Janthinobacterium sp. Marseille: mma_1391
Help
Entry
mma_1391 CDS
T00561
Symbol
ugp1
Name
(GenBank) Uncharacterized giant conserved protein
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
mms
Janthinobacterium sp. Marseille
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mms00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
mms02000
]
mma_1391 (ugp1)
Transporters [BR:
mms02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
mma_1391 (ugp1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HemolysinCabind
DpnII
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABR91230
UniProt:
A6SXT4
LinkDB
All DBs
Position
1571705..1580881
Genome browser
AA seq
3058 aa
AA seq
DB search
MATAPVSKSANNQPALDKNGAPIRVVTPDQQGNFQLKIGKGDIAKVHIVDVDMVLYLNDG
TKLVLAGGAIGAMDDSVMVDFSNGRDSAAHMMDQVGIIPLQKLDQPRVLSTEPQGGDGRG
NMQEEASYRQTEGAQDLAAQAQAANAAISAISKAMVQLANVVQSNAQPVNNFKSNYEGQA
SLQQPLIKPVAPVLPERPGVTPQEFVIGPNAPAISVHLTNTVGTTQDGTTLKGSGGSSAF
NSDTNTSNIAQIAPQIINAGNDVREIWANGEAPLNPTTPSNTFSKILDVQITGDGKVQSL
TISGVPTNMTIVGATFLGNGVYQIAVSPDTKNYQLELRYNTVEPNANAPIHQDFKLNFEL
AIITTDGIQVLNSVRQVVLKDATTADDLNYANPITGESALVLPAQGLSHVVHAGDNAGTT
IYGSNANDFLYGGTGDDTLYGGKGNTYFQGGAGDDKIVGGVNTGGTNINTVGYTNSTSGV
TVDLNTGNALDGFGGHDTLQNIQKVIGSAHDDTFIVGANTKGVDGGSGGKDTIDFSASNA
AVTVNLTTGTGTGGYAQNVTFTNIENVVGSSYNDTFIASSVANIFDGGAGGSNTVSYANS
PSSSTSGVTVDLLNGVGSGNDAAGDKYINIQNVIGSAYNDTFVANQEANNFDGMGGVNTV
SYAGSASGVEVDFYKGQGSGGNAAGDSYKNIQNVIGSSFDDKFVADTDSLNFDGGAGGSD
TVSYERYLSGVVVDASRNVGGIELTPAVGNTPATYSNSYTNIDKFVGTAYSDLFIASNRA
DNFDGLGGVDTVSYAADTVGVIVNLVTGQGSGAGSLADGDTLANIENVIGGSGNDTFVAN
DSANVFDGGLGSNTVDYSASTTGAVTVDLFHANGVGTSGGFAQGDKFINIQNVIGSVFDD
TFVASAAANTFDGGGGNHNRVSYANDTVGVTIDLVNGTGSGAGSLADGDKFFNIQDATGG
SGNDTFIASSVANAFNGGLGTNTVSYEYSDVGVTVDLVAGTGTGGYADGDTLTNIQNVKG
STSDDLFIANNVANSFVGNGGVDTVSYIKATDGNGVTVDLNAGVGTGGYAEGDRYQGIRN
ATGTSYDDTFVASNLANTFDGGLGSNTVSYAASNTGVTVNLLTGEGAGGYAQDDRYISIQ
NVIGSASDDLFIANGSVNRFDGGVSTAISHNRVSYATDTADLTIDLLNAGVAGIGGNAEG
DTYVNIQDVTGGLGNDTFIASAAANNFDGGGGTHNRVSYASDTANLTIDLLTPGATGVGG
NAQGDTYTNIQDITGGSGDDTFIANAAANNFDGGTSTATSHNRVSYASDTANLTIDLLNA
GAIGLGGNAQGDTYTNIQDITGGSGDDTFIASAAANNFDGGTSTATSHNRVSYATDTADL
TIDLLTVGAIGQGGNAQGDTYTNIQDLTGGLGNDTFIASAAANNFDGGGGTHNRVSYATD
TANLTIDLLNAGAIGLGGNAQGDTYTNIQDLTGGLGNDTFIASAAANAFDGGGGTHNRVS
YATDTADLTIDLLTVGAIGQGGNAQGDTYTNIQDLTGGLGNDTFIASAAANAFDGGGGTH
NRVSYATDTADLTIDLLTVGAIGQGGNAQGDTYTNIQDLTGGLGNDTFIASAAANAFDGG
GGTHNRVSYATDTANLIINLSDKTASGVTAGTGSGGYAAGDTYTNIQDATGGSGNDIFVA
SLAANSFEGGAGSNTVSYASSVGGVTVNLSSQTVGGVASNTGSGNYADGDVYSNIQNVIG
STGNDTFIGGAAVNTFTGNGGSDTVSYAASTAGVKVNLSGTALETVGAGRGAGGDANNDT
YVGISNVTGSLFDDVFFANNSVNTFDGGGGTLHNRVSYAASSTGIIVNLSDKTILGVNAG
RGSLGDANNDTYINIQDITGTSGNDTFIASAAENIFDGDGGNNTVNYGASDTGVIVNLSA
VAQNGVASLRGSGGYANNDAYTNIQNVTGSLFDDLFYGSNVANIFDGGTGSLHNRVSYAN
DTANLVINLSDKTASGANAGKGLNGNAAGDTYINIQDATGGSGNDTFVASSAENRFDGGA
GSDTVSYASSDAPVIVNLSAVTLGGVASMRGSGGYANNDEYTSIENVIGSSGNDTFYASA
DTAAAANRFDGGGGTHNRVSYEAATADLTVNLITNTGSGGALGDTYANIQDVTGGTGNDT
FVANSSINFFDGGGGTHNRVSYTADTAALIINLSDKTASGVAAGTGSGGNAAGDTYTNIQ
DATGGTGNDTFIASSAENRFDGGTGSDTVSYASSDAPVIVNLSAVTLGGVASMRGSGGYA
NNDEYTSIENVIGSSGNDIFYASADTAAAANKFDGGGGTQNRVSYEAATADVLINLFNGA
ATLNGVSVAANSGAGGALGDTYANIQDVAGGSGNDTFNASAVSNRFDGGNGVNTVSYQSL
AGPVNIDIKNMTGSSAFQNGYLFYNIQNLIGTAGNDTLGGAAGGNSTLTGGAGADALTGY
GLNNTASYAGAAAAVTVNLSGAVVGGVAARSGKGGDAEGDTYTGIQNVTGGNGNDLFIAS
GDTNIFNGGAGNNTVSYAGSTAGVIANLNTATGSTGDATGDTFINVQNLTGTAFADKLTG
LLGGGSVLTGGAGADQLIGQGYNGTAGTANTASYVGSTSGVTINLSSVTVDVSNPLGGLA
AGSGRGGDAEGDTLSGIQNLVGSSFNDTFYASAQTNIFNGGVSDASSHNRVVYTNTTGDM
IINLSDTTVSGVAAGRGSGGEAAADTYINIQDVTGGGGNDTLIGGLAANYFDGGGGNNTV
SYASTNSTAVTVDLFHGTGTGGYAQGDTYTNIQNVIGSSGNDLFYASTVANNFNGGSGGN
DTVSYQYSTGAPIVASLVAGVGGTGGDASGDQYTSIENLTGSANVNSTLYGDGLDNILTA
LGLTNTNLLEGGLGADTLDGRQGGHNTLNGGLGADNFYVQATGGAMTNITAINGGGGLTA
TTYAASTYDTLKIFGLTTAEPVLNMTNFLDGKVSSLNRIDVTGDGTSTKLLFTAADVQAL
VGVGGTLTVMLDNSGGANDSIVSTGFFEAGQNGTQNYYAFYSDSTYTHEIARINVQYV
NT seq
9177 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctaccgctcctgtttccaaatccgctaataaccagcctgcgctggataagaatggt
gcacctatccgtgtcgttacgccggatcagcagggcaatttccaactgaaaattggcaag
ggcgatatcgccaaggtccatatcgtcgacgtcgatatggtgctttacctgaatgacggt
accaaactggtgctggccggtggcgcgattggtgcgatggacgacagtgtgatggtcgac
ttcagcaatggtcgcgatagtgccgcccatatgatggaccaggtcggtatcatcccgctg
caaaaactggatcagccgcgcgtcttgagtacggagccgcaaggtggcgacggacgcggc
aatatgcaggaggaagcctcctaccgccagacggaaggtgcgcaagacctggccgcacag
gcacaagccgcgaatgcggcaatttccgcaatcagcaaggcgatggtgcaactggcgaac
gtggtgcaaagtaatgcgcagccggtcaataacttcaaatcgaactatgaaggccaggct
tcactacagcagccgctgatcaaacctgtggcaccggtcttgccggaacgtccgggtgtc
acaccgcaggaatttgtgatcgggccgaatgcgccggcgatctcggtgcatctgacgaat
acggtgggtacaacgcaggacggcactactttgaagggaagtggcggcagcagtgctttc
aactcggatacgaatacttcaaatattgcgcaaattgcgccgcaaataattaatgcgggc
aatgacgtgcgcgagatatgggcgaatggcgaagcacccctgaacccgactactccaagc
aatacattcagtaaaatccttgacgtacaaattaccggtgacggtaaggtacagagcctg
accatatcgggcgtaccgaccaatatgaccatcgtcggtgcgactttcctcggcaatggc
gtgtaccaaattgcagtatcgccggacaccaagaattaccaactcgaattacgttacaac
acggttgagcctaatgcgaacgcgcctatccatcaagatttcaaactgaattttgaactg
gcgattattaccactgacggcatccaggtgttaaacagtgtgcgacaggttgtacttaag
gatgcgactaccgcagacgacctgaactatgcgaatccgataacgggtgaaagcgcgctg
gtattgccggcgcaaggcctgtcacacgtcgtacacgccggtgacaacgccggtacgacg
atttacggtagtaacgcgaatgactttttgtacggcggtaccggggatgacaccttgtat
ggcggcaagggaaacacctatttccagggcggtgccggcgacgacaagatcgttggtgga
gtgaacactggcggaaccaacattaataccgtcggttatacgaattcgacttcgggagtg
acggtcgacctgaataccggcaatgcgctggatggtttcggtgggcacgacaccttgcaa
aacatccagaaggtgatagggagtgcgcatgacgatacatttatcgtcggtgcgaacacc
aagggagtggatggcggctccggtggcaaggatacgatagatttctctgcatcgaatgca
gccgtcacggttaacctgacgaccggtaccggtaccggtggctatgcacaaaatgttacc
ttcacgaacatcgagaatgtggtcggtagcagctataacgatacttttattgcgagcagt
gttgcaaatatttttgacggtggtgcaggcggctccaatacggtgtcatatgcgaactcg
ccatcaagttcgacatcgggtgtgacagtcgatttgctgaatggtgtgggtagtggcaat
gatgcggctggtgacaaatacatcaatatccagaatgtgatcggtagtgcttataacgat
acttttgttgcgaatcaggaagccaataatttcgatggcatgggcggcgtcaatacggtt
agttacgcaggctcggcaagtggcgtcgaagtagacttttacaaaggccagggtagtggc
ggtaatgcagcaggcgatagctataaaaatatccagaacgtaatcggcagttcttttgac
gacaaatttgttgccgataccgatagtctgaattttgatggtggcgcgggcggcagcgat
acggttagctatgaacggtatttgtcaggtgtcgttgtcgatgcatcgcgtaatgttggc
ggcattgaacttacgcctgcggtcgggaatacacccgcgacctattccaacagctatacc
aatatcgataaattcgtcggtactgcttactcggatttatttatcgccagcaatcgcgcc
gataattttgatggcttgggtggcgttgacacagtcagctacgcagccgataccgttggt
gtcatcgtcaatctggtgaccgggcaaggttctggtgccggcagcctggctgatggcgat
acgctggcgaatattgaaaatgtcataggcggtagtggtaacgatacctttgtcgctaat
gactccgccaatgtattcgacggtggccttggttccaatactgtggattacagtgcttcc
accaccggtgcggtcacggtggatttattccatgcaaatggcgttggcaccagcggtggt
tttgcgcagggcgataaattcatcaatatccaaaacgtgatcggcagtgtattcgacgat
acctttgtcgccagtgcagctgcgaacacctttgatggcggtggcggcaatcataaccgc
gtcagctatgccaacgatacggtgggcgtgacgatagatttggtgaatggaaccggttcc
ggtgcaggcagcctggcagacggggataaattcttcaatatccaggatgcgaccggcggc
agcggcaacgatacttttatcgccagcagtgtcgccaatgcctttaatggcgggctgggt
acgaatacagtgagctatgagtactcggacgtcggtgtaacggtagacctggttgcaggc
actggtactggcggctatgccgatggtgataccttaaccaatatccagaacgtcaaaggc
agcaccagcgatgatttgtttatcgcgaataatgtcgctaactcctttgtcggtaacggt
ggtgtggataccgtcagctatatcaaggcgaccgacgggaatggcgtcacggtagatttg
aatgcaggcgtaggtaccggtggttatgccgagggtgatcgctatcagggtattcgtaat
gcaacgggcaccagctacgacgatacctttgttgccagcaatctggcaaacacctttgat
ggcggactcggctcgaatacggtcagctatgccgcttccaataccggcgtgacggttaac
ctgttgacgggcgagggcgccggcggctatgcgcaagacgatcgctacatttcgatccaa
aatgtaatcggtagtgccagcgatgatttgtttattgcgaatggttccgtcaatcgcttt
gatggtggcgtgagcacagctatttcgcataatcgcgtcagctatgccaccgacaccgct
gacttgacgatcgatttgctgaatgccggcgtggcaggcattggcgggaatgccgaaggc
gacacttacgttaacatccaggatgtcaccggcggcctcggtaatgacactttcatcgcc
agcgcggcggcgaataattttgatggcggtggcggcacccataaccgcgtcagctatgcg
tctgatacagcgaacctgacgatagatttattgaccccgggggcgactggtgtaggcggt
aatgcccagggcgatacctataccaatatccaggacattactggtggttcgggtgacgat
accttcatcgcaaatgcggcagcgaacaacttcgacggcggtaccagcacggcgacttca
cataaccgtgtcagctatgcatctgatacagcgaatctcacgatagatttgttgaacgcc
ggcgcaattggccttggtggtaacgcccagggcgatacctataccaatatccaggacatc
accggtggttctggtgacgataccttcatcgcaagtgcggctgcgaataacttcgacggc
ggtaccagcacggcgacttcacataaccgggtcagctatgcgacggatacagcggatctg
acgattgatttgttgaccgtcggcgcaattggccagggcggtaacgcgcaaggcgatact
tataccaatatccaggatttgactggtggtttgggcaatgacacctttatcgcgagtgcg
gcggcaaataattttgatggtggaggcggtacacataaccgtgtcagctatgcgacggat
acggctaatttaacgattgatttgttgaacgcaggtgcaattggcctgggcggtaatgcg
caaggcgatacctataccaatattcaggatttgaccggtggtttgggcaatgacaccttc
attgccagcgcagcggcgaatgcctttgatggcggtggcggcacacataaccgcgtcagc
tatgcgaccgataccgcggatctgacgattgatttgttgactgttggtgcaattggccag
ggtggtaatgcacagggcgatacctataccaatatccaggacctgaccggtggtttgggc
aatgacaccttcattgccagcgcagcggcgaatgcctttgatggcggcggcggcacgcat
aaccgcgtcagctatgcgaccgataccgcggatctgacgattgatttgttgactgttggt
gcaattggccagggtggtaatgcacagggcgatacctataccaatatccaggacctgacc
ggtggtttgggtaatgacaccttcattgccagcgcagcggcgaatgcctttgatggtggt
ggcggtacacataaccgcgtgagctatgcgaccgatacggcaaacctgattattaatctg
tctgacaagactgcatccggtgtcacggcagggacgggctcaggcggatatgcggcaggc
gatacctacaccaatatccaggacgcgaccggcggcagtggcaacgatatcttcgttgcg
agcctggctgcgaatagttttgagggtggtgccggctccaatacagtgagctatgcgtcg
tcagttggcggagtaaccgtcaacctgtcttcgcaaacagtgggtggtgtggcatcgaat
accggtagtggcaactatgccgatggcgatgtctacagcaatatccagaatgtcatcggc
agtactggtaacgataccttcatcggtggtgccgcagtcaacactttcacgggtaatggc
ggtagcgataccgtcagctatgcggcatcgacggccggcgttaaagtaaatttgtccggc
actgcactggaaacggtaggtgctggtcggggcgcgggtggcgatgcgaataacgatact
tatgttggaatcagcaacgtaaccggcagtttgtttgatgacgtattttttgccaataac
tcggtcaatacatttgacggtggcggcgggacattgcacaaccgggtcagttatgcggca
tcgagcacaggcattatcgtcaacctttccgataaaacgatactgggcgtgaacgccggt
cgcggctcgctgggtgatgcgaataacgatacttatatcaatatccaggacattaccggc
acttccggtaatgacaccttcattgccagtgcagcagagaatatttttgacggtgatggt
ggcaataatacggtgaactacggtgcctcggatacgggtgtgattgtcaacctgagcgcg
gtggcgcaaaacggtgtggcgagtttgcgtggtagcggtggctatgcgaataacgacgct
tataccaatatccagaatgtcacaggcagcctgttcgatgacttgttctatggcagcaat
gtcgcgaatatttttgacggtggtaccggtagtctgcacaatcgcgtcagctatgccaac
gatacggctaacctggttatcaatttgtctgataagacagcttcaggtgcgaatgcagga
aaaggtttaaacggcaatgcggccggcgatacctatatcaatatccaggatgctaccggt
ggttccggcaacgatacatttgttgccagctcggcggaaaaccggtttgatggtggcgca
ggcagcgatacggtcagctacgcatcgtcggatgcgccggtaattgtcaatttatctgcg
gtgacactgggtggtgtcgcttcgatgcgcggtagtggcggttatgcaaataacgacgag
tacaccagcatagagaatgtcataggcagcagtggcaatgatactttttatgccagtgcc
gatacggcggctgccgccaacaggtttgatggcggcggcggtacacataatcgtgtgagt
tatgaagctgcaaccgcggacttgacggttaacctcattaccaacactggcagcggtgga
gcgctgggtgacacctatgccaatattcaggatgtaaccggcggcaccggcaacgatact
tttgttgccaattcctcgatcaacttttttgacggtggtggtggtacacataaccgcgtg
agttataccgctgacacggctgccctgatcattaatctttccgacaagacagcttcgggc
gtggcagctggtaccggttccggcggcaatgcggccggcgatacctataccaatatccag
gatgcaaccggtggtaccggcaacgatacatttattgcgagttcggcggaaaaccggttt
gatggtggcacaggcagcgatacggtcagctacgcatcgtcggatgcaccggtgattgtc
aatttgtctgcagtgacgctgggtggtgtagcgtcgatgcgcggtagtggcggttacgca
aataatgatgaatacaccagcatagagaatgtcataggcagcagtggcaatgatattttt
tacgccagtgccgatacggcagctgcagccaacaagtttgatggtggtggtggcacgcaa
aatcgcgtgagttatgaagctgcaactgcggatgtactgatcaatcttttcaacggcgct
gcgaccctgaacggagtgagtgttgccgccaacagcggcgcaggtggggcactgggcgat
acctatgccaatatccaggatgtggcaggcggctccggtaacgacaccttcaacgccagt
gcggtctccaacagatttgatggtggcaacggagtgaataccgtcagctatcaatcgttg
gctggtccggtcaacattgatatcaagaacatgaccggcagcagtgcgttccagaatggc
tacctcttttacaatatccagaacctgattggtactgcaggcaacgatacgctgggtggt
gcggcaggtggtaattcgacactgaccggcggtgccggcgctgatgcgctgacaggctat
ggtttgaacaatactgcgagctatgcaggtgcagcggccgctgtgacggttaacctttcc
ggcgctgtggtcggtggagtggcggcacgcagcggtaaaggtggtgacgcagaaggtgac
acgtataccggcattcaaaacgtcaccggcggcaacggcaacgatttgtttattgccagt
ggcgataccaatattttcaacggcggtgcaggcaataacacggtcagctatgcaggatca
accgctggtgtgatcgctaatttgaacacggcgaccggttcgaccggtgatgccaccggc
gacactttcatcaatgttcaaaatcttaccgggacggcttttgccgacaaactgactggc
ttgctgggcggtggttccgttttgaccggtggcgcaggtgctgatcaattgatagggcag
ggttacaacggaacagctggaacagcaaataccgccagctatgtcggctccacttcaggt
gtaaccattaacctgtcgtccgtgacggtggatgtatcgaatcctttgggtggcttggct
gcaggttctggtcgcggtggggatgccgaaggtgacaccttgtctggtatccagaatctg
gttggcagcagcttcaacgataccttctatgccagcgcacagaccaatatatttaatggt
ggtgtgtcggacgcaagctcccataacagagtggtctataccaataccactggcgacatg
attatcaacctgtcggacacgaccgtctcgggcgtggcagcaggcagaggtagcggcggc
gaagccgcagcagatacttacatcaacatccaggatgtaacgggtggcggcggcaacgat
accctgatcggcggattggcagccaactattttgatggtggtggcggcaacaacaccgtc
agctatgcgagcaccaacagtacggcggtgacggtcgacctgttccacggcaccggaacc
ggcggttatgcgcagggtgatacctacacgaatatacagaacgttattggtagttccggt
aatgatcttttctatgcaagtacggttgccaataacttcaatggcggcagcggcggtaac
gataccgtgagttaccaatattcgactggcgctcctatcgtggccagcctggtagcggga
gtgggcggcactggtggcgacgcaagcggtgaccaatatacctccatcgaaaatttgacc
ggtagtgcgaatgtcaacagcacgttgtatggtgacggcctggataatattctgacagcg
cttggtttaaccaataccaacttgctggaaggtggtcttggcgcggatacactggatggg
cgtcagggcgggcacaataccctgaacggcggccttggtgcggataacttctatgtgcag
gctactggcggcgccatgacgaatatcacggcgatcaatggcggtggcggccttaccgcg
actacttatgcagccagcacctacgacacactgaagatatttggcctgactactgccgag
ccagtgctcaatatgaccaatttcctggacggcaaggtcagcagccttaaccggattgat
gtgacaggggacggcacttcaaccaagctgttgtttacagctgcagacgtacaggctttg
gttggtgtgggtgggacgctcaccgtgatgctggacaatagcggaggggcaaatgactct
atcgtgagtaccggttttttcgaagcggggcagaacggtacacaaaactactatgccttc
tacagcgatagcacttacacacatgaaattgcccgtatcaatgtgcagtacgtgtaa
DBGET
integrated database retrieval system