Candidatus Paracaedibacter acanthamoebae: ID47_08690
Help
Entry
ID47_08690 CDS
T03232
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K04744
LPS-assembly protein
Organism
paca
Candidatus Paracaedibacter acanthamoebae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
paca00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
paca02000
]
ID47_08690
Transporters [BR:
paca02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
ID47_08690
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LptD
LptD_N
LptD_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIK96786
UniProt:
A0A077AWG2
LinkDB
All DBs
Position
complement(1801392..1803692)
Genome browser
AA seq
766 aa
AA seq
DB search
MSFLRFLLLLSIALPCSTEARQKNSVKQTKNSKPLNKAPTFLQSDELSYDDLNQVVTASG
RVYITQNEQLLYADEVQYFKTVDTVVAKGHAWLRDKEGNFSFADQITLSNKMADGFVENI
KVLMIDNSRIAGNRAKRYGGKRVVVWQGVYSPCDVCKTDPTKAPLWQLKSDKIIHDQDAK
VIQYHHAWMEMWGWPIFYVPYFSHPDPAVKRKTGFLMPIYGHSNDFGYSITVPYFIASGE
NHDFTFYPTFTSRQGIIPALEHRYRFDDGEYTMHGSYAGKTTTGFSPNSNPNHYGRANRD
RWHYFLNARYDVTPDVLFTLDVRRASDLTYLKRFPVLPKGSTDPFAASMTLTSTVALERF
RSESYGAIRSYIFQADRQKTVPVVLPIVQYSYETLPGFYGETLMADFNFLNLYRHQGIVG
RAAESMMRGSLGVGGQIPYVSKWGDIWSLKAYVRGDLYHMNGYNTQINNKLKDRTQDRYY
PQASLTWRYPFLKAMESMHWILEPATMITTSSIGGNFIEIPNEDTPVVLVDTTNLFRDNR
MYGIDRIDSGHRFVYGLNSKQLFNCSRKVNFFFGQSVRIDKNQVLPLNSGEDRKASNFVS
GVQIVPIQWLDLRSRLMLNRHNLSVDVAESSTSVSSKWLTGSIGHVFYNKNFTVNNQRIS
QLIWNMTLGKYHGFSLTYGELRNLGDRQSIELLNRTVSIKHETECLISTFSVIRTGFRDR
DLKPDTKIILQLDFKNLGSIYPVNISGVGGVRQAPVPRTANTPVTN
NT seq
2301 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcctttcttcgttttcttttattgttgtcaattgctttgccttgcagtaccgaagct
aggcaaaagaactctgtaaaacaaactaaaaattctaagcccttgaataaggcgccaaca
tttttgcagtcagatgaattaagttatgatgatcttaatcaagttgtaactgcatctgga
cgcgtttatattactcagaatgaacaattgctgtatgccgatgaagttcagtactttaaa
actgtggacacggtggttgctaaaggacatgcttggctgagagataaagaagggaacttt
tcattcgctgatcagataactctatcgaataaaatggccgatggttttgttgaaaatatc
aaagtcttaatgattgataattccaggatcgctggaaatcgggctaaaagatatggtggt
aaacgggttgttgtctggcaaggcgtttattcaccctgtgatgtttgtaaaacagacccc
acgaaggctccgttgtggcaattaaagtccgataaaattattcatgatcaagacgctaaa
gtaattcaatatcatcacgcctggatggaaatgtggggatggccaattttctatgttcct
tatttttcccacccagacccagcagtaaagcgtaagacaggttttcttatgccaatttat
gggcatagtaatgattttggttatagcattacagtgccatattttattgccagtggtgag
aatcatgactttacgttttatccaacatttaccagtagacaaggtatcatcccagcttta
gagcatcgctatcgcttcgatgatggtgaatatacaatgcatggaagttatgcagggaag
acaacaacaggtttttcaccaaattctaatcctaatcattatggacgggcaaatcgcgac
agatggcattattttttaaacgctcgctacgatgttacccctgatgttttatttacattg
gatgttcggcgtgccagtgatttaacctatttaaaacgatttcctgtcttgcccaaaggc
tcaaccgatccttttgctgccagcatgaccttaacctcaactgttgctttagaaagattc
cgttcggaaagttatggggctatccgatcctatatattccaagcagaccgccaaaaaaca
gtgccggttgttttgccgatcgttcagtattcctatgaaactttgcctggtttttatggt
gaaacgctgatggctgatttcaattttctaaatttatatcggcatcaaggaattgtggga
cgtgctgccgagtctatgatgcgtggatccttgggcgtaggaggtcaaattccctatgtt
tctaagtggggggatatttggtccttaaaagcttatgtgcgcggcgatctctatcatatg
aatggttataatacccagattaataataagcttaaagataggacgcaggatcgctattat
cctcaagcctctttaacatggcgttatccattcttgaaagctatggaaagcatgcactgg
attttagagcctgcgacgatgatcactacttcttcaattggaggaaattttatcgaaatt
cccaatgaagataccccagttgttttagtagatacaaccaatttgtttcgagataatcgt
atgtacggtatcgatcgtatcgattcagggcatcgatttgtttacggtctaaactcaaaa
caactttttaattgctcgcgtaaagttaatttcttctttggtcaaagcgtgcgaattgat
aaaaaccaagttttgcctctcaattcgggagaggatcgtaaggcctcaaactttgtctca
ggggtacaaattgttcctatacagtggttggatcttaggtctcgcttaatgttaaatcgc
cataacctgagcgtagatgtagcggaatcgtctactagtgttagctctaaatggctcaca
ggctcgattggtcatgtattctataacaagaattttaccgttaataatcagcgtatttcg
caacttatctggaatatgacactgggtaaataccatggtttttctttgacttatggggag
ttgcgcaatctgggagatcgtcagtccatagaacttttgaatcgaacagtctccattaag
catgaaactgaatgcttgatttctacgttttctgttattcgaactgggttccgggatcgg
gatttaaaacctgatactaaaattatcttgcaattagatttcaagaatttaggtagcatc
tatcctgtaaatattagtggagttggtggcgtgcgtcaggcacctgttcctcgcacggca
aatacaccggtcactaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
