Lysinibacillus varians: T479_08195
Help
Entry
T479_08195 CDS
T03062
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
lgy
Lysinibacillus varians
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Flg_new
Invasin_D3
SLH
Filamin
Big_1
Glyco_hydro2_C5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHN24071
UniProt:
A0A806LPJ3
LinkDB
All DBs
Position
1727574..1730282
Genome browser
AA seq
902 aa
AA seq
DB search
MTIQLKDAQGNNITTGGETVTIASSVGTVSAVTDHNNGSYTATLTAPTTIGTGSINASVG
GRTIPTTASVQFVSGPPSLAKSTVTVNDSSLLADGTSQTTVTVKLKDAQGNDVTTGGATV
SISSTLGIIGTVTTHNNGTYTATLTAPSTVGTSILSATVNGNAIAATTSVQFIPKPAQTV
VASVASNTPTVGSDNMITLSVKNALGDIDTTFNGIKNVTILGYNQAPNGSFGNVNGEPLT
SSSQVVAIDFTNGIATANLKLNAATTQSIEFSVLGVNTASSNSVTITPVAGSAASMKVTT
DLKAPTINGGLFSQQPVVTLYDAYENVSVNDYTKIITVAKKDAGAWTLTGTLTAKANAGI
VSFSDLGSVNAANVSGAQLSFDATGLGQITSSGVTLLPKQLTVSFDATGGSPVGDLTISY
DDKINAPTAPTKTGYTFAGWYKDATLTTEWDFATETVTEDTTLYGKWDANSYTMTFHTNG
GTAVAPILATYGEKATAPTAPTKTGYTFAGWYKDATLTNKWDFATETVTEDTTLYGKWDA
NSYTVTFHTDGGTAVAPITATYGEKATAPTAPTKTGYTFAGWYKDATLTNKWDFATETVT
EDTTLYGKWAINSYTVTFNTNGGTTVAPVTITYDKKITKPAAPTKVGHTFAGWYKSDTLT
TQWDFLIDVVTKDTALYAKWFVNSSSGSDGQSSTPTTPSVPENPKTPSNEPSNPVETPHT
EPSKPETEAQDIIFSDVPKTHWAWEMIQDMTRKGIITGYPDKTFRPNDYIKRQHIAIMFT
RAFELEAIRETVSFKDVLPSHPYYEAITKLYQAGIVDGSNGEFHPDAFLTRAQMAKVLVE
ALQLTPNGISHFKDVPPTHWSYNYIATLQQEGIALGDDGYFKPNDPLTRAQFVALMYRAM
NR
NT seq
2709 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaccatccagttaaaagatgcacaaggaaataacattacaacgggtggggagacggta
acgattgcgtcatcagtaggaacggttagtgctgtgacggatcataacaatggtagctat
acggctactctaactgccccgacgacaatcggtactggtagcatcaatgcaagtgtcggt
ggaagaacgataccaacaacggctagcgtgcaatttgtctctggtccaccatcattagca
aagagcaccgttactgttaacgatagttcgctgctcgcggacggaacaagccagacgact
gtaaccgtgaagttgaaagatgcgcaaggaaatgatgttacaactggtggagcgacagta
agtatatcgtcaactctagggataattggtaccgtcacaactcataacaatggtacctat
acagcgactctaaccgctcctagcactgttggtacgagtatactcagtgcaactgttaat
ggcaatgccattgccgccacgaccagtgtacaattcattccaaaacctgcgcaaacggtg
gtcgcttcggtggcatcgaatacgccaacagtaggttccgataatatgattacgttatct
gtaaaaaatgcactgggagatatagatacaacctttaatggcattaaaaacgttacgatt
ttgggctacaaccaagcacccaatgggtcgtttgggaatgtaaatggagagccattgact
tcatcaagtcaagtagtcgctatagacttcacgaacggaatagctacagcgaatttgaaa
ttgaatgcagcaacgacacagtcaattgagtttagtgtgttaggtgtaaacacagctagt
agcaattcggtaacgattacaccagttgcgggaagtgcggctagcatgaaggtaacgaca
gatcttaaagcccccacaataaatggagggttatttagtcaacaacctgtagtgacactt
tatgatgcttatgaaaatgtcagtgtcaatgattatactaaaattattactgtggcgaaa
aaagacgcaggcgcatggacattaacagggacgttaacagcgaaagcaaatgctggaatc
gtcagcttttctgatttaggatcagtgaatgcagcaaatgtttctggcgcacagttgtca
ttcgacgcaacaggactcggtcagataacaagctcaggtgttacacttttgccaaaacaa
ttaacggtcagctttgatgcaaccggtggtagtccagtaggagacttaacaatctcttat
gacgacaaaatcaatgccccaacagcgccaacgaaaacaggttatacatttgccggttgg
tacaaagatgcaacgttgactaccgagtgggattttgcgaccgaaacagtgacagaggat
acaaccctgtatgggaaatgggacgcaaatagctatacgatgacgtttcatacaaatggt
ggtacagcggtagccccaatcttagcaacatatggcgaaaaagcaacagcgccaacagcg
ccaacaaaaacaggttatacatttgccggttggtacaaagatgcgacgttaactaacaag
tgggattttgcgaccgaaacagtgacagaggatacaaccttgtatgggaaatgggacgca
aatagctatacggtgacgtttcatacagatggtggtacagcggtagccccaatcacagca
acatatggcgaaaaagcaacagcgccaacagcgccaacaaaaacaggttatacatttgcc
ggttggtacaaagatgcgacgttaactaacaagtgggattttgcgactgaaacagtgaca
gaggatacaaccttgtatggtaagtgggcaatcaatagttatacggtgacctttaacaca
aatggtggaactaccgtagcgcccgtcactataacatatgataaaaaaataacgaaaccg
gcagcaccaacaaaggtaggtcatacgtttgcgggctggtataagagcgatactttgaca
acacaatgggatttcctaatagatgtggtgacaaaagatacagcgctatatgcaaaatgg
tttgtaaatagttcatctggtagtgatggtcaatcttcgacaccaacaacgccgtccgtt
ccagagaatccaaaaacgccatcaaatgaaccaagtaatcctgtggaaacgccacatact
gagccatcaaaaccagagacggaggcgcaagacattattttctctgatgttccgaaaacg
cattgggcttgggagatgattcaggatatgacgagaaaaggaattattactggctatccc
gataaaacatttcgtccgaatgattatattaaacgtcagcatattgccattatgtttacg
cgtgcttttgagctagaagcaatacgtgagacggtatcatttaaggatgttttgccgagt
catccatattatgaagctattacgaaattatatcaggcagggattgtcgatggttcaaat
ggagaatttcatccagatgcctttctgacacgtgcacaaatggctaaagtgcttgtagaa
gcgttacagctaacacccaatggtataagccattttaaagatgtgccaccgacacattgg
agttacaactatatagcgaccttacaacaagaaggaattgcattaggggatgatggctat
tttaaaccgaatgatcctctgacacgtgcacaatttgttgcattgatgtaccgagcaatg
aatcgctaa
DBGET
integrated database retrieval system