Helicobacter pylori SJM180: HPSJM_03075
Help
Entry
HPSJM_03075 CDS
T01323
Name
(GenBank) cytoplasmic pump protein of the hefABC efflux system HefC
KO
K03296
hydrophobic/amphiphilic exporter-1 (mainly G- bacteria), HAE1 family
Organism
hpm
Helicobacter pylori SJM180
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hpm00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09193 Unclassified: signaling and cellular processes
99977 Transport
HPSJM_03075
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADO02207
UniProt:
E1PZ66
LinkDB
All DBs
Position
609888..612968
Genome browser
AA seq
1026 aa
AA seq
DB search
MYKTAINRPITTLMFALAIVFFGTMGFKKLSVALFPKIDLPTVVVTTTYPGASAEIIESK
VTDKIEEAVMGIDGIKKVTSTSSKNVSIVVIEFELEKPNEEALNDVVNKISSVRFDDSNI
KKPSINKFDTDSQAIISLFVSSSSVPVTTLNDYAKNTIKPMLQKINGVGGVQLNGFRERQ
IRIYADPTLMNKYNLTYADLFSTLKAENVEIDGGRIVNSQRELSILINANSYSVADVEKI
QVGNHVRLGDIAKIEIGLEEDNTFASFKDKPGVILEIQKIAGANEIEIVDRVYEALKHIQ
AISPNYEIRPFLDTTGYIRTSIEDVKFDLVLGAILAVLVVFAFLRNGTITLVSAISIPIS
IMGTFALIQWMGFSLNMLTMVALTLAIGIIIDDAIVVIENIHKKLEMGMDKRKASYEGVR
EIGFALVAISAMLLSVFVPIGNMKGIIGRFFQSFGITVALAIALSYVVVVTIIPMVSSVV
VNPRHSRFYVWSEPFFKALESHYTRLLQWVLNHKLIIFIAVVLVFVGSLFVASKIGMEFM
LKEDRGRFLVWLKAKPGVSIDYMTQKSKIFQKAIEKHAEVEFTTLQVGYGTTQNPFKAKI
FVQLKPLKERKKEHQLGQFELMSALRKELKSMPEAKGLDTINLSEVSLLGGGGDSSPFQT
FVFSHSQEAVDKSVENLKKFLLENPELKGKIEGYHTSTSESQPQLQLKILRQNANKYGVS
AQTIGSVVSSAFSGTSQASVFKEDGKEYDMIIRVPDNKRVSVEDIKRLQVRNKYDKLMFL
DALVEITETKSPSSISRYNRQRSVTVLAQPKAGISLGEILTQVSKNTKEWLVEGANYRFT
GEADNAKETNGEFLVALATAFVLIYMILAALYESILEPFIIMVTMPLSFSGAFFALGLVH
QPLSMFSMIGLILLIGMVGKNATLLIDVANEERKKGLNIQEAILFAGKTRLRPILMTTIA
MVCGMLPLALASGDGAAMKSPIGIAMSGGLMISMVLSLLIVPVFYRLLAPIDDKIKRFYQ
NQKTLE
NT seq
3081 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtataaaacagcgattaatcgtcctattacgaccttgatgtttgctttggcgattgtc
ttttttgggactatgggttttaaaaaattgagcgtggcgcttttccctaaaattgatctg
cctacggtggtggttactacgacttatcctggggctagcgctgaaatcatagagagtaag
gtaaccgataagattgaagaagcggtgatggggattgatgggatcaaaaaggttacttct
acgagttctaaaaatgtgagtattgtcgtcattgaatttgaattagaaaaacctaatgaa
gaagccttaaacgatgtggttaataaaatttcttcggtgcgttttgatgactccaacatt
aaaaaaccctctatcaataaatttgataccgacagccaagccattatttcattgtttgtg
agcagttcaagcgtgccggttacaacccttaatgactacgctaaaaacaccattaaaccc
atgctccaaaaaatcaatggggtagggggcgtgcagctcaacggctttagggagcgccag
attaggatttatgcggatcccactttgatgaataaatacaacctgacttatgcggatctt
ttcagcacgcttaaagcggagaatgtggaaattgatggggggcgcattgtcaatagccaa
agggaattgtctattttaattaatgcgaatagttatagcgttgcggatgtagaaaagatc
caagtgggcaatcatgtgcgtcttggcgatattgcaaaaattgaaatcggtttagaagaa
gacaacacttttgcgagctttaaagacaaacccggtgtgattttagaaatccaaaagatt
gccggagcgaatgaaattgaaatcgtggatagggtgtatgaagctttaaaacacattcaa
gccattagccctaactatgaaatcagaccctttttagacaccacgggctatatccgcacc
tctattgaagatgtgaaatttgacttagtcttaggggcgattttggcggttttagtggtg
tttgcgttcttgcgtaacggcacgatcactttagtttcagcgatttctatccctatttct
atcatggggacttttgcgctcattcaatggatgggcttttcattaaacatgctcaccatg
gtggctttaacgctagcgatagggattatcattgatgatgcgatcgtggtgattgaaaac
atccataaaaagctagaaatgggcatggataagcgcaaagcgagttatgagggggtgagg
gaaattggctttgctctagtggcgatttcagcgatgctgctctctgtttttgtgcctata
gggaacatgaaaggcattatcgggcgctttttccaaagctttgggatcacggtggcttta
gcgatcgctctgtcgtatgtggtggtcgttacgattatccccatggtaagctcagtggtg
gtcaatcccaggcattctcgtttttatgtgtggagtgagcctttttttaaggctttagag
tctcattacaccagattgctccaatgggtgttaaaccacaagctcattatctttatagcg
gtggttttagtgtttgtgggttcgctttttgtggcttctaagattggtatggagttcatg
ctgaaagaagatagggggaggtttttggtgtggcttaaggctaaaccgggcgtgagcata
gattacatgacacaaaagagtaagatctttcaaaaagcgattgaaaagcatgctgaagtg
gaattcaccaccttgcaagtgggttatggcaccacacaaaacccttttaaggctaaaatt
tttgtgcagctcaagcctttaaaagagcgcaaaaaagagcaccaattggggcaatttgag
ttgatgagtgctttaaggaaggaattaaaaagcatgcctgaagctaaaggtttagatact
attaatctttctgaagtctcgcttttaggtggcggtggggatagttcgcccttccaaacc
tttgtgttttcccattctcaagaagcggtggataaaagcgtggagaatttgaaaaaattc
ttattggaaaaccctgaattaaaaggcaaaattgaaggctatcatacaagcacgagcgaa
tcgcaaccgcaattgcaactgaaaatcttaagacaaaacgccaacaaatacggcgtgagc
gctcaaaccattggatcagtggtgagctctgctttttctgggacttctcaagcgagcgtg
ttcaaagaagatggtaaagaatacgacatgatcattagagtgcctgataacaagcgcgtt
tctgtagaggacatcaaacgcttgcaagtgcgtaataaatacgataaattgatgttctta
gacgctttggtggaaatcacagaaactaaaagcccgtccagcatttctcgttataaccgc
caacgcagcgttacggtgctcgctcaacctaaagcgggtatctctttaggggaaatttta
acgcaagtgagcaaaaacactaaagaatggctggttgaaggggcgaattacagattcacc
ggtgaagcggataacgctaaagagactaatggggaatttttagtcgctttagcgacagcg
tttgtgctgatttatatgattttagcggcgttgtatgagtccattttagagccttttatc
atcatggttaccatgcctttaagcttttcaggggcgtttttcgctttaggtttagtgcat
cagcctttgagcatgttctctatgataggcttgatcttgctcattggtatggtgggtaaa
aacgctacgcttttaattgatgtggcgaatgaagagcgtaaaaaaggtttgaatatccaa
gaagccattttatttgccggcaaaacccgtctaagaccgattttaatgacgaccattgct
atggtttgtggcatgctgcctttagcgttggcgagtggggatggagcggcgatgaaatcc
cctatagggattgcgatgagtgggggcttgatgatttctatggtgctaagcttactcatt
gtgccggtgttttatcgtttgctcgctcccatagacgacaaaatcaagcggttttatcaa
aaccaaaaaactttagaatga
DBGET
integrated database retrieval system