Lactobacillus acidophilus NCFM: LBA0058
Help
Entry
LBA0058 CDS
T00231
Name
(GenBank) putative phage DEAD box family helicase
Organism
lac
Lactobacillus acidophilus NCFM
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF3427
ResIII
Helicase_C
SWI2_SNF2
PLDc_2
DEAD
RE_NgoFVII
AAA_22
DEAD_assoc
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAV41962
UniProt:
Q5FMW2
LinkDB
All DBs
Position
54086..56920
Genome browser
AA seq
944 aa
AA seq
DB search
MADAMQDAILNGLYDSSYPGSETLGPSILSNNHDEKIWSILRNELYSCTGFTWAVAFITQ
DMLVPLKVVLADLAQKNVSGTIITGSYLNFNNPKVFEELKKIPNLEIKVATESGFHAKGY
LFEHKDYQTVVIGSANFTRAALLTNYEWALKISSKTQADLTRQMAQKLAELEKNSFVLTD
EWLAEYKKNWIKPVSNTKKIVSNAKIEPNQMQKAALKNLNSLVNEGAKRALVVSATGTGK
TYLGAFAVKDFKPKKFLYIVHRQQIAKKTLDSFYKVIGGAKSDYGILSGNHHDTDKRYLF
ATIQTLSQDNVLDDLVRNEFDYILIDEAHRTAAPSYQKIINYFQPKFLLGMTATPERMDE
QNVYQIFDYNLAYEIRLRDALEEKMLAPFHYVGVQDYESNNQIIDETTNLRYLASKERVN
YVLKEMDYYGYCGDKAKGLVFCSRQEEAHELANLFSEKGHPAVALTNKDSDKKRIEVVSQ
LADGDIEYIIAVDLFNEGIDIPSLNQIIMLRNTQSAIVFIQQLGRGLRKYPGKEFVTILD
FIGNYKNNYLIPIALNQDNSRDKDKVKRETRLPNFIDVSTINFSKIASDRILASLDQIKL
DSMRELRSSYQELKNKLGRIPFLLDFYQYGTVAPEVFANNHGLSSYATFLEKMGEPIELN
KYEDEVLSFVTKELLNGKRAHELVLLKMLLKQNFVKQEDYLAKLQHKKIYVNDEVLSSVD
DILDLSFFDVKQGKTTKKAQYGDRPLIEHSNLFDYKLNDELRNALNKNSMFKQLFKDVID
VGLELNRQYNNQSQFTLYQQYDRKDACRLLNWAKDVSAPMYGYRVGEKDTPIFITYRKDD
HEKRNALYHNTLEDGRSLRWYTRVPRHLDSEEVKKLLHTKDMHLHLFVKRSDADGKQFFY
LGEATIQADSVKEELLGVKKKPAVGMNLLLKHPLDNSMHELLFE
NT seq
2835 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcagatgcaatgcaagatgcgatcttaaatggtttgtatgattcatcctatcctggt
agtgaaacattaggtccaagtattttaagtaataatcatgatgaaaaaatttggtcaatt
ttgagaaacgaattatatagttgtacaggatttacgtgggcagtagcgtttataactcaa
gatatgcttgttcctttgaaagttgtacttgctgatttagcgcaaaaaaatgtcagtgga
acaataattacaggaagctatttaaattttaataatccaaaagtttttgaagaattaaag
aaaattcctaacttagaaataaaagtcgcaacagaaagtggctttcatgccaagggatat
ttgtttgaacataaagattatcaaacagtggtaattggtagtgccaactttacccgagca
gcgcttcttaccaattatgaatgggctctgaagattagttcaaaaactcaggctgatcta
actagacaaatggcacaaaaacttgctgaattagaaaagaatagttttgttcttactgat
gaatggctagctgaatacaagaaaaattggattaaacctgtaagtaatactaaaaaaatc
gtttcaaatgcaaaaattgagccgaatcaaatgcagaaagctgctttaaaaaatttaaat
tcattagtaaatgaaggagctaagcgggctttagtagtttcggctactggaacgggtaag
acttatttaggtgcttttgctgtaaaagactttaagcctaaaaaatttttatatatagtg
catcgtcagcaaatagctaaaaaaactcttgatagtttttacaaagtaattggtggagca
aagtcagattatggcatattaagcggtaatcaccatgatactgataaaagatatttattt
gctacaattcaaacattaagccaagataatgtgcttgatgatctagttagaaacgaattt
gattacattttaattgatgaggcacatagaactgccgctcctagttatcagaaaattata
aattattttcaacctaaattcttattagggatgacagcgacgcctgaaagaatggatgag
caaaatgtgtatcaaatttttgactataatttggcatatgagattcggttgagggatgca
ttagaagaaaagatgttggctccttttcattatgtgggtgtgcaagactatgaaagcaat
aatcaaataatcgatgaaacaacaaatttacgttatttagcatctaaagaacgtgtaaat
tatgttttaaaggaaatggattattatggctactgcggagataaggctaaaggtttagta
ttttgcagtagacaagaagaagcgcatgaattagcaaatcttttttctgaaaaaggtcat
cctgctgtggcattgactaataaggatagtgacaaaaaacggattgaagttgtaagccaa
ttagcagacggagatatcgaatatattattgctgttgatttgtttaatgaaggtatagat
attccctcattgaatcaaattattatgttgcgcaatactcaatctgctatcgtatttatt
cagcaattagggcgcggccttagaaaatatccaggtaaagaatttgtgacaattcttgat
tttattggaaattataaaaataattacttaattccaattgcgttgaatcaagacaattct
cgtgataaagataaggtcaaaagagagacgagattacctaattttattgatgtttctaca
attaactttagtaagatagcttctgatagaattttagcttcacttgatcagatcaaattg
gatagtatgcgtgagttacgaagtagttatcaagaattaaaaaataaattaggtcgaatt
ccgtttttgttagatttctatcaatatgggacagttgctccggaagtttttgcaaataac
cacggactaagtagttatgcaacctttttagaaaaaatgggcgaaccaattgagcttaat
aaatatgaagatgaagtattaagttttgtcactaaagaactacttaatggtaaaagagca
catgaattagttttgttaaaaatgctgttgaagcaaaactttgttaagcaagaagattat
cttgctaagctgcaacataaaaaaatctatgttaacgatgaagtgttaagttcagtagac
gatattttagatttatcattttttgatgtaaagcagggaaaaactactaaaaaagctcaa
tatggtgataggccattaattgagcatagtaatttatttgattataaattgaatgatgaa
ttaaggaatgcattgaataaaaattcaatgtttaaacagctttttaaggatgtaatagat
gtcggtcttgaactaaatcggcagtacaataaccaaagtcaatttacgttgtaccaacaa
tatgatagaaaagatgcctgtcgtttacttaattgggctaaagatgtttctgcaccaatg
tatggctatcgtgtaggtgaaaaagatactccaatttttattacttatcgtaaagatgat
catgaaaaacgaaatgcactatatcataataccctagaagatggacgtagcttgcgttgg
tatactagagtaccacgacatttagattcagaagaggtaaagaagttattgcatactaaa
gacatgcatttacatttatttgtgaaaagaagcgatgccgacggaaagcagttcttctat
ttaggagaagctacaattcaggctgattcagttaaagaagagcttttaggtgttaagaaa
aagccggcggtagggatgaatttacttctaaagcatcctttagataattcaatgcatgaa
ttgttatttgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
