KEGG   ORTHOLOGY: K18696
Entry
K18696                      KO                                     
Symbol
GDE1
Name
glycerophosphodiester phosphodiesterase [EC:3.1.4.46]
Pathway
map00564  Glycerophospholipid metabolism
Reaction
R01030  sn-glycero-3-phosphocholine glycerophosphohydrolase
R01470  sn-glycero-3-phosphoethanolamine glycerophosphohydrolase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09103 Lipid metabolism
   00564 Glycerophospholipid metabolism
    K18696  GDE1; glycerophosphodiester phosphodiesterase
Enzymes [BR:ko01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.4  Phosphoric-diester hydrolases
    3.1.4.46  glycerophosphodiester phosphodiesterase
     K18696  GDE1; glycerophosphodiester phosphodiesterase
Other DBs
COG: COG0584 COG0666 COG5408
GO: 0008889
Genes
CSCU: 111612779
NAI: NECAME_01964
EGL: EGR_04043
ATH: AT3G02040(SRG3) AT5G41080(GDPD2) AT5G43300(GDPD3)
ALY: 110229803 9299743 9306725
CRB: 17875210 17878788 17893337
CSAT: 104719778 104724480 104725132 104732690 104760622 104771476 104773488 104773917
EUS: EUTSA_v10003237mg EUTSA_v10021007mg EUTSA_v10027797mg
BRP: 103839248 103848808 103849862 103850206 103864052
BNA: 106352709 106379192 106393734 106402897 106409941 106431752 106435266 106446213 125577885 125602320
BOE: 106296872 106316924 106320208 106325247 106339398
RSZ: 108811345 108816246 108827925 108849352
THJ: 104805317 104814200 104822422 104825641
CPAP: 110813024
CIT: 102608187 102610916
CIC: CICLE_v10015568mg CICLE_v10031648mg
PVY: 116129881
MINC: 123196872 123223731 123223732
TCC: 18601075
GRA: 105769937 105777253 105794798
GHI: 107886704 107893244 107897301 107909535 107914174 107935840
GAB: 108470887 108484687 108489719
HSYR: 120122547 120149057 120159580 120185634 120215105 120216220
DZI: 111291950 111299500 111316523 111316524
EGR: 104419117 104433711
GMX: 100781085 100807698
GSJ: 114391245 114400820
PVU: PHAVU_001G091000g
VRA: 106758596
VAR: 108326797
VUN: 114194240
VUM: 124846896
CCAJ: 109815327
APRC: 113862661
MTR: 11440032
TPRA: 123888125
CAM: 101502205
PSAT: 127126786
VVO: 131609817
LJA: Lj1g3v3892190.1(Lj1g3v3892190.1)
ADU: 107490821 107494688
AIP: 107604989 107605647
AHF: 112697146 112719994 112755044 112792354
LANG: 109338933 109339033 109339037 109339041 109339043 109341940 109343525
PCIN: 129320927
QSA: O6P43_009733 O6P43_030633
FVE: 101297566 101310489 101310776
RCN: 112187651 112200792 112201084
PPER: 18782987 18790072
PMUM: 103322120 103330293
PAVI: 110745107 110764432
PDUL: 117614063 117621553
MDM: 103404157 103411114 103425541 103452429
MSYL: 126583817 126596849 126608444 126612157
PXB: 103929059 103936100 103938517 103941021 103943629 103966565
ZJU: 107417562 107428042
MNT: 21389125 21389126 21400487
CSAV: 115701510 115708092
CSV: 101216746 101216924
CMO: 103491824 103494578
BHJ: 120069698 120071788
MCHA: 111014715 111023410
CMAX: 111470895 111481883 111486683
CMOS: 111435313 111439169 111442177
CPEP: 111791693 111793316 111800593
RCU: 8274303 8285297
JCU: 105630178 105644865
HBR: 110646743 110646744 110659894
MESC: 110612935 110626325 110627959
POP: 18107142 7460574 7495809
PEU: 105117070 105117802 105133737 105140582
PALZ: 118038153 118043102 118055300
JRE: 109001316 109004778
CILL: 122302245 122313984
CAVE: 132179173 132179179 132181530
QSU: 111994503 111997110
QLO: 115976394 115979308
TWL: 119996152 120001067 120016989
VVI: 100261754
VRI: 117931102
SLY: 101261081 101264545
SPEN: 107008900 107029680
SOT: 102579608 102585312
SSTN: 125842653 125847846
SDUL: 129874465 129885087
CANN: 107860821
LBB: 132622133 132626218
NTA: 107763020 107783429 107795620 107812476
NSY: 104217521 104231427
NTO: 104087326 104104116
NAU: 109209781 109213361
INI: 109158331 109175865 109178799
ITR: 116000480 116001836 116023184
SIND: 105177463
OEU: 111398091 111409237
EGT: 105964082
SSPL: 121762757 121763289 121767659 121802664
SMIL: 131015995
SHIS: 125201433 125222714
APAN: 127258444
HAN: 110868577 110904141 110911202 110921337 110926186
ECAD: 122578348
LSV: 111876135 111888849 111912322
CCAV: 112514873 112527790
DCR: 108192792 108199808
CSIN: 114310737 114315850
RVL: 131298450 131303892
AEW: 130768305 130775640 130777746
BVG: 104895222 104897502
SOE: 110775160 110785743
CQI: 110690494 110694671 110711542 110724999
ATRI: 130808703 130823734
MOF: 131144809 131167754
NNU: 104591797 104592800
MING: 122077269
TSS: 122656037
PSOM: 113274354 113277320 113281403 113362820
OSA: 4329468 4335688 4346156
DOSA: Os02t0514500-01(Os02g0514500) Os04t0394100-00(Os04g0394100) Os08t0535700-00(Os08g0535700)
OBR: 102704440 102707277
OGL: 127764737 127781383
BDI: 100823116 100832479 100842769
ATS: 109736941 109751662 109764746
TDC: 119269367 119277368 119330580 119341172 119354987 119364125
TAES: 123045328 123049340 123071179 123079539 123151970 123169912 123185441
TUA: 125527533 125541508 125541632 125541633 125544201 125545125
LPER: 127316577 127319551 127321233
LRD: 124672161 124687155 124703895
SBI: 8059588 8060599 8072002
ZMA: 100191201 100216744 100383215
SITA: 101769804 101780211 101785008
SVS: 117852494 117860409 117865722
PVIR: 120640768 120655854 120702968 120713002
PHAI: 112896599 112898730 112902709
PDA: 103697856 103707832 103708094 120111853
EGU: 105034279 105048963 105051040 105061408
MUS: 103979644 103993452 103994171 104000671
ZOF: 121981984 121985846 122041105 122044445 122045610 122049012
DCT: 110099096
PEQ: 110037507
AOF: 109823877 109830619 109837344 109838602 109850481
MSIN: 131239383 131246686
NCOL: 116258115
ATR: 18434442
SMO: SELMODRAFT_128673 SELMODRAFT_82124
PPP: 112280349 112281113 112289398 112290323
CRE: CHLRE_03g203600v5
VCN: VOLCADRAFT_60393
MNG: MNEG_1087 MNEG_14002
CSL: COCSUDRAFT_61026 COCSUDRAFT_83698
CVR: CHLNCDRAFT_138426 CHLNCDRAFT_138688
OLU: OSTLU_4812
OTA: OT_ostta01g04280
BPG: Bathy01g03620
MIS: MICPUN_93904
MPP: MICPUCDRAFT_48113(JGI:MicpuC2_48113)
SCE: YPL110C(GDE1)
SEUB: DI49_5353
SPAO: SPAR_P01600
AGO: AGOS_AGR223W
ERC: Ecym_7094
KLA: KLLA0_F00660g
KMX: KLMA_50022(GDE1)
LTH: KLTH0E13882g
VPO: Kpol_1048p28
ZRO: ZYRO0A10296g
CGR: CAGL0J07040g
NCS: NCAS_0C01820(NCAS0C01820)
NDI: NDAI_0E02540(NDAI0E02540)
TPF: TPHA_0I01580(TPHA0I01580)
TBL: TBLA_0B04300(TBLA0B04300)
TGB: HG536_0A06990
TDL: TDEL_0A05440(TDEL0A05440)
ZMK: HG535_0C03130
PPA: PAS_chr2-2_0314
DHA: DEHA2G24684g
PIC: PICST_84114
PGU: PGUG_03069
SPAA: SPAPADRAFT_142062
LEL: PVL30_004885(GDE1)
CAL: CAALFM_C504510WA(GDE1)
CTP: CTRG_06029
COT: CORT_0F00910
CDU: CD36_54140
CTEN: CANTEDRAFT_137394
YLI: YALI0E32791g
CLU: CLUG_02761
CLUS: A9F13_07g00759
CAUR: CJI96_0005420
SLB: AWJ20_2720(GDE1)
PKZ: C5L36_0B09100
BBRX: BRETT_004660
OPA: HPODL_00439
NCR: NCU01747
NTE: NEUTE1DRAFT117372(NEUTE1DRAFT_117372)
SMP: SMAC_02434
PAN: PODANSg1657 PODANSg6590
PBEL: QC761_307510(GDE1_1) QC761_508170(GDE1_2)
PPSD: QC762_307510(GDE1_1)
PPSP: QC763_307510(GDE1_1) QC763_508170(GDE1_2)
PPSA: QC764_307510(GDE1_1) QC764_508170(GDE1_2)
TTT: THITE_2123923
CTHR: CTHT_0005190
MGR: MGG_06704
PPEI: PpBr36_07195
PGRI: PgNI_05767
TMN: UCRPA7_5139
SSCK: SPSK_02938
FGR: FGSG_01473
FPU: FPSE_04976
FPOA: FPOAC1_001584
FVN: FVRRES_01792
FVR: FVEG_09554
FOX: FOXG_11239
NHE: NECHADRAFT_89788
FFC: NCS54_00036100
FKR: NCS57_00034200
FMU: J7337_000410
MAW: MAC_00081 MAC_01774
MAJ: MAA_01770
PCHM: VFPPC_02048 VFPPC_03366
CMT: CCM_05136
AMUS: LMH87_000201 LMH87_011081
PLJ: VFPFJ_07142
PTKZ: JDV02_006374(GDE1)
VAL: VDBG_01531
VDA: VDAG_02025
CFJ: CFIO01_13340
CLUP: CLUP02_01395
CHIG: CH63R_10302
SAPO: SAPIO_CDS4017
ELA: UCREL1_4804 UCREL1_532
PFY: PFICI_00008 PFICI_00337 PFICI_11351
SSL: SS1G_02203
BFU: BCIN_13g01600(Bcgde1)
MBE: MBM_09538
PSCO: LY89DRAFT_170547
GLZ: GLAREA_01613 GLAREA_08894
ANI: ANIA_00137
AFM: AFUA_5G11590
ACT: ACLA_014660
NFI: NFIA_075680
AOR: AO090011000866 AO090026000669
ANG: An15g04850 An18g03170
AFV: AFLA_005622 AFLA_008257
ALUC: AKAW2_31270A(GDE1) AKAW2_60261A
ACHE: ACHE_41167S(GDE1)
APUU: APUU_12015A(GDE1)
PCS: N7525_007119 N7525_011110
PDP: PDIP_60250
POU: POX_d05257
TMF: EYB26_001537
TRG: TRUGW13939_05630
CIM: CIMG_07775 CIMG_09163
CPW: CPC735_015810 CPC735_042000
URE: UREG_02126 UREG_05211 UREG_07018
PBL: PAAG_02401
PBN: PADG_05542
ABE: ARB_01837 ARB_03100
TVE: TRV_05822 TRV_06408
BGH: BDBG_01017
PNO: SNOG_15042
PTE: PTT_08947
BZE: COCCADRAFT_101684
BSC: COCSADRAFT_279042
AALT: CC77DRAFT_593262
ARAB: EKO05_0001371
ZTR: MYCGRDRAFT_110829
PFJ: MYCFIDRAFT_190734
FFU: CLAFUR5_11059
CBET: CB0940_07138
NPA: UCRNP2_1159
SPO: SPAPB1E7.05(gde1)
SOM: SOMG_00786(gde1)
ECU: ECU01_1380
EIN: Eint_011320
EHE: EHEL_011290
ERO: EROM_011220
NCE: NCER_100043
SRE: PTSG_05107
DDI: DDB_G0290085
DPP: DICPUDRAFT_35223
DFA: DFA_07167
PIF: PITG_13245
PSOJ: PHYSODRAFT_330776
TVA: TVAG_2v0600630
 » show all
Reference
PMID:16141200
  Authors
Fisher E, Almaguer C, Holic R, Griac P, Patton-Vogt J
  Title
Glycerophosphocholine-dependent growth requires Gde1p (YPL110c) and Git1p in Saccharomyces cerevisiae.
  Journal
J Biol Chem 280:36110-7 (2005)
DOI:10.1074/jbc.M507051200
  Sequence
[sce:YPL110C]
Reference
PMID:16172116
  Authors
Fernandez-Murray JP, McMaster CR
  Title
Glycerophosphocholine catabolism as a new route for choline formation for phosphatidylcholine synthesis by the Kennedy pathway.
  Journal
J Biol Chem 280:38290-6 (2005)
DOI:10.1074/jbc.M507700200
  Sequence
[sce:YPL110C]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system