Laccaria bicolor: LACBIDRAFT_314561
Help
Entry
LACBIDRAFT_314561 CDS
T01044
Name
(RefSeq) hypothetical protein
Organism
lbc
Laccaria bicolor
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
WD40
ANAPC4_WD40
NBCH_WD40
eIF2A
Cytochrom_D1
PROPPIN
NACHT
AAA_16
NB-ARC
nSTAND3
AAA_22
AAA
Zeta_toxin
NRF
APS_kinase
RNA_helicase
Vinculin
AAA_19
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
6084801
NCBI-ProteinID:
XP_001889138
JGI:
314561
UniProt:
B0DYT3
LinkDB
All DBs
AA seq
1505 aa
AA seq
DB search
MNVNITSNTNDADNMFGLDPGAGDFLRDCGRGGLQALEIVAMSEDVFSPTLKAAVVDTLA
IIDITTKFNSNKKAWAEFSESLIRQVEQIVQYSCHYGKDHVPCAWQTSLDHLKGILKHLK
GRVADVQQYIQWRRLPSFTENMAYIEELKGKLNEAMGTFNAHQIVEGNLYESTLTEIESK
ETCTEVAQVSVLAGAQDIQMDHAVIIAANTVTYNNDGKLSHKINERMEESKKNEWLKELK
APSHKQRETCMPGTCVNVLRDIQVWLHDLNMPNILWLSGSPGSGKTTIASTVVADFESFS
GQFFFHRDQAEFCDPDNLWRHLALDLALGNNALGKSIAKALETQKANIRGLNISKQFEHL
IVKPVQEVFQDTETPLLVVIDALDECDQYQKLLPSLKSWSWQLPKFLKLLITSRRYLDIQ
STLNPISYPVYLHTGDQVSDQTYDDLELYFTTRFSDMTRLQTSLHLNWPGPDKISFLVTK
AAGLYIWAKSAMDFILHRGGDAEERLNVICSDSGEGIDAIDTLYQRIVFVAFQGLREAEK
KSLSSVLGAIVIAKNPLCPSDLEQLLGVRDALSTISQLSPVLLISNTGHLHICHQSFTDF
LLDQKRSKNFWVDSQKHSLCFAESCLKYMSAKLKFNFFDLKTSHILNKDVPNLMDHIKNV
KSTALDHASHFWAIYLQKYCDQTLQWQIMNEMEQFLREHLLHWLEIMSIMEAIDHAAHSI
LLAVSWSKDLKPSVSDFADDAHQFIMTFLEPISDAAPHIYISALPFAPQNSQMSLQYMKH
FTKTLKIQNGQRKQWSDRCLLRIQGNNTAVAYSPNGRHIVSGCYDGAVCIWDAVTGHSIM
DPLEGHDEKTTSVAYSPNGKHIVSGSYDKTLRVWDALTGQSVMDPLKGHSDWVNSVAYSP
SGRHIISGSADHTVRIWDAGTGWCVMDPLIGHDEGVKCVAYSPNGMSIVSGSLDSTIQVW
DAGTGQCVMDPLIGHDEAVECVAYSPDGMRIISGSLDCTVRVWDALSGQSIMVLLRGSDY
IESVAFSPNGEDIVCGTECHTIRCWNALTSQCIKSPLENGKKTIFSVAFSPNGKHIISGC
RDGTIRVWDAMAGHTEVDCPTGHDDGINSVAFSPNCRHIVSGSDDTTLRVWDALTGVSVM
GSLKGHNSNVESVAFSSDGKYIASGSADCTVRVWDALTGQSVIAPFKGHDNWVLSVAFSP
DGRYITSGSSDKTVRVWDVLTGQTTLDPFIGHGDHVNSVAYSPDGRFIISGSCDKTIRIW
DAQTGQSLMNPLIGHGDDVKAVAFSPDGRYIVSGSCDRTVRVWNFQTGQSVMDPLKGHSS
YVLSVAFSPEGRYIVSCSRDQTIRLWDARTGHSVGDPFKGHDMAVLSVVFSPDGSHITSG
SADKTIRLWDAETGYTNLNPSASSVVLPSTLLLSEVRKNVNNIGTHHNISPIFKGEPAVF
YPAKGPSNWIMGEDSLSYLFWVPPSNRHGLFFPRTINVLNSTPTILDFSNFVHGTNWSQC
FSPAS
NT seq
4518 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacgtgaacatcactagcaacaccaacgacgccgacaatatgtttgggttggatccc
ggagcgggcgactttctgcgagattgtggcagaggtggtctccaggcgctcgaaattgtc
gctatgtccgaggatgttttttcgccgactttgaaagcggctgttgtcgacaccttggcc
atcattgatatcactacgaaatttaattccaataagaaagcctgggctgagttctcggag
agtctcatcaggcaggttgagcagattgttcagtatagctgtcattatgggaaggatcac
gttccgtgtgcttggcaaacaagtcttgatcatctcaaaggaattttgaaacatctgaaa
ggaagagttgcagatgttcaacagtacatccaatggaggagacttcccagtttcacagag
aatatggcatacatagaggagttaaagggtaagttgaatgaagccatgggtactttcaat
gcacatcagattgtagaaggaaatttatatgaaagtactctcacagagattgagagcaag
gagacttgtacggaagtggcccaagtaagtgttctggcaggggcgcaggatattcagatg
gaccatgctgtaattattgctgcaaatactgtcacctacaacaatgatggaaaactttca
cacaaaattaatgagaggatggaagaatcaaagaaaaatgaatggttgaaagaattgaag
gctccatcacataagcaaagggagacctgcatgcctggaacttgtgtgaatgtgctcaga
gacatccaagtgtggcttcatgaccttaacatgccaaatattctctggctatctggaagt
cctggttctgggaagacaacaattgcttcaactgttgttgctgactttgaatctttctct
gggcaattcttctttcaccgtgatcaggctgagttttgtgatccagacaatctgtggaga
caccttgctttggatcttgcactaggaaacaatgctctgggaaaatctatagctaaggca
ttagagacacagaaagctaacatcagaggtctcaatatttccaaacagtttgagcatctg
attgtcaaaccagtccaggaggtctttcaggatactgaaacacctcttcttgttgttatt
gatgctcttgatgaatgtgaccaatatcagaaacttttaccatcattgaaatcttggtct
tggcagcttcccaaatttctcaaactactcatcacaagtcgtcgctatcttgatattcag
agtacactgaatcctattagttaccctgtttaccttcatactggagatcaagtttctgat
cagacctatgatgaccttgagctttactttactaccagattctctgatatgactcgattg
caaacatcactgcatctgaactggcctggtccagataaaatttcttttcttgtaacaaag
gctgcagggctctatatttgggctaaatctgcaatggactttatcttgcacagaggtggt
gatgctgaagaaaggttgaatgtcatttgctctgactctggggaaggcattgatgctatt
gacaccttgtaccagcgaattgtttttgttgcttttcaggggttgagagaagcagagaaa
aaatctttatcatcagttttaggagcaattgttattgcaaagaacccactttgtcccagt
gatcttgaacagcttctgggagttcgagatgcattgtcaacaattagccaactgagccca
gtactgttgatcagtaatactggccatttgcatatctgtcatcagtcttttacagacttt
ctgcttgaccaaaagcggtctaagaatttttgggtggattctcagaagcatagtctctgt
tttgctgaatcttgtttgaaatatatgagtgcaaagctcaaattcaatttttttgatctg
aaaacatcacatattctaaataaagatgttccaaatttgatggaccatattaagaatgtg
aaatctactgctctagatcatgcaagccacttctgggcaatttacctgcaaaaatattgt
gatcaaactttacaatggcaaatcatgaatgagatggaacaattcctgagggaacatctt
ttacattggctggaaattatgagcataatggaagccattgatcatgctgctcactcaata
ttgttggctgtgagttggagcaaagatttgaaacccagtgtatcagactttgcagatgat
gcacaccaatttataatgacattccttgaaccaatatctgatgcagccccacatatatat
atatcagcactgccatttgcaccacaaaattctcaaatgtctctgcagtatatgaaacac
tttacaaaaactttgaaaattcagaatggtcagaggaaacagtggtcagacaggtgtctt
ctgagaatacagggaaataatactgcagttgcatattcacctaatggaaggcacattgtc
tctggatgttatgatggagcagtctgcatctgggatgctgtaacaggccatagtatcatg
gatcctcttgaaggccatgatgagaaaactacctcagttgcatattctcctaatggaaag
cacattgtctctggatcttatgacaagacactcagagtctgggatgctctgacaggccag
agtgtaatggatcctctaaaaggccacagtgattgggttaattcagttgcatattctcca
agtggaaggcatattatttcagggtctgctgatcacacagtcagaatctgggatgctgga
acaggttggtgtgtgatggatccactcattggccatgatgagggagttaagtgtgttgca
tattctcctaatggaatgagcattgtttctggatctttagattctaccattcaagtctgg
gatgctggaacaggtcagtgtgtgatggatccacttattggtcatgatgaggcagttgag
tgtgttgcatattctcctgatggaatgaggattatttctggatctttggattgtactgtt
agagtctgggatgctttatctggtcagagcataatggttctcctcagaggctctgattat
attgaatcagtagctttttctcccaatggtgaggatattgtttgtgggactgaatgtcat
acaattagatgttggaatgctctgacaagtcagtgcataaaaagtcctcttgaaaatggc
aagaaaacaattttttcagtggctttttctcccaatggcaaacatataatttctggttgt
agagacggtacaatcagagtttgggatgctatggcaggtcatactgaggtagattgtccc
acaggccatgatgatgggataaactcagttgcattttctcctaattgcagacacattgtc
tctgggtctgatgatacaacactcagagtttgggatgccctgacaggtgtaagtgtcatg
ggttcacttaaaggtcataacagtaatgttgaatcagttgcattctcttctgatggcaaa
tacattgcctctggatctgctgattgcacagtcagagtctgggatgctctaacaggacag
agtgtcatagctcctttcaaaggccatgataattgggtcctttcagttgcattttctcct
gatggtagatacattacatctggatctagtgacaagacagtcagagtctgggatgtacta
acagggcagacaacactggatcctttcataggtcatggtgatcatgttaattcagttgca
tattctccagatggcagattcattatttctgggtcttgtgacaaaactatcagaatatgg
gatgctcagactggtcaaagtctaatgaatccccttattggccatggggatgatgttaag
gctgttgccttttccccagatggaaggtacattgtctctggatcttgtgatagaactgtc
agggtgtggaattttcagacaggtcagagtgtgatggatcctctcaaagggcatagtagt
tatgttctttcagttgcattctctcctgaagggaggtatattgtttcttgttctcgtgac
caaacaattagactctgggatgctaggacaggtcacagtgtgggagatccattcaaaggc
catgacatggctgttctatcagttgtgttttcacctgatggtagtcatatcacttctgga
tctgcagacaaaaccattagactctgggatgctgaaacaggttacactaacctaaatccc
tcagcttcttcagttgtgttgccatccacactcttgctgtctgaagtcaggaaaaatgtt
aataacattggtactcatcacaacatatcccccattttcaagggtgaacctgctgttttc
tatcctgctaaagggcctagtaattggatcatgggagaagattctctgtcatatctcttc
tgggtgccaccaagcaatagacatggcttattcttcccaagaacaattaatgtactgaac
agcactccaaccatacttgatttcagtaactttgtccatggtacaaattggagccaatgt
ttttcaccagcctcataa
DBGET
integrated database retrieval system