Marivirga tractuosa: Ftrac_1894
Help
Entry
Ftrac_1894 CDS
T01365
Name
(GenBank) OmpA-related protein
Organism
mtt
Marivirga tractuosa
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CarboxypepD_reg
CarbopepD_reg_2
Invasin_D3
fn3_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADR21880
UniProt:
E4TSS0
LinkDB
All DBs
Position
2273831..2277154
Genome browser
AA seq
1107 aa
AA seq
DB search
MKRILQSLCGIAILLAFATGSAFAQGVTTSGLSGVVKDDKGEELPGATVQAVHTTTGTTY
GAVTNVDGRFRMPNVRVGGPYTVTVTFVGFQEYVLENINLSLGQTRNLEVTLDEESTILQ
EVVVKSTKGETIDGDRTGASTNLSNERIASMPTINRSINDFTRLNPQSNGTSFGGADNRY
NNYTIDGNLYNNNFGLGSSQFAGGNPISVDAIEEVQVNIAPYDVTQSGFTGASVNAVTKS
GTNNIEASAYTLFRNQNTQGTTLNGGQDVPFSESKTQIHGVTLGLPIIKDKLFFFGSFEY
EDNAIPGDTRRAARPEQGLFPDLELGIARMTADQAQFVQEQLQEIYGYETGAFENYPFED
VATRMNFRLDYNLNQQNKIMVRYNNFQQRRDVGINGSSLRYINELRLGNTVRFGNEALTF
RNGNYGSEESVQSIVGEWTSTINNNMANKLNVGYTSSVSQRYIPGDQNFPMSEIVEFQGS
TPLYFASLGTELFTRGNLLDNKTFNITNNFNYFMGKHTFTAGVNFEYMTFDNAFNPMWDG
WYRWNSYDDFVAAVIDRDPSVRPAGFAIGFTYDENNPFELPTDRTEFGQVGIYVQDEYQA
NEDLILTAGLRMELPFYPIDAPRNPSVEALGISVEDPRNPGEFIEPRVDQFPSVNPVFSP
RFGFNWDALGDKTLQVRGGTGVFTGRPIFVHLSNQINGNGVTRGGIGIEADEWGQDGNPE
WEGFQADINYYRPNPAEQEPGVSSGLSITDPNFKLPQTWRSNLAADYVFNGFVFTVEGIF
SKDYNTPFSTNLSSRPTGDAVIIGGNEYPTYTQEALGGAINELFYLTNINDRTYAGLTLG
VEKDWGKGIFTSLAYTRSQARDFGLSGGSQAASLWPSDVQQGRNNPEEGFSRFDQPNRVV
GLIAFNTKGLNETNNTSFNLYYSGGEQGRFSYTYSGNLSGENNGVSLMYIPENFEDAQLV
DRTSGGVITQTAEEQWEILNNYIENDPYLSENRGSVSERNGAILPWLHRLDLSITQDIHL
TKDPSKHKLQFRADILNVLNMMNDSWGVSRRTVQRNLMQFVDTDENGNGQFTINPIQGES
TFPTDVTVPNFDLGQTWSAQFGVKYIF
NT seq
3324 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagagaattttacagagtttatgtggaatagcgattttgttagcttttgcaacagga
tcggcttttgcgcagggtgtaactacatcgggactttcaggtgtagtaaaagacgacaag
ggagaagagttacctggtgcaactgtgcaggcagtacacactacaacaggtacaacttac
ggtgctgtgaccaatgtggatggtagatttagaatgccaaacgtaagagttggtggtcca
tacacagtgacagttacatttgtgggttttcaagagtatgtgcttgaaaatataaacctt
tctttaggtcaaacacgtaatcttgaagttactttagatgaagaatcaacaatacttcag
gaagtagttgtaaaatctactaaaggtgagactattgatggagacagaacaggtgcttct
acaaacttatcaaatgagagaattgcttcaatgcctactattaaccgtagcattaacgat
tttactcgtttaaatcctcagtcgaatggtactagttttggtggtgcagataataggtac
aacaactacacaatagacggtaacttatacaataataatttcggtttgggaagctcacaa
tttgctggtggaaacccaatatcagttgacgccatcgaagaagtgcaagtaaacattgct
ccttatgatgtgactcaaagtggctttacaggtgcaagtgtaaatgctgtaactaaatca
ggaaccaataatatagaagcttcagcttatacgcttttcagaaaccagaatacacaaggt
actaccttaaatggtggccaagatgtccctttttcagagtctaagacacaaatacatggt
gtaactttaggccttccaatcatcaaagacaaattattctttttcgggtcattcgaatat
gaagacaatgctatacctggtgatacccgaagagcagctagaccagagcaagggctattt
ccagatttagaattaggaattgctcgtatgactgctgaccaagctcaatttgtgcaagag
caactacaagaaatctacggatacgaaacaggtgcgttcgaaaactatccttttgaggat
gttgctactcgaatgaatttcagactagactataatctgaatcagcaaaataaaattatg
gtacgctacaataacttccagcaaagaagagatgtaggaattaatggaagcagtcttcgg
tacatcaatgagctaagacttggaaatactgttcgcttcggaaatgaggcattgaccttt
agaaatggtaattacggaagtgaagaaagtgtacaatcgatcgtaggagaatggacttcc
accattaataataacatggctaacaaactaaatgttggttatactagctctgtatcgcaa
agatatattcctggggatcaaaactttccaatgtctgagattgttgagtttcaaggttcc
acaccactatactttgcatctttagggactgagctatttacaagaggtaatttactggat
aacaaaacctttaatatcacaaacaacttcaactatttcatgggaaaacacaccttcaca
gctggtgttaatttcgaatacatgacatttgataatgcattcaacccaatgtgggatgga
tggtacagatggaattcttatgatgattttgtggcagccgttatagatcgtgatcctagt
gtacgtcctgctggctttgccataggatttacttatgatgaaaacaatccatttgagctt
cctactgacagaactgaatttggtcaagtaggtatatatgtgcaagatgagtaccaagcg
aatgaagacttgatattgactgcaggtttacgaatggaactaccattctatcccattgac
gctccgagaaatccaagtgttgaggcattaggaataagtgtagaggatccaagaaaccca
ggtgaatttattgagccaagagtagatcagttcccatcagttaatccagtattttctcct
cgtttcggtttcaactgggatgcattaggtgataaaactttgcaagtgcgtggtggtacg
ggtgttttcactggtcgtccaatttttgttcacttatctaaccaaattaatggtaatggt
gtaactcgaggaggaataggtattgaagctgacgagtggggtcaagatggaaatccagaa
tgggaaggttttcaggctgatattaattattatcgccctaatccggctgagcaagagcca
ggcgtatcaagtggtctttcaattaccgatcctaattttaaattaccacaaacatggaga
agtaatttagctgcggattatgtattcaatggttttgtatttactgttgaaggtattttc
tcaaaagattataacacaccatttagtaccaacttatcaagtagacctacaggggatgct
gttattattggtggaaatgaatatcctacctacacccaagaagcgttgggaggtgctata
aatgaattgttttatttgacaaatattaatgacagaacctacgctggtttaactttaggt
gtagaaaaagactggggaaaaggtatatttactagcttagcttatacgagaagtcaagca
agagattttggtttaagtggtggttcacaagctgcgtctttatggcctagtgatgttcag
caaggtagaaacaatccggaagaaggattctcacgtttcgatcagcctaatagagtggtt
ggtttaattgcttttaataccaaaggattaaacgaaacaaacaatacttcttttaattta
tactactctggtggagaacaaggtagattttcttacacttatagtggtaacttaagtggt
gaaaacaatggtgtttcgttaatgtacatccctgaaaattttgaagatgcacaattagtg
gatagaactagtggaggagtaatcactcaaactgctgaagagcaatgggaaattctaaac
aactatattgagaatgatccatacctaagcgaaaatagaggttcagtttctgaaagaaat
ggagctattttgccatggttacatagattagacctttcaataactcaggatatccactta
actaaagacccaagcaagcataagcttcaatttagagcagatatacttaatgtactaaat
atgatgaatgattcgtggggtgtaagcagacgaactgtccaaagaaacttaatgcaattt
gttgatactgatgaaaacggaaatggacaatttacgatcaatccgattcaaggagagtct
acattcccaacagatgttactgtaccaaactttgatttaggtcagacttggagtgctcaa
tttggcgttaaatacatattttaa
DBGET
integrated database retrieval system
