Mycoplasmopsis bovis HB0801: Mbov_0694
Help
Entry
Mbov_0694 CDS
T02143
Symbol
rpoC
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta'
KO
K03046
DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:
2.7.7.6
]
Organism
mbi
Mycoplasmopsis bovis HB0801
Pathway
mbi03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mbi00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
Mbov_0694 (rpoC)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
mbi03021
]
Mbov_0694 (rpoC)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mbi03400
]
Mbov_0694 (rpoC)
Enzymes [BR:
mbi01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
Mbov_0694 (rpoC)
Transcription machinery [BR:
mbi03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
RNA polymerase
Core subunits
Mbov_0694 (rpoC)
DNA repair and recombination proteins [BR:
mbi03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
Mbov_0694 (rpoC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_1
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFM52043
LinkDB
All DBs
Position
complement(818606..823042)
Genome browser
AA seq
1478 aa
AA seq
DB search
MNSFNKKIAKEIKKIKISLAAQDDVKNWSCGEVTKPETINYKSYKPERDGLFDELIFGPT
TDFKCPICGTKYKKSDENTICEKTPMCQKYQPVILPKMVRRSRMGHIHLENPVVHFWFFK
IDHSIISKLLGLRIANSNKTVSKGDLEKLIYYKSHIVLEDGGLKKLQKNAIIDISDAAII
YADALEELKERFEKDTEEYEIISEALAELESYAVSQTGQDYGIDFYEYNEIIHEFSKAKI
STGSKAIEYLLENIDLKAEAEFIESEIEKINQHFDSNPTASIKAQERSKLYKRLAVVNAF
IHSGQDPKSMLIYDLPVIPADLRPLVQLDGGRHSTSDVNELYRRIIIRNNRLKKWEETDA
PMLIKQNEFRMIQEAVDALIDNSRKKPAPVTSKDNRPLKSISDTLTGKKGRFRQNLLGKR
VDYSGRSVIVVGPELKMHQVGVPREMAAKLFEPWIIKELINGDSHINSIKAGKKAIENLD
PIIWPYVEKAIEGKVVLLNRAPTLHRLSIQAYEPVLIRGKAIKLHPLSCTPFNADFDGDQ
MAIHVPISDEAVREARELMLASKNILGPKDGEPIINPAQDIILGLYYLTMEKSVAIDGDK
VVGEGKFFSTYDEMLLAYENKLVSLHARVALPINEINKKRLNYSPENKYIISTVGKFIFN
RAFPESFEFVFGKHVEYVNKTDANGEVKLSEKEVVYTSNNKNQLEQFLLPYGQNFAEVIA
KMPLNLPLSKKDVAKIVRRVYDKYVAIVTKSDVASVINQINANDISQIFDLCAELKDFNG
KQIDVNHVEILEKIIVEEYKIISQEIILRERTEEPIWTVNDYTKLLEIVWFKYTNVVANV
LDNIKELGYKFSTISGTTISISDVITHQDTKSRIAEGDKYIELLKDYFDQGLMTDDERYN
ATIAKWAAIKDDIEKDLKKLTKLYPDNSLFMMFNSGARGNSSNFVQLAGMRGLMNNNTKV
LKADAENERVVRSTVEIPVKSSFLNGLTAYEFYSSTHGARKGLTDTALNTAKSGYLTRRL
VDVAQGITVREEDCGTDYGFQVKDILDTKTNTVIEGLYDRIEGRFTNKAIYGKDGQLIVD
AGVLITPEIATEIIENEIKKVEIRSVLSCYTPNGVCKKCYGKDLALNRVVNIGEAVGVIA
AQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVAGVEDITGGFGRLIELIDAYDSPWGRPAVISNYYGRITD
IKRIKEGSESVEYDVITQEYKTRDGKVNSVEYKTRAGRKVRVKVNDKVRPGQKIVEGPIV
LNNLLRVGDTRLVQNYILKEVQKLYRLQGITISDKYIEIIIRQMLSKILITDSGDSEFFN
GSLVDIHVYQKESARLISEGKKPPFGEVKIKGAKQIPLLSDSFLAAASYQETPKILVNAS
IKAQVDRLKGLKENIILGHKIPAGTNSNFEENGKYDLRNPKSYFADKYDPDIKTVKFVAD
ENEILSMENRVEIQHIFDEFQSEAFASNMIEFTDESDN
NT seq
4437 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatagttttaataagaaaatagcaaaagaaattaaaaaaataaaaatatcattagcg
gctcaagacgatgttaaaaattgatcatgtggtgaagtaacaaaacctgaaacaattaac
tataagagctataaaccagagcgtgatggtttatttgatgaacttatttttggtcctaca
actgactttaaatgtcctatttgcggcactaagtataagaaaagtgatgaaaacacaatt
tgtgaaaagacaccaatgtgtcaaaaatatcaacctgttattttacctaaaatggttaga
agaagcagaatgggtcacattcatttagaaaaccctgttgtgcacttttgattttttaag
atcgaccactcaattatttctaagttattaggtttaagaatagcaaattcaaataagact
gtttcaaagggtgatttggaaaaattaatttactataagagtcacattgttttagaagat
gggggtcttaagaaacttcaaaagaatgctattattgatatttcagatgctgctattatc
tatgcagacgctttagaagaacttaaagaaagattcgaaaaagatactgaagagtatgaa
ataattagcgaagcattagctgaattagaatcatatgcagtttcacaaactggtcaagat
tatggtattgacttctatgaatacaatgaaattattcatgaattttctaaggctaaaatt
tcaactggttctaaggctattgaatacttattagaaaatatagatctaaaagctgaggct
gaatttattgaaagtgaaattgaaaaaatcaatcaacactttgacagcaatcctactgca
tcaataaaagcacaagaaagatctaaactatacaaacgtttagccgtagttaacgctttt
attcactcagggcaagatcctaaatcaatgcttatttatgatcttccagtaattcctgct
gatttgcgtccattagtacaattagatggcggtcgtcattcaactagtgatgtcaacgaa
ctttatcgtcgtattattattagaaataatcgtttgaaaaaatgggaagaaactgatgct
cctatgcttattaagcaaaatgaatttagaatgattcaagaagctgttgatgctttaatt
gataattctagaaagaaacctgcaccagttacttcaaaagataatcgcccacttaagtca
attagtgacacactaactggtaaaaaaggtagatttagacaaaaccttctaggtaagcgt
gttgattattctggtcgttcagttattgttgttggacctgaattaaaaatgcatcaagtt
ggtgtgccacgtgaaatggccgctaaattgtttgaaccttgaattattaaagaattaatt
aatggtgatagccacataaattcaattaaagctggtaaaaaagcaattgaaaacttagac
ccaattatctgaccttatgttgaaaaagctattgaaggtaaggttgtgcttttaaaccgt
gcccctacactccaccgtttatctattcaagcatatgaacctgtgcttatccgtggtaaa
gcaattaaacttcacccactttcatgtaccccatttaatgctgacttcgatggtgaccaa
atggctatccacgtgcctattagcgatgaagctgtgcgtgaagcaagagagctaatgtta
gcttcaaaaaacattttagggcctaaagatggtgaacctattattaaccctgcacaagat
attatccttggtctttactacctaacaatggaaaaatctgtcgctattgatggtgacaaa
gttgttggtgaaggtaagttcttctctacatatgatgaaatgttattagcatatgaaaac
aaattagtttcacttcatgctcgtgtggcattgccaattaatgaaattaacaagaaaagg
cttaattattcacctgaaaataaatacataatttcaactgtgggtaagtttatttttaat
agagcctttcctgaaagttttgaatttgtttttggtaaacatgtcgaatatgtcaataaa
acagatgcaaacggcgaagttaagttaagtgaaaaagaagtagtttacacttcaaacaat
aagaatcagctagagcagttcctacttccttatggccaaaatttcgctgaagttattgca
aaaatgccacttaatttaccattaagtaaaaaggacgtggctaaaattgtacgtagagtt
tatgacaaatatgttgctatagtaacaaagagcgatgttgcaagcgttataaaccaaatc
aacgcaaatgatataagtcaaatttttgatttatgtgctgaattaaaggactttaacggc
aagcaaattgacgttaaccatgttgaaatattagaaaaaattattgttgaagaatataag
attatctctcaagaaataatactaagagaaagaactgaagaacctatttgaacagttaat
gattacacaaaattgttagaaattgtttgatttaaatatactaacgttgttgctaatgtt
ttggataacattaaagaattaggttacaaattctcaacaatttcaggaactacaatttca
attagtgacgttattactcaccaagatactaagagcagaattgctgaaggcgataaatac
atcgagctattaaaagattattttgatcaaggtttaatgactgatgacgaaagatataat
gcaacaattgctaagtgagctgctattaaggatgatattgaaaaagaccttaagaaacta
actaagctttatcctgataactcattatttatgatgtttaactctggagctcgtggtaac
tcaagtaacttcgtgcaattagctggtatgcgtggacttatgaacaacaacacaaaggtg
ttaaaagccgatgctgaaaacgaacgtgttgttcgttcaactgttgaaattccagttaag
tcatctttcctaaatggtcttactgcttatgaattctattcatcaactcacggtgctcgt
aaaggtttaactgatacagcgcttaacacagctaaatctggttatttaactagaagatta
gttgacgttgctcaaggaattacagtaagagaagaagactgtggaactgactatggcttc
caagttaaagacattttagacactaaaaccaatactgttattgaaggtttatatgacaga
attgaaggaagatttactaataaagcaatttatggtaaagacggacaattaatagttgac
gctggcgtgctaattactcctgaaattgcaactgaaattattgaaaacgaaattaagaaa
gttgaaatccgttcagttctttcatgttatacacctaatggtgtatgtaagaagtgctat
ggtaaggacttagcgcttaaccgtgtagttaacatcggtgaagcagttggtgttattgcg
gctcaatcaataggtgaaccaggtacacagctaactatgcgtacattccatactggtggg
gttgctggtgttgaagatatcactggcggttttggtagattaattgaattaattgatgcc
tatgattcaccatgaggccgtccagctgttatttctaattattatggtcgcataactgat
attaaacgtattaaagaaggctctgaatcggttgaatatgatgttattactcaagagtat
aaaactcgtgatggcaaagtaaattcagttgagtataaaactagagctggcagaaaagta
agagtaaaagttaatgataaagttagaccagggcaaaagatcgttgaaggtccaattgtg
cttaacaatttattaagagttggtgatacacgtttggtgcaaaattacattcttaaagaa
gtgcaaaaactataccgtttacaaggtattaccattagtgacaaatatattgaaataatt
attcgtcaaatgctttctaagattttaattactgactcaggtgattcagaattctttaat
ggttcattagtagatatccatgtttatcaaaaggaaagtgctcgtttaatttcagaaggt
aaaaagccaccttttggtgaagtaaaaattaaaggagctaaacaaattccattattatct
gattcattcttggctgctgcttcatatcaagaaactccaaagattttagttaatgcatct
attaaggcacaagttgacagacttaaagggctaaaggaaaacattatcctaggtcataaa
atacctgctggaactaactctaactttgaagaaaacggaaaatatgacttacgtaaccca
aaatcatattttgcagataaatatgatccggatattaaaactgttaagttcgtggctgat
gaaaatgaaatattaagcatggaaaacagagttgaaattcaacacatttttgatgaattt
cagtctgaagcatttgcttcaaatatgattgaatttacagacgaatctgataattaa
DBGET
integrated database retrieval system
