Lotus japonicus: Lj1g3v1812230.1
Help
Entry
Lj1g3v1812230.1 CDS
T04348
Symbol
Lj1g3v1812230.1
Name
(Kazusa) -
Organism
lja
Lotus japonicus
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PPR_2
PPR_1
PPR
PPR_3
PPR_long
MRP-S27
RPM2
ATP13
Motif
LinkDB
All DBs
AA seq
1118 aa
AA seq
DB search
MTVLVLCSSTACCSSSSSSMSSCYALADTNFSVLSNNGFLGGKNFVKMKNLSKGCCLKWK
KNGRRQMGHRGFRLRCAHEVVVVNGSKSKISVSPEEVIGVLKSISDPSSSLSYLKSVAQL
PSLVLTTDACNYMLELLGAHRRVEDMVVVFNLMQKHVIYRNLNTYLTIFKALSVKGGIRQ
APFALGRMRQAGFVLNAYSYNGLIHLVVQPGFCIEALKVYRRMISEGMKPSMKTYSALMV
ALGRRRETGIVMSLLEEMETLGLKPNIYTYTICIRVLGRAGRIDDACGILKKMDNEGCGP
DVVTYTVLIDALCTAGKLDKAKELYIKMRGSSHKPDRVTYISLMDKFSNCGDLEMVRKFW
SEMEAGGYAPDVVTYTILVEALCKSGNVDHAFAMLDVMRTKGIFPNLHTYNTLISGLLKL
RRLDEALELFENMESLGVGPTAYSYVLFIDYYGKSGDTGKALGTFEKMKRRGIVPSIVAC
NASLYTLAEMGRIREAKDIFNDLHNCGFSPDSVTYNMMMKCYSKAGQIDKAIGLLAEMMS
NGYEPDVIIVNSLIDTLYKDDRVDEAWQMFRRLEDLKLAPTVVTYNILLTGLGKEGKIPK
ALELFGSMSVSGCPPNTVTFNALLDCLCKNDAVDLALKMFCRMTAMNCSPDVLTYNTVIH
GLIKEGRTDYAFWFFHQMKKFLAPDHVTLCTLLPGIVRYGRVEDAIKIVVEFVHQAGSHT
DKQFWGELIECILVEAKIEEAIAFAERLVFDASCQDDHVMLPLIRVLCKRKKALDAQNLF
DKFTKTLGVHPTLESYNCLMDGLLACNVTEKALELFVEMKNAGCHPNIFTYNLLLDAHGK
SRRIAELFELYNEMLCRGCKPNAVTQNIIISALVKSNSLNKALDLYYELISGDFSPTPCT
YGPLIDGLLKAERCDEALKFFEEMLDYQCKPNSAIYNILINGFGKAGKIDIACDFFKRMV
KEGIRPDLKSYTILVECLCMTGRVDEAVHYFEELKLTGLDPDTVSYNLMINGLGKSRRLE
EALSLFSEMKNKGISPDLYTYNALILHLGIAGMIDQAGKMYEELQLVGLEPNVFTYNALI
RGHSMSGNKDQAFSVFKNMMVGGFSPNAETYAQLPNKG
NT seq
3358 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaccgtcttagttctctgctcctcaaccgcttgttgtagcagcagcagcagcagtatg
tcatcttgttacgctttggctgatactaatttctctgttctaagcaataatgggttctta
ggagggaagaattttgtcaaaatgaagaatttatcaaaagggtgttgtttaaaatggaag
aaaaatggaagaagacaaatgggtcatcgtggttttaggctaagatgtgcccatgaggtt
gttgtggtgaatggcagcaagagcaaaataagtgtgtcacctgaggaagttattggcgtt
ttgaagtctatttcggatccgagttcgagtctttcgtacttgaaatcggttgcccagttg
ccgagtcttgtgctcacgactgacgcgtgcaattacatgcttgagttattgggggctcac
aggagggttgaggatatggttgttgtttttaatttgatgcaaaagcatgttatttacagg
aatttgaatacctacctgactattttcaaggctctctcagttaaaggtgggattcgacag
gcaccgtttgcgcttggaaggatgaggcaagctgggtttgtgttgaatgcctattcatat
aatggactgattcatttggtagtccaacctggcttctgtattgaggctttgaaggtttac
agaagaatgatctcagaagggatgaagcctagcatgaagacgtactcagcattaatggtg
gcattggggaggagaagggaaactggaatcgttatgagtttattggaagagatggaaact
ttgggtttgaagccaaatatctacacatataccatatgcattagagtgcttgggagggca
gggagaattgatgatgcttgtgggattttgaagaaaatggataatgaaggatgcgggcct
gatgttgtcacttatacggttctaattgatgctctttgtactgcagggaaacttgataag
gccaaggagttatatataaagatgagaggtagcagtcacaaacctgaccgggtaacatat
attagtttgatggacaagtttagtaactgtggcgacttggagatggtgagaaaattctgg
agtgagatggaggctggtggttatgctcctgatgtggttacctacactatacttgttgag
gctttatgcaagtccgggaatgttgatcatgcatttgctatgttagacgtgatgagaaca
aaagggatttttccaaatcttcatacgtacaacacattgatctctggacttttgaagttg
agaagattagatgaggcattagaactctttgaaaatatggaatctttgggtgttggacct
actgcttattcgtatgttcttttcatcgactattatggaaagtctggtgatactggaaaa
gctcttggcacctttgaaaaaatgaaaagaagaggcattgtgcctagtatagtagcgtgt
aatgcatctttatatactcttgcagaaatgggtaggatcagagaagcaaaagatatattc
aatgatcttcacaattgtgggttttcaccagattcagtaacctataatatgatgatgaag
tgctacagcaaagcagggcaaatagacaaagcaatcgggcttttggctgagatgatgagc
aatgggtatgaaccagatgttattatagttaattctttaattgacacactttacaaggat
gatcgagttgatgaggcgtggcaaatgttccgaagactggaggatttgaagctagctcct
acagttgtgacatacaacattttacttaccggtttggggaaggaggggaaaatcccaaag
gcccttgaattatttgggagtatgtcagtgtctgggtgccctccaaacaccgtaacattt
aacgcactccttgattgtctttgcaagaatgatgcagttgatttggccttgaagatgttc
tgtagaatgacagcgatgaactgtagtcctgatgttctgacatataacactgttatccat
ggcttgatcaaagaaggcagaactgattatgcattctggtttttccatcaaatgaagaaa
tttctcgcccctgatcatgtaactttgtgcaccctccttcccggtattgtgaggtatgga
agggttgaggatgcaatcaagattgttgtagaatttgtccatcaggcaggttcacataca
gacaaacaattctggggagagttgatagaatgtattttagttgaagcaaaaattgaagag
gccattgcatttgctgaaagattggtgttcgatgctagttgccaagatgaccatgtaatg
ttacctctaatcagagttctgtgtaagcggaagaaggcccttgatgctcaaaatttattt
gacaaattcaccaaaactttaggagttcacccaaccctggaatcatataattgcttgatg
gatgggcttcttgcatgcaatgtcactgaaaaggctttagaactttttgtggagatgaag
aatgctggttgtcacccaaacatcttcacttacaacttgttgcttgatgctcatggtaaa
tctaggaggattgctgaactttttgaattgtacaatgagatgctgtgtaggggatgcaag
cctaatgctgtaactcaaaatattatcatctctgcccttgtgaaatctaatagcctaaat
aaggcattagatttatattatgaactcattagtggtgatttctctcccactccctgcaca
tatggccctcttatagatggtcttttaaaggctgaaagatgtgatgaagcactgaagttt
tttgaggagatgttggactatcaatgcaagcccaactctgctatttacaatattctcatc
aatggatttgggaaagcaggtaaaattgatattgcttgtgattttttcaaaaggatggtt
aaggaaggaataaggccagacttgaaatcctacaccattcttgtagaatgcctgtgcatg
actggtagagttgatgaagctgtgcactactttgaggaactaaagttaactggccttgat
cctgatacagtttcttacaatcttatgatcaatgggcttggaaaatcacgtcggttggag
gaagctctttctcttttcagtgaaatgaagaataagggaatttctcccgatctttatact
tataatgcattgattctccatcttggaattgctggaatgatagaccaagctggaaaaatg
tatgaggaactgcaactggtgggtcttgaacctaatgtcttcacttataatgctctcatt
cgcggtcacagtatgtctggaaataaagaccaagccttttctgtattcaagaacatgatg
gttggggggtttagccccaatgcggaaacatatgctcaactgcctaataaaggttgat
DBGET
integrated database retrieval system
