KEGG   ORTHOLOGY: K12574
Entry
K12574                      KO                                     
Symbol
rnj
Name
ribonuclease J [EC:3.1.-.-]
Pathway
map03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K12574  rnj; ribonuclease J
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis
    K12574  rnj; ribonuclease J
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Prokaryotic type
  Bacterial mRNA degradation factors
   RNA degradosome components
    Ribonucreases
     K12574  rnj; ribonuclease J
Other DBs
COG: COG0595
Genes
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HYO: NNO_2127
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GME: Gmet_0366
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GBM: Gbem_3971
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DFL: DFE_0085
DGG: DGI_1594
DDE: Dde_1137
DAS: Daes_2173
DPI: BN4_10016
PPRF: DPRO_0016(rnjA)
PSEF: PSDVSF_00160(rnj)
PNW: SYK_00160(rnj)
LIP: LI0561
LIR: LAW_00579
DVM: DvMF_2926
CLIH: KPS_003371
DBA: Dbac_2375
THEW: TDMWS_04140(rnj)
DRT: Dret_1939
DOV: DSCO28_27470(rnj)
DWD: DSCW_61230(rnj)
DALK: DSCA_54830(rnj)
DML: Dmul_07930(rnajA)
DLI: dnl_11370(rnjA)
DMM: dnm_012410(rnjA)
DEK: DSLASN_22180(rnj)
SFU: Sfum_1597
ADE: Adeh_0095
AORY: AMOR_26140(rnj)
APAU: AMPC_29090(rnj)
MXA: MXAN_1479
MAI: MICA_1349
MAN: A11S_1280
BMX: BMS_0072
BSU: BSU14530(rnjA) BSU16780(rnjB)
BSH: BSU6051_14530(rnjA) BSU6051_16780(rnjB)
BSUT: BSUB_01580(rnjA) BSUB_01810(rnjB)
BSUL: BSUA_01580(rnjA) BSUA_01810(rnjB)
BSO: BSNT_07951(ykqC) BSNT_08193(ymfA)
BSQ: B657_14530(rnjA) B657_16780(rnjB)
BSX: C663_1496(rnjA) C663_1723(rnjB)
BSS: BSUW23_07470(rnjA) BSUW23_08640(rnjB)
BLI: BL01207(ymfA) BL01626(ykqC)
BLD: BLi01668(rnjA) BLi01903(rnjB)
BLH: BaLi_c17030(rnjA) BaLi_c19370(rnjB)
BAQ: BACAU_1401(ykqC) BACAU_1633(rnjB)
BYA: BANAU_1363(ykqC) BANAU_1632(rnJB)
BQY: MUS_1538(ykqC) MUS_1832(ymfA)
BAML: BAM5036_1365(rnjA) BAM5036_1599(rnjB)
BAMA: RBAU_1410(rnjA) RBAU_1639(rnjB)
BAMN: BASU_1389(rnjA) BASU_1618(rnjB)
BAMB: BAPNAU_2089(rnjB) BAPNAU_2328(rnjJ)
BAMY: V529_13840(ykqC) V529_16190(ymfA)
BMP: NG74_01485(rnjA) NG74_01723(rnjB)
BAO: BAMF_1527(rnjA) BAMF_1750(rnjB)
BAZ: BAMTA208_08750(rnjB) BAMTA208_09885(rnjA)
BQL: LL3_01557(rnjA) LL3_01837(rnjB)
BXH: BAXH7_01784(ymfA) BAXH7_02017(ykqC)
BMOJ: HC660_15180(rnjA) HC660_17430(rnjB)
BSTR: QI003_07850(rnjA) QI003_08995(rnjB) QI003_12420(rnjB)
BANV: DJ46_2637(rnjB) DJ46_2886(rnjA) DJ46_458
BTM: MC28_2967 MC28_3266(rnjA)
BTG: BTB_c38700(rnjB) BTB_c41110(rnjA)
BTW: BF38_2833 BF38_4967(rnjB) BF38_5148(rnjA)
BWW: bwei_0976(rnjA) bwei_1160
BMYO: BG05_2047(rnjA) BG05_2226(rnjB)
BMYC: DJ92_1071(rnjA) DJ92_4343 DJ92_839(rnjB)
BMET: BMMGA3_05275(rnjA) BMMGA3_06400(rnjB)
BGY: BGLY_1662(rnjA) BGLY_2097(rnjB)
BFD: NCTC4823_02430(rnjB) NCTC4823_02645(ykqC)
BCAB: EFK13_08065(rnjA) EFK13_09220(rnjB)
BRY: M0696_07930(rnjA) M0696_09075(rnjB)
BACL: BS34A_16120(rnjA) BS34A_18460(rnjB)
BZH: NF868_06260(rnjA) NF868_07425(rnjB)
BAEI: RE735_11425(rnjB) RE735_12600(rnjA)
BMH: BMWSH_1091(ymfA) BMWSH_3658 BMWSH_3889(ykqC)
BMEG: BG04_1053(rnjB) BG04_3634(rnjA) BG04_3862
BEO: BEH_05205
BKW: BkAM31D_10120(rnjA_1) BkAM31D_15695(rnjA_2)
OIH: OB1408
OJD: NP439_16700(rnjA)
OON: NP440_15580(rnjA)
GGH: GHH_c09930(rnjA) GHH_c12030(rnjB)
GEA: GARCT_01073(rnjA) GARCT_01286(rnjB)
PCAL: BV455_00595(rnjB) BV455_00813(rnjA)
PARG: PspKH34_25550(rnj_1) PspKH34_27670(rnj_2)
ANM: GFC28_1177(rnjB) GFC28_1396(rnjA)
AAMY: GFC30_1349(rnjA) GFC30_1572(rnjB)
ANL: GFC29_232(rnjA) GFC29_450(rnjB)
AXL: AXY_16240
LYP: MTP04_11130(rnjA) MTP04_13310(rnj_1) MTP04_32510(rnj_2)
HHD: HBHAL_2803(rnjA)
HLI: HLI_02610
HNZ: P9989_09580(rnjA)
HSAN: MUN89_14795(rnjA)
HSHI: MUO14_21920(rnjA)
HAMY: MUO15_05645(rnjA)
TAID: KS242_07240(rnjA)
VPN: A21D_03799(rnjA)
VNT: OLD84_08275(rnjA)
VIK: KFZ58_08070(rnjA)
PASA: BAOM_1487(rnj) BAOM_1719(rnj) BAOM_2371(rnj) BAOM_3278(rnj)
RAX: KO561_08080(rnjA)
GCS: MUN88_18455(rnjA)
GSM: MUN87_00575(rnjA)
PCHU: QNI29_09110(rnjA)
BCOA: BF29_219 BF29_4(rnjA)
BBEV: BBEV_1771(rnjB) BBEV_1968(rnjA)
PHJ: LC071_21105(rnjA)
SUZ: MS7_1046(rnjA) MS7_1233(rnjB)
SAUC: CA347_1004(rnjA) CA347_1193(rnjB)
SARL: SAP2_15680(rnj2) SAP2_17320(rnj1)
LMR: LMR479A_1053(rnjA) LMR479A_1523(rnjB)
BAYD: BSPP4475_09210(rnjA) BSPP4475_18745(rnjA)
PPM: PPSC2_03835(rnj) PPSC2_10175(ykqC)
PPO: PPM_0711(M1-898) PPM_1947(ykqC)
PLV: ERIC2_c21070(rnjA)
PSAB: PSAB_14480
PRI: PRIO_3448(rnjA1) PRIO_4015(rnjA3)
PSWU: SY83_16330
PBK: Back11_13600(rnj_1) Back11_21580(rnj_2)
ASOC: CB4_01912(rnjA)
COHN: KCTCHS21_37750(rnj)
AAD: TC41_1400(rnj) TC41_2166
BTS: Btus_1570
EFF: skT53_03090(rnj)
PABS: JIR001_18210(rnj)
LLA: L61727(yqgA) L89418(yciH)
LLK: LLKF_0339(yciH) LLKF_1770(yqgA)
LLT: CVCAS_0274(yciH) CVCAS_1526(yqgA)
LLS: lilo_0244(yciH) lilo_1542(yqgA)
LLJ: LG36_0286(yciH) LG36_1567
LPK: LACPI_1017(rnjB) LACPI_1698(rnjA)
LPET: lgb_01350(rnj2) lgb_01831(rnj1)
SPYA: A20_0790 A20_1641(rnjA)
SGC: A964_1159 A964_1681(rnj)
SAGS: SaSA20_1005(rnj_1) SaSA20_1468(rnj_2)
SSUI: T15_0149(rnj) T15_1496
SEZ: Sez_0284(ykqC) Sez_1226
SDA: GGS_1136 GGS_1750(ykqC)
STRN: SNAG_1443(rnjB) SNAG_1766
SFER: NCTC12278_00737(rnjB) NCTC12278_01673(rnjA)
SPSU: NCTC13786_00416(rnjB) NCTC13786_01434(rnjA)
SPOC: NCTC10925_00765(rnjB) NCTC10925_01738(rnjA)
SURN: NCTC13766_00199(rnjA) NCTC13766_01362(rnjB)
SACO: SAME_00277(rnjA) SAME_01078
STOY: STYK_15280(rnj_1) STYK_18650(rnj_2)
SMIE: NCTC11169_00677(rnjB) NCTC11169_01689(rnjA)
LXO: KIM322_06820(rnj_1) KIM322_06960(rnj_2)
LRH: LGG_00949 LGG_01311(ykqC) LGG_01340(ykqC)
LSN: LSA_09680(rnjB) LSA_09910(rnjA)
LHIL: G8J22_00993(rnj1) G8J22_01015(rnj2)
LGS: LEGAS_0493(rnjB) LEGAS_1057 LEGAS_1237(rnjA)
XAK: KIMC2_07190(rnj_1) KIMC2_17480(rnj_2)
XAP: XA3_06830(rnj_1) XA3_16950(rnj_2)
VLC: G314FT_07810(rnj1) G314FT_09310(rnj2)
CRN: CAR_c04800 CAR_c08790(rnjA) CAR_c09460(rnjB)
CML: BN424_1348(rnjA) BN424_1416(rnjB)
JDA: BW727_100501(rnjA) BW727_100530(rnj2)
CAC: CA_C1683
CAE: SMB_G1708(rnjA)
CAY: CEA_G1696
CPE: CPE1775
CPF: CPF_2028
CPR: CPR_1745
CTC: CTC_01058
CBO: CBO2559
CBN: CbC4_1541
CKL: CKL_1329
CKR: CKR_1225
CSR: Cspa_c12490(rnjA1) Cspa_c16620(rnjA2)
CPAT: CLPA_c04930(rnjA1) CLPA_c21440(rnjA2)
CPAE: CPAST_c04930(rnjA1) CPAST_c21440(rnjA2)
CSB: CLSA_c13320(rnjA1) CLSA_c22750(rnjA2) CLSA_c38470(rnjA3)
CLT: CM240_1959(rnjA) CM240_2966(rnjA)
CSQ: CSCA_2880
CLD: CLSPO_c13090(rnjA1) CLSPO_c26430(rnjA2)
CACE: CACET_c18000(rnjA)
CTYK: CTK_C18860(rnjA)
CCOH: SAMEA4530647_0884(rnjA)
CRW: CROST_021530(rnjA)
CFB: CLFE_021440(rnjA)
CAUN: CLAUR_008400(rnjA)
CNN: CNEO_3429
CGEL: psyc5s11_14170(rnj_1) psyc5s11_42920(rnj_3)
ASF: SFBM_0837
HHW: NCTC503_01591(rnjA)
CTH: Cthe_1302
HSC: HVS_11165(rnjA2)
CCE: Ccel_1772
CSS: Cst_c16200(rnjA)
CSD: Clst_1562
ESR: ES1_12580
ESU: EUS_06420
CCEL: CCDG5_0691(rnjA)
RCH: RUM_07740
FPR: FP2_16020
FPA: FPR_21610
OVA: OBV_36990
SMAN: C12CBH8_15260(rnj)
PFAA: MM59RIKEN_15440(rnj)
VFA: MM35RIKEN_18640(rnj)
VCOP: MM50RIKEN_20660(rnj)
STH: STH1556
CMIC: caldi_05210(rnj)
SWO: Swol_1268
SLP: Slip_1027
SALQ: SYNTR_1060
SGY: Sgly_2232
PTH: PTH_0698(YSH1) PTH_0934(YSH1) PTH_1289
DAE: Dtox_3163
AACX: DEACI_3197
ELM: ELI_3736
TMR: Tmar_1037
SAY: TPY_1683(rnj)
HFV: R50_1387(rnjA)
CTHM: CFE_1523
BHU: bhn_I2477
RIX: RO1_23110
RIM: ROI_10910
BPRO: PMF13cell1_02082(rnjA_1) PMF13cell1_04134(rnjA_2)
BCOC: BLCOC_11690(rnjA_1) BLCOC_31500(rnjA_2)
BHV: BLHYD_24830(rnjA)
CPY: Cphy_2294
CSCI: HDCHBGLK_03572(rnjA)
CHYL: CE91St63_22810(rnj)
HSD: SD1D_1616(rnjA)
EHL: EHLA_1995
ACEL: acsn021_25060(rnj)
ACHT: bsdcttw_30610(rnj)
AHB: bsdtb5_30080(rnj)
CBIL: EUBC25_23260(rnj)
CPRO: CPRO_26580(rnjA)
CBAR: PATL70BA_3426(rnjA)
AOE: Clos_1660
PHX: KGNDJEFE_01502(rnjA)
TMY: TEMA_17760(rnjA_1)
TEB: T8CH_1334(rnjA)
EAC: EAL2_c12580(rnjA)
CST: CLOST_1482(rnjA)
TTE: TTE1253
THX: Thet_1409
TIT: Thit_1046
TKI: TKV_c11660(rnjA)
CHY: CHY_1157
GEK: kuro4_03930(rnj_1) kuro4_17690(rnj_2)
TTM: Tthe_1267
TSH: Tsac_1975
MTA: Moth_1069
MTHO: MOTHE_c10290(rnjA)
MTHZ: MOTHA_c11180(rnjA)
TAE: TepiRe1_1393(rnjA)
NCD: ACONDI_00980(rnjA)
KME: H0A61_02590(rnjA)
CSC: Csac_1195
ATE: Athe_0627
CDIA: CaldiYA01_18270(rnj)
FMA: FMG_0631
APR: Apre_0941
PMIC: NW74_03080
PHAR: NCTC13077_01149(rnjA)
PIV: NCTC13079_00914(rnjA)
VRM: 44547418_01785(rnjA)
MED: MELS_0733
SRI: SELR_15770(rnjA)
MANA: MAMMFC1_03828(rnjA)
STED: SPTER_18870(rnjA) SPTER_37350(rnjB)
AIN: Acin_1138(rnj)
PFAC: PFJ30894_01680(rnjA)
EUC: EC1_15660
ABSI: A9CBEGH2_09120(rnj2) A9CBEGH2_09700(rnj)
EBM: SG0102_14660(rnj_1) SG0102_26060(rnj_2)
LCG: L3BBH23_15780(rnj_1) L3BBH23_16430(rnj_2)
FIT: Fi14EGH31_14730(rnj_1) Fi14EGH31_19160(rnj_2)
LPIL: LIP_2563
MFER: D500_00285(rnjA) D500_00644
MHA: HF1_00550(ykqC) HF1_15370
MOV: OVS_04435
MYT: MYE_02110(rnj2) MYE_02795(rnjA)
HCR: X271_00087(rnjB) X271_00266(rnjA)
PML: ATP_00210 ATP_00211(ykqC)
NZS: SLY_0009(ykqC) SLY_0014(ykqC)
PSOL: S284_05000 S284_05030(ykqC)
PLUF: LFWB_6950(rnj) LFWB_6960(rnj)
AOC: Aocu_09380(rnjA1) Aocu_11240(rnjA2)
ABRA: BN85305970(rnjA) BN85307870
MANR: MPAN_008540(rnj) MPAN_012510(rnjA)
SIXO: SHM_17950(rnj)
MHR: MHR_0444
MHM: SRH_01670
MCM: MCAL160_0059(mbl) MCAL160_0746(mbl)
MCOM: NCTC10178_00416(rnjB) NCTC10178_00555(rnjA)
MPU: MYPU_7040(MYPU_7040) MYPU_7050(MYPU_7050)
MBI: Mbov_0767 Mbov_0802(rnj)
MCY: MCYN_0171(MCYN0171) MCYN_0451(MCYN0451)
MFEL: JPM2_1980(rnj) JPM2_4940
MHOM: MLBD4_02005(rnjA) MLBD4_02180(rnjB)
MHYV: MHSN_00185
MEQR: JPM7_1100(rnj) JPM7_5890
UUR: UU509 UU570
MPE: MYPE5290(MYPE5290) MYPE9430(MYPE9430)
APV: Apar_0787
OLS: Olsu_0966
PCAT: Pcatena_07660(rnj)
LCAL: ATTO_09510
ELE: Elen_1625
GPA: GPA_03490
AEQ: AEQU_1067
AHAT: ADCFC_12720(rnj)
CBAC: JI75_04055
MTU: Rv2752c
MTC: MT2822
MRA: MRA_2777
MTUR: CFBS_2905
MTD: UDA_2752c
MTUC: J113_19105
MTUE: J114_14685
MTUH: I917_19300
MTUL: TBHG_02684
MTUT: HKBT1_2896
MTUU: HKBT2_2899
MBB: BCG_2768c
MBT: JTY_2762
MBX: BCGT_2584
MAF: MAF_27570
MMIC: RN08_3038
MORY: MO_002876(rnj)
MLE: ML1512
MLB: MLBr01512
MPA: MAP_2863c
MAO: MAP4_0945
MAVI: RC58_04645
MAVU: RE97_04645
MAV: MAV_3643
MIT: OCO_34710
MIA: OCU_34760
MID: MIP_05225
MYO: OEM_35160
MIR: OCQ_35930
MLP: MLM_1473
MMAN: MMAN_03290(rnj)
MMI: MMAR_1963
MPSE: MPSD_19770(rnj)
MSHO: MSHO_52310(rnj)
MMC: Mmcs_2117
MKM: Mkms_2163
MJL: Mjls_2104
MMM: W7S_17365
MHAD: B586_14790
MSHG: MSG_01780(rnj)
MFJ: MFLOJ_14660(rnj)
MSTO: MSTO_16220(rnj)
MSIM: MSIM_05440(rnj)
MSAK: MSAS_55470(rnj)
MXE: MYXE_31790(rnj)
MNV: MNVI_33720(rnj)
MNM: MNVM_35450(rnj)
MCOO: MCOO_01910(rnj)
MSEO: MSEO_05860(rnj)
MHEK: JMUB5695_03180(rnj)
MGAU: MGALJ_08460(rnj)
MLJ: MLAC_26820(rnj)
MBRD: MBRA_45780(rnj)
MSHJ: MSHI_21040(rnj)
MLM: MLPF_0842(rnj)
MKY: IWGMT90018_38650(rnj)
MVA: Mvan_2388
MGI: Mflv_3999
MVQ: MYVA_2262
MHAS: MHAS_02389(rnj)
MDU: MDUV_21740(rnj)
MCHT: MCHIJ_44230(rnj)
MDR: MDOR_14740(rnj)
MMAG: MMAD_23090(rnj)
MMOR: MMOR_40700(rnj)
MFX: MFAL_03970(rnj)
MAIC: MAIC_20140(rnj)
MIJ: MINS_21950(rnj)
MALV: MALV_13130(rnj)
MTY: MTOK_41430(rnj)
MPSC: MPSYJ_42970(rnj)
MARZ: MARA_16840(rnj)
MGAD: MGAD_15670(rnj)
MHEV: MHEL_45150(rnj)
MSAR: MSAR_32980(rnj)
MANY: MANY_06670(rnj)
MAUB: MAUB_56180(rnj)
MPOF: MPOR_27050(rnj)
MPHU: MPHO_12850(rnj)
MMAT: MMAGJ_56910(rnj)
MBOK: MBOE_48900(rnj)
MSEI: MSEDJ_35320(rnj)
MCEE: MCEL_14020(rnj)
MKR: MKOR_15690(rnj)
MAB: MAB_3083c
MABB: MASS_3023
MCHE: BB28_15610
MSTE: MSTE_03063(rnj)
MMIN: MMIN_02050(rnj)
MHIB: MHIB_19480(rnj)
ASD: AS9A_1648
CGL: Cgl1970(Cgl1970)
CGB: cg2160
CGU: WA5_1895
CGT: cgR_1799
CGM: cgp_2160
CGJ: AR0_09290
CEF: CE1863
CDI: DIP1463
CJK: jk1128
CUR: cu0863
CPSE: CPTA_01842
CPSU: CPTB_01920
CPSF: CPTC_01836
CRD: CRES_1222
CVA: CVAR_1629
CTER: A606_06530
COA: DR71_2047
CSP: WM42_2438
CPHO: CPHO_04980
CAQU: CAQU_07540
CAMG: CAMM_05790
CPRE: Csp1_12200(rnj)
CSUR: N24_2041
CCYC: SCMU_16060(rnj)
CACC: CACC_07490
CCOY: CCOY_07540
CHAD: CHAD_07360
CDUR: CDUR_07855
CHAN: CHAN_05845
CAPP: CAPP_07165
NFA: NFA_38680
NWL: NWFMUON74_23050(rnj)
NSPU: IFM12276_16840(rnj)
RER: RER_27330
REY: O5Y_12550
ROP: ROP_67340
RFA: A3L23_01467(rnj_1) A3L23_04547(rnj_2)
RHS: A3Q41_01889(rnj_1) A3Q41_03722(rnj_2)
RHU: A3Q40_01445(rnj)
REQ: REQ_19430
GBR: Gbro_2191
GOR: KTR9_2108
GOM: D7316_00710(rnj)
TPR: Tpau_1763
TPUL: TPB0596_28250(rnj)
TSD: MTP03_19460(rnj)
SRT: Srot_1988
SCO: SCO5745(SC9A10.09)
SALB: XNR_1122
SGR: SGR_1775
SGB: WQO_26640
SFI: SFUL_5662
SMAL: SMALA_5669
SFA: Sfla_1605
SBH: SBI_03360
SVE: SVEN_5394
SALS: SLNWT_1541
STRP: F750_5253
STRE: GZL_03014
SLD: T261_2344
STRM: M444_25325
SLE: sle_17880(sle_17880) sle_19240(sle_19240) sle_61650(sle_61650)
SALU: DC74_5828
SALL: SAZ_30845
STRD: NI25_10515
SLAU: SLA_5611
SALF: SMD44_06360(rnj)
SALJ: SMD11_1858(rnj)
SFK: KY5_5873
SGE: DWG14_02313(rnj)
SNF: JYK04_06141(rnj)
STUI: GCM10017668_52240(rnj)
SHUN: DWB77_02171(rnj)
SAUH: SU9_025805
SNIG: HEK616_53220(rnj)
SXT: KPP03845_105438(rnj)
KSK: KSE_53350
TWH: TWT_615
TWS: TW632
LXX: Lxx16090
MTS: MTES_0312
MOO: BWL13_00928(rnj)
MLV: CVS47_01063(rnj)
MOY: CVS54_02134(rnj)
MSUW: GCM10025863_11740(rnj)
AQK: AKACHI_04420(rnj)
AMAU: DSM26151_11820(rnj)
AMAV: GCM10025877_30130(rnj)
AMIN: AUMI_13520
HEH: L3i23_09800(rnj)
AGX: AGREI_1301(rnj)
PSEV: USB125703_00008(rnj)
GMN: GMOLON4_321(rnj)
NAEI: GCM126_35070(rnj)
ART: Arth_1453
ARX: ARZXY2_2394(rnj)
AAU: AAur_1587
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Reference
  Authors
Even S, Pellegrini O, Zig L, Labas V, Vinh J, Brechemmier-Baey D, Putzer H
  Title
Ribonucleases J1 and J2: two novel endoribonucleases in B.subtilis with functional homology to E.coli RNase E.
  Journal
Nucleic Acids Res 33:2141-52 (2005)
DOI:10.1093/nar/gki505
  Sequence
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system