Pseudopedobacter saltans: Pedsa_0842
Help
Entry
Pedsa_0842 CDS
T01430
Name
(GenBank) integral membrane sensor hybrid histidine kinase
Organism
psn
Pseudopedobacter saltans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Reg_prop
HATPase_c
Response_reg
Y_Y_Y
HTH_18
HTH_AraC
HisKA
SGL
PSII_BNR
HATPase_c_5
KIP1
HATPase_c_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADY51414
UniProt:
F0S9Q8
LinkDB
All DBs
Position
1049559..1053545
Genome browser
AA seq
1328 aa
AA seq
DB search
MLAAKRWSFKLFIILFLVSPSIFAQMKNTFEHITVEQGLSQSAVLSIAQDSLGFMWFGTK
DGLNRYDSKNVEVYRSKSKDPKSLSSSININTLLVDSKGFLWIGTQHGLNKYLAESDSFQ
QFLHRGDNPKTISNEVIRSLFEDNEGNVWVGTEKGLNKVLPDGSIERFEVEKYSKNGLTN
DFIKTIYQDRQGIMWLGTTGGLVKMTNAGKTYKFKFYESDKNKENSISGNDISSIIEDYQ
GNLWIGTRLKGFNLFDRNKETFVRFDIRSGVGLSSDDIRKITVDKNGKLWIATLGGVNIF
NPLISKVEQIFVNEPENPNSLSQNSTYDIYQDKLGSMWIGTYFGGLNITHTLNPPFTLYQ
HFSYKNSLSSNIVSAMVEDGYGNLWIGTEGGGLNYLDRKTGRFKEYKHTQGEENSLSSNL
VKDLALDAEGNLWATTFEGGLNVYNPKTGKFRIYKHTSSLKSNRLSNILIDSKQKVWVGS
RNGLFIYDSHLDIFKQTDVPHSFISSIYEDSEGRIWVASDTGLFLKGNKSNHFVNITLKD
NPSWFLRINAISEDSKGKIWFATHNGILVYSDKDKTVKLYTENQGLPTNSILGVIEDNQK
NLWFSTTKGLVKFEKGIFKTYNTADGLAGNVFNFNSFLKGGNGELFFGGFNGMISFRPED
IKENKAKPTVILTGVYLPDKVVKVGDETEILKKAIWDTPKIGIPYKESVFSLDFAVLNYI
SPNKNKYAYKLEGIDKQWIELQSPNISFNKLSDGEYILLVRGSNNDGVWSDIKKLKITIY
PPFWKSWWAYLFYLAIIAGIGFVVIRYFIMEALLKKEHEVHQLKVDFFRNVSHEIRTPLT
LILGPIEKLIGDPETSLPIKDQLSGVNKHVKRLTKLINELLDFSKVEAGKMKLRVERVNL
VDFTHDIYQSFQYKARETGIQYRFSSAKSSIEAYIDKAQLEKVFYNLLSNAFKFTPNDGR
VDVTIEETATDILVRIIDSGKGIGKENKEKIFTNFYQEDTDQRNIGTGIGLALSKSIAKL
HKGDLIVEDDDRETIFCLSLKKGFEHLNEFEIIEDQYEGKLADYDVDVEEQENEAELPSI
LVIEDNKEVRDFVVDTLKEKYSVLTAENGSEGLKLTLTHMPDIVISDVMMPVMDGIAYCR
AVKSDERINHIPVVLLTARTGESDELEGLKIGADAYMTKPFTIDKLKYTVSNLVALQEAM
RSKFTRRLSLEPNQPETEHPDNRFIEKVLHLLEENIGNPNFGVNDFASEIGMSTPIFYKK
IKAITGLTVNNFMKSFRLKRALQLMEQKRGTISEIAYNVGFTDPKYFSKEFKKQFGKTPT
EFISCQYS
NT seq
3987 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcttgctgcaaagagatggagttttaaactgttcataatcctttttcttgtctctccg
tcaattttcgcccaaatgaaaaatacatttgagcatatcactgttgaacaaggtctttcc
caaagtgcagtgttatccattgcgcaggacagcttgggctttatgtggttcggaacaaag
gacggtttaaatcggtacgattcgaaaaatgtagaggtttatcgaagtaaatcaaaagat
cctaaatctttaagcagcagtataaatatcaatacccttcttgttgattctaaaggtttt
ttatggataggaacgcaacatggcttaaataagtatttggccgaaagtgattcttttcag
caatttctacatcggggggataatccgaaaacaatttctaatgaggttatcagatcttta
ttcgaagataatgaagggaatgtttgggtaggtaccgaaaagggattgaataaagtgctg
ccagacggaagtatcgaaaggtttgaagtagaaaagtatagtaaaaatggcttaacaaat
gactttattaaaacaatttatcaggatcggcagggcattatgtggttgggaactaccggt
ggtttggtgaagatgacaaatgcgggaaaaacgtataaatttaaattttacgagtcagat
aaaaataaagaaaattcaatatcaggtaatgatattagttcaataatcgaagattaccaa
gggaatttgtggataggaacacgattaaaagggttcaatctctttgatcgcaacaaagaa
acatttgttagattcgatattaggtcgggggtggggttaagcagtgatgatatcaggaaa
attacggtagataaaaacgggaagctatggattgccacacttggaggagtaaacattttt
aatcctctaattagcaaggtagaacaaatatttgttaacgaacccgagaatcccaacagt
ttaagccaaaattcaacctatgatatttatcaggataaattgggctctatgtggatcgga
acctactttggcgggctgaatattacccacactttaaatcctccattcactttatatcag
catttctcttataaaaattctcttagtagcaatatagttagcgcaatggtggaagatggt
tatgggaatctatggatagggacagaaggaggcggtttaaattatttggatcggaaaacg
ggtagatttaaagaatacaaacatactcagggcgaggaaaattcgctaagttccaatctt
gtaaaagatcttgctttagacgcagaagggaatttatgggcaacgacgtttgaggggggc
ttaaatgtatacaatcctaaaactggtaaattccgaatatataaacatacttcatcatta
aaatcaaatagattatctaatatcttaatagacagcaaacaaaaggtttgggtaggaagc
agaaatggcctgtttatttatgatagccatttagatatctttaaacaaacagatgtaccg
cattcctttatatcatcaatttatgaagatagtgagggccgaatctgggtagcaagtgat
accggtttgtttttaaaagggaacaaatcaaatcactttgtcaatatcacattaaaagat
aatccatcctggtttttacgtataaatgcaatatcagaagattcaaaaggaaaaatatgg
tttgctacacataacggaatattagtttactcggataaagataagacggttaaactttat
accgaaaatcagggtttgcctaccaattctattttaggagtaatagaagataaccaaaag
aatttatggtttagtacgacaaaagggctggttaagtttgaaaaaggcatatttaaaact
tacaatacggcagatggtcttgcagggaatgtttttaattttaactcttttttgaaaggc
ggaaacggagaactcttttttggtggttttaatggtatgataagctttaggccggaggat
atcaaggaaaataaagcaaaacctacagtaattttaaccggagtttatttacctgataaa
gttgttaaagtaggtgacgaaacagaaatattaaaaaaggccatttgggatactcctaaa
ataggtattccttataaagaaagtgttttcagtctcgactttgcagttttgaattacata
agtccaaataaaaacaaatacgcatataaattagaaggcatcgataagcaatggatagag
ctgcagtcacctaatatttcctttaataaactttctgatggagagtatatattattggta
agaggaagtaataatgatggtgtttggagtgatattaaaaagcttaagataacgatctat
ccgccgttttggaaaagttggtgggcttatcttttttatcttgcgataatagcgggtatt
ggttttgttgtcatcaggtattttatcatggaagccctgttgaaaaaggaacatgaagtt
caccaattgaaagtagatttttttagaaatgtttctcacgaaatccgaactcctttaacc
ctgattttaggtccaattgaaaagttaataggagatccggaaacgagtttaccaattaag
gaccaattatcaggagttaataaacatgtaaagcgtctgaccaaacttattaacgaactg
ctagactttagcaaagtagaagcaggtaagatgaaactgcgtgttgaaagagtcaatttg
gttgattttacacatgatatttatcagtcttttcaatacaaggcaagagaaacaggtatt
caatatcgttttagcagtgccaagtcgtcgatagaagcttatatagataaagctcagtta
gaaaaggttttctataatttattgtcaaatgcttttaaattcacgcctaatgatggtagg
gttgatgttactatagaagaaactgctactgatattttggtaagaataatcgacagtgga
aaaggaattggtaaggaaaacaaggaaaagatatttacaaatttctatcaggaggatacc
gatcaaaggaatataggtaccggtataggattggcgttatcgaaaagtatcgcaaagctg
cataaaggtgatttaatagttgaagacgatgatagagaaacaatattctgtctttcatta
aaaaaggggttcgaacatttaaatgagtttgaaattatagaagaccaatacgaaggtaaa
ttagcagattatgatgtagatgttgaagaacaggaaaatgaagctgagttaccttccata
cttgtgatagaagacaataaagaagtacgtgattttgttgtggatacgctaaaagagaaa
tatagtgtattaactgccgaaaacggaagcgaaggattgaagcttacattgactcatatg
cccgatattgtaataagtgatgttatgatgccggttatggatggaatagcgtattgcaga
gcagtaaaatcagatgaaaggataaaccatattcctgtagttttactaactgccagaaca
ggagaatccgatgaattggaaggattgaaaatcggtgctgatgcatatatgacaaaacct
tttacgatagataagcttaaatataccgtttctaatcttgttgctttacaggaagcaatg
cgcagcaaatttacaagaagattgagtttggaacctaatcaacccgaaaccgaacatcct
gacaatcgatttatagaaaaagtattgcatcttttggaagagaacattggtaatccaaat
tttggagtaaatgattttgcttcggaaataggaatgagtacacctatcttctataaaaaa
attaaggccattacggggcttactgttaataattttatgaagtctttcaggctaaaaaga
gccctccaattaatggaacaaaaacgcggaacaatttccgaaatagcctataatgttggt
tttaccgatccaaaatattttagcaaagaatttaagaagcaattcgggaagacgccaaca
gagtttatttcgtgccaatatagttga
DBGET
integrated database retrieval system