KEGG   Methanobrevibacter smithii: Msm_0411
Entry
Msm_0411          CDS       T00539                                 
Name
(GenBank) adhesin-like protein
Organism
msi  Methanobrevibacter smithii
SSDB
Motif
Pfam: DUF11 Chlam_PMP CARDB Integrin_A_Ig_3 Chlam_OMP6
Other DBs
NCBI-ProteinID: ABQ86616
UniProt: A5UK88
LinkDB
Position
complement(391477..395721)
AA seq 1414 aa
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NT seq 4245 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
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DBGET integrated database retrieval system