Lacticaseibacillus rhamnosus Lc 705: LC705_00884
Help
Entry
LC705_00884 CDS
T00990
Name
(GenBank) Phage-related protein
Organism
lrl
Lacticaseibacillus rhamnosus Lc 705
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PhageMin_Tail
ApoLp-III
Tropomyosin
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAR89723
LinkDB
All DBs
Position
872841..877706
Genome browser
AA seq
1621 aa
AA seq
DB search
MLGNLGQIAATVSLNIDPFQVSQRVLNSSIKATAAELRAQDAAFKGSEKSMNNMRSTYDT
LSRQAKNYQAQLRKQREQYDENSKAVERLNKSETASQEEINRATKLQANAASQYNRTAAA
AAQNENRMAALRKEIALQSDGWTKVSNGASKFASVTEKASSKLTSFGSTMTKAVTAPIAI
GFVAAAKSAIDFNSQIQAMGPLLTNGGAITAKYRAQLDQLASASKKWSVEYGISTTAIND
GMSEMIKRGYTAAQTLGAMPAVLNAAKASGDDFNDVMHVSTSVLEQFGLKTESTTGMLKN
TSRVTDALTYVANATAAGFQDMGEAMTYVGPSAHAAGISLEETAAAIGIMSNKGIEGSVA
GTALRGALTRLLKPSKQNLQGFNELGISVADFKKGTLTLPEILDKIKNNTKGWTDQQRAS
AVALAFGTEAQAGMNALISAGGGELRKYTSEAEHASGTTAKIANQLNNTDAAKLKRFQES
IHVLGIEVGQKLLPTLTPLIKTATDVVNAFAKMDSGTQQTIIKFAAFAAVVGPASSLIGG
ALKPVAALSKGISGIAGVIGRASVAAKIGGTAMDVLKSGFSKTAFEALKVAPAAAAAADG
ASGMGAAMGGAAASGTGLLAALGPIVPVVLGVTAVVGAGVAIWELWGKKALESADRTSRW
GTDIGADADRSASKMKDASGAISGAFNDTNHTVEQNSKTIKKGFDDITKAAKESSKNTQT
ALDKLAKQVGGSTADQIRKDAAEMKKADDARIKQIEANAKQSKSITESASKEHAEFTRDQ
IQILDNLRKSSAAEAVKTLRISGTQQANVLKAINGEKIRMSQAAAKEQYSQMQQAFANEL
DTNGRHYAAIKNSSEMSTSDKNRAIEALEKDHQDKMKVIYAGAIQAMKAQGLSSKTIQQQ
LQTEFGATASQAKKAMNAYSDAVSKGVKDTKQFAAAVSDGMSKNVKKAGNDWNKLVLDPK
TGKVITNLPEVLHDTANTKEGWKRLTFDLKNAKISTNAKETIAIALASTDKWNSLSVDEK
NAIIKETGRKDLADLMKRMVSWNDLTLEQQQAVVKGDYAPLVDAIIQAGTWNQLDVEDKQ
VLVKDKANIPLVDALVNSGRWNKLDLKTQNALLQAKGKKDLEDVLFNMGLWNSLDMNEKY
AQLKAIGKTDLADMIDQLGLWDTITPKQMEAAVKGDYSQLTAAIDQVHGWNQLDTKQLEA
IVQDKATVPLIQAMIQNQKWNGLSVEEKNAILKTKGMPELADMVVKYGSFDSLPDSTKRL
LINDDDARQKLIAAGVNMDKYNVDVNPDAKILKGDSNPLLAETIKAKEVIADYATVLPDK
KQFGGNSSGVTNAAKSGEGSIGHYDTVLPGLKLFIGDPSSVNGASSQGEASIKGFNSVNP
QTKPFKGDSSSVNSESSKGQSSVLMFNGKEPLDKYFNGHDKTSGPAAAAKRAVSSFGGDQ
TITKTFNFVANVSSTIAKLLHLKNGTSDFGGNGFAMVNDASGSNYQEPIITPNGNMFMFK
ERNVVFPLARHSMVIPADKARRMNIPRFAGGTTDFGGAANRINQLNPQTFVTSISSGSNS
RVEDLLARLIELTTYQISNPSVPEGKVVLDNGREVGRWLYPTINKLKNRDTIMSNRRRGI
F
NT seq
4866 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctaggaaatctcggacaaattgcggccaccgtaagcttgaacattgatccgtttcaa
gtaagccagcgagttttgaattcttcaattaaagcaactgccgctgagttgcgggctcaa
gatgctgcgtttaagggctctgaaaagtctatgaacaatatgcgttcaacctatgacaca
ttgagccgccaggcaaagaactaccaagctcagcttcgaaaacagcgagaacagtatgat
gaaaattcgaaagcagttgaaagacttaataaaagtgagactgcatcgcaggaagaaatt
aatcgtgctacaaagctgcaagctaatgctgcatcacagtataatcggactgctgccgct
gctgctcaaaatgaaaatcgaatggcggccttacgcaaagagattgcgctgcaaagtgac
ggctggactaaagtatcaaacggtgcatcaaagtttgcatctgttactgaaaaggcaagc
tctaagctaactagtttcggatcaacgatgaccaaggcagtaaccgctccaattgccatt
gggtttgtggcagccgctaaatctgctattgatttcaacagccagattcaagcaatggga
cctttgctaacaaacgggggtgcgattactgccaagtatcgtgcgcaacttgatcaacta
gcatcagcatctaaaaaatggtcggttgaatatggcatttccacgaccgctattaacgac
ggcatgtcagaaatgatcaagcgtggctataccgctgcgcaaactttaggcgctatgcct
gcagttctcaatgcagcaaaagcgtctggggatgacttcaacgatgttatgcatgtttct
acatccgttttggagcaatttggtctaaagacagaatcaacaacgggcatgcttaaaaac
acttctcgcgttacagatgctcttacctatgttgctaatgctactgcagcaggattccaa
gatatgggcgaggcaatgacgtatgtcgggccttctgctcatgctgctggtatctcacta
gaagaaacagcggctgctattggtattatgagcaacaaagggattgaaggatcagttgct
ggcacggcgttacgtggtgctttaacaagactgttgaagccttctaagcaaaatcttcaa
ggctttaatgaattaggcatatctgttgctgatttcaaaaaaggaactttaacccttcca
gagattcttgacaaaatcaagaataacactaaggggtggacggaccagcaacgtgcttct
gcagtagcgttggcttttggcactgaagcgcaagccggcatgaatgccttgattagtgca
ggtggcggtgagctacgcaaatataccagtgaagctgaacatgctagcggaacaactgcc
aaaattgctaaccagttaaacaatacggatgccgccaaattgaagagatttcaagagtcg
attcatgttttaggaattgaagtaggccaaaaacttctaccgacgctgactcctcttatc
aaaacagcaaccgatgttgtcaatgcctttgcaaaaatggacagcggtacgcaacaaacc
attatcaaatttgcagcgtttgcggcagttgtagggccagcgagttctcttatcggtgga
gctcttaagcccgttgctgctttgagcaaaggaatatctggaattgcgggagtcattggg
cgagcatccgtagccgcaaaaattggcgggactgcaatggatgtccttaagtctgggttt
agcaagacagcttttgaagcactgaaggttgcacctgcagcggctgcggcagcagatggt
gcttctggaatgggagcggccatgggcggagccgcagcgagcggaacagggttgctagcg
gcattgggaccaatcgtcccagttgttttaggtgtgacagcagtcgtcggtgccggtgta
gccatctgggaattatggggcaaaaaggctcttgagtctgctgacagaacttcacgatgg
ggcactgatattggtgccgatgccgaccgatctgcttccaaaatgaaagatgcatctggg
gcaatttctggtgcttttaatgatacaaaccacacagtcgagcaaaatagcaaaaccatc
aaaaaaggctttgatgacattacgaaggccgctaaagaatcgtccaaaaatacccaaacc
gcactcgacaagttggcgaagcaagtcggtggatcgactgctgatcagattcgtaaagac
gcagcagaaatgaagaaggccgacgatgcacgtatcaagcaaattgaggctaatgccaaa
caatctaagtcaattactgaatctgccagcaaagaacatgccgaatttactcgagatcaa
attcagattctggataatttgcgcaagagcagtgcagccgaggccgttaagacacttaga
atttccggtacccaacaagcgaatgtcttaaaagctattaatggcgaaaagattcggatg
agtcaagcagcggctaaggaacagtacagccagatgcagcaggcatttgccaatgaactt
gatactaatgggcgacattatgctgcgattaaaaattcatctgaaatgagcacctctgat
aaaaatcgggctattgaagcgctagaaaaagatcatcaagataaaatgaaagtcatctat
gccggtgcaattcaggctatgaaagcacaagggctttcaagcaagacgattcagcaacaa
cttcaaaccgagtttggtgcgaccgcttctcaagccaaaaaggcgatgaatgcctattcc
gatgcggtgagcaagggggttaaggacacaaagcagtttgcagccgctgtatcagatgga
atgagcaagaacgtcaagaaagctggcaacgattggaacaagctagttcttgatccaaaa
acaggcaaagttatcacgaatcttccggaggtgttgcacgatacagctaataccaaagaa
gggtggaagcgtctaacctttgacttaaaaaatgcaaagattagcactaatgcaaaagaa
acaattgccatagcactggcatcaactgataagtggaattcgcttagcgtcgatgagaag
aacgcaatcatcaaagagactggccgaaaagatttggctgatcttatgaagcgcatggtt
tcttggaatgatttaacgcttgaacagcagcaggcggttgtcaaaggagactatgcaccg
ctggttgacgcgattattcaagctggtacatggaatcaactagatgtggaagacaagcaa
gtcttggtaaaagacaaggctaacattccgttggttgatgcgctcgttaattctggtcgg
tggaataagcttgacctcaagactcaaaatgcgcttctacaagcaaagggcaaaaaagat
ttagaagatgttttgttcaatatggggctttggaacagcctcgacatgaatgagaaatat
gcccaactaaaggcaataggtaaaacggatttagctgacatgattgatcagctaggactg
tgggacactatcactcctaagcaaatggaggctgcagttaaaggggactacagtcaacta
acggcggcaattgatcaggttcatggctggaatcaacttgatacaaagcaattagaggca
atagttcaggataaagcaactgttccgctgattcaggcaatgattcaaaatcaaaagtgg
aatggcctttcggttgaagaaaagaatgcaattctgaaaactaaaggcatgccagaatta
gctgacatggttgtcaaatatggctcatttgatagtttaccggattcgacaaaacgattg
ttgataaatgatgacgatgccaggcaaaagctgattgctgctggagtcaacatggataaa
tataatgtcgatgttaatcccgatgccaaaattttaaagggagatagcaatccactatta
gccgaaacaattaaagccaaagaagtaatcgctgactatgcaactgtgttacctgataaa
aagcagttcggtggaaactctagcggcgttaccaatgcagccaaatctggcgaaggaagc
atcgggcattacgatacagttcttccgggacttaagctgtttatcggtgatcctagtagt
gtgaacggtgcttctagtcaaggagaagcatctataaagggatttaatagcgtcaaccct
caaacaaaaccatttaaaggcgattcatcgagtgttaatagcgagtcatcaaaggggcaa
agcagtgttctgatgtttaacggcaaggagccgttagacaaatactttaatggccacgat
aaaactagtgggcctgctgctgcagcaaagcgggcagtcagttccttcggcggtgatcag
acgattactaaaacgtttaatttcgtagctaacgtaagctcaacaattgctaagcttctt
caccttaagaacggcacttctgattttggcgggaacggatttgcgatggttaacgatgcc
tccggatctaactatcaagagcctattatcactcctaatggcaacatgtttatgttcaaa
gaacgaaatgtggtttttccgcttgctcgtcactcaatggttattcctgctgataaggct
cgtcgaatgaacattccacgttttgctggtggcaccacagacttcggaggcgctgctaat
agaataaaccaattgaatccgcaaacctttgttaccagcatttctagtggtagcaatagt
cgtgttgaggatttgctagcaagactgatcgaattaacaacttatcagattagtaacccg
tctgttcctgaaggcaaggttgttctcgacaatgggcgtgaagtaggacggtggctgtat
ccaacaattaataaattgaaaaacagagacaccattatgagtaatagaagaagggggatt
ttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
