KEGG   ORTHOLOGY: K12867
Entry
K12867                      KO                                     
Symbol
SYF1, XAB2
Name
pre-mRNA-splicing factor SYF1
Pathway
map03040  Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    K12867  SYF1, XAB2; pre-mRNA-splicing factor SYF1
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis
    K12867  SYF1, XAB2; pre-mRNA-splicing factor SYF1
   03041 Spliceosome
    K12867  SYF1, XAB2; pre-mRNA-splicing factor SYF1
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   Transport factors
    Other transport factors
     K12867  SYF1, XAB2; pre-mRNA-splicing factor SYF1
Spliceosome [BR:ko03041]
 Complex B
  Other components
   Prp19-related factors
    K12867  SYF1, XAB2; pre-mRNA-splicing factor SYF1
 Complex C
  Other components
   Prp19-related factors
    K12867  SYF1, XAB2; pre-mRNA-splicing factor SYF1
Genes
HSA: 56949(XAB2)
PTR: 468695(XAB2)
PPS: 100981363(XAB2)
GGO: 101128233(XAB2)
PON: 100458625(XAB2)
NLE: 100583813(XAB2)
HMH: 116478356(XAB2)
MCC: 704109(XAB2)
MCF: 102146263(XAB2)
MTHB: 126942509
MNI: 105484413(XAB2)
CSAB: 103233804(XAB2)
CATY: 105589156(XAB2)
PANU: 101016549(XAB2)
TGE: 112613420(XAB2)
MLEU: 105541138(XAB2)
RRO: 104679484(XAB2)
RBB: 108525988 108534542(XAB2)
TFN: 117076079(XAB2)
PTEH: 111522629(XAB2)
CANG: 105512964(XAB2)
CJC: 100408254(XAB2)
SBQ: 101032366(XAB2) 101039991
CIMI: 108283669(XAB2)
CSYR: 103252247(XAB2)
MMUR: 105885637(XAB2)
LCAT: 123635319(XAB2)
PCOQ: 105807925(XAB2)
OGA: 100966238(XAB2)
MMU: 67439(Xab2)
MCAL: 110300067(Xab2)
MPAH: 110336392(Xab2)
RNO: 245976(Xab2)
MCOC: 116068833(Xab2)
ANU: 117698325(Xab2)
MUN: 132650552(Xab2)
CGE: 100767687(Xab2)
MAUA: 101832412(Xab2)
PROB: 127237224(Xab2)
PLEU: 114681407 114683168(Xab2)
MORG: 121464936(Xab2)
MFOT: 126491603
AAMP: 119824986(Xab2)
NGI: 103743302(Xab2)
HGL: 101700264(Xab2)
CPOC: 100719499(Xab2)
CCAN: 109690967(Xab2)
DORD: 105998790(Xab2)
DSP: 122119678(Xab2)
PLOP: 125348692(Xab2)
NCAR: 124968731
MMMA: 107157341(Xab2)
OCU: 100340616
OPI: 101521268(XAB2) 101529898
TUP: 102482848(XAB2)
GVR: 103596857(XAB2)
CFA: 484995(XAB2)
CLUD: 112666432(XAB2)
VVP: 112909673(XAB2)
VLG: 121496263(XAB2)
NPO: 129522514(XAB2)
AML: 100465848(XAB2)
UMR: 103681894(XAB2)
UAH: 113242929(XAB2)
UAR: 123777555(XAB2)
ELK: 111161861
LLV: 125085619
MPUF: 101671907(XAB2)
MNP: 132010908(XAB2)
MLK: 131823439(XAB2)
NVS: 122909787(XAB2)
ORO: 101384845(XAB2)
EJU: 114200842(XAB2)
ZCA: 113918823(XAB2)
MLX: 118005879(XAB2)
NSU: 110593771(XAB2)
LWW: 102729068(XAB2)
FCA: 101097459(XAB2)
PYU: 121013908(XAB2)
PCOO: 112852899(XAB2)
PBG: 122488637(XAB2)
LRUF: 124523931
PTG: 102951799(XAB2)
PPAD: 109254184(XAB2)
PUC: 125928979
AJU: 106970794
HHV: 120244884(XAB2)
BTA: 528991(XAB2)
BOM: 102283562(XAB2)
BIU: 109561642(XAB2)
BBUB: 102412305(XAB2)
BBIS: 104979776(XAB2)
CHX: 102175851(XAB2)
OAS: 101122353(XAB2)
BTAX: 128050324(XAB2)
ODA: 120863910(XAB2)
CCAD: 122440360(XAB2)
MBEZ: 129558627(XAB2)
SSC: 100525328(XAB2)
CFR: 102508827(XAB2)
CBAI: 105078275(XAB2)
CDK: 105087561(XAB2)
VPC: 102543307(XAB2)
BACU: 103016467(XAB2)
LVE: 103088473(XAB2)
OOR: 101285367(XAB2)
DLE: 111165976(XAB2)
PCAD: 102990523(XAB2)
PSIU: 116752043(XAB2)
NASI: 112400301(XAB2)
ECB: 100060674(XAB2)
EPZ: 103540066(XAB2)
EAI: 106844516(XAB2)
MYB: 102253187 102254282(XAB2)
MYD: 102767827(XAB2)
MMYO: 118657671(XAB2)
MNA: 107540641(XAB2)
PKL: 118725793(XAB2)
EFUS: 103294996(XAB2)
HAI: 109396090(XAB2)
DRO: 112296406(XAB2)
SHON: 118987705(XAB2)
AJM: 119045321(XAB2)
PDIC: 114509943(XAB2)
PHAS: 123813228(XAB2)
MMF: 118643608(XAB2)
RFQ: 117037799(XAB2)
PPAM: 129064996(XAB2)
PALE: 102895855(XAB2)
PGIG: 120599032(XAB2)
PVP: 105307689(XAB2)
RAY: 107519922(XAB2)
MJV: 108399686(XAB2)
TOD: 119240431(XAB2)
SARA: 101557184(XAB2)
LAV: 100670380(XAB2)
TMU: 101345037
ETF: 101651142(XAB2)
DNM: 101439428(XAB2)
MDO: 100026972(XAB2)
GAS: 123244450(XAB2)
SHR: 100930593(XAB2)
AFZ: 127545328
PCW: 110203360(XAB2)
OAA: 100090866(XAB2)
TGU: 115491599
OTC: 121339180(XAB2)
PRUF: 121365659(XAB2)
PHI: 102101630(XAB2)
PMAJ: 107198832(XAB2)
CCAE: 111922652(XAB2)
CBRC: 103611335(XAB2)
FPG: 101911257(XAB2)
FCH: 102059277(XAB2)
HLE: 104836575(XAB2)
AGEN: 126037508
CPEA: 104388938(XAB2)
AAM: 106494601(XAB2)
AROW: 112964651
TGT: 104567748(XAB2)
ASN: 102379719(XAB2)
AMJ: 102571642(XAB2)
PSS: 102454877(XAB2)
CMY: 102930731(XAB2)
CCAY: 125628953(XAB2)
DCC: 119845800(XAB2)
CPIC: 101931942(XAB2)
TST: 117888755(XAB2)
CABI: 116822696(XAB2)
MRV: 120390937(XAB2)
ACS: 100567964(xab2)
ASAO: 132768486(XAB2)
PVT: 110080442(XAB2)
SUND: 121922150(XAB2)
PBI: 103051574(XAB2)
PMUR: 107296162(XAB2) 107296607
CTIG: 120315321(XAB2)
TSR: 106543443(XAB2)
PGUT: 117659508(XAB2)
APRI: 131191874(XAB2)
PTEX: 113433593(XAB2)
NSS: 113418199(XAB2)
VKO: 123035460(XAB2)
PMUA: 114590780(XAB2)
PRAF: 128407648(XAB2)
ZVI: 118079959(XAB2)
HCG: 128344790(XAB2)
GJA: 107111602(XAB2)
STOW: 125427839(XAB2)
XLA: 100036801(xab2.L)
XTR: 100216162(xab2)
NPR: 108797011(XAB2)
RTEM: 120933197(XAB2)
BBUF: 120986255(XAB2)
BGAR: 122927327(XAB2)
MUO: 115466368(XAB2)
GSH: 117346456(XAB2)
DRE: 387600(xab2)
SRX: 107711255(xab2) 107757340
SGH: 107563325(xab2)
PTET: 122342076(xab2)
LROH: 127163360(xab2)
PPRM: 120489951(xab2)
RKG: 130086080(xab2)
MAMB: 125267210(xab2)
CIDE: 127510115
MASI: 127450073
TROS: 130561499(xab2)
TDW: 130426788(xab2)
MANU: 129430840(xab2)
IPU: 108257107
IFU: 128600667(xab2)
PHYP: 113546265(xab2)
SMEO: 124376412(xab2)
TFD: 113648107(xab2)
TVC: 132864217(xab2)
AMEX: 103039703(xab2)
CMAO: 118806131(xab2)
EEE: 113581860(xab2)
CHAR: 105905715(xab2)
TRU: 101062170(xab2)
TFS: 130515075(xab2)
LCO: 104918567(xab2)
NCC: 104952490(xab2)
TBEN: 117493395(xab2)
CGOB: 115011672(xab2)
PGEO: 117450659(xab2)
GACU: 117548852(xab2)
ELY: 117268433(xab2)
EFO: 125879756(xab2)
PLEP: 121956528(xab2)
SLUC: 116059435(xab2)
ECRA: 117957421(xab2)
ESP: 116703661(xab2)
PFLV: 114568899(xab2)
GAT: 120827171(xab2)
PPUG: 119220842(xab2)
AFB: 129098859(xab2)
CLUM: 117735120(xab2)
MSAM: 119896493(xab2)
SCHU: 122869106(xab2)
CUD: 121503674(xab2)
ALAT: 119013858(xab2)
MZE: 101482524(xab2)
ONL: 100707795(xab2)
OAU: 116323224(xab2)
OLA: 101157537(xab2)
OML: 112146868(xab2)
XMA: 102219864(xab2)
XCO: 114160527(xab2)
XHE: 116736111(xab2)
PRET: 103468751(xab2)
PFOR: 103143719(xab2)
PLAI: 106938383(xab2)
PMEI: 106915644(xab2)
GAF: 122821571(xab2)
PPRL: 129363235(xab2)
CVG: 107083041(xab2)
CTUL: 119785355(xab2)
NFU: 107378337(xab2)
KMR: 108243675(xab2)
ALIM: 106529341(xab2)
NWH: 119421702(xab2)
AOCE: 111580736(xab2)
MCEP: 124997466(xab2)
CSEM: 103392861(xab2)
POV: 109634087(xab2)
SSEN: 122760715(xab2)
HHIP: 117766594(xab2)
HSP: 118123741(xab2)
LCF: 108902635
SDU: 111227226(xab2)
SLAL: 111653729(xab2)
XGL: 120806988(xab2)
HCQ: 109507633(xab2)
SSCV: 125983818
SBIA: 133514173(xab2)
PEE: 133414704(xab2)
PTAO: 133466381(xab2)
BPEC: 110169811(xab2)
MALB: 109965890(xab2)
BSPL: 114860345(xab2)
SJO: 128379527(xab2)
SASA: 100380533(syf1) 106607544
OTW: 112235611 112258441(xab2)
OMY: 110485139 110537977(xab2)
OGO: 124000550(xab2) 124016225
OKE: 118365088 118384129(xab2)
SALP: 111980647(xab2) 111980838
ELS: 105023373(xab2)
SFM: 108935750(xab2)
PKI: 111849207(xab2)
AANG: 118216426(xab2)
LOC: 102698010(xab2)
PSPA: 121309088(xab2)
PSEX: 120539972(xab2)
LCM: 102354367(XAB2)
RTP: 109928450(xab2)
CPLA: 122552214(xab2)
HOC: 132835813(xab2)
LERI: 129714371(xab2)
PMRN: 116944918(XAB2)
LRJ: 133341790(XAB2)
BFO: 118420439
BBEL: 109465996
CIN: 100183671
LPIC: 129278144
APLC: 110981073
AJC: 117118610
SKO: 100373254
DME: Dmel_CG6197(fand)
DER: 6549605
DSE: 6609035
DSI: Dsimw501_GD29621(Dsim_GD29621)
DAN: 6496542
DSR: 110189582
DPO: 4805169
DPE: 6592654
DWI: 6640830
DGR: 6559134
DAZ: 108611269
DNV: 108654520
DHE: 111595465
DVI: 6626317
CCAT: 101457958
BOD: 106617004
BDR: 105222218
RZE: 108362869
AOQ: 129245364
MDE: 101893909
SCAC: 106091221
LCQ: 111677380
LSQ: 119613502
GFS: 119636646
ECOE: 129951089
CLON: 129614121
HIS: 119655504
ACOZ: 120956945
AARA: 120902530
AMER: 121600441
ASTE: 118507161
AFUN: 125771778
AMOU: 128310185
AALI: 118465259
AAG: 110679261
AALB: 109432314
CPII: 120415394
CNS: 116340265
BCOO: 119085375
AME: 412159
ACER: 107993883
ALAB: 122712610
ADR: 102676944
AFLR: 100869086
BIM: 100741128
BBIF: 117206985
BVK: 117235933
BVAN: 117154356
BTER: 100642601
BAFF: 126916065
BPYO: 122565997
BPAS: 132905156
FVI: 122529931
CCAL: 108625328
OBB: 114880631
OLG: 117608100
NMEA: 116433890
CGIG: 122398345
SOC: 105204175
MPHA: 105830781
AEC: 105152136
ACEP: 105625132
PBAR: 105424941
VEM: 105569320
HST: 105183715
DQU: 106741467
CFO: 105255099
FEX: 115233718
LHU: 105674004
OBO: 105286469
PCF: 106788657
PFUC: 122514377
VPS: 122634801
VCRB: 124430405
NVI: 100118067
CSOL: 105365939
TPRE: 106656964
LHT: 122499344
LBD: 127285244
MDL: 103571009
CGLO: 123272368
FAS: 105270602
DAM: 107044818
CINS: 118074103
VCAN: 122411726
CCIN: 107265133
DSM: 124411037
NPT: 124220231
NFB: 124182957
NLO: 107224136
NVG: 124304894
AROA: 105691893
TCA: 656462
DPA: 109535769
SOY: 115884016
AGRG: 126743716
ATD: 109594026
CSET: 123318464
AGB: 108911564
LDC: 111506259
NVL: 108556352
APLN: 108742188
PPYR: 116171490
OTU: 111424788
BMOR: 101740068
BMAN: 114244582
BANY: 112048288
MJU: 123880907
NIQ: 126781185
VCD: 124530797
MCIX: 123669570
PMAC: 106713728
PPOT: 106099713
PXU: 106118298
PRAP: 111001570
PBX: 123707197
PNAP: 125055724
ZCE: 119828574
CCRC: 123706230
LSIN: 126969194
HAW: 110373118
HZE: 124645853
TNL: 113493249
SLIU: 111362262
OFU: 114357373
PXY: 105395673
PGW: 126376438
CCRN: 123298688
API: 100165988
DNX: 107170924
AGS: 114131620
RMD: 113553757
ACOO: 126833302
DVT: 126898422
BTAB: 109037577
DCI: 103512050
CLEC: 106670622
HHAL: 106685630
NLU: 111056137
FOC: 113206584
TPAL: 117639781
ZNE: 110833829
CSEC: 111867714
SGRE: 126271995
IEL: 124169805
FCD: 110845702
DMK: 116917764
DPZ: 124327026
PVM: 113814774
PJA: 122247754
PCHN: 125036561
PMOO: 119592589
HAME: 121870967
PCLA: 123774810
CQD: 128695269
PTRU: 123513555
ESN: 126999483
HAZT: 108678339
EAF: 111698978
LSM: 121123071
TCF: 131888892
ISC: 8041873
DSV: 119435932
RSAN: 119404154
RMP: 119187711
VDE: 111253011
VJA: 111271592
DPTE: 113795073
DFR: 124493186
CSCU: 111639543
PTEP: 107453555
UDV: 129226808
SDM: 118196933
LPOL: 106475113
PMEO: 129599434
CEL: CELE_C50F2.3(syf-1)
CBR: CBG_11979
BMY: BM_BM13935(Bma-syf-1)
TSP: Tsp_03302
PVUL: 126819218
PCAN: 112574950
BGT: 106065954
GAE: 121384436
HRF: 124114406
HRJ: 124253616
CRG: 105337236
CVN: 111125937
CANU: 128156430
MYI: 110456127
PMAX: 117321718
MCAF: 127729436
MMER: 123556922
RPHI: 132759290
OBI: 106870639
OSN: 115212150
LAK: 106180750
SHX: MS3_00008928(XAB2)
EGL: EGR_01892
NVE: 5508827
EPA: 110252781
ATEN: 116304949
ADF: 107332912
AMIL: 114961117
PDAM: 113676990
SPIS: 111339443
DGT: 114518887
XEN: 124439538
HMG: 100211944
HSY: 130656494
AQU: 100640718
ATH: AT5G28740
ALY: 9310514
CRB: 17883101
BRP: 103854624
BOE: 106327015
RSZ: 108836228
THJ: 104799261
CPAP: 110817789
CIT: 102624825
PVY: 116107956
TCC: 18596941
GRA: 105769039
GAB: 108453130
DZI: 111275098
VAR: 108343033
VUN: 114187836
VUM: 124831616
CCAJ: 109803534
APRC: 113849598
MTR: 11434840
TPRA: 123905551
CAM: 101500879
PSAT: 127082744
LJA: Lj6g3v2080270.1(Lj6g3v2080270.1)
ADU: 107463985
AIP: 107617329
PCIN: 129305287
FVE: 101308548
PPER: 18777386
PMUM: 103324632
PAVI: 110758000
PXB: 103965461
ZJU: 107423123
MNT: 21389817
CSAV: 115722140
CSV: 101209661
CMO: 103484548
BHJ: 120073284
MCHA: 111012330
CMAX: 111477778
CMOS: 111453335
CPEP: 111803503
RCU: 8281757
JCU: 105649472
MESC: 110603647
POP: 7490793
PEU: 105108494
PALZ: 118047369
CILL: 122275776
CAVE: 132170569
QLO: 115989721
TWL: 120005760
VVI: 100267056
VRI: 117923771
SLY: 101268140
SPEN: 107007786
SOT: 102596412
SSTN: 125843550
SDUL: 129886951
CANN: 107862923
LBB: 132644573
NSY: 104248341
NTO: 104105655
NAU: 109227277
INI: 109160570
ITR: 116029412
SIND: 105173470
OEU: 111377050
SMIL: 130988667
APAN: 127252541
HAN: 110872449
LSV: 111900559
CCAV: 112520395
CSIN: 114320158
BVG: 104897852
SOE: 110785053
ATRI: 130809129
MOF: 131153559
NNU: 104588638
MING: 122057008
TSS: 122650161
OSA: 4344088
DOSA: Os06t0235800-00(Os06g0235800) Os07t0644300-02(Os07g0644300)
OBR: 102712920
OGL: 127779185
BDI: 100840289
ATS: 109734331
TUA: 125523661
SBI: 8073102
SITA: 101775476
SVS: 117843827
PHAI: 112880445
PDA: 103706735
EGU: 105057065
MUS: 103996935
DCT: 110113825
PEQ: 110020633
AOF: 109848989
NCOL: 116248034
PPP: 112286419
APRO: F751_1973
MPP: MICPUCDRAFT_14528(JGI:MicpuC2_14528)
SCE: YDR416W(SYF1)
SEUB: DI49_0589
KMX: KLMA_30661(SYF1)
NCS: NCAS_0A12160(NCAS0A12160)
NDI: NDAI_0A04100(NDAI0A04100)
TPF: TPHA_0E02010(TPHA0E02010)
TBL: TBLA_0D01710(TBLA0D01710)
TDL: TDEL_0A03830(TDEL0A03830)
KAF: KAFR_0E03350(KAFR0E03350)
KNG: KNAG_0C04410(KNAG0C04410)
LEL: PVL30_004477(SYF1)
CAL: CAALFM_C406410WA(CaO19.2893)
SLB: AWJ20_2139(SYF1)
NCR: NCU08036
NTE: NEUTE1DRAFT145530(NEUTE1DRAFT_145530)
PBEL: QC761_602190(SYF1)
PPSD: QC762_602190(SYF1)
MGR: MGG_07087
PGRI: PgNI_03263
SSCK: SPSK_07037
FPOA: FPOAC1_006743(MSP41)
FMU: J7337_011751(MSP41)
MAW: MAC_09296
MAJ: MAA_02701
CMT: CCM_00384
PTKZ: JDV02_006464(SYF1)
BFU: BCIN_12g05100(Bcsyf1)
MBE: MBM_04290
ALUC: AKAW2_31332A(SYF1)
ACHE: ACHE_41225S(SYF1)
APUU: APUU_12048A(SYF1)
ABE: ARB_04371
TVE: TRV_03161
PTE: PTT_16531
SPO: SPBC211.02c(cwf3)
SOM: SOMG_00552(cwf3)
CNE: CNE01310
CNB: CNBE1250
CDEU: CNBG_4129
TASA: A1Q1_01546
CCAC: CcaHIS019_0405930(SYF1)
ABP: AGABI1DRAFT68807(AGABI1DRAFT_68807)
ABV: AGABI2DRAFT199759(AGABI2DRAFT_199759)
MORE: E1B28_002592(SYF1)
SCM: SCHCO_02607249(SCHCODRAFT_02607249)
MGL: MGL_2822
MRT: MRET_3419
DDI: DDB_G0277977(xab2)
DFA: DFA_12083(xab2)
EHI: EHI_073300(9.t00070)
PMAL: PMUG01_14070100(XAB2)
PREL: PRELSG_1452000(XAB2)
TAN: TA20005
TPV: TP01_0087
CPV: cgd7_970
SMIN: v1.2.035531.t1(symbB.v1.2.035531.t1)
FCY: FRACYDRAFT_136548(XAB2)
NGD: NGA_0248201(SYF1) NGA_0248202(SYF1)
SPAR: SPRG_19174
 » show all
Reference
  Authors
Nakatsu Y, Asahina H, Citterio E, Rademakers S, Vermeulen W, Kamiuchi S, Yeo JP, Khaw MC, Saijo M, Kodo N, Matsuda T, Hoeijmakers JH, Tanaka K
  Title
XAB2, a novel tetratricopeptide repeat protein involved in transcription-coupled DNA repair and transcription.
  Journal
J Biol Chem 275:34931-7 (2000)
DOI:10.1074/jbc.M004936200
  Sequence
[hsa:56949]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system