Prevotella melaninogenica: HMPREF0659_A5092
Help
Entry
HMPREF0659_A5092 CDS
T01286
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
pmz
Prevotella melaninogenica
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_S46
Trypsin_2
Trypsin
TipAS
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADK96058
LinkDB
All DBs
Position
I:128416..130539
Genome browser
AA seq
707 aa
AA seq
DB search
MKKSTLLIAGLLALGSTSMHADEGMWTLYNLPDAVYEQMVAEGFQLPRNMLYGAPNAISN
SVINFSGFCSGVVVSPNGLVFTNHHCGFSAINALSTVEHDYMKDGFYAKSYAEELPSKDL
FVSFMKKQEDITPRVNKLIAGKNAEQTEAIIDSLTNHLTDSIKTIDKTLHISVDAFYEGN
KYYATTYQDFQDVRLVFTVPKSMGKFGGETDNWMWPRQTSDFSVFRIYADPKTNGPAAYS
KDNVPYKPANWAPVSLEGYKDKDFAMTIGYPGSTNRYLSSFGIQQRRDIENTVQVQVRDI
KLAIMKKYMDKNEKTRLQYENKYVTSANYWKNSIGMNKCIDSIGLIRQKAEYEAKIQRWL
DEKTVKDPTVNVDLKKLSNLYKESAEPALVQAYWNESFWKVSELIQRAIDITRGAIEPQG
PKDDESAQYVQFKDNSSDWNLALDKEMTAAMLKNYAEHVPAAYRPEVFNVIKTKFGNNYK
KYTDWLYANSKLLVKDHKFYNDENTLNDPGIQLGVELVMLYQQVMTNYVSKIEAIEQEEK
KLCEAKVQMEMDMPHYSDANFTMRMSYGQVGGYMIGGFDSNYYTTAESLVEKMKLGKKLE
DYKVEPIMMDLMSAKNFGRYADKTTGKMQLCFLTNNDITGGNSGSPMFDGKGRLIGLAFD
GNWDSLSSDINFDRKLARCIGVDIRFVLYLMDKWGHADRLLQEINPQ
NT seq
2124 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaaatcgactttacttattgccggacttctcgcattgggtagtacatccatgcac
gccgacgagggtatgtggacgctctataacttgccagatgccgtctacgaacaaatggta
gctgagggattccagttgccacgcaacatgctttatggcgcacctaacgctattagcaat
tctgttatcaacttctctggcttctgctcaggtgttgttgtatcaccaaatggtcttgtc
ttcactaatcatcactgtggattcagcgcaattaatgccctttccaccgttgaacatgat
tatatgaaggatggtttctatgcaaaaagctatgcagaggaactcccaagcaaggacttg
tttgtgtcctttatgaagaagcaggaggatattactcctcgtgttaataagcttattgca
ggtaagaatgctgaacagacagaggcgattatcgattctcttacaaatcatttgaccgac
tctatcaagaccattgataagactttgcatatcagtgttgatgctttctacgagggaaat
aagtattatgccactacatatcaggacttccaagacgtacgtttggtgttcacagtacca
aagagtatgggtaagttcggtggtgaaacagacaactggatgtggccacgacagacaagt
gacttctctgtgttccgtatttatgccgatcctaagaccaacggaccagctgcctactca
aaggataatgtgccttataagccagctaactgggctcctgtaagtcttgagggttataag
gataaggattttgcaatgacaattggctatcctggctctactaatcgttacttgtcttcg
ttcggtatacagcagcgtagagacatcgagaacaccgttcaggtacaagttcgtgatatc
aagctcgctattatgaagaagtacatggataagaacgagaagactcgtctccaatatgag
aacaagtacgttacatcagctaactactggaagaactctattggtatgaataaatgtatt
gattccatcggtttgattcgtcagaaggctgaatatgaggctaagatacagagatggttg
gatgaaaagaccgtgaaggaccctactgtaaatgttgatctcaagaagttaagcaacctt
tataaggagagtgctgagcctgctctggttcaagcttactggaacgagtcattctggaag
gtgtctgaattgattcagagagctattgatatcacccgtggtgctatcgaaccacagggc
cctaaggatgatgaatcagcacagtatgtacagtttaaggacaatagtagcgactggaac
ttagcccttgataaggaaatgacagccgctatgttgaagaactatgctgaacacgtacct
gctgcgtatcgtccagaagtatttaatgttatcaaaacaaagttcggtaacaattataag
aagtacactgactggctctatgcaaatagtaaattacttgttaaggaccataagttctat
aatgatgagaacacactcaacgacccaggtatacagcttggagtagaactcgtgatgctc
tatcagcaagttatgaccaactatgttagcaagatagaagctatcgagcaggaagagaag
aaactttgcgaggcaaaggtacagatggagatggatatgccacattacagtgacgctaac
ttcacgatgcgtatgtcttatggtcaggtaggtggttatatgattggtggctttgacagc
aactactacacaactgctgagagtcttgttgagaagatgaagttaggtaagaaacttgag
gattacaaggttgagcctattatgatggaccttatgagtgctaagaactttggtcgttat
gctgataagacaactggtaagatgcagctttgcttccttactaacaatgatatcactggt
ggtaactcaggttctccaatgttcgatggtaagggtcgccttattggtcttgctttcgac
ggtaactgggatagcctttcaagcgatatcaacttcgatcgcaagctcgcacgttgtatt
ggtgttgacatccgtttcgtcctctacctgatggataagtggggtcatgctgaccgccta
ctgcaggaaattaacccacagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
