGENVLFFGRKESKTVGSSSSGGITPAAS
GNGTADNGKLQTIFTGNGDTFKGNLLAENGGKNTMTFYKNGKIEGSTGIVQITANNASNT
IELRNGGSITNARILSQEGGKNSIGFSTSDGGASSASQTGGSTTPNSKFDAISSGNNSST
TILLQTPMTLDANITYGGHFAGNSYVYDGSNNTVTLFFANKRSEGTTAPSTTPSNNASQT
RAASQISNTSPVNSTSSTTELAASFKDGISLQLQDKSINLDGKDGTYSTSFISTAMAHGL
GANSTTPLHVHVIKSGDANNVNNSITLSGVAVGSVSALSSSDATNPAAINSTYTINLQNK
SIFLGSFSKDLQNSHTKVNLVLEHNAKFIADSSTQLENLTIQAATFDKNDSATPTLLQNN
TVVDVASGGGSNNITREGNTFYLLSIGKDPTNIAQATGGASSASQTGSTGGSTPTGSTTP
NNALGANGLSGSNALFRVYVNTNANQGSNGSNNGSGAALNNQHSSNGSGLYGYIYSDRVI
VHNVKNSASGNTITRSTGGSTSTATSITPLTEYLQILASGNVSSIKYHGGGTETKGNIGV
ATVRNDASGKALVDFKTIGTIVGFDALDTKLIAIKTDAYGKVKNNGLSGAGASGGTSGGG
IHGNDYTTYFLQSGVSGTSRANQLASATALASNYYLYLANINSLNKRLGELRNNPHANGV
WIRLFNGMQTTTFALQTKSIYTTLQGGYDYAFGSEGANDYLGFAISYANAGMDSLMRAQA
FNHAQKGIKSSSGNAFEIALYNSYVQDGATRSTNFKNGLYSDSIIKLSFLANKIKLAGNN
NTPSVNNFGFTFSQEIGYRFLLGENQEWYITPQGELTLGYLNQSNLKQVLGSHYLSGVQT
SIFTLQGRIGSSFGYRFYQFTADKNYYPEIYLGLYGVGNYIGGGDITLISNLGSVNALRT
LGSTGRFLFNLGTNFTIKDNHRVYFDFERSFGGRIIVDYQFNIGYRYSFGENKKYASLAG
SISQTIKRDEKKQNKEEITE
NT seq
3843 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaaaattctcaaactataaaaaaattttccagccattcattactaacacttttgtg
ttctctcttgcttctagcttcgggaatgcagcagatggtgcaagtcaaatcacagtaaca
gtagataatccagcggctgaaaaacagactgctgcagtaagtgggagtggcgggaatgct
acttttttgtttacaaatggtgctggcagtctcgtgcaagatggagctacaagcgcaggc
gtaggaactgcaacgggaacaaacatagtggtaaatattgcaaatacaataaatactttt
agcgtgactggtaaggcgctaacaggtggaagcggtggtgtggggagtgcgggaaagcca
gtaaatctaacctttgattttggtgacatctcaggtagtcaaaaaacattgaatctaaat
attggtagcacgggtgcaggtcaggccaatgccttgactgggaatgttaatgtcattgga
ggtgggggcagtaatttgcaaaagggaaatgcaggcacaacatttaatgcgaattttgat
aaagcgattgtgactggaaatatcaccacaagaaggggagcaagtggtgcgggagcaaat
catattacatttagcaatactggtgcaaatcaggcaacagtggtattgagggggaatatt
cttaactttggaggcataaataatgtgagctttgatcaaggaaccatgaagggaaatatt
gaagcaaggcatcttagcaatgcaagccctggatacaatcaagtacaattcttgcaagat
ggagtggtgtatgaggggaatatcactgcaagtggtggagagaatgtgttattttttggt
agaaaggaatccaaaacagttggatctagcagcagtggtggcatcactcctgctgcctct
ggcaatggcactgcagacaatggcaaattacaaaccattttcactggcaatggagatacc
ttcaaaggaaatctcctagcagaaaatggtggaaaaaacactatgacattttataaaaat
ggcaagattgaaggcagcacaggcattgtgcaaatcacagctaataatgctagcaatact
attgaactaagaaatggcggaagcatcacaaatgctaggatcctctcacaagaaggaggc
aaaaactccattggcttttccacttctgatggaggagcaagcagtgcaagccaaacaggt
ggttccacaacccccaactcaaagtttgatgcaatctcttctggcaataatagttctacc
accatcctcctccaaactcccatgaccctagatgctaacatcacttatggagggcatttt
gctgggaattcctatgtttatgatggcagcaataatactgtaactctattctttgccaat
aagagaagtgagggcactacagctcctagcacaactccctctaacaatgcaagtcaaacc
agggcagcttcacaaataagcaatacaagcccagtaaatagcacaagttctactacagag
ctggctgcaagcttcaaagatggcatctctttgcaactccaagataaaagcataaattta
gatggcaaggatggcacttattctacctcttttatctccactgctatggctcatggacta
ggagctaatagcacaactcctctccatgtccatgtaataaaaagtggtgatgcaaataat
gtcaacaactccatcacattaagtggtgttgcagtgggctctgtaagtgcactttcctct
tctgatgcgacaaatcctgcagcaataaattctacctatacaattaacctgcaaaataaa
agcatcttcctaggaagctttagcaaggatttgcaaaatagccacaccaaggtaaatttg
gtattagaacacaatgcaaaattcattgcagattccagcacacagctagaaaatctcacc
atccaagcagccacctttgataaaaatgatagtgcaacacccactcttttgcaaaacaat
accgtagtagatgttgctagtgggggtggcagcaataatattacaagagagggaaatacc
ttctatctcctaagcattggaaaggatcccacaaatatagcacaagcaactggaggtgca
agcagtgcaagtcaaacaggtagtacaggtggttccacacccacaggttccacaacccca
aataatgcactaggagccaatggtcttagcggaagtaatgcgctctttagggtctatgta
aataccaatgccaatcaaggaagcaatggtagcaataatggcagtggagcagcattgaat
aatcaacactcctctaatggcagcggcctttatggatatatttattctgatagggtgatt
gttcataatgtcaaaaacagtgcttctggaaatacaatcactagaagcactgggggaagt
acaagcactgcaactagcatcacacctctcacagaatacctccaaatcctagcaagtggc
aatgtatcaagcattaaatatcatggtggtggtacagaaactaagggaaatattggagtg
gcaacagtgagaaatgatgcctctggcaaagcattagtagattttaaaaccataggaaca
attgtgggatttgatgcgcttgataccaagctcattgctataaaaacagatgcctatggc
aaggtaaagaacaatggacttagtggagctggagctagtggaggcactagtgggggtgga
attcatggaaatgactacaccacttatttcttgcaatctggggtttctggtacttctagg
gcaaaccaacttgcatcagccactgcactagctagtaattactatctctacctagccaat
atcaatagcctaaataagcgcctaggagaacttagaaataatccccatgccaatggtgtg
tggatccgactatttaatggtatgcaaaccacaacctttgcgctccaaaccaaatccatc
tacaccactctgcagggtggctatgattatgcctttggaagtgagggggctaatgattat
ctaggctttgcaatctcttatgccaatgcgggtatggattctctcatgagggctcaagca
ttcaatcatgcacaaaaaggaatcaaatctagcagtggcaatgcctttgaaatcgcactc
tataactcctatgtacaagatggtgcaacaagaagcacgaattttaaaaatggtctttat
agtgatagcatcataaagcttagctttcttgctaataaaatcaagcttgcagggaataac
aacactcccagtgtgaataactttggctttaccttttctcaagagattggctatcgcttc
ttgctaggggaaaatcaagagtggtacattactccacaaggggagctcactctgggatat
ttaaaccaaagcaatctcaaacaggtgctaggaagccattatcttagtggtgtgcaaacc
tccatcttcacattgcaaggacgcataggaagcagctttggctataggttttatcaattc
actgcagataaaaactattacccagagatttatttgggattgtatggagtggggaattat
attggtgggggagatatcaccctcatctccaatctaggttctgtaaatgctttaaggaca
ctaggctctacgggaagattcctctttaacctagggacaaatttcaccatcaaagacaat
cacagagtgtactttgattttgaaagaagctttggaggcaggattattgtagattatcaa
ttcaacattggctatcgctatagctttggagaaaacaagaaatatgcctctttagcaggt
agcattagccagactatcaagagagatgagaagaaacaaaacaaagaagaaataacagaa
tga
DBGET
integrated database retrieval system