Mycoplasmopsis bovis HB0801: Mbov_0411
Help
Entry
Mbov_0411 CDS
T02143
Symbol
uvrA
Name
(GenBank) excinuclease ABC subunit A
KO
K03701
excinuclease ABC subunit A
Organism
mbi
Mycoplasmopsis bovis HB0801
Pathway
mbi03420
Nucleotide excision repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mbi00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03420 Nucleotide excision repair
Mbov_0411 (uvrA)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mbi03400
]
Mbov_0411 (uvrA)
DNA repair and recombination proteins [BR:
mbi03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
GGR (global genome repair) factors
Mbov_0411 (uvrA)
DSBR (double strand breaks repair)
NHEJ (non-homologous end-joining)
SHDIR (short-homology-dependent illegitimate recombination)
Supressor
Mbov_0411 (uvrA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UvrA_inter
ABC_tran
UvrA_DNA-bind
SMC_N
RsgA_GTPase
nSTAND1
AAA_29
AAA_16
AAA_18
DnaJ_CXXCXGXG
nSTAND3
APS_kinase
AAA_21
ATPase
MeaB
PRK
PASTA
Phage_TAC_8
THP2
Spa1_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFM51768
LinkDB
All DBs
Position
complement(477083..479914)
Genome browser
AA seq
943 aa
AA seq
DB search
MSARDQIIIHGAKENNLKNINLTIPKNQLIVFTGLSGSGKSSLAFNTIYEEGRRRYVDSL
SNYARLFLGGTNKPNVDSIEGLSPSISIEQKTTHNNPRSTVGTVTEIYDYFRLLFARIGK
PYCPNHKIPITTQTNNDILKSIYEFPDQTRLYILSPIVDGEKGTHANLFEKLKKDGFLRV
QVDGQIYSLDDEIKLEKNIKHYIDIVVDRVVLNEENQNRISEAISVALDYSKGLLKVETI
EGEVKKFSKLHSCIYKDFDMPKIDTKLFSFNAPFGSCELCKGLGVNLRADFDALVPEKWR
TINDGAIKIYANIVNSQNLEWQEFDILLNTYKIDKNTPIDQLSKEEIEIIKYGSKEDIEY
VLVSSSGNKTRRNRHIPGILEKIENDYFNTSSERIRDWLKKYMGSFTCEKCKGSRLNKYA
LSIKVNDFNIDDFTRMSVEDVLETLENLKLNSEETYISQLILNELYNRLYFLKNVGLGYL
TLNRNAETLSGGESQRIKLATQIGSNLTGVLYVLDEPSIGLHQKDNEKLIQTLKNMVNLG
NTLIVVEHDEDTIKSADYIVDIGPYAGVHGGKIVAQGTLEDIKNCEESLTGSYLSGKRKI
LTPLFRRSGNGKTLIINGASENNLKNINVKFPLGKFIGVTGVSGSGKSSLVNEILVKGLT
KYLSKSQTEKVGKFSSFSGSFNVDKIVAVNQSPIGRTPRSNPATYTSVFDDIRDIFASVE
ESKTRGYAKGRFSFNVPGGRCEKCSGDGYLKIEMHFLPDVYVPCDECEGKRYNRETLEIK
YRGKNISDVLDMTVEDALVFFEARANIKNKLQTLSDVGLNYIKLGQPSTTLSGGEAQRVK
LATYLQKPPTGKTIYVLDEPTTGLHSYDVANLLSVLNKIVDNGDTVVVIEHNLDVIKCCD
HIIDLGPDGGKNGGMVIATGTPEQVAKIEKSYTGQYLKKILNL
NT seq
2832 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtgcaagagatcaaattattattcacggtgctaaagaaaataatttaaaaaacata
aatcttacgattcctaaaaatcagttaattgtatttacaggactatctggcagtggtaaa
agtagtttagcatttaatacaatttatgaagaaggtcgcagaagatatgttgatagctta
agtaattatgcgcgcctatttctaggcggaactaacaaacctaatgttgattcaatcgaa
ggacttagtccttctatttcaattgagcaaaaaactactcataataaccctagatcaact
gttggaaccgtaactgaaatttatgactactttagattactatttgctcgtattggtaag
ccttattgtccaaatcataaaattcctattactacgcaaactaataatgacattttaaaa
agcatctatgaatttcccgatcaaactcgtttatacatactttcaccaattgttgatggt
gaaaaaggcactcatgctaacctttttgagaaactaaaaaaagatggctttttacgtgtt
caagttgatggtcaaatttactcactagatgatgaaattaagttagaaaaaaacataaaa
cactatattgatattgtagttgatagagttgtacttaatgaagaaaatcaaaatagaatt
tctgaagctattagtgttgctttagattattctaaagggcttttgaaagtagagactatt
gaaggagaagttaaaaagttttctaaattacactcatgtatttacaaagactttgatatg
cctaaaattgatactaaattattttcatttaatgcaccatttggctcatgtgaattatgt
aaaggtttaggagttaacctaagagctgattttgatgctttggtgcctgaaaaatgaaga
actattaatgatggtgctatcaaaatttatgccaatatagttaatagtcaaaacttagaa
tggcaagagtttgatattttgctaaacacatataaaatagacaaaaacactccaattgat
cagctttccaaggaagaaattgaaataataaaatatggctctaaagaagatattgaatat
gttttagtttcgtcaagtggcaataaaactagaagaaacagacacattcctggaatttta
gaaaaaattgaaaatgactacttcaatacatcaagcgaaagaattagagactgacttaaa
aaatatatgggttcattcacttgcgaaaaatgcaagggttctagattaaataaatatgca
cttagcataaaagttaatgattttaatattgatgactttaccagaatgagtgttgaagat
gtattagaaacgttagaaaacctaaagcttaatagtgaagaaacgtacatttctcaactt
attttaaatgaactttataaccgtttgtattttttaaaaaatgttggtttaggttacttg
acacttaatagaaatgccgaaactcttagtggaggcgaaagtcaaagaatcaaacttgca
actcaaattggctcaaatttaactggggttttatatgttttagatgagccatcaattgga
cttcatcaaaaggataatgaaaaacttattcaaacacttaaaaatatggttaatttagga
aataccttaattgttgttgagcatgatgaagatactattaaaagtgctgattatattgtt
gatattggaccatatgctggagtacatggtggtaaaattgtggctcaaggcactctagaa
gatattaaaaattgtgaagagtcattaactggaagctatttaagtggtaaaagaaaaatt
ctaactcctttgtttagaagaagtggaaatggtaaaacattaataattaatggtgctagt
gaaaataatttaaaaaacattaacgtaaagtttcctttaggtaaatttataggggttaca
ggtgtttctggaagcggcaaaagtagcttagttaatgagatattggttaaaggactaact
aaatatttatcaaaatcgcaaactgaaaaagttggtaaatttagctcatttagtggctca
tttaatgtggataaaattgtggcagttaaccaaagtccaattggcagaactcctagaagt
aatccagcaacctatacttcagtttttgatgatattagagatatatttgcttccgtagaa
gaatctaagacaaggggatatgctaaaggaagatttagctttaatgttcctggaggaaga
tgtgaaaagtgttcaggagatggttatctaaaaattgaaatgcactttttacctgatgtt
tatgtaccttgtgatgagtgcgaaggcaaaagatacaatagggagacattagaaataaaa
tatagaggcaaaaatatttctgatgtcttggatatgaccgttgaagatgctttagtattt
tttgaagcacgtgctaatataaaaaataaattacaaacacttagcgatgtggggctaaac
tatataaaattaggtcagccatctacaacattaagtggtggggaagcacaaagggttaaa
cttgctacatatttacaaaaaccgcctacaggtaaaacaatttatgtcctagatgagcca
acaactggattacactcttatgatgtagctaacttactaagtgttttaaataaaattgtt
gataatggcgatacggttgtagtaattgagcataatttagatgttattaagtgttgcgac
catattattgatctagggcctgatggtggtaaaaatggtggtatggttatagcaacagga
acacctgagcaagttgctaaaatcgaaaagagttatactggtcaatatttgaagaaaata
cttaatttatag
DBGET
integrated database retrieval system