Candidatus Methylopumilus turicensis: BN1209_1236
Help
Entry
BN1209_1236 CDS
T03844
Name
(GenBank) Filamentous hemagglutinin-like protein (fragment)
Organism
mbac
Candidatus Methylopumilus turicensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TPS
ESPR
KPP10_Orf10
TrkA_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CEN56276
UniProt:
A0A0B7IVF0
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(1229758..1233639)
Genome browser
AA seq
1293 aa
AA seq
DB search
MNKNVFRLVYSKHLGMFVPAAETASGHAGKASSSAARSRRRLLAVMMASSLALSASLSMA
DALDGLMPTGGLVPAGNPASWEGATYVKNGAVMDINQNIPKAILNWEKLNLSNGETLNFN
QASASWSALNRIHSIDPSSIAGNVNALGHVYFINSNGIIFGNGAQINVGSLTASSLNLTD
TLFKNGVISDPKNPSFSGTTGFVQVDAGANLNASAGGRIMLLAPNVRNDGIIHTPEGQTI
LAAGQKVYLSGSTDPAGLLVEVDTGGTATNLGDIVSKLGNVTMVGLAVNQQGRISASTSV
RANGSVKLLARDTVTVPQNQAVASRGGVLTLANNSVTKIDVEVADKEEILTSQLTDTSGN
KVLGSSKVELSGGVININGSIVANGGDVSAIAKFNPSLSTDLKNSAADAVSATRVYLGSD
ASIDVSGLDATAPMSRNQLEIQLYSEQLKDTPLLRGTDFLGKTIYVDARKGTDLIAADAL
EAAKAIKGVTIAEVMSKAGTVKFENSLGDVILAKGSNVDVSGGTVTYESGFVRESQILYK
GNNIAISAADKNTPYEGFADIYSVTDQKWGVTRSWDLGNKYGQFYQAYANGRDAGAVNIV
ATNALLAADLRGFQKEGYYQRDGQVLGGSFIFTLNPAAGDSPSFRFVTDNNNILSSNFSV
VGELDTASQKFGLGSSLTPGVIQVETTMFSTDKTASAGGFSRFSLNALAGNIAVDAPIQL
SPKGSVELQTMGQINVNASITSPGGMIAIKGGDTSLGDNVNISTSGIYTNDTVGIAGATL
NNVVTDAGTITIAQNDINNRGLSIGQGVRIEANAGAWLNSSKLLNGGKGGSITLTGVASL
GDTITSAYGFSKGGSLALTAYRNIQVGGQSPAALDIANTLWLPESFFGQGGFSQYNIKTS
YLDSSILIGDFAGTRTTILPQTQTLLTNAGYRSLLSGADMSIVASPILPASYLRKPASIT
FNSFGKLTLQENATVKLDAPNSGAGGSIGLQSNEQMTLLGSLITPAGVISADLLSTMSQY
PEYDDKLSIFVGSQALLSAKGHYAVTPSNNGLIKAAVSEAGSISLNGGDRAVVVLKEGSL
LDVSGVSGEVDEALQAGYARKILNGSAGSISIAGRNGMVLDGDMKASASASGADGSLSIT
FAGSDDSTGVYPNGARIFELTPSKVVRGLNIDVNSTLTAFNGSGVISSGLISAQQIADAG
FGKLTLDVDRSGQGDKILIANTLNLKLQNSLILKTSLLEVANNVTANLSADYIAVGGASS
VRPSSGGGGVTTQWAVDRFDWRCGFRRGECNKT
NT seq
3882 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaaaacgtatttagattagtgtatagcaagcatctgggcatgttcgttccagcg
gcagaaacggcctcaggccatgctggcaaggcttcttccagcgctgcccgtagccgcaga
cggttgttggctgtcatgatggccagcagtcttgctttatccgctagtttaagtatggct
gacgctttggatgggttgatgccaactgggggcttagtgccagcagggaacccagcctct
tgggaaggtgccacttacgtaaaaaatggtgcagtcatggatattaatcaaaatatccct
aaggccattttgaattgggaaaaactcaatttatccaatggcgaaacgctgaacttcaat
caagcaagcgcatcatggtctgccctcaatcgcattcatagtattgatccaagcagtatt
gctggtaatgtcaatgcgctcggccatgtgtattttattaatagcaatggcattattttt
ggcaatggtgcacaaattaatgtcggatcgctcaccgcaagctcgcttaatcttaccgat
acattatttaaaaacggggtcatctctgatcctaaaaacccatcattttcaggcaccaca
ggatttgtgcaagtagatgcaggcgcaaatctgaatgcaagtgcgggtggtcgcattatg
ctgctggcgcccaatgtccgtaatgatggcatcatccacacccctgaaggccaaaccatc
ttggcggcaggacaaaaagtatatctttccggcagtactgaccctgcaggcctgttggtt
gaggtagatactggtggcactgcgaccaatttgggtgacatcgtctcgaaattgggtaat
gtcacgatggttggcttagcggtcaaccagcaaggtagaatctcagcgtccacgtcggtg
cgggctaatggttctgttaagttgttagcgcgcgatactgtgactgtcccacaaaatcaa
gctgtcgctagtcgtggtggtgtgctgactttagccaataatagcgtcactaagattgat
gtagaagtggcagataaagaagaaattctcacatctcaattgaccgatacttcaggaaat
aaggtgttaggatcatcgaaggtggagttgagtggtggggtcattaatattaatggcagt
attgtcgcgaatggtggagatgtaagtgccattgccaaattcaatcctagtttatcaaca
gatctaaaaaactctgctgcagacgctgtttctgcaacccgtgtttatcttggcagtgat
gcttctattgatgtctcgggtttagatgctactgcacctatgtcaagaaatcagttggag
attcagctctattctgagcagttaaaagacacgcctttattgcgcggtactgattttttg
ggtaagacgatttatgtggatgctcgcaagggcacagacttaattgctgccgatgcgctt
gaggccgccaaagcgattaaaggcgttaccattgctgaagtgatgtcaaaagcaggtact
gtaaaatttgagaatagtctaggcgatgtgatcctagcaaagggctcgaatgtggatgtt
tctggcggaactgtgacttatgagtcaggctttgtacgcgagagtcaaatactctataaa
ggcaataatattgccatttctgcggcagataaaaatacgccctatgaagggtttgcggat
atttattcggtaaccgaccaaaagtggggggtcaccagaagctgggatcttggcaataaa
tatggtcaattctatcaggcttacgccaatggtagggatgcaggggctgtcaatattgtc
gccacaaatgcgctattagccgctgatttaagaggctttcaaaaagagggttattaccag
cgtgatggtcaagtgctgggaggaagctttatttttacgctcaatccagctgcaggggat
tcgcccagctttagatttgtgactgacaataacaatatcctgtcgagtaatttttcagtt
gtaggtgagctcgatactgcctctcaaaaatttgggctgggaagctcgctcacacctggt
gtcattcaagttgagacaaccatgttttcaacagataaaaccgcatctgcaggtggattt
agtcggttcagtttaaatgctttggcgggaaatattgccgtagatgcgcctattcaactc
tcacccaaaggcagtgttgagctacagactatggggcagattaacgtcaatgcgagtatt
acttcgcctggcggtatgatagcaatcaaagggggcgatacaagtttaggtgacaatgta
aacataagtacctctggtatttatactaacgacacagtgggcattgctggtgccactcta
aataatgttgtgacagatgctggcacgattacgattgcacaaaatgatattaataataga
ggactctctatcggacaaggtgtccgcattgaggcgaacgctggcgcttggttaaacagt
agtaagctattgaatggtggtaaaggcggaagcattacgcttactggggttgctagtctt
ggcgatacaatcacttcggcctatggttttagcaagggaggaagtcttgctttaactgcc
tatcgaaatattcaagtgggtggtcaatctccagcggctctggacatcgcgaacacatta
tggttgcctgaaagcttttttggtcagggtggttttagtcaatacaacattaagaccagt
tatttagattcctctattttgattggtgattttgcaggtacaaggacaacgattctcccg
caaacacaaacgctactgacaaatgcgggctatcggtctttattaagtggcgctgatatg
agcattgtggcgagtccaatattgccagcgagttatctccgaaaacctgcatccatcact
tttaattcatttggtaagttaacgcttcaagagaatgctaccgtgaagttagatgcgcct
aattcaggtgctggcggaagtattggtctgcaatcaaatgagcaaatgaccctcttgggt
agcctcattacaccagcaggcgttattagcgctgatttgctaagtacaatgagtcaatat
cctgaatatgatgataaattgagcatttttgtaggttctcaggctctgttaagcgcaaaa
ggacattatgccgtgacgccaagtaataatggcctcattaaagcagcagtatcagaagct
ggaagtattagcttaaatggtggtgaccgagcggtggttgtgcttaaagaagggagcctg
cttgatgtaagcggtgtgtcaggggaagtggatgaagcccttcaggctggatatgccaga
aaaatactgaatggttcggccggcagtattagcatcgctgggcgtaatggcatggtgctt
gatggtgatatgaaagcatcagcttcagcttctggcgcagatggatctttaagtataact
ttcgcaggcagtgatgattcaacgggtgtttatcccaacggcgctcgtatatttgagcta
acgccaagcaaggttgttcgtggtttaaatattgacgttaacagcacattaactgcattt
aatggttctggcgttatctcctctggccttatttccgcacagcagattgctgatgccggt
tttggaaaactgaccttagatgttgatcgaagtgggcagggtgacaagattttaattgct
aatacattaaatttgaagttacaaaactcgcttatcctcaaaactagcttgcttgaagta
gctaataacgtcactgctaatttaagtgcagattatattgcagtgggtggtgcatcttca
gtaaggccttcatcagggggggggggagttacaactcaatgggcagtggatagatttgat
tggcgatgtggctttcgcaggggtgagtgcaacaaaacttaa
DBGET
integrated database retrieval system