Psychrobacter cryohalolentis: Pcryo_2246
Help
Entry
Pcryo_2246 CDS
T00350
Name
(GenBank) Lytic murein transglycosylase
Organism
pcr
Psychrobacter cryohalolentis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SLT_2
PG_binding_1
PG_binding_3
FG-GAP
PG_binding_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABE76023
UniProt:
Q1Q8I0
LinkDB
All DBs
Position
2755114..2756586
Genome browser
AA seq
490 aa
AA seq
DB search
MRLNHLSTLSLLTAAIGLSLASTAQAAKPDAPNLSNAQFQQCLDGLKNSSKFRDVDSYTF
NNYRPSEPDPSVIQSLNYQPEFQKDVWDYLSSLVDTERVEDGIRAKRQWADTLRKIESRY
GVKAEHVLGVWGVESNFGQTLGKKPLFESLATLSCFDRRQSYFQGEYANALKIVQNGDIA
PSDMTGSWAGAFGQTQFMPSTFLELAVDFDGDGRRDLVNSVPDALASTANFLDKRGYRSG
EAWGYEVKLPSGFWAASNRKDKKSMSHWRNQGLTLANGSPLPSDLSSAGLLLPAGPDGPA
FLVGKNFDTFYSYNASESYALAIAHLSDLITRESSSKTDFITAWPTDDPGIGRQESRAIQ
QALLNAGYDIGAVDGIIGDNTRTAIQQYQSSRGIFPADGRAGQKFYRAIVGNTAPNTSQY
GNQYNQPTNSRPLNPASADRMGQLIQQQNTTSNSYSQPIAISPSKSSTTRYRRVTGADGT
IKLVRIDEGS
NT seq
1473 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgcttgaatcacttatccaccttatctttattgacggcagcgattggcttaagtctt
gccagcaccgctcaagctgccaagccagacgccccaaacttgtctaatgctcagtttcag
cagtgtctagatggtctaaaaaactctagcaaatttcgtgatgttgatagctataccttt
aataactatcgtcccagtgagcctgaccctagtgttattcaatcgctaaactatcaacct
gaatttcaaaaagacgtttgggattatttgtcatcacttgttgataccgaacgcgtagaa
gatggtatccgtgccaagcgtcaatgggcggatacgttacgtaaaattgaatcgcgctat
ggcgttaaagccgagcacgtattaggcgtttggggcgtagagtctaactttgggcagaca
ttgggcaaaaaacctttgtttgaatctttagcgaccctatcttgctttgatcgccgccaa
agctatttccaaggcgaatatgccaatgcactaaaaatcgtccaaaacggtgatattgcg
ccaagcgatatgacaggttcatgggcaggcgcgtttggtcagacgcagtttatgccaagt
acatttttagagttggcagtcgacttcgatggcgatggtcgccgcgacttggtcaatagc
gtccccgatgcccttgcctctacggcaaacttcttagataaacgtggctaccgttcaggc
gaagcatggggttatgaggtaaaactgccaagtggattttgggcagcgtccaaccgtaaa
gataaaaaatcgatgagccactggcgcaatcaaggtttaacccttgctaatggcagcccg
cttccttctgacttgagtagtgctggattattattaccagccggtcctgacggccctgca
ttcttagtcggtaaaaactttgatacgttctattcttataacgcctcagaaagctatgca
ctggcgattgcccatttatcagatttgattactcgcgagagtagtagtaaaactgacttt
atcacagcatggccaactgacgatcctggtattggtcgtcaagaatccagagcgattcag
caagcattattaaatgcaggatatgatatcggcgccgtcgatggcattatcggtgataat
actcgtactgctatccagcagtaccagtctagccgtggcatttttccagctgatggacgt
gcagggcagaaattctatcgtgccatcgttggtaatacggcgcctaatacttcgcaatac
ggcaatcagtataaccagccaacaaacagtcgtcctttaaaccccgcgtctgctgatcgt
atgggacaattaattcaacagcaaaatactacatctaatagctactcacagcctatagcg
atcagcccatcaaaatcaagcacaacgcgatatcgccgtgtaacgggtgctgatggtact
ataaaactggtacgtattgatgaaggctcttga
DBGET
integrated database retrieval system